Description du projet
Les lactobacilles sont probablement bien plus que des probiotiques
Les lactobacilles font partie des bactéries lactiques, un grand groupe caractérisé par leur capacité à produire de l’acide lactique comme principal ou seul produit final du métabolisme glucidique. L’intérêt porté à ces bactéries est monté en flèche au cours de ces vingt dernières années, dû en grande partie à l’espèce de lactobacilles qui habite dans l’appareil digestif humain et qui possède des propriétés bénéfiques pour la santé. Les lactobacilles sont présents dans bien d’autres endroits, dont les plantes et les matériaux dérivés des plantes, les aliments fermentés comme le yaourt et les olives, et dans les cavités orales et le vagin des êtres humains et d’autres mammifères. Toutefois, leur rôle dans tous ces endroits reste largement inconnu. Le projet Lacto-Be, financé par l’UE, étudie ce sujet fascinant en combinant la microbiologie, l’écologie moléculaire et la génomique comparative. De nouvelles informations pourraient faciliter la sélection de souches en fonction des propriétés souhaitables pour des applications spécifiques.
Objectif
Lactobacillus bacteria have a strong, but underexplored potential as sustainable bio-based solutions for many food and health-related problems. Since Nobel-laureate Eli Metchnikoff hypothesized that lactic acid bacteria can promote human health in the gut, the research on lactobacilli and probiotics has mainly focused on the human gut and fermented dairy foods. However, a major knowledge gap exists on the beneficial potential of Lactobacillus species in other human body sites (vagina, skin, upper respiratory tract), animals (e.g. chickens, honey bees), plants, crops, and even on abiotic surfaces. In addition, lactobacilli play a key role in many plant- and vegetable-based fermentations, where they promote the shelf life and nutritional value of food and feed. Yet, why and how Lactobacillus species can be beneficial in such a wide variety of niches is currently underexplored. Therefore, the core aim of this project is a systematic and integrated analysis of the evolutionary history, ecology, and beneficial functions of Lactobacillus species. I propose an unconventional approach situated at the intersections of molecular microbiology (focusing on a single microbe), molecular ecology (focusing on microbial communities) and comparative genomics with an evolutionary perspective on niche adaptation of lactobacilli. By looking deeper into Lactobacillus biology, a paradigm shift can be made moving from a classical ad hoc base to a unique knowledge-based framework for strain selection and analysis of fitness and performance.
Champ scientifique
Mots‑clés
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
2000 Antwerpen
Belgique