La genómica, clave para lograr una acuicultura sostenible
La acuicultura consiste en la cría y recolección de peces, mariscos y plantas acuáticas. Es uno de los sectores alimentarios de más rápido crecimiento: solo en la Unión Europea (UE), la acuicultura mueve unos 3 900 millones de euros y da empleo a unas 57 000 personas. Mantener sanos a los peces es un elemento vital para lograr una producción rentable: una infección contagiosa puede devastar un negocio. Los productores están constantemente atentos a posibles brotes y a la forma de criar peces más resistentes. «Eso se consigue normalmente haciendo pruebas en peces con patógenos en un entorno controlado para ver qué peces son susceptibles o resistentes al desafío», explica el coordinador del proyecto AQUA-FAANG, Sigbjørn Lien, de la Universidad Noruega de Ciencias de la Vida. «Eso puede ser costoso y, obviamente, no es bueno para los peces, ya que muchos mueren».
Cría de peces resistentes a las enfermedades
El equipo del proyecto AQUA-FAANG pretendía desarrollar nuevas herramientas para ayudar a criar peces resistentes a las enfermedades de un modo más eficaz y humano. Para lograrlo, el equipo del proyecto estudió en profundidad la composición genética de seis especies de peces de gran importancia para la acuicultura europea. La idea era ampliar nuestros conocimientos sobre la base genética de la resistencia a las enfermedades y, potencialmente, generar métodos de cría más precisos para mejorar la salud de los peces sin dañarlos. «Por ejemplo, queríamos identificar las regiones reguladoras del genoma responsables de la activación y desactivación de determinados genes», explica Lien. «Por ejemplo, cuando te infectas por un virus esto puede desencadenar la activación o desactivación de algunos genes». Identificar la variación genética en esas regiones da a los criadores una ventaja a la hora de identificar los peces que tienen más o menos probabilidades de ser resistentes a las enfermedades.
Avances en el ámbito de la genómica de los peces
El equipo de AQUA-FAANG reunió a expertos del mundo académico y de la industria para producir miles de conjuntos de datos genómicos funcionales. Dichos conjuntos de datos se centraron en las seis especies de peces más importantes de la acuicultura europea: salmón atlántico, trucha arco iris, lubina, dentón común, rodaballo y carpa común. «Todos los datos producidos se han hecho públicos», añade Lien. Esos datos están disponibles en Ensembl, un navegador genómico que apoya la investigación en genómica funcional y comparativa. Lien y su equipo esperan que los datos sean utilizados por otros investigadores para avanzar en el ámbito de la genómica de peces.
Programas específicos de cría de peces
A nivel práctico, el equipo de AQUA-FAANG ha mantenido un portal de datos, que contiene todas las actividades y resultados del proyecto. El equipo del proyecto también ha desarrollado un juego de misterio, una aventura interactiva diseñada para sumergir a los jugadores en los secretos e innovaciones del proyecto AQUA-FAANG. «Nuestros recursos deberían ser especialmente útiles para las empresas de mejora genética, ayudándolas a organizar programas de mejora genética orientados a aumentar la resistencia a las enfermedades y el crecimiento», afirma Lien. «Eso podría contribuir a hacer más sostenible el sector». AQUA-FAANG fue financiado por la UE en la misma convocatoria que otros dos proyectos: BovReg, centrado en el genoma bovino, y GENE-SWitCH, centrado en los genomas reguladores de cerdos y pollos. Esos proyectos han aunado sus esfuerzos para formar EuroFAANG. El objetivo de este proyecto es estrechar las relaciones entre los proyectos europeos de investigación genómica y fomentar el intercambio de datos y herramientas.
Palabras clave
AQUA-FAANG, genómica, acuicultura, peces, enfermedades, Ensembl, EuroFAANG
