Projektbeschreibung
Genomik: Der Weg zur Sicherung der Zukunft europäischer Aquakultur
Die Aquakultur, das kontrollierte Verfahren für die Aufzucht von Wasserorganismen, ist der weltweit am schnellsten wachsende Sektor der Lebensmittelproduktion. Die Aufrechterhaltung der Fischgesundheit ist entscheidend für eine effektive Produktion, doch Infektionskrankheiten stellen eine ständige Bedrohung dar. Das EU-finanzierte Projekt AQUA-FAANG zielt darauf ab, unser Verständnis der Genomfunktion und der Anwendung der Genotyp-zu-Phänotyp-Vorhersage bei den sechs wichtigsten Fischarten in der europäischen Aquakultur zu verbessern. Wenn wir verstehen, wie das komplette Genom des Fisches gesteuert wird, können Schlüsselprobleme wie z. B. Infektionskrankheiten angegangen werden. Dies kann in der Folge zu einer nachhaltigen und profitablen Aquakulturproduktion führen. Das Projekt wird ein Konsortium von Fachleuten ins Leben rufen, um ein langfristiges interaktives Zentrum der genombiologischen Grundlagenforschung aufzubauen.
Ziel
Recent developments in genomics have advanced innovation in European aquaculture. However, despite the creation of reference quality genome sequences for the main species, our understanding of genome functions remains limited. AQUA-FAANG will deliver a step improvement in understanding of genome function and exploitation of genotype-to-phenotype prediction in the six most important European farmed fish species. The project brings together world-leading interdisciplinary expertise and industry partners providing direct pathways to commercial exploitation. AQUA-FAANG will functionally annotate the genomes of all six species, employing standardized experimental assays and analysis pipelines defined by the FAANG initiative. AQUA-FAANG datasets will be shared and coordinated with other FAANG initiatives via the FAANG data coordination centre, and made available through the Ensembl genome browser. As infectious disease is of paramount concern for sustainable aquaculture, the project focuses on understanding functional genomic regions in both healthy and immune-challenged fish. This will improve knowledge of the genomic basis for disease resistance and is complemented by novel approaches to increase understanding of immune cell heterogeneity. Standardized comparative analyses will provide essential insights into genome functions that cannot be gained from study of single species. Functional assays will be used to study intermediate phenotypes and prioritise causative genetic variants in trait-associated genomic regions to accelerate selection of disease-resistant stocks. Functionally-enriched marker panels will be developed to improve accuracy of genomic selection. An active programme of stakeholder engagement and dissemination will ensure uptake of project outputs by industry, academia, the public and in policy. The outputs will enhance precision breeding, drive competitiveness within the aquaculture sector, and enhance food and nutrition security in Europe.
Wissenschaftliches Gebiet
Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- H2020-EU.3.2. - SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy Main Programme
- H2020-EU.3.2.1.1. - Increasing production efficiency and coping with climate change, while ensuring sustainability and resilience
- H2020-EU.3.2.3.1. - Developing sustainable and environmentally-friendly fisheries
Thema/Themen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
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H2020-SFS-2018-2
Finanzierungsplan
RIA - Research and Innovation actionKoordinator
1433 As
Norwegen
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Beteiligte (23)
EH8 9YL Edinburgh
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69117 Heidelberg
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6708 PB Wageningen
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75007 Paris
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2905 AT Capelle Aan Den Ijssel
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AB24 3FX Aberdeen
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35122 Padova
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19013 Attikia Anavissos
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15782 Santiago De Compostela
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00 901 Warszawa
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08007 Barcelona
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B15 2TT Birmingham
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SW7 2AZ LONDON
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KY16 9DR St Andrews
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7462 Trondheim
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48017 Conselice
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72015 Fasano
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27278 Lugo
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15292 A Coruna
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07007 Palma De Mallorca
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27002 Lugo
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37380 Nouzilly
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190 02 ATHINA
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