Projektbeschreibung
Die Evolution einzelner Zellen bei der akuten lymphatischen Leukämie
Wie bei vielen Krebsarten herrscht auch bei der akuten lymphatischen Leukämie (ALL) genetische Heterogenität vor. Das könnte erklären, warum die Behandlung nicht vollumfänglich anschlägt. Das EU-finanzierte Projekt scTALLmap wird das Genom und Transkriptom einzelner Zellen von ALL-Patientinnen und -Patienten bei der Diagnosestellung, im Laufe der Behandlung und bei einem Rückfall analysieren. Aus dieser Auswertung wird ein umfassendes Bild des Verhaltens einzelner Zellen bei akuter lymphatischer Leukämie entstehen, das Erkenntnisse über die Rückfallmechanismen liefert. Anhand der zellulären Heterogenität und den bei der Diagnose vorhandenen besonders gefährlichen Subklonen soll eine Risikostratifikation der Erkrankten durchgeführt werden. Durch diese Informationen werden personalisierte Behandlungen möglich, die zielgerichtet die aggressiven leukämischen Subklone angreifen.
Ziel
Spaniards have their daily siesta, Germans like sausages and Belgians love beer. Stereotypes can certainly be misleading, just like judging a cell by its membership to a particular cell type, the so-called population-based analysis. Nowadays we know that tumors are tremendously heterogeneous and, in the era of single-cell sequencing, we have the exquisite opportunity to study each individual cell with unprecedented resolution. Acute lymphoblastic leukemia (ALL), which is the most common cancer in children, shows extensive genetic intratumoral heterogeneity. This heterogeneity might be the underlying reason for an incomplete response to treatment and for the development of relapse. In order to envision its clinical implementation, it is essential to first i) generate a single-cell map and ii) accumulate evidence on how the subclonal composition affects the response to treatment. With this aim, I will build a comprehensive single-cell overview of the composition, development and response to therapy for the aggressive subtype T-cell ALL. I will perform integrative single-cell genome and transcriptome profiling of ex vivo carefully selected pediatric samples at diagnosis, during drug treatment and in case of relapse. This approach will provide realtime temporal information about the sensitivity of each cell type to the therapy and about how relapse can develop. I will use state-of-the-art single-cell technologies to which the host institute has early access. Moreover, I will apply my previous single-cell expertise and bring a unique mix of experimental and computational skills to the lab. The results of scTALLmap, will have significant impact in leukemia by paving the way for improved risk-stratification based on the cellular heterogeneity and the presence of high-risk subclones at diagnosis. Ultimately, it will permit the design of novel and more personalized therapeutic modalities sparing toxicity and targeting the full complement of leukemia subclones.
Wissenschaftliches Gebiet
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht.
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
Thema/Themen
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordinator
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgien