Comprendre l'épidémiologie de Trypanosoma cruzi
La maladie de Chagas est une infection parasitique provoquée par le protozoaire Trypanosoma cruzi. Le parasite est transmis à l'homme par l'intermédiaire d'insectes suceurs de sang et l'infection restera à vie en dépit des réactions immunitaires. T. cruzi se multiplie dans une variété de tissus provoquant un phénotype clinique relativement complexe. Un autre point remarquable est qu'il existe au moins six lignées génétiques dans la même espèce de parasite. Associée à une épidémiologie complexe, ces facteurs empêchent la prévention de la maladie. Avec l'objectif de délimiter l'épidémiologie de cette espèce génétiquement diversifiée, le projet financé par l'UE intitulé CHAGASEPINET («Comparative epidemiology of genetic lineages of Trypanosoma cruzi») a exploité des technologies à haute résolution. Pour faciliter le dépistage et l'identification rapides des lignées de T. cruzi, le consortium a développé une méthode de dosage basée sur la réaction en chaîne par polymérase suivie d'une technique de polymorphisme de longueur de fragment de restriction (RFLP). Ce test requiert l'isolation parasitaire à partir d'échantillons cliniques avant toute analyse. Pourtant, il s'agit d'une technique de test fiable, spécifique et hautement reproductible pour l'identification de lignées de parasite. D'autres techniques telles que le typage par séquençage multilocus (MLST, pour multilocus sequence typing) et le typage moléculaire par analyse des microsatellites (MLMT, pour multilocus microsatellite typing) ont été développées pour identifier des lignées de T. cruzi. L'avantage d'utiliser la MLMT est que les microsatellites évoluent rapidement et permettent de suivre les origines et l'expansion des génotypes particuliers. Ceci en fait une technique idéale pour l'analyse génétique de population à haute résolution. Malheureusement, ces méthodes de génotypage révèlent uniquement les lignées de parasite présentes dans les échantillons testés et non celles prélevées ailleurs dans l'organisme. En revanche, la méthode de sérologie par lignée permet la détection d'anticorps de sérum aux cibles peptidiques de parasites spécifiques. Une réalisation importante du projet a été la compilation d'un nombre important d'échantillons cliniques pour établir une biobanque d'ADN, de sérum et de parasite. Ces échantillons ont été comparés en utilisant des méthodologies de sérologie spécifique par lignée et par génotypage développées au cours du projet. Les partenaires européens et sud-américains ont travaillé en étroite collaboration pour délimiter l'épidémiologie moléculaire complexe de l'infection T. cruzi, plus particulièrement en Bolivie, au Brésil, en Colombie, en Équateur et au Venezuela. Les informations générées comportent un impact important socioéconomique et sociétal et devraient améliorer la sensibilisation à la maladie et la surveillance.
