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System omics to unravel the gut-kidney axis in Chronic Kidney Disease.

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Publications

Microbiome in Chronic Kidney Disease (CKD): An Omics Perspective

Auteurs: Sonnal Lohia, Antonia Vlahou, Jerome Zoidakis
Publié dans: Toxins, 2022, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins14030176

Integration of Urinary Peptidome and Fecal Microbiome to Explore Patient Clustering in Chronic Kidney Disease

Auteurs: Mavrogeorgis E, Valkenburg S, Siwy J, Latosinska A, Glorieux G, Mischak H, Jankowski J
Publié dans: Proteomes, 2024, ISSN 2227-7382
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/proteomes12020011

Food-Derived Uremic Toxins in Chronic Kidney Disease

Auteurs: Mara Lauriola; Ricard Farré; Pieter Evenepoel; Saskia Adriana Overbeek; Björn Meijers
Publié dans: Toxins, 2023, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins15020116

Glycosylation Analysis of Urinary Peptidome Highlights IGF2 Glycopeptides in Association with CKD

Auteurs: Sonnal Lohia; Agnieszka Latosinska; Jerome Zoidakis; Manousos Makridakis; Harald Mischak; Griet Glorieux; Antonia Vlahou; Vera Jankowski
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, 2023, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms24065402

Gut–Kidney Axis Investigations in Animal Models of Chronic Kidney Disease

Auteurs: Piotr Bartochowski; Nathalie Gayrard; Stéphanie Bornes; Céline Druart; Angel Argilés; Magali Cordaillat-Simmons; Flore Duranton
Publié dans: Toxins, 2022, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins14090626

Alterations of the peptidomic composition of peripheral plasma after portal hypertension correction by transjugular intrahepatic portosystemic shunt

Auteurs: Giulia Ilaria Bagarolo, Shruti Bhargava, Robert Schierwagen, Wenyi Gu, Vera Jankowski, Josefin Soppert, Emona Barzakova, Federica Cascone, Olaf Tyc, Christiane Kuhl, Heidi Noels, Jonel Trebicka, Joachim Jankowski
Publié dans: npj Gut and Liver, Numéro 1, 2024, ISSN 3004-9806
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s44355-024-00001-z

Impact of Uremic Toxins on Endothelial Dysfunction in Chronic Kidney Disease: A Systematic Review

Auteurs: Harlacher, Eva, Julia Wollenhaupt, Constance C. F. M. J. Baaten, and Heidi Noels
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, 2022, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms23010531

Investigation of the human-gut-kidney axis by fecal proteomics, highlights molecular mechanisms affected in CKD

Auteurs: Lohia S, Valkenburg S, Stroggilos R, Lygirou V, Makridakis M, Zoidakis J, Verbeke F, Glorieux G, Vlahou A
Publié dans: Heliyon, 2024, ISSN 2405-8440
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e32828

Urinary peptide analysis to predict the response to blood pressure medication

Auteurs: Mayra Alejandra Jaimes Campos; Emmanouil Mavrogeorgis; Agnieszka Latosinska; Susanne Eder; Lukas Buchwinkler; Harald Mischak; Justyna Siwy; Peter Rossing; Gert Mayer; Joachim Jankowski
Publié dans: Nephrology Dialysis Transplantation, 2024, ISSN 0931-0509
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/ndt/gfad223

Probiotics for kidney disease

Auteurs: Chiara Favero, Alberto Ortiz, Maria D Sanchez-Niño
Publié dans: Clinical Kidney Journal, 2022, ISSN 2048-8505
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/ckj/sfac056

Gene Expression Monotonicity across Bladder Cancer Stages Informs on the Molecular Pathogenesis and Identifies a Prognostic Eight-Gene Signature

Auteurs: Rafael Stroggilos; Maria Frantzi; Jerome Zoidakis; Marika Mokou; Napoleon Moulavasilis; Emmanouil Mavrogeorgis; Anna Melidi; Manousos Makridakis; Konstantinos Stravodimos; Maria G. Roubelakis; Harald Mischak; Antonia Vlahou
Publié dans: Cancers, 2022, ISSN 2072-6694
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers14102542

Uremic Toxin Lanthionine Induces Endothelial Cell Mineralization In Vitro

Auteurs: Annapaola Coppola, Carmela Vigorito, Patrizia Lombari, Yuselys García Martínez, Margherita Borriello, Francesco Trepiccione, Diego Ingrosso, Alessandra F. Perna
Publié dans: Biomedicines, 2022, ISSN 2227-9059
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/biomedicines10020444

Multiple urinary peptides display distinct sex-specific distribution

Auteurs: Mina IK, Mavrogeorgis E, Siwy J, Stojanov R, Mischak H, Latosinska A, Jankowski V
Publié dans: Proteomics, 2024, ISSN 1613-6810
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/pmic.202300227

Exploratory Study Analyzing the Urinary Peptidome of T2DM Patients Suggests Changes in ECM but Also Inflammatory and Metabolic Pathways Following GLP-1R Agonist Treatment

Auteurs: Sonnal Lohia; Justyna Siwy; Emmanouil Mavrogeorgis; Susanne Eder; Stefanie Thöni; Gert Mayer; Harald Mischak; Antonia Vlahou; Vera Jankowski
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, 2023, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms241713540

The Gut Microbiota in Kidney Transplantation: A Target for Personalized Therapy?

Auteurs: García-Martínez, Yuselys; Borriello, Margherita; Capolongo, Giovanna; Ingrosso, Diego; Perna, Alessandra
Publié dans: Biology, 2023, ISSN 2079-7737
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/biology12020163

Gut-Derived Metabolites and Their Role in Immune Dysfunction in Chronic Kidney Disease.

Auteurs: Griet Glorieux; Tessa Gryp; Alessandra F. Perna
Publié dans: Toxins, Numéro 1, 2020, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins12040245

Microbial-Derived Tryptophan Catabolites, Kidney Disease and Gut Inflammation

Auteurs: Madella, Avra Melina, Jeroen Van Bergenhenegouwen, Johan Garssen, Rosalinde Masereeuw, and Saskia Adriana Overbeek
Publié dans: Toxins, 2022, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins14090645

Microphysiological Systems to Recapitulate the Gut–Kidney Axis

Auteurs: Laura Giordano, Silvia Maria Mihaila, Hossein Eslami Amirabadi, Rosalinde Masereeuw
Publié dans: Trends in Biotechnology, 2021, ISSN 0167-7799
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2020.12.001

Integrating single-cell multi-omics and prior biological knowledge for a functional characterization of the immune system

Auteurs: Schäfer, Philipp Sven Lars; Dimitrov, Daniel; Villablanca, Eduardo; Saez-Rodriguez, Julio
Publié dans: Nat Immunol, 2023, ISSN 1529-2908
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41590-024-01768-2

Postbiotics and Kidney Disease

Auteurs: Favero, Chiara; Giordano, Laura; Mihaila, Silvia Maria; Masereeuw, Rosalinde; Ortiz, Alberto; Sanchez-Niño, Maria Dolores; Afd Pharmacology; Pharmacology
Publié dans: Toxins, 2022, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins14090623

Homeostasis in the Gut Microbiota in Chronic Kidney Disease

Auteurs: Shruti Bhargava; Erik Merckelbach; Heidi Noels; Ashima Vohra; Joachim Jankowski
Publié dans: Toxins, 2022, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins14100648

Reproducibility Evaluation of Urinary Peptide Detection Using CE-MS

Auteurs: Emmanouil Mavrogeorgis; Harald Mischak; Agnieszka Latosinska; Justyna Siwy; Vera Jankowski; Joachim Jankowski
Publié dans: Molecules, Numéro 2, 2021, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules26237260

Combining LIANA and Tensor-cell2cell to decipher cell-cell communication across multiple samples

Auteurs: Hratch Baghdassarian; Daniel Dimitrov; Erick Armingol; Julio Saez-Rodriguez; Nathan E. Lewis
Publié dans: Cell Rep Methods, 2024, ISSN 2667-2375
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.crmeth.2024.100758

Comparison of methods and resources for cell-cell communication inference from single-cell RNA-Seq data

Auteurs: Daniel Dimitrov; Dénes Türei; Martin Garrido-Rodriguez; Paul L. Burmedi; James S. Nagai; Charlotte Boys; Ricardo O. Ramirez Flores; Hyojin Kim; Bence Szalai; Ivan G. Costa; Alberto Valdeolivas; Aurélien Dugourd; Julio Saez-Rodriguez
Publié dans: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30755-0

Multicellular factor analysis of single-cell data for a tissue-centric understanding of disease

Auteurs: Ricardo O. Ramirez Flores; Jan D. Lanzer; Daniel Dimitrov; Britta Velten; Julio Saez-Rodriguez
Publié dans: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.93161

Gut Microbiota and Their Derived Metabolites, a Search for Potential Targets to Limit Accumulation of Protein-Bound Uremic Toxins in Chronic Kidney Disease

Auteurs: Mieke Steenbeke, Sophie Valkenburg, Tessa Gryp, Wim Van Biesen, Joris R. Delanghe, Marijn M. Speeckaert, Griet Glorieux
Publié dans: Toxins, 2021, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins13110809

Urinary peptidomic liquid biopsy for non-invasive differential diagnosis of chronic kidney disease

Auteurs: Emmanouil Mavrogeorgis; Tianlin He; Harald Mischak; Agnieszka Latosinska; Antonia Vlahou; Joost P Schanstra; Lorenzo Catanese; Kerstin Amann; Tobias B Huber; Joachim Beige; Harald D Rupprecht; Justyna Siwy
Publié dans: Nephrology Dialysis Transplantation, 2024, ISSN 0931-0509
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/ndt/gfad200

Phosphate, Microbiota and CKD

Auteurs: Chiara Favero; Sol Carriazo; Leticia Cuarental; Raul Fernandez-Prado; Elena Gomá-Garcés; Maria Vanessa Perez-Gomez; Alberto Ortiz; Beatriz Fernandez-Fernandez; Maria Dolores Sanchez-Niño
Publié dans: Nutrients, Numéro 2, 2021, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu13041273

decoupleR: ensemble of computational methods to infer biological activities from omics data

Auteurs: Pau Badia-i-Mompel, Jesús Vélez Santiago, Jana Braunger, Celina Geiss, Daniel Dimitrov, Sophia Müller-Dott, Petr Taus, Aurelien Dugourd, Christian H Holland, Ricardo O Ramirez Flores, Julio Saez-Rodriguez
Publié dans: Bioinformatics Advances, 2022, ISSN 2635-0041
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioadv/vbac016

Blood Endotoxin Levels as Biomarker of Nonalcoholic Fatty Liver Disease: A Systematic Review and Meta-analysis

Auteurs: Josefin Soppert, Elisa Fabiana Brandt, Nicole Maria Heussen, Emona Barzakova, Lars Mathias Blank, Lars Kuepfer, Mathias Walter Hornef, Jonel Trebicka, Joachim Jankowski, Marie-Luise Berres, Heidi Noels
Publié dans: Clinical Gastroenterology and Hepatology, Numéro 21, 2023, Page(s) 2746-2758, ISSN 1542-3565
Éditeur: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1016/j.cgh.2022.11.030

How will artificial intelligence and bioinformatics change our understanding of IgA Nephropathy in the next decade

Auteurs: Roman D. Bülow; Daniel Dimitrov; Peter Boor; Julio Saez-Rodriguez
Publié dans: Seminars in Immunopathology, Numéro 1, 2021, ISSN 1863-2300
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/s00281-021-00847-y

Butyrate promotes kidney resilience through a coordinated kidney protective response in tubular cells

Auteurs: Favero C, Pintor-Chocano A, Sanz A, Ortiz A, Sanchez-Niño MD
Publié dans: Biochemical Pharmacology, 2024, ISSN 0006-2952
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bcp.2024.116203

Prognosis and Personalized In Silico Prediction of Treatment Efficacy in Cardiovascular and Chronic Kidney Disease: A Proof-of-Concept Study

Auteurs: Jaimes Campos MA, Andújar I, Keller F, Mayer G, Rossing P, Staessen JA, Delles C, Beige J, Glorieux G, Clark AL, et al.
Publié dans: Pharmaceuticals, 2023, ISSN 1424-8247
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ph16091298

Urine Peptidome Analysis Identifies Common and Stage-Specific Markers in Early Versus Advanced CKD

Auteurs: Sam Hobson; Emmanouil Mavrogeorgis; Tianlin He; Justyna Siwy; Thomas Ebert; Karolina Kublickiene; Peter Stenvinkel; Harald Mischak
Publié dans: Proteomes, 2023, ISSN 2227-7382
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/proteomes11030025

Uremic Toxins and Cardiovascular System

Auteurs: Sophie Valkenburg, Griet Glorieux, Raymond Vanholder
Publié dans: Cardiology Clinics, 2021, ISSN 0733-8651
Éditeur: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1016/j.ccl.2021.04.002

Collagen-Derived Peptides in CKD: A Link to Fibrosis

Auteurs: Emmanouil Mavrogeorgis; Harald Mischak; Agnieszka Latosinska; Antonia Vlahou; Joost P. Schanstra; Justyna Siwy; Vera Jankowski; Joachim Beige; Joachim Jankowski
Publié dans: Toxins; Volume 14; Numéro 1; Pages: 10, Numéro 2, 2021, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins14010010

What If Not All Metabolites from the Uremic Toxin Generating Pathways Are Toxic? A Hypothesis

Auteurs: Raymond Vanholder; Sanjay K. Nigam; Stéphane Burtey; Griet Glorieux
Publié dans: Toxins, 2022, ISSN 2072-6651
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/toxins14030221

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