Se necesitan bases de datos y criterios unificados para los modelos murinos
Las iniciativas destinadas a la recopilación de datos y la generación sistemática de ratones mutantes condicionales utiliza el sistema binario Cre-lox. Y a pesar de que varias bases de datos existentes ofrecen líneas que expresan la recombinasa Cre (líneas Cre driver), existen ciertos obstáculos para aprovechar plenamente el poder de los mutantes condicionales. El proyecto Create («Coordinación de recursos para la expresión condicional de alelos de ratón mutados») está trabajando para subsanar estas deficiencias, centrándose en la disponibilidad de líneas de ratones bien caracterizadas que expresan la recombinasa Cre siguiendo patrones específicos según el tipo de tejido, órgano o célula. Junto con un Grupo Internacional de Coordinación (ICG), el consorcio Create reúne a ocho de las principales bases de datos de ratón y grupos de investigación implicados en la mutagénesis condicional. Create tiene como objetivo ofrecer un recurso de datos sobre las líneas que expresan la recombinasa Cre (Cre driver) bien anotado e integrado y coordinar la expansión del mismo. La recopilación, integración, expansión y difusión de las bases de datos de ratón Cre driver se realizará a través de un portal web unificado accesible en todo el mundo. Ubicado en Europa, el centro de bases de datos del Laboratorio Europeo de Biología Molecular-Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI) ha desarrollado y puesto en marcha la web Create, que utiliza un sistema de gestión de datos BioMart. Además, Create organiza actividades tales como talleres específicos para desarrollar un plan de trabajo para la selección de nuevas tecnologías y métodos para mejorar la recombinación mediada por Cre in vivo, generar y analizar nuevas líneas de Cre driver, definir los criterios de caracterización e integrar la producción de líneas de Cre driver en Europa con otras empresas similares a nivel internacional. Respecto a esto último, el primer Taller anual Create y Reunión del ICG celebrado en 2009 en el Reino Unido puede considerarse un primer éxito. El tercer objetivo del proyecto consiste en resumir las necesidades de la comunidad internacional de investigación del ratón. Esto se está logrando mediante la recopilación de la información necesaria para el análisis en profundidad de la mutagénesis en diferentes tipos de células y tejidos. Por otra parte, Create está preparando la expansión de los recursos Cre driver a través de una encuesta que aportará las demandas y sugerencias de interés para las nuevas líneas de Cre. Los resultados de dicha encuesta constituirán la principal fuente para la selección de las líneas de Cre driver que se generarán en los sucesivos proyectos del Séptimo Programa Marco.
