The origin and evolution of Life in the universe

Leistungen

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Veröffentlichungen

An X-ray spectroscopy study of structural stability of superhydrogenated pyrene derivatives

Autoren: Yining Huo, Mónica K Espinoza Cangahuala, Vicente Zamudio-Bayer, Marcelo Goulart, Markus Kubin, Martin Timm, J Tobias Lau, Bernd von Issendorff, Ronnie Hoekstra, Shirin Faraji, Thomas Schlathölter
Veröffentlicht in: Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Ausgabe 523, 2023, Seite(n) 865-875, ISSN 0035-8711
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1093/mnras/stad1341

Enantioselective Self-Replicators

Autoren: Shuo Yang, Yannick Geiger, Marc Geerts, Marcel J. Eleveld, Armin Kiani, Sijbren Otto
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 145, 2023, Seite(n) 16889-16898, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c05472

Impact of ancestral sequence reconstruction on mechanistic and structural enzymology

Autoren: Callum R. Nicoll, Marta Massari, Marco W. Fraaije, Maria Laura Mascotti, Andrea Mattevi
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 82, 2024, Seite(n) 102669, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102669

Achieving Control in Micro-/Nanomotor Mobility

Autoren: Alexander D. Fusi, Yudong Li, Dr. A. Llopis-Lorente, Dr. Tania Patiño, Prof. Dr. Jan C. M. van Hest, Dr. Loai K. E. A. Abdelmohsen
Veröffentlicht in: Angewandte ChemieBron:Wiley Online Library: Complete Journals, Ausgabe volume 135, issue 5, 2023, ISSN 0044-8249
Herausgeber: John Wiley and Sons,
DOI: 10.1002/ange.202214754

Exploring Intra- and Inter-Regional Interactions in the IDP α-Synuclein Using smFRET and MD Simulations

Autoren: Gobert Heesink, Mirjam J. Marseille, Mohammad A. A. Fakhree, Mark D. Driver, Kirsten A. van Leijenhorst-Groener, Patrick R. Onck, Christian Blum, Mireille M.A.E. Claessens
Veröffentlicht in: Biomacromolecules, Ausgabe 24, 2023, Seite(n) 3680-3688, ISSN 1525-7797
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.3c00404

Temporal segregation of biosynthetic processes is responsible for metabolic oscillations during the budding yeast cell cycle

Autoren: Vakil Takhaveev, Serdar Özsezen, Edward N. Smith, Andre Zylstra, Marten L. Chaillet, Haoqi Chen, Alexandros Papagiannakis, Andreas Milias-Argeitis, Matthias Heinemann
Veröffentlicht in: Nature Metabolism, Ausgabe 5, 2023, Seite(n) 294-313, ISSN 2522-5812
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1038/s42255-023-00741-x

Vanillyl alcohol oxidase from Diplodia corticola: Residues Ala420 and Glu466 allow for efficient catalysis of syringyl derivatives

Autoren: Daniel Eggerichs, Nils Weindorf, Maria Laura Mascotti, Natalie Welzel, Marco W. Fraaije, Dirk Tischler
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 299, 2024, Seite(n) 104898, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104898

Asymmetric Synthesis of Chiral‐at‐P Alkenylphosphonamidates through Nickel‐Catalyzed C−P Coupling of Phosphoramidites and Alkenyl Halides

Autoren: Xiao‐Bing Chen, Damián Padín, Charlotte N. Stindt, Ben L. Feringa
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 62, 2023, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202307450

Bacterial multi‐solute transporters

Autoren: Dirk J. Slotboom, Thijs W. Ettema, Mark Nijland, Chancievan Thangaratnarajah
Veröffentlicht in: FEBS Letters, Ausgabe 594, 2023, Seite(n) 3898-3907, ISSN 0014-5793
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1873-3468.13912

Author Correction: CRISPR-based transcriptional activation tool for silent genes in filamentous fungi

Autoren: László Mózsik, Mirthe Hoekzema, Niels A.W. de Kok, Roel A.L. Bovenberg, Yvonne Nygård, Arnold J.M. Driessen
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe vol 11, issue 1, 2021, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-99654-6

Cryo-EM studies of membrane proteins at 200 keV

Autoren: Chancievan Thangaratnarajah, Jan Rheinberger, Cristina Paulino
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 76, 2024, Seite(n) 102440, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102440

All-Photochemical Rotation of Molecular Motors with a Phosphorus Stereoelement

Autoren: Gregory B. Boursalian, Eise R. Nijboer, Ruth Dorel, Lukas Pfeifer, Omer Markovitch, Alex Blokhuis, Ben L. Feringa
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 142, 2023, Seite(n) 16868-16876, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.0c08249

Role of Curvature‐Sensing Proteins in the Uptake of Nanoparticles with Different Mechanical Properties

Autoren: Daphne Montizaan, Catherine Saunders, Keni Yang, Sajitha Sasidharan, Sourav Maity, Catharina Reker‐Smit, Marc C. A. Stuart, Costanza Montis, Debora Berti, Wouter H. Roos, Anna Salvati
Veröffentlicht in: Small, Ausgabe 19, 2023, ISSN 1613-6810
Herausgeber: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202303267

Quorum sensing communication between lipid-based artificial cells

Autoren: Antoni Llopis-Lorente, Bastiaan C. Buddingh', R. Martínez-Máñez, Jan C. M. van Hest, Loai K. E. Abdelmohsen
Veröffentlicht in: Chemical Communications, Ausgabe 59, 2024, Seite(n) 579-582, ISSN 1359-7345
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cc05367e

Water content of rocky exoplanets in the habitable zone

Autoren: Ádám Boldog, Vera Dobos, László L. Kiss, Marijn van der Perk, Amy C. Barr
Veröffentlicht in: Astronomy & Astrophysics, Ausgabe 681, 2024, Seite(n) A109, ISSN 0004-6361
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1051/0004-6361/202346988

A comparative laboratory study of soft X-ray-induced ionization and fragmentation of five small PAH cations

Autoren: Yining Huo, Mónica K. Espinoza Cangahuala, Vicente Zamudio-Bayer, Marcelo Goulart, Markus Kubin, Martin Timm, J. Tobias Lau, Bernd von Issendorff, Ronnie Hoekstra, Shirin Faraji, Thomas Schlathölter
Veröffentlicht in: The European Physical Journal D, Ausgabe 77, 2023, ISSN 1434-6060
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1140/epjd/s10053-023-00763-w

Key features of inhibitor binding to the human mitochondrial pyruvate carrier hetero-dimer

Autoren: Sotiria Tavoulari, Tom J.J. Schirris, Vasiliki Mavridou, Chancievan Thangaratnarajah, Martin S. King, Daniel T.D. Jones, Shujing Ding, Ian M. Fearnley, Edmund R.S. Kunji
Veröffentlicht in: Molecular Metabolism, Ausgabe 60, 2022, Seite(n) 101469, ISSN 2212-8778
Herausgeber: Elsevier GmbH
DOI: 10.1016/j.molmet.2022.101469

Lipid-Based Nanoparticle Functionalization with Coiled-Coil Peptides for <i>In Vitro</i> and <i>In Vivo</i> Drug Delivery

Autoren: Dennis Aschmann; Renzo A. Knol; Alexander Kros
Veröffentlicht in: Accounts of Chemical Research, Ausgabe 57, 8,, 2024, Seite(n) 1098–1110, ISSN 0001-4842
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.accounts.3c00769

Structural consequences of BMPR2 kinase domain mutations causing pulmonary arterial hypertension

Autoren: Apirat Chaikuad, Chancievan Thangaratnarajah, Frank von Delft, Alex N. Bullock
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 9, 2022, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-54830-7

Ancestral-sequence reconstruction unveils the structural basis of function in mammalian FMOs

Autoren: Callum R Nicoll, Gautier Bailleul, Filippo Fiorentini, María Laura Mascotti, Marco W Fraaije*, Andrea Mattevi
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe vol 27, 2019, Seite(n) 14-24, ISSN 1545-9985
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0347-2

Fitness landscape of substrate-adaptive mutations in evolved amino acid-polyamine-organocation transporters

Autoren: Foteini Karapanagioti, Úlfur Águst Atlason, Dirk J Slotboom, Bert Poolman, Sebastian Obermaier
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 13, 2024, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.93971.3

Stoichiometry alone can steer supramolecular systems on complex free energy surfaces with high selectivity

Autoren: Dávid Komáromy, Theodora Tiemersma-Wegman, Johan Kemmink, Giuseppe Portale, Paul R. Adamski, Alex Blokhuis, Friso S. Aalbers, Ivana Marić, Guillermo Monreal Santiago, Jim Ottelé, Ankush Sood, Vittorio Saggiomo, Bin Liu, Pieter van der Meulen, Sijbren Otto
Veröffentlicht in: Chem, Ausgabe 7, 2023, Seite(n) 1933-1951, ISSN 2451-9294
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chempr.2021.05.020

CRISPR-based transcriptional activation tool for silent genes in filamentous fungi

Autoren: László Mózsik, Mirthe Hoekzema, Niels A W de Kok, Roel A L Bovenberg, Yvonne Nygård, Arnold J M Driessen
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe vol 11, issue 1, 2021, Seite(n) 13 pages, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-80864-3

Natamycin sequesters ergosterol and interferes with substrate transport by the lysine transporter Lyp1 from yeast

Autoren: Maria Szomek, Peter Reinholdt, Hanna-Loisa Walther, Holger A. Scheidt, Peter Müller, Sebastian Obermaier, Bert Poolman, Jacob Kongsted, Daniel Wüstner
Veröffentlicht in: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, Ausgabe 1864, 2024, Seite(n) 184012, ISSN 0005-2736
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamem.2022.184012

Bidirectional ATP-driven transport of cobalamin by the mycobacterial ABC transporter BacA

Autoren: Mark Nijland; Solène N. Lefebvre; Chancievan Thangaratnarajah; Dirk J. Slotboom
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15 / 1, 2024, Seite(n) 9 pages, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46917-1

Reconstructing the evolutionary history of F420-dependent dehydrogenases

Autoren: M. Laura Mascotti, Hemant Kumar, Quoc-Thai Nguyen, Maximiliano Juri Ayub, Marco W. Fraaije
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 8, 2022, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-35590-2

Investigating the biochemical signatures and physiological roles of the FMO family using molecular phylogeny

Autoren: C.R. Nicoll, M.L. Mascotti
Veröffentlicht in: BBA Advances, Ausgabe 4, 2023, Seite(n) 100108, ISSN 2667-1603
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bbadva.2023.100108

One Soai reaction, two mechanisms?

Autoren: Yannick Geiger
Veröffentlicht in: Chemical Society Reviews, Ausgabe 14604744, 2022, ISSN 1460-4744
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cs01038g

Endocytosis-like DNA uptake by cell wall-deficient bacteria

Autoren: Renée Kapteijn, Shraddha Shitut, Dennis Aschmann, Le Zhang, Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Anat Akiva, Gilles P. van Wezel, Alexander Kros, Dennis Claessen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33054-w

The topological shadow of $${{{\mathbb {F}}}_1}$$-geometry: congruence spaces

Autoren: Oliver Lorscheid, Samarpita Ray
Veröffentlicht in: Mathematische Zeitschrift, Ausgabe 306, 2024, ISSN 0025-5874
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00209-023-03425-0

Hybrid Biodegradable Nanomotors through Compartmentalized Synthesis

Autoren: Imke AB Pijpers, Shoupeng Cao, Antoni Llopis-Lorente, Jianzhi Zhu, Shidong Song, Rick RM Joosten, Fenghua Meng, Heiner Friedrich, David S Williams, Samuel Sánchez, Jan CM van Hest, Loai KEA Abdelmohsen
Veröffentlicht in: Nano Letters, Ausgabe issue 20 / 6, 2020, Seite(n) 4472-4480
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.0c01268

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