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CC-LEGO: robust protein blocks to build cages and layers

Veröffentlichungen

Multivalent designed proteins neutralize SARS-CoV-2 variants of concern and confer protection against infection in mice

Autoren: ANDREW C. HUNT, JAMES BRETT CASE, YOUNG-JUN PARK, LONGXING CAO, KEJIA WU, ALEXANDRA C. WALLS, ZHUOMING LIU, JOHN E. BOWEN, HSIEN-WEI YEH, SHALLY SAINI, LOUISA HELMS, YAN TING ZHAO, TIEN-YING HSIANG, TYLER N. STARR, INNA GORESHNIK, LISA KOZODOYLAUREN CARTER, RASHMI RAVICHANDRAN, LYDIA B. GREENWADIM L. MATOCHKO, CHRISTY A. THOMSONBASTIAN VÖGELI, ANTJE KRÜGER, LAURA A. VANBLARGAN, RITA E. CHEN, BAO
Veröffentlicht in: SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE, Ausgabe 19466234, 2022, ISSN 1946-6234
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/scitranslmed.abn1252

Ensuring scientific reproducibility in bio-macromolecular modeling via extensive, automated benchmarks

Autoren: Julia Koehler Leman, Sergey Lyskov, Steven M. Lewis, Jared Adolf-Bryfogle, Rebecca F. Alford, Kyle Barlow, Ziv Ben-Aharon, Daniel Farrell, Jason Fell, William A. Hansen, Ameya Harmalkar, Jeliazko Jeliazkov, Georg Kuenze, Justyna D. Krys, Ajasja Ljubetič, Amanda L. Loshbaugh, Jack Maguire, Rocco Moretti, Vikram Khipple Mulligan, Morgan L. Nance, Phuong T. Nguyen, Shane Ó Conchúir, Shourya S. Roy
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 20411723, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27222-7

Interpreting neural networks for biological sequences by learning stochastic masks

Autoren: Johannes Linder, Alyssa La Fleur, Zibo Chen, Ajasja Ljubetič, David Baker, Sreeram Kannan & Georg Seelig
Veröffentlicht in: nature machine intelligence, Ausgabe 25225839, 2021, ISSN 2522-5839
Herausgeber: Nature Group Publishing
DOI: 10.1038/s42256-021-00428-6

EMBO Beyond Biology: Connecting peptide, protein, and DNA design with systems chemistry

Autoren: DAVE, MASSARANO, KATZIR, STRMŠEK, LJUBETIČ, SEMENTA
Veröffentlicht in: Chem, Ausgabe 24519294, 2022, Seite(n) 319-324, ISSN 2451-9294
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chempr.2021.12.021

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