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Advancing European Aquaculture by Genome Functional Annotation

Descripción del proyecto

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La clave genómica para garantizar el futuro de la acuicultura europea

La acuicultura, el proceso controlado de cría de organismos acuáticos, es el sector productor de alimentos de mayor crecimiento del mundo. Mantener la salud de los peces es fundamental para una producción eficaz, pero las enfermedades infecciosas constituyen una amenaza frecuente. El proyecto AQUA-FAANG, financiado con fondos europeos, se propone mejorar la comprensión de la función del genoma y del uso de la predicción genotipo-fenotipo en seis de las especies piscícolas más importante de la acuicultura europea. Comprender cómo funciona el genoma de estos peces puede ayudar a abordar cuestiones como las enfermedades infecciosas y, además, puede resultar en una producción acuícola rentable y sostenible. El proyecto establecerá un consorcio de expertos que crearán un centro interactivo duradero dentro de la investigación fundamental de la biología del genoma.

Objetivo

Recent developments in genomics have advanced innovation in European aquaculture. However, despite the creation of reference quality genome sequences for the main species, our understanding of genome functions remains limited. AQUA-FAANG will deliver a step improvement in understanding of genome function and exploitation of genotype-to-phenotype prediction in the six most important European farmed fish species. The project brings together world-leading interdisciplinary expertise and industry partners providing direct pathways to commercial exploitation. AQUA-FAANG will functionally annotate the genomes of all six species, employing standardized experimental assays and analysis pipelines defined by the FAANG initiative. AQUA-FAANG datasets will be shared and coordinated with other FAANG initiatives via the FAANG data coordination centre, and made available through the Ensembl genome browser. As infectious disease is of paramount concern for sustainable aquaculture, the project focuses on understanding functional genomic regions in both healthy and immune-challenged fish. This will improve knowledge of the genomic basis for disease resistance and is complemented by novel approaches to increase understanding of immune cell heterogeneity. Standardized comparative analyses will provide essential insights into genome functions that cannot be gained from study of single species. Functional assays will be used to study intermediate phenotypes and prioritise causative genetic variants in trait-associated genomic regions to accelerate selection of disease-resistant stocks. Functionally-enriched marker panels will be developed to improve accuracy of genomic selection. An active programme of stakeholder engagement and dissemination will ensure uptake of project outputs by industry, academia, the public and in policy. The outputs will enhance precision breeding, drive competitiveness within the aquaculture sector, and enhance food and nutrition security in Europe.

Ámbito científico

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Convocatoria de propuestas

H2020-SFS-2018-2020

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Convocatoria de subcontratación

H2020-SFS-2018-2

Régimen de financiación

RIA - Research and Innovation action

Coordinador

NORGES MILJO-OG BIOVITENSKAPLIGE UNIVERSITET
Aportación neta de la UEn
€ 1 810 394,75
Dirección
UNIVERSITETSTUNET 3
1433 As
Noruega

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Región
Norge Oslo og Viken Viken
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 2 106 719,75

Participantes (23)

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Última actualización: 16 Septiembre 2024

Mi folleto

Permalink: https://cordis.europa.eu/project/id/817923/es

European Union, 2024