Les grilles de superinformatique apportent leur contribution au milieu médical
Deux réseaux de superinformatique ont uni leurs forces dans une simulation distribuée de l'efficacité des médicaments sur les souches mutantes du virus de l'immunodéficience humaine (VIH). Les infrastructures Distributed European Infrastructure for Supercomputing Application (DEISA, l'infrastructure européenne distribuée pour les applications de superinformatique) et GridAustralia-Australian Partnership for Advanced Computing (APAC, GridAustralia - le partenariat australien consacré à l'informatique avancée) utilisent toutes deux des plateformes de base incompatibles (UNICORE 5 et Globus Tool Kit respectivement). Cependant, les chercheurs ont réussi à diffuser les tâches dans deux grilles informatiques haute performance (HPC pour high performance computing). Le VIH est un virus extrêmement sujet à la mutation; c'est pourquoi il devient résistant aux médicaments qui permettent de réduire les charges virales des patients ainsi que de lier et de bloquer les enzymes virales dangereuses. Ainsi, les patients sont souvent dans l'obligation de modifier leur régime médicamenteux. Il est primordial de sélectionner le médicament approprié afin d'offrir au patient le meilleur traitement qui soit ainsi que d'empêcher le développement d'une résistance accrue au médicament. Les simulations réalisées par le DEISA et l'APAC visent à aider le processus en testant l'efficacité de médicaments antiviraux spécifiques sur un certain nombre de souches mutantes du VIH. Ces tests analysent les énergies d'interaction moyenne entre les médicaments anti-VIH et la souche de protéase VIH. Ils devraient offrir une évaluation précise de l'efficacité des médicaments. Un nombre considérable de calculs est nécessaire pour atteindre cet objectif; c'est pourquoi ce processus bénéficierait grandement de la puissance de traitement des superordinateurs. Les chercheurs sont convaincus que le temps consacré à trouver une solution pourrait être considérablement réduit grâce à l'utilisation de plusieurs superordinateurs dans une seule grille et à la répartition des tâches dans différentes grilles au même moment. Pour la première fois, l'efficacité du transfert de données bidirectionnel fiable et automatisé entre la grille européenne DEISA et la grille australienne APAC a été démontrée.