Description du projet
L’évolution d’une cellule dans la leucémie aiguë lymphoblastique
Comme de nombreux types de cancer, la leucémie aiguë lymphoblastique (LAL) présente une hétérogénéité génétique, qui pourrait expliquer les réponses incomplètes au traitement. Le projet scTALLmap, financé par l’UE, analysera le génome et le transcriptome de cellules individuelles extraites d’échantillons de patients LAL lors du diagnostic, durant le traitement et en cas de rechute. Cette analyse permettra de proposer une vue d’ensemble d’une cellule de LAL et fournira des informations sur le mécanisme de la rechute. Les chercheurs utiliseront l’hétérogénéité cellulaire et la présence de sous-clones à risque élevé au stade du diagnostic pour réaliser une stratification des risques chez les patients. Enfin, ces informations ouvriront la voie à des traitements personnalisés qui cibleront particulièrement les sous-clones agressifs de la leucémie.
Objectif
Spaniards have their daily siesta, Germans like sausages and Belgians love beer. Stereotypes can certainly be misleading, just like judging a cell by its membership to a particular cell type, the so-called population-based analysis. Nowadays we know that tumors are tremendously heterogeneous and, in the era of single-cell sequencing, we have the exquisite opportunity to study each individual cell with unprecedented resolution. Acute lymphoblastic leukemia (ALL), which is the most common cancer in children, shows extensive genetic intratumoral heterogeneity. This heterogeneity might be the underlying reason for an incomplete response to treatment and for the development of relapse. In order to envision its clinical implementation, it is essential to first i) generate a single-cell map and ii) accumulate evidence on how the subclonal composition affects the response to treatment. With this aim, I will build a comprehensive single-cell overview of the composition, development and response to therapy for the aggressive subtype T-cell ALL. I will perform integrative single-cell genome and transcriptome profiling of ex vivo carefully selected pediatric samples at diagnosis, during drug treatment and in case of relapse. This approach will provide realtime temporal information about the sensitivity of each cell type to the therapy and about how relapse can develop. I will use state-of-the-art single-cell technologies to which the host institute has early access. Moreover, I will apply my previous single-cell expertise and bring a unique mix of experimental and computational skills to the lab. The results of scTALLmap, will have significant impact in leukemia by paving the way for improved risk-stratification based on the cellular heterogeneity and the presence of high-risk subclones at diagnosis. Ultimately, it will permit the design of novel and more personalized therapeutic modalities sparing toxicity and targeting the full complement of leukemia subclones.
Champ scientifique
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
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Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgique