"Vive la difference" nell'identità delle proteine
La malattia monogenica fibrosi cistica è normalmente caratterizzata dalla disfunzione della proteina chiave CFTR (regolatore della conduttanza transmembrana della fibrosi cistica). La variazione della gravità della malattia in diversi individui è dovuta, in larga misura, al ruolo della proteine in molte vie diverse. Pertanto, l'espressione della malattia varia in base ad altri fattori genotipici e ambientali. La complessità dell'interazione proteina-proteina presentata dalla FC la rende ideale per l'analisi con gli studi proteomici. Una conoscenza dettagliata della struttura e della funzione delle proteine coinvolte nelle cascate molecolari potrebbe portare la ricerca verso una terapia personalizzata per ogni singolo paziente. ProteoSys AG, un'azienda con sede in Germania, è esperta nella ricerca basata sulla proteomica. Come partner del progetto EUROPROCF, uno dei suoi obiettivi principali era adattare l'analisi delle proteine dalle cellule dei pazienti FC con la stessa mutazione ma con diversi fenotipi usando una versione adattata dell'analisi su gel 2D (bidimensionale) ad alte prestazioni. Il metodo ottenuto incorpora la marcatura di due o più campioni di proteine con isotopi di iodio radioattivi. Questa è stata incorporata nella piattaforma ProteoTopeTM. È stata ottenuta la visualizzazione differenziale delle proteine, incluse le loro varianti di splicing e le isoforme post-translazionali ottenute per l'analisi proteomica. Le proteine marcate in modo differenziale vengono mescolate e separate da 2D-PAGE (elettroforesi bidimensionale su gel di poliacrilamide) mentre sono insieme nel campione. Praticamente questo si ottiene nello stesso modo in cui è possibile determinare il rapporto dell'intensità del segnale radioattivo separato che arriva da ogni radioisotopo. I pattern differenziali di proteine presenti in malattie come la FC hanno un impatto sul processo di scoperta del farmaco. Inoltre, la piattaforma ProteoTopeTM si può applicare ad altre aree di interesse proteomico, inclusa la ricerca tumorale.
