Descrizione del progetto
La genomica è la chiave per garantire il futuro dell’acquacoltura europea
L’acquacoltura, il processo controllato di allevamento di organismi acquatici, è il settore di produzione alimentare in più rapida crescita al mondo. Mantenere la buona salute dei pesci è fondamentale per una produzione efficace, ma le malattie infettive sono una minaccia costante. Il progetto AQUA-FAANG, finanziato dall’UE, si propone di migliorare la nostra comprensione della funzione del genoma e dell’uso della previsione da genotipo a fenotipo nelle sei specie ittiche più importanti dell’acquacoltura europea. Capire in che modo è controllato il genoma completo del pesce potrebbe risolvere questioni chiave quali le malattie infettive, portando conseguentemente a una produzione di acquacoltura sostenibile e redditizia. Il progetto creerà un consorzio di esperti che svilupperà un nodo interattivo di lungo termine nell’ambito della ricerca di base sulla biologia del genoma.
Obiettivo
Recent developments in genomics have advanced innovation in European aquaculture. However, despite the creation of reference quality genome sequences for the main species, our understanding of genome functions remains limited. AQUA-FAANG will deliver a step improvement in understanding of genome function and exploitation of genotype-to-phenotype prediction in the six most important European farmed fish species. The project brings together world-leading interdisciplinary expertise and industry partners providing direct pathways to commercial exploitation. AQUA-FAANG will functionally annotate the genomes of all six species, employing standardized experimental assays and analysis pipelines defined by the FAANG initiative. AQUA-FAANG datasets will be shared and coordinated with other FAANG initiatives via the FAANG data coordination centre, and made available through the Ensembl genome browser. As infectious disease is of paramount concern for sustainable aquaculture, the project focuses on understanding functional genomic regions in both healthy and immune-challenged fish. This will improve knowledge of the genomic basis for disease resistance and is complemented by novel approaches to increase understanding of immune cell heterogeneity. Standardized comparative analyses will provide essential insights into genome functions that cannot be gained from study of single species. Functional assays will be used to study intermediate phenotypes and prioritise causative genetic variants in trait-associated genomic regions to accelerate selection of disease-resistant stocks. Functionally-enriched marker panels will be developed to improve accuracy of genomic selection. An active programme of stakeholder engagement and dissemination will ensure uptake of project outputs by industry, academia, the public and in policy. The outputs will enhance precision breeding, drive competitiveness within the aquaculture sector, and enhance food and nutrition security in Europe.
Campo scientifico
Parole chiave
Programma(i)
- H2020-EU.3.2. - SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy Main Programme
- H2020-EU.3.2.1.1. - Increasing production efficiency and coping with climate change, while ensuring sustainability and resilience
- H2020-EU.3.2.3.1. - Developing sustainable and environmentally-friendly fisheries
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
RIA - Research and Innovation actionCoordinatore
1433 As
Norvegia
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Partecipanti (23)
EH8 9YL Edinburgh
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69117 Heidelberg
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6708 PB Wageningen
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75007 Paris
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2905 AT Capelle Aan Den Ijssel
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AB24 3FX Aberdeen
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35122 Padova
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19013 Attikia Anavissos
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15782 Santiago De Compostela
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00 901 Warszawa
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08007 Barcelona
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B15 2TT Birmingham
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SW7 2AZ LONDON
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KY16 9DR St Andrews
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L’organizzazione si è definita una PMI (piccola e media impresa) al momento della firma dell’accordo di sovvenzione.
7462 Trondheim
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48017 Conselice
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72015 Fasano
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27278 Lugo
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15292 A Coruna
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07007 Palma De Mallorca
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27002 Lugo
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37380 Nouzilly
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190 02 ATHINA
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