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Risultati finali
A unified approach to modelling population structures
Completion of the research programme for Work Package 2The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into four components (labelled D2.1-D2.4 below): D2.1: Two-strategy symmetric games D2.2: Multi-strategy symmetric games D2.3: Asymmetric time constraints in symmetric games D2.4: Time constraints in complex ecosystems
4th annual workshop and annual reportThe year 4 annual workshop, associated training activities and annual report(workshop in month 43*/ report completed by month 46).
Completion of the research programme for Work Package 3The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into three components (labelled D3.1-D3.3 below): D3.1 Algorithms for the extraction of salient features in networks-of-traces, data segmentation for data reduction and visualization and alignment of epidemic traces for discovering relationships. D3.2.Analytical methods to identify unknown dependencies across the input parameters and output variables spanning the different layers of the data. D3.3. Visualization tool-enabling analysis, exploration, and visualization of large epidemic simulations
Integrated interactionsA unified approach to modelling interaction mechanisms
3rd annual workshop and annual reportThe year 3 annual workshop, associated training activities and annual report(workshop in month 31*/report completed by Month 34).
Completion of the research programme for Work Package 4The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into four components (labelled D4.1-D4.6 below): D4.1: Group effects model with optimal control extension for therapy D4.2: Model of tumour heterogeneity, diversification of cancer cells, and therapy in response to spatial heterogeneity in distance to blood vessels D4.3: Modelling multiple treatments within heterogeneous tumours D4.4: Adaptive therapy by treating communities of tumour cells D4.5: Integration with other work plan D4.6: Model validation
1st annual workshop and annual reportThe year 1 annual workshop, associated training activities and annual report (workshop in month 7*/report completed by month 10).
2nd annual workshop and annual reportThe year 2 annual workshop, associated training activities and annual report (workshop in month 19*/report completed by month 22).
Completion of the research programme for Work Package 1The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into six components (labelled D1.1-D1.6 below): D1.1: Independence properties of the framework D1.2: Classification and study of the evolutionary dynamics D1.3: Developing approximation methods for large complex structures D1.4: Incorporating strategic movements D1.5: Analysing framework applicability and robustness D1.6: Incorporating realistic models
Pubblicazioni
Autori:
D. Timothy Bishop, Mark Broom, Richard Southwell
Pubblicato in:
Dynamic Games and Applications, Numero 10/3, 2020, Pagina/e 591-617, ISSN 2153-0785
Editore:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-019-00343-x
Autori:
Tamás Varga, József Garay, Jan Rychtář, Mark Broom
Pubblicato in:
Theoretical Population Biology, Numero 134, 2020, Pagina/e 15-35, ISSN 0040-5809
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.tpb.2020.03.005
Autori:
Mark Broom, Igor V. Erovenko, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Dynamic Games and Applications, 2020, ISSN 2153-0785
Editore:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-020-00358-9
Autori:
Garay,J; Cressman,R; Xu,F; Broom,M; Csiszár,V, Móri,TF.
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, 2020, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2020.110306
Autori:
Chris Cannings, Mark Broom
Pubblicato in:
Journal of Dynamics & Games, Numero 7/1, 2020, Pagina/e 37-64, ISSN 2164-6074
Editore:
American Institute of Mathematical Sciences
DOI:
10.3934/jdg.2020003
Autori:
Křivan, Vlastimil
Pubblicato in:
Pokroky matematiky, fyziky a astronomie, Numero 62/3, 2017, Pagina/e 185-201, ISSN 0032-2423
Editore:
Jednota českých matematiků a fyziků
Autori:
Li You, Joel S. Brown, Frank Thuijsman, Jessica J. Cunningham, Robert A. Gatenby, Jingsong Zhang, Kateřina Staňková
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 435, 2017, Pagina/e 78-97, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.08.022
Autori:
Joel S Brown, Kateřina Staňková
Pubblicato in:
Current Opinion in Insect Science, Numero 21, 2017, Pagina/e 26-32, ISSN 2214-5745
Editore:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.cois.2017.05.007
Autori:
Tomás A. Revilla, Vlastimil Křivan
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 440, 2018, Pagina/e 42-57, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.12.019
Autori:
Ross Cressman, Abdel Halloway, Gordon G. McNickle, Joe Apaloo, Joel S. Brown, Thomas L. Vincent
Pubblicato in:
Theoretical Population Biology, Numero 116, 2017, Pagina/e 1-17, ISSN 0040-5809
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.tpb.2017.04.003
Autori:
Christoforos Hadjichrysanthou, Mark Broom, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Journal of Mathematical Biology, 2017, ISSN 0303-6812
Editore:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s00285-017-1177-7
Autori:
Chris Cannings, Mark Broom
Pubblicato in:
Journal of Dynamics and Games, Numero 4/4, 2017, Pagina/e 285-318, ISSN 2164-6066
Editore:
American Institute of Mathematical Sciences
DOI:
10.3934/jdg.2017016
Autori:
Robert Spencer, Mark Broom
Pubblicato in:
Behavioral Ecology, Numero 29/1, 2017, Pagina/e 60-78, ISSN 1045-2249
Editore:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/beheco/arx125
Autori:
Sicong Liu, Silvestro Poccia, K. Selçuk Candan, Gerardo Chowell, Maria Luisa Sapino
Pubblicato in:
Journal of Infectious Diseases, Numero 214/suppl 4, 2016, Pagina/e S427-S432, ISSN 0022-1899
Editore:
University of Chicago Press
DOI:
10.1093/infdis/jiw305
Autori:
Jingsong Zhang, Jessica J. Cunningham, Joel S. Brown, Robert A. Gatenby
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-017-01968-5
Autori:
Tomás A. Revilla, Vlastimil Křivan
Pubblicato in:
PLOS ONE, Numero 11/8, 2016, Pagina/e e0160076, ISSN 1932-6203
Editore:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0160076
Autori:
József Garay, Ross Cressman, Tamás F. Móri, Tamás Varga
Pubblicato in:
Journal of Mathematical Biology, 2018, ISSN 0303-6812
Editore:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s00285-018-1207-0
Autori:
Mark Broom, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Dynamic Games and Applications, Numero 27 Sep 2016, 2016, ISSN 2153-0785
Editore:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-016-0204-4
Autori:
Péter Bayer, Joel S. Brown, Kateřina Staňková
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 455, 2018, Pagina/e 191-204, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.07.014
Autori:
Jessica J. Cunningham, Joel S. Brown, Robert A. Gatenby, Kateřina Staňková
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 459, 2018, Pagina/e 67-78, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.09.022
Autori:
Karan Pattni, Mark Broom, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Discrete & Continuous Dynamical Systems - B, Numero 23/5, 2018, Pagina/e 1997-2026, ISSN 1553-524X
Editore:
American Institute of Mathematical Sciences
DOI:
10.3934/dcdsb.2018191
Autori:
Karan Pattni, Mark Broom, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 429, 2017, Pagina/e 105-115, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.06.034
Autori:
Vlastimil Křivan, Theodore E. Galanthay, Ross Cressman
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 455, 2018, Pagina/e 232-248, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.07.003
Autori:
Vlastimil Křivan, Ross Cressman
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 416, 2017, Pagina/e 199-207, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.01.010
Autori:
Jozsef Garay, Villo Csiszar, Tamas Mori
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero Volume 415, 21 February 2017, Pages 1–12, 2017, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2016.11.029
Autori:
Christopher E. Overton, Mark Broom, Christoforos Hadjichrysanthou, Kieran J. Sharkey
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 468, 2019, Pagina/e 45-59, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.02.009
Autori:
Mark Broom, Karan Pattni, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Bulletin of Mathematical Biology, 2018, ISSN 0092-8240
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1007/s11538-018-00545-1
Autori:
Pedro H. T. Schimit, Karan Pattni, Mark Broom
Pubblicato in:
Physical Review E, Numero 99/3, 2019, ISSN 2470-0045
Editore:
Physical Review
DOI:
10.1103/physreve.99.032306
Autori:
Mark Broom, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Dynamic Games and Applications, Numero 26 Dec 2016, 2016, ISSN 2153-0785
Editore:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-016-0212-4
Autori:
Joel S. Brown, Jessica J. Cunningham, Robert A. Gatenby
Pubblicato in:
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Numero 64/3, 2017, Pagina/e 512-518, ISSN 0018-9294
Editore:
Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI:
10.1109/TBME.2016.2623564
Autori:
Joel S. Brown
Pubblicato in:
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Numero 283/1838, 2016, Pagina/e 20160847, ISSN 0962-8452
Editore:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rspb.2016.0847
Autori:
Robert A. Gatenby, Jingsong Zhang, Joel S. Brown
Pubblicato in:
Cancer Research, Numero 79/13, 2019, Pagina/e 3174-3177, ISSN 0008-5472
Editore:
American Association for Cancer Research
DOI:
10.1158/0008-5472.can-19-0807
Autori:
Ross Cressman, Vlastimil Křivan
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 460, 2019, Pagina/e 262-273, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.10.033
Autori:
Li You, Maximilian Knobloch, Teresa Lopez, Vanessa Peschen, Sidney Radcliffe, Praveen Koshy Sam, Frank Thuijsman, Kateřina Staňková, Joel Brown
Pubblicato in:
Games, Numero 10/1, 2019, Pagina/e 13, ISSN 2073-4336
Editore:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/g10010013
Autori:
G. Chowell, K. Mizumoto, J. M. Banda, S. Poccia, C. Perrings
Pubblicato in:
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numero 374/1775, 2019, Pagina/e 20180272, ISSN 0962-8436
Editore:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rstb.2018.0272
Autori:
Sicong Liu, Silvestro Roberto Poccia, K. Selçuk Candan, Maria Luisa Sapino, Xiaolan Wang
Pubblicato in:
ACM Transactions on Multimedia Computing, Communications, and Applications, Numero 14/1, 2018, Pagina/e 1-24, ISSN 1551-6857
Editore:
Association for Computing Machinary, Inc.
DOI:
10.1145/3152123
Autori:
Katerina Stanková, Joel S. Brown, William S. Dalton, Robert A. Gatenby
Pubblicato in:
JAMA Oncology, Numero 5/1, 2019, Pagina/e 96, ISSN 2374-2437
Editore:
JAMA
DOI:
10.1001/jamaoncol.2018.3395
Autori:
Mark Broom, Ross Cressman, Vlastimil Křivan
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 483, 2019, Pagina/e 109993, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.109993
Autori:
Tamás Varga, Tamás F. Móri, József Garay
Pubblicato in:
Journal of Mathematical Biology, 2019, ISSN 1432-1416
Editore:
Springer
DOI:
10.1007/s00285-019-01440-6
Autori:
Igor V. Erovenko, Johann Bauer, Mark Broom, Karan Pattni, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Numero 475/2230, 2019, Pagina/e 20190399, ISSN 1364-5021
Editore:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rspa.2019.0399
Autori:
Mark Broom, Igor V. Erovenko, Jonathan T. Rowell, Jan Rychtář
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 484, 2020, Pagina/e 110002, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.110002
Autori:
Johann Bauer, Mark Broom, Eduardo Alonso
Pubblicato in:
Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Numero 475/2231, 2019, Pagina/e 20190355, ISSN 1364-5021
Editore:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rspa.2019.0355
Autori:
Vlastimil Křivan, Tomás A. Revilla
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 480, 2019, Pagina/e 112-128, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.08.003
Autori:
Giacomo Cavallo, Francesco Di Mauro, Paolo Pasteris, Maria Luisa Sapino, K. Selcuk Candan
Pubblicato in:
Journal of Intelligent Information Systems, Numero 53/3, 2019, Pagina/e 453-480, ISSN 0925-9902
Editore:
Kluwer Academic Publishers
DOI:
10.1007/s10844-019-00559-8
Autori:
Sarah R. Amend, Robert A. Gatenby, Kenneth J. Pienta, Joel S. Brown
Pubblicato in:
Current Pathobiology Reports, Numero 6/4, 2018, Pagina/e 209-218, ISSN 2167-485X
Editore:
Springer Nature
DOI:
10.1007/s40139-018-0185-7
Autori:
Robert A. Gatenby, Yael Artzy-Randrup, Tamir Epstein, Damon R. Reed, Joel S. Brown
Pubblicato in:
Cancer Research, Numero 80/3, 2020, Pagina/e 613-623, ISSN 0008-5472
Editore:
American Association for Cancer Research
DOI:
10.1158/0008-5472.can-19-1941
Autori:
Jeffrey B. West, Mina N. Dinh, Joel S. Brown, Jingsong Zhang, Alexander R. Anderson, Robert A. Gatenby
Pubblicato in:
Clinical Cancer Research, Numero 25/14, 2019, Pagina/e 4413-4421, ISSN 1078-0432
Editore:
American Association for Cancer Research
DOI:
10.1158/1078-0432.ccr-19-0006
Autori:
Ross Cressman, Miklós Koller, M. Barnabás Garay, József Garay
Pubblicato in:
Dynamic Games and Applications, 2019, ISSN 2153-0785
Editore:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-019-00324-0
Autori:
Kateřina Staňková
Pubblicato in:
Nature Ecology & Evolution, Numero 3/3, 2019, Pagina/e 336-337, ISSN 2397-334X
Editore:
Nature
DOI:
10.1038/s41559-018-0785-y
Autori:
József Garay, Villő Csiszár, Tamás F. Móri
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 430, 2017, Pagina/e 86-91, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.06.031
Autori:
Aming Li, Mark Broom, Jinming Du, Long Wang
Pubblicato in:
Physical Review E, Numero 93/2, 2016, ISSN 2470-0045
Editore:
American Physical Society
DOI:
10.1103/PhysRevE.93.022407
Autori:
Ross Cressman, Vlastimil Křivan
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 503, 2020, Pagina/e 110382, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2020.110382
Autori:
Mark Broom, Vlastimil Křivan
Pubblicato in:
Journal of Theoretical Biology, Numero 506, 2020, Pagina/e 110426, ISSN 0022-5193
Editore:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2020.110426
Autori:
Jung Hyun Kim, Mao-Lin Li, K. Selçuk Candan, Maria Luisa Sapino
Pubblicato in:
Proceedings of the 40th International ACM SIGIR Conference on Research and Development in Information Retrieval - SIGIR '17, 2017, Pagina/e 525-534, ISBN 9781-450350228
Editore:
ACM Press
DOI:
10.1145/3077136.3080794
Autori:
Silvestro Roberto Poccia, Maria Luisa Sapino, Sicong Liu, Xilun Chen, Yash Garg, Shengyu Huang, Jung Hyun Kim, Xinsheng Li, Parth Nagarkar, K. Selcuk Candan
Pubblicato in:
Proceedings of the 20th International Conference on Extending Database Technology, {EDBT} 2017, Numero yearly event, 2017, Pagina/e 582--585, ISBN 978-3-89318-073-8
Editore:
OpenProceedings.org
DOI:
10.5441/002/edbt.2017.75
Autori:
Xinsheng Li, K. Selçuk Candan, Maria Luisa Sapino
Pubblicato in:
Proceedings of the 26th International Conference on World Wide Web - WWW '17, Numero yearly publication, 2017, Pagina/e 243-252, ISBN 9781-450349130
Editore:
ACM Press
DOI:
10.1145/3038912.3052641
Autori:
Yash Garg, Silvestro Roberto Poccia
Pubblicato in:
Proceedings of the 2017 ACM on International Conference on Multimedia Retrieval - ICMR '17, 2017, Pagina/e 489-493, ISBN 9781-450347013
Editore:
ACM Press
DOI:
10.1145/3078971.3079009
Autori:
F. J. Muros, J. M. Maestre, L. You, K. Stankova
Pubblicato in:
2017 IEEE 56th Annual Conference on Decision and Control (CDC), 2017, Pagina/e 5539-5544, ISBN 978-1-5090-2873-3
Editore:
IEEE
DOI:
10.1109/CDC.2017.8264481
Autori:
Ruocheng Guo, Paulo Shakarian
Pubblicato in:
2016 IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Networks Analysis and Mining (ASONAM), Numero 18 Aug 2016, 2016, Pagina/e 591-598, ISBN 978-1-5090-2846-7
Editore:
IEEE
DOI:
10.1109/ASONAM.2016.7752296
Autori:
Nikhil Kumar, Ruocheng Guo, Ashkan Aleali, Paulo Shakarian
Pubblicato in:
2016 IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Networks Analysis and Mining (ASONAM), Numero 18 Aug 2016, 2016, Pagina/e 1329-1336, ISBN 978-1-5090-2846-7
Editore:
IEEE
DOI:
10.1109/ASONAM.2016.7752408
Autori:
Rosaria Rossini, Silvestro Poccia, K. Selcuk Candan, Maria Luisa Sapino
Pubblicato in:
Proceedings of the 11th International Conference on Management of Digital EcoSystems, 2019, Pagina/e 36-43, ISBN 9781-450362382
Editore:
ACM
DOI:
10.1145/3297662.3365830
Autori:
Xilun Chen,
K. Selcuk Candan,
Maria Luisa Sapino
Pubblicato in:
Proceedings of the Thirty-Second {AAAI} Conference on Artificial Intelligence, 2018, Pagina/e 5078--5085
Editore:
AAAI.org
Autori:
Xinsheng Li,
Kasim Selcuk Candan,
Maria Luisa Sapino
Pubblicato in:
34th {IEEE} International Conference on Data Engineering, {ICDE} 2018, 2018, Pagina/e 1144-1155
Editore:
IEEE
Autori:
Ross Cressman, Joe Apaloo
Pubblicato in:
Handbook of Dynamic Game Theory, 2016, Pagina/e 1-50, ISBN 978-3-319-27335-8
Editore:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-319-27335-8_6-1
Autori:
Mark Broom, Vlastimil Křivan
Pubblicato in:
Handbook of Dynamic Game Theory, 2016, Pagina/e 1-39, ISBN 978-3-319-27335-8
Editore:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-319-27335-8_31-1
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