Modélisation des données concernant la toxicité alimentaire pour les pesticides
La prévision des activités biomoléculaires à l'aide des bases de données et de la modélisation constitue un outil de plus en plus accepté par le public. Ces dernières permettent de prévoir les niveaux de toxicité pour des groupes de produits chimiques tels que les pesticides. L'utilisation de modèles de relation quantitative structure-activité (QSAR) signifie que la préservation de nos écosystèmes n'a plus besoin d'être en désaccord avec les intérêts économiques de l'industrie. Les modèles QSAR pourraient impliquer que les tests de biotoxicité conventionnels plus longs et plus onéreux risquent de devenir rapidement obsolètes. Le projet DEMETRA financé par l'UE s'est lancé dans le développement d'un logiciel consacré à la prévision de la toxicité chimique de quatre organismes clés de nos chaînes alimentaires. Les groupes y participant comprenaient des écotoxicologues, des représentants de l'industrie et des organismes gouvernementaux. Afin de mettre au point des modèles sur la toxicité alimentaire touchant les colins de Virginie, les partenaires du projet de l'institut Mario Negri pour la recherche pharmacologique en Italie ont compilé des données concernant un ensemble de 98 pesticides. Les deux principaux composants impliqués dans l'étude constituent une description complète des composants ainsi que des données fiables et détaillées sur la toxicité. L'Organisation de coopération et de développement économiques (OCDE) a rédigé les principes de la validation du modèle QSAR. Parmi les critères à respecter, la base de données consacrée à la toxicité devait contenir un maximum de données. Le groupe a donc sélectionné la base de données du programme sur les pesticides du bureau de l'agence pour la protection de l'environnement (EPA-OPP) pour le modèle QSAR. D'autre part, d'autres sources très fiables de données ont été utilisées à des fins de comparaison visant à ratifier les données en vue d'obtenir des informations plus précises. Les scientifiques ont mis au point une méthode permettant d'attribuer une valeur unique à chaque composé à partir de données multiples et ont imposé un filtrage strict afin de garantir un résultat aussi fiable que possible. En ce qui concerne la description des composés, l'équipe a offert trois niveaux d'information: chimique, qui implique la description moléculaire, mathématique (le descripteur moléculaire) et un ensemble de valeurs de toxicité pour les composés. Les utilisateurs potentiels compteront les propriétaires de bases de données utilisées dans le cadre du projet. Ceci indique le niveau de coopération envisagé étant donné qu'ensemble, ils pourront fusionner leurs données en tant qu'«audit externe» pour un contrôle de validité. Parmi les autres utilisateurs, citons les organismes de régulation, l'industrie, les chercheurs universitaires et le grand public. Les données sont en effet en libre accès sur le site web du projet DEMETRA à l'adresse suivante: http://www.demetra-tox.net. Ces travaux devraient constituer la base du développement de nouvelles approches au modèle QSAR.
