Una base de datos para la genética inversa del arroz
En la UE se cultiva el 10% de los cereales de todo el mundo. Dado que dos terceras partes del suministro energético mundial proceden de alimentos básicos como los cereales, la importancia económica de estos cultivos es muy elevada. Los avances logrados en la genómica funcional han abierto la puerta a la mejora genética de los cereales. El arroz u Oryza sativa es idóneo para tal fin, dado que su genoma es pequeño (tan sólo contiene doce cromosomas), ya se ha mapeado en gran medida y es susceptible de transformación. El objetivo global del proyecto financiado con fondos comunitarios CEREALGENETAGS era aprovechar al máximo el potencial genético del arroz por medio de técnicas proteómicas y genómicas. Seguidamente se podrían modificar las relaciones entre genes y rasgos genéticos de algunos cultivos de cereales. El personal científico asociado al proyecto de Plant Research International (Países Bajos) creó una colección de variantes mutantes de arroz para elaborar una base de datos que permitiera a los usuarios identificar genes marcados. Se empleó una técnica de modificación de transposones para insertar secuencias del maíz en genotipos del arroz y, así, generar poblaciones mutantes más amplias. Después se aisló el ADN situado a los lados de estos insertos a partir de 6.000 plantas y se creó una base de datos de etiquetas de secuencias flanqueantes. De este modo se creó un recurso que cuenta con unos mil genes, muchos de los cuales rigen funciones que podrían ser de gran utilidad para el cultivo de plantas, como secuencias reguladoras de genes homeobox, MADS y de quinasa, así como otras relacionadas con la resistencia a enfermedades. Los especialistas en genética molecular y fitogenética pueden hallar líneas de inserción en genes de interés y, seguidamente, extraer toda la información relativa a estas secuencias. Se puede acceder a más detalles sobre esta técnica de genética inversa para el arroz en http://orygenesdb.cirad.fr/tools.html. En esta página web se ofrecen varias herramientas con las que el usuario puede buscar y extraer la información de tipo genético y proteómico que necesite partiendo de distintos puntos.
