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Coordination of resources for conditional expression of mutated mouse alleles

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Une base de données et des critères unifiés sont nécessaires pour les modèles de souris

Aujourd'hui, la souris est l'organisme modèle le plus utilisé pour étudier la maladie chez l'homme. Pour exploiter le potentiel existant en termes de bénéfices sur le long terme, il est nécessaire d'arriver à une production et une utilisation standardisée de souris mutantes.

Les initiatives visant à collecter des données et à générer de manière systématique des mutants conditionnels de souris utilisent le système binaire Cre-lox. Bien que plusieurs bases de données offrent des souches Cre existantes, il subsiste des obstacles pour exploiter pleinement le potentiel des mutants conditionnels. Le projet Create («Coordination of resources for conditional expression of mutated mouse alleles») cherche à résoudre ces problèmes en se concentrant sur la disponibilité de lignées de souris bien caractérisées qui expriment la Cre-recombinase selon des schémas spécifiques des tissus, des organes et des types de cellule. Avec un groupe de coordination international (ICG), le consortium Create réunit huit grands gestionnaires de bases de données de souris et des groupes de recherche travaillant sur la mutagenèse conditionnelle. L'objectif du projet Create est de fournir une ressource de données de souches Cre bien annotées et intégrées et de coordonner son expansion. La collecte, l'intégration, l'expansion et la dissémination des bases de données de souches de souris Cre se fera à l'aide d'un portail web unifié accessible dans le monde entier. Hébergé en Europe, le centre de base de données EMBL-EBI (European Molecular Biology Laboratory–European Bioinformatics Institute) a développé et lancé le site web Create, qui utilise un système de gestion de données BioMart. Des activités comme des ateliers ciblés sont mis en place pour développer une feuille de route pour sélectionner les technologies et les méthodes émergentes pour améliorer la recombinaison par Cre in vivo, générer et analyser de nouvelles lignées de souche Cre, définir des critères de caractérisation et intégrer la production de souches Cre en Europe avec des initiatives semblables au niveau international. Un premier succès dans ce sens a été le premier atelier annuel Create et la réunion de l'ICG qui se sont tenus en 2009 au Royaume-Uni. Le troisième objectif consiste à dégager les besoins de la communauté internationale de recherche sur les souris. Pour cela, les données nécessaires sont collectées pour une analyse en profondeur de la mutagenèse dans différents types de cellules et de tissus. D'autre part, le projet Create se prépare pour l'expansion de la ressources de souches Cre en conduisant une enquête qui fera remonter les demandes et les suggestions concernant les nouvelles lignées Cre. Les résultats de l'enquête constitueront la principale source de choix des souches Cre à générer lors des projets suivants du 7e programme-cadre.

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