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SCIENTIA-FELLOWS II: International Postdoctoral Fellowship Programme

Leistungen

3rd call: communication link to Euraxess

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1st call: communication link to Euroaxess

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2nd call: communication link to Euroaxess

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Veröffentlichungen

Colorimetric and Electrochemical Screening for Early Detection of Diabetes Mellitus and Diabetic Retinopathy—Application of Sensor Arrays and Machine Learning

Autoren: Georgina Faura; Gerard Boix-Lemonche; Anne Kristin Holmeide; Rasa Verkauskiene; Vallo Volke; Jelizaveta Sokolovska; Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Sensors, Ausgabe Vol 22, Iss 718, p 718, 2022, ISSN 1424-8220
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/s22030718

Divalent ligand-monovalent molecule binding.

Autoren: Mathijs Janssen; Harald Stenmark; Andreas Carlson
Veröffentlicht in: Soft Matter, 2021, ISSN 1744-683X
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1sm00070e

Genetic Association Between Schizophrenia and Cortical Brain Surface Area and Thickness

Autoren: Weiqiu Cheng, Oleksandr Frei, Dennis van der Meer, Yunpeng Wang, Kevin S. O’Connell, Yunhan Chu, Shahram Bahrami, Alexey A. Shadrin, Dag Alnæs, Guy F. L. Hindley, Aihua Lin, Naz Karadag, Chun-Chieh Fan, Lars T. Westlye, Tobias Kaufmann, Espen Molden, Anders M. Dale, Srdjan Djurovic, Olav B. Smeland, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: JAMA Psychiatry, Ausgabe 78/9, 2021, Seite(n) 1020, ISSN 2168-622X
Herausgeber: American Medical Association
DOI: 10.1001/jamapsychiatry.2021.1435

Intracorneal Implantation of 3D Bioprinted Scaffolds Containing Mesenchymal Stromal Cells Using Femtosecond‐Laser‐Assisted Intrastromal Keratoplasty

Autoren: Gerard Boix‐Lemonche; Richard M. Nagymihaly; Essi M. Niemi; Natasha Josifovska; Stian Johansen; Morten C. Moe; Hanne Scholz; Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Macromolecular Bioscience, 2023, ISSN 1616-5195
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/mabi.202200422

The human lens is capable of trilineage differentiation towards osteo-, chondro-, and adipogenesis—a model for studying cataract pathogenesis

Autoren: Boix-Lemonche, Gerard; Nagymihaly, Richard M.; Lumi, Xhevat; Petrovski, Goran
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1164795

Determination of CAR T cell metabolism in an optimized protocol

Autoren: Sandy Joaquina; Christopher Forcados; Benjamin Caulier; Benjamin Caulier; Benjamin Caulier; Else Marit Inderberg; Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Vol 11 (2023), Ausgabe 2, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1207576

Thermoplastic Elastomer (TPE)–Poly(Methyl Methacrylate) (PMMA) Hybrid Devices for Active Pumping PDMS-Free Organ-on-a-Chip Systems

Autoren: Mathias Busek, Steffen Nøvik, Aleksandra Aizenshtadt, Mikel Amirola-Martinez, Thomas Combriat, Stefan Grünzner, Stefan Krauss
Veröffentlicht in: Biosensors, Ausgabe 11/5, 2021, Seite(n) 162, ISSN 2079-6374
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/bios11050162

Pump-less, recirculating organ-on-a-chip (rOoC) platform

Autoren: M. Busek; A. Aizenshtadt; T. Koch; A. Frank; L. Delon; M. Amirola Martinez; A. Golovin; C. Dumas; J. Stokowiec; S. Gruenzner; E. Melum; S. Krauss
Veröffentlicht in: Lab on a Chip, 2023, ISSN 1473-0197
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2lc00919f

Evolutionary and functional history of the Escherichia coli K1 capsule

Autoren: Sergio Arredondo-Alonso, George Blundell-Hunter, Zuyi Fu, Rebecca A. Gladstone, Alfred Fillol-Salom, Jessica Loraine, Elaine Cloutman-Green, Pål J. Johnsen, Ørjan Samuelsen, Anna K. Pöntinen, François Cléon, Susana Chavez-Bueno, Miguel A. De la Cruz, Miguel A. Ares, Manivanh Vongsouvath, Agnieszka Chmielarczyk, Carolyne Horner, Nigel Klein, Alan McNally, Joice N. Reis, José R. Penadés, Nich
Veröffentlicht in: nature communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39052-w

GAK and PRKCD are positive regulators of PRKN-independent mitophagy

Autoren: Michael J. Munson, Benan J. Mathai, Matthew Yoke Wui Ng, Laura Trachsel-Moncho, Laura R. de la Ballina, Sebastian W. Schultz, Yahyah Aman, Alf H. Lystad, Sakshi Singh, Sachin Singh, Jørgen Wesche, Evandro F. Fang, Anne Simonsen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26331-7

Estimating the Logarithm of Characteristic Function and Stability Parameter for Symmetric Stable Laws

Autoren: Jüri Lember; Annika Krutto
Veröffentlicht in: Methodology and Computing in Applied Probability, 2021, ISSN 1387-5841
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11009-021-09908-z

Pharmacologic Control of CAR T Cells.

Autoren: Benjamin Caulier; Jorrit M. Enserink; Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, 2021, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22094320

Robust monolithic solvers for the Stokes-Darcy problem with the Darcy equation in primal form

Autoren: Wietse M. Boon; Timo Koch; Miroslav Kuchta; Kent-André Mardal
Veröffentlicht in: SIAM Journal on Scientific Computing, 2022, ISSN 1064-8275
Herausgeber: Society for Industrial and Applied Mathematics
DOI: 10.1137/21m1452974

Mge-cluster: a reference-free approach for typing bacterial plasmids

Autoren: Sergio Arredondo-Alonso, Rebecca A Gladstone, Anna K Pöntinen, João A Gama, Anita C Schürch, Val F Lanza, Pål Jarle Johnsen, Ørjan Samuelsen, Gerry Tonkin-Hill, Jukka Corander
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, 2023, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqad066

Recovering Escherichia coli Plasmids in the Absence of Long-Read Sequencing Data

Autoren: Julian A. Paganini, Nienke L. Plantinga, Sergio Arredondo-Alonso, Rob J. L. Willems, Anita C. Schürch
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 9/8, 2021, Seite(n) 1613, ISSN 2076-2607
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms9081613

Mixed fatty acid-phospholipid protocell networks.

Autoren: Inga Põldsalu; Elif Senem Köksal; Irep Gözen
Veröffentlicht in: Physical Chemistry Chemical Physics, 2021, ISSN 1463-9076
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cp03832j

Lithium increases mitochondrial respiration in iPSC-derived neural precursor cells from lithium responders

Autoren: Jordi Requena Osete, Ibrahim A. Akkouh, Denis Reis de Assis, Attila Szabo, Evgeniia Frei, Timothy Hughes, Olav B. Smeland, Nils Eiel Steen, Ole A. Andreassen, Srdjan Djurovic
Veröffentlicht in: Molecular Psychiatry, 2021, ISSN 1359-4184
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-021-01164-4

A (Dual) Network Model for Heat Transfer in Porous Media

Autoren: Timo Koch, Kilian Weishaupt, Johannes Müller, Bernhard Weigand, Rainer Helmig
Veröffentlicht in: Transport in Porous Media, Ausgabe 140/1, 2021, Seite(n) 107-141, ISSN 0169-3913
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11242-021-01602-5

A high-throughput multiplexing and selection strategy to complete bacterial genomes

Autoren: Alonso, Sergio Arredondo; Pöntinen, Anna K.; Cleon, Francois Pierre Alexandre; Gladstone, Rebecca Ashley; Schürch, Anita C.; Johnsen, Pål Jarle; Samuelsen, Ørjan; Corander, Jukka
Veröffentlicht in: GigaScience, 2021, ISSN 2047-217X
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gigascience/giab079

Nonlinear mixed-dimension model for embedded tubular networks with application to root water uptake

Autoren: Timo Koch; Hanchuan Wu; Martin Schneider
Veröffentlicht in: Journal of Computational Physics, 2022, ISSN 0021-9991
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jcp.2021.110823

Robust analysis of prokaryotic pangenome gene gain and loss rates with Panstripe

Autoren: Gerry Tonkin-Hill; Rebecca A Gladstone; Anna K Pöntinen; Sergio Arredondo-Alonso; Stephen D Bentley; Jukka Corander
Veröffentlicht in: Genome Research, 2023, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.277340.122

Mutational analysis and protein profiling predict drug sensitivity in multiple myeloma cell lines

Autoren: Mariaserena Giliberto; Leonardo Miranda Santana; Toril Holien; Kristine Misund; Sigve Nakken; Daniel Vodak; Eivind Hovig; Leonardo A. Meza-Zepeda; Eivind Coward; Anders Waage; Kjetil Taskén; Sigrid S. Skånland
Veröffentlicht in: Frontiers in Oncology, 2022, ISSN 2234-943X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2022.1040730

Shared genetic architecture between schizophrenia and subcortical brain volumes implicates early neurodevelopmental processes and brain development in childhood

Autoren: Cheng, Weiqiu; van der Meer, Dennis; Parker, Nadine; Hindley, Guy Frederick Lanyon; O'Connell, Kevin Sean; Wang, Yunpeng; Shadrin, Alexey; Alnæs, Dag; Bahrami, Shahram; Lin, Aihua; Karadag, Naz; Holen, Børge; Fernández-Cabello, Sara; Fan, Chun-Chieh; Dale, Anders; Djurovic, Srdjan; Westlye, Lars Tjelta; Frei, Oleksandr; Smeland, Olav Bjerkehagen; Andreassen, Ole
Veröffentlicht in: molecular psychiatry, 2022, ISSN 1359-4184
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-022-01751-z

Charting the Landscape of Genetic Overlap Between Mental Disorders and Related Traits Beyond Genetic Correlation

Autoren: Guy Hindley, Oleksandr Frei, Alexey A Shadrin, Weiqiu Cheng, Kevin S O'Connell, Romain Icick, Nadine Parker, Shahram Bahrami, Naz Karadag, Daniel Roelfs, Børge Holen, Aihua Lin, Chun C Fan, Srdjan Djurovic, Anders M Dale, Olav B Smeland, Ole A Andreassen
Veröffentlicht in: American Journal of Psychiatry, 2022, ISSN 0002-953X
Herausgeber: American Psychiatric Publishing, Inc.
DOI: 10.1176/appi.ajp.21101051

Reversible heat production during electric double layer buildup depends sensitively on the electrolyte and its reservoir

Autoren: Fabian Glatzel, Mathijs Janssen, Andreas Härtel
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, Ausgabe 154/6, 2021, Seite(n) 064901, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0037218

Bacterial Toxin-Triggered Release of Antibiotics from Capsosomes Protects a Fly Model from Lethal Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Infection

Autoren: Renée L. Tonkin, Anna Klöckner, Adrian Najer, Carolina J. Simoes da Silva, Cécile Echalier, Marc S. Dionne, Andrew M. Edwards, Molly M. Stevens
Veröffentlicht in: Advanced Healthcare Materials, 2022, ISSN 2192-2659
Herausgeber: World Scientific
DOI: 10.1002/adhm.202200036

Seizing the moment: Zebrafish epilepsy models

Autoren: Kinga Gawel, Melanie Langlois, Teresa Martins, Wietske van der Ent, Ettore Tiraboschi, Maxime Jacmin, Alexander D. Crawford, Camila V. Esguerra
Veröffentlicht in: Neuroscience & Biobehavioral Reviews, Ausgabe 116, 2020, Seite(n) 1-20, ISSN 0149-7634
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.neubiorev.2020.06.010

Retinal Pigment Epithelium Cell Development: Extrapolating Basic Biology to Stem Cell Research

Autoren: Santosh Gupta; Lyubomyr Lytvynchuk; Taras Ardan; Hana Studenovska; Georgina Faura; Lars Eide; Ljubo Znaor; Slaven Erceg; Knut Stieger; Jan Motlik; Kapil Bharti; Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Biomedicines, Vol 11, Iss 2, p 310 (2023), Ausgabe 1, 2023, ISSN 2227-9059
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biomedicines11020310

Spontaneous Formation of Prebiotic Compartment Colonies on Hadean Earth and Pre-Noachian Mars

Autoren: Köksal, Elif; Põldsalu, Inga; Friis, Henrik; Mojzsis, Stephen J; Bizzarro, Martin; Gözen, Irep
Veröffentlicht in: chemsystemschem, 2022, ISSN 2570-4206
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/syst.202200012

Quantitative analysis of neuronal mitochondrial movement reveals patterns resulting from neurotoxicity of rotenone and 6-hydroxydopamine

Autoren: Rui F. Simões; Rute Pino; Maurício Moreira-Soares; Jaromira Kovarova; Jiri Neuzil; Jiri Neuzil; Rui D. M. Travasso; Paulo J. Oliveira; Teresa Cunha-Oliveira; Francisco B. Pereira
Veröffentlicht in: The FASEB Journal, 2021, ISSN 0892-6638
Herausgeber: Federation of American Societies for Experimental Biology
DOI: 10.1096/fj.202100899r

Transmission Line Circuit and Equation for an Electrolyte-Filled Pore of Finite Length

Autoren: Mathijs Janssen
Veröffentlicht in: PHYSICAL REVIEW LETTERS, 2021, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.126.136002

Apparent nosocomial adaptation of Enterococcus faecalis predates the modern hospital era

Autoren: Anna K. Pöntinen, Janetta Top, Sergio Arredondo-Alonso, Gerry Tonkin-Hill, Ana R. Freitas, Carla Novais, Rebecca A. Gladstone, Maiju Pesonen, Rodrigo Meneses, Henri Pesonen, John A. Lees, Dorota Jamrozy, Stephen D. Bentley, Val F. Lanza, Carmen Torres, Luisa Peixe, Teresa M. Coque, Julian Parkhill, Anita C. Schürch, Rob J. L. Willems, Jukka Corander
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21749-5

Cryo-EM structure of Helicobacter pylori urease with an inhibitor in the active site at 2.0 Å resolution

Autoren: Eva S. Cunha, Xiaorui Chen, Marta Sanz-Gaitero, Deryck J. Mills, Hartmut Luecke
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20485-6

Emergence and dissemination of antimicrobial resistance in Escherichia coli causing bloodstream infections in Norway in 2002–17: a nationwide, longitudinal, microbial population genomic study

Autoren: Gladstone, Rebecca Ashley; McNally, Alan; Pöntinen, Anna Kaarina; Tonkin-Hill, Gerry; Lees, John A.; Skytén, Kusti Onni; Cléon, Francois Pierre Alexandre; Christensen, Martin Owczarek Korsner; Haldorsen, Bjørg; Bye, Kristina K.; Gammelsrud, Karianne Wiger; Hjetland, Reidar; Kümmel, Angela; Larsen, Hege; Lindemann, Paul Christoffer; Löhr, Iren Høyland; Marvik, Åshild; Nilsen, Einar; Noer, M
Veröffentlicht in: The Lancet Microbe, 2021, ISSN 2666-5247
Herausgeber: Elsevier Ltd.
DOI: 10.1016/s2666-5247(21)00031-8

Regulatory Network of PD1 Signaling Is Associated with Prognosis in Glioblastoma Multiforme

Autoren: Camila M. Lopes-Ramos; Tatiana Belova; Tess H. Brunner; Marouen Ben Guebila; Daniel Osorio; John Quackenbush; Marieke L. Kuijjer; Marieke L. Kuijjer
Veröffentlicht in: Cancer Research, 2021, ISSN 0008-5472
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-21-0730

Using iPSC Models to Understand the Role of Estrogen in Neuron-Glia Interactions in Schizophrenia and Bipolar Disorder.

Autoren: Denis Reis de Assis; Attila Szabo; Jordi Requena Osete; Francesca Puppo; Kevin S. O’Connell; Ibrahim A. Akkouh; Timothy P. Hughes; Evgeniia Frei; Ole A. Andreassen; Srdjan Djurovic
Veröffentlicht in: 10, Ausgabe 1, 2021, ISSN 2073-4409
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/cells10020209

Academic User View: Organ-on-a-Chip Technology

Autoren: Mathias Busek; Aleksandra Aizenshtadt; Mikel Amirola-Martinez; Ludivine Delon; Stefan Krauss
Veröffentlicht in: biosensors, 2022, ISSN 2079-6374
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/bios12020126

Estimates for the astrocyte endfoot sheath permeability of the extra-cellular pathway

Autoren: Timo Koch; Vegard Vinje; Kent-André Mardal
Veröffentlicht in: Fluids and Barriers of the CNS, 2023, ISSN 2045-8118
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12987-023-00421-8

Dynamic density functional theory for the charging of electric double layer capacitors

Autoren: Ma, Ke Janssen, Mathijs Adriaan Lian, Cheng Van Roij, René
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Physics, 2022, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0081827

Protocells: Milestones and Recent Advances

Autoren: Irep Gözen; Elif Senem Köksal; Inga Põldsalu; Lin Xue; Karolina Spustova; Esteban Pedrueza‐Villalmanzo; Ruslan Ryskulov; Fanda Meng; Aldo Jesorka
Veröffentlicht in: Small, 2022, ISSN 1613-6829
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/smll.202106624

fieldcompare: A Python package for regression testing simulation results

Autoren: Dennis Gläser; Timo Koch; Sören Peters; Sven Marcus; Bernd Flemisch
Veröffentlicht in: Journal of Open Source Software, 2023, ISSN 2475-9066
Herausgeber: Journal of Open Source Software
DOI: 10.21105/joss.04905

SCN1A overexpression, associated with a genomic region marked by a risk variant for a common epilepsy, raises seizure susceptibility

Autoren: Katri Silvennoinen, Kinga Gawel, Despina Tsortouktzidis, Julika Pitsch, Saud Alhusaini, Karen M. J. van Loo, Richard Picardo, Zuzanna Michalak, Susanna Pagni, Helena Martins Custodio, James Mills, Christopher D. Whelan, Greig I. de Zubicaray, Katie L. McMahon, Wietske van der Ent, Karolina J. Kirstein-Smardzewska, Ettore Tiraboschi, Jonathan M. Mudge, Adam Frankish, Maria Thom, Margaret J. Wright,
Veröffentlicht in: Acta Neuropathologica, 2022, ISSN 0001-6322
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00401-022-02429-0

Knockdown of sarcolipin (SLN) impairs substrate utilization in human skeletal muscle cells

Autoren: Abel M. Mengeste; Parmeshwar Katare; Andrea Dalmao Fernandez; Jenny Lund; Hege G. Bakke; David Baker; Stefano Bartesaghi; Xiao-Rong Peng; Arild C. Rustan; G. Hege Thoresen; Eili Tranheim Kase
Veröffentlicht in: Molecular Biology Reports, 2022, ISSN 0301-4851
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11033-022-07387-0

Design and clinical application of injectable hydrogels for musculoskeletal therapy

Autoren: Øystein Øvrebø; Giuseppe Perale; Jonathan P. Wojciechowski; Cécile Echalier; Jonathan R. T. Jeffers; Molly M. Stevens; Håvard J. Haugen; Filippo Rossi
Veröffentlicht in: Bioengineering & Translational Medicine, 2022, ISSN 2380-6761
Herausgeber: American Institute of Chemical Engineers
DOI: 10.1002/btm2.10295

The cholesterol transport protein GRAMD1C regulates autophagy initiation and mitochondrial bioenergetics

Autoren: Matthew Yoke Wui Ng, Chara Charsou, Ana Lapao, Sakshi Singh, Laura Trachsel-Moncho, Sebastian W. Schultz, Sigve Nakken, Michael J. Munson & Anne Simonsen
Veröffentlicht in: nature communications, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-3

Projection-based resolved interface 1D-3D mixed-dimension method for embedded tubular network systems

Autoren: Timo Koch
Veröffentlicht in: Computers & Mathematics with Applications, 2022, ISSN 0898-1221
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.camwa.2022.01.021

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