Leistungen
A unified approach to modelling population structures
Completion of the research programme for Work Package 2The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into four components (labelled D2.1-D2.4 below): D2.1: Two-strategy symmetric games D2.2: Multi-strategy symmetric games D2.3: Asymmetric time constraints in symmetric games D2.4: Time constraints in complex ecosystems
4th annual workshop and annual reportThe year 4 annual workshop, associated training activities and annual report(workshop in month 43*/ report completed by month 46).
Completion of the research programme for Work Package 3The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into three components (labelled D3.1-D3.3 below): D3.1 Algorithms for the extraction of salient features in networks-of-traces, data segmentation for data reduction and visualization and alignment of epidemic traces for discovering relationships. D3.2.Analytical methods to identify unknown dependencies across the input parameters and output variables spanning the different layers of the data. D3.3. Visualization tool-enabling analysis, exploration, and visualization of large epidemic simulations
Integrated interactionsA unified approach to modelling interaction mechanisms
3rd annual workshop and annual reportThe year 3 annual workshop, associated training activities and annual report(workshop in month 31*/report completed by Month 34).
Completion of the research programme for Work Package 4The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into four components (labelled D4.1-D4.6 below): D4.1: Group effects model with optimal control extension for therapy D4.2: Model of tumour heterogeneity, diversification of cancer cells, and therapy in response to spatial heterogeneity in distance to blood vessels D4.3: Modelling multiple treatments within heterogeneous tumours D4.4: Adaptive therapy by treating communities of tumour cells D4.5: Integration with other work plan D4.6: Model validation
1st annual workshop and annual reportThe year 1 annual workshop, associated training activities and annual report (workshop in month 7*/report completed by month 10).
2nd annual workshop and annual reportThe year 2 annual workshop, associated training activities and annual report (workshop in month 19*/report completed by month 22).
Completion of the research programme for Work Package 1The research in this work package will lead to one deliverable, which we break down into six components (labelled D1.1-D1.6 below): D1.1: Independence properties of the framework D1.2: Classification and study of the evolutionary dynamics D1.3: Developing approximation methods for large complex structures D1.4: Incorporating strategic movements D1.5: Analysing framework applicability and robustness D1.6: Incorporating realistic models
Veröffentlichungen
Autoren:
D. Timothy Bishop, Mark Broom, Richard Southwell
Veröffentlicht in:
Dynamic Games and Applications, Ausgabe 10/3, 2020, Seite(n) 591-617, ISSN 2153-0785
Herausgeber:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-019-00343-x
Autoren:
Tamás Varga, József Garay, Jan Rychtář, Mark Broom
Veröffentlicht in:
Theoretical Population Biology, Ausgabe 134, 2020, Seite(n) 15-35, ISSN 0040-5809
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.tpb.2020.03.005
Autoren:
Mark Broom, Igor V. Erovenko, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Dynamic Games and Applications, 2020, ISSN 2153-0785
Herausgeber:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-020-00358-9
Autoren:
Garay,J; Cressman,R; Xu,F; Broom,M; Csiszár,V, Móri,TF.
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, 2020, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2020.110306
Autoren:
Chris Cannings, Mark Broom
Veröffentlicht in:
Journal of Dynamics & Games, Ausgabe 7/1, 2020, Seite(n) 37-64, ISSN 2164-6074
Herausgeber:
American Institute of Mathematical Sciences
DOI:
10.3934/jdg.2020003
Autoren:
Křivan, Vlastimil
Veröffentlicht in:
Pokroky matematiky, fyziky a astronomie, Ausgabe 62/3, 2017, Seite(n) 185-201, ISSN 0032-2423
Herausgeber:
Jednota českých matematiků a fyziků
Autoren:
Li You, Joel S. Brown, Frank Thuijsman, Jessica J. Cunningham, Robert A. Gatenby, Jingsong Zhang, Kateřina Staňková
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 435, 2017, Seite(n) 78-97, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.08.022
Autoren:
Joel S Brown, Kateřina Staňková
Veröffentlicht in:
Current Opinion in Insect Science, Ausgabe 21, 2017, Seite(n) 26-32, ISSN 2214-5745
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.cois.2017.05.007
Autoren:
Tomás A. Revilla, Vlastimil Křivan
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 440, 2018, Seite(n) 42-57, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.12.019
Autoren:
Ross Cressman, Abdel Halloway, Gordon G. McNickle, Joe Apaloo, Joel S. Brown, Thomas L. Vincent
Veröffentlicht in:
Theoretical Population Biology, Ausgabe 116, 2017, Seite(n) 1-17, ISSN 0040-5809
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.tpb.2017.04.003
Autoren:
Christoforos Hadjichrysanthou, Mark Broom, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Journal of Mathematical Biology, 2017, ISSN 0303-6812
Herausgeber:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s00285-017-1177-7
Autoren:
Chris Cannings, Mark Broom
Veröffentlicht in:
Journal of Dynamics and Games, Ausgabe 4/4, 2017, Seite(n) 285-318, ISSN 2164-6066
Herausgeber:
American Institute of Mathematical Sciences
DOI:
10.3934/jdg.2017016
Autoren:
Robert Spencer, Mark Broom
Veröffentlicht in:
Behavioral Ecology, Ausgabe 29/1, 2017, Seite(n) 60-78, ISSN 1045-2249
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/beheco/arx125
Autoren:
Sicong Liu, Silvestro Poccia, K. Selçuk Candan, Gerardo Chowell, Maria Luisa Sapino
Veröffentlicht in:
Journal of Infectious Diseases, Ausgabe 214/suppl 4, 2016, Seite(n) S427-S432, ISSN 0022-1899
Herausgeber:
University of Chicago Press
DOI:
10.1093/infdis/jiw305
Autoren:
Jingsong Zhang, Jessica J. Cunningham, Joel S. Brown, Robert A. Gatenby
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-017-01968-5
Autoren:
Tomás A. Revilla, Vlastimil Křivan
Veröffentlicht in:
PLOS ONE, Ausgabe 11/8, 2016, Seite(n) e0160076, ISSN 1932-6203
Herausgeber:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0160076
Autoren:
József Garay, Ross Cressman, Tamás F. Móri, Tamás Varga
Veröffentlicht in:
Journal of Mathematical Biology, 2018, ISSN 0303-6812
Herausgeber:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s00285-018-1207-0
Autoren:
Mark Broom, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Dynamic Games and Applications, Ausgabe 27 Sep 2016, 2016, ISSN 2153-0785
Herausgeber:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-016-0204-4
Autoren:
Péter Bayer, Joel S. Brown, Kateřina Staňková
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 455, 2018, Seite(n) 191-204, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.07.014
Autoren:
Jessica J. Cunningham, Joel S. Brown, Robert A. Gatenby, Kateřina Staňková
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 459, 2018, Seite(n) 67-78, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.09.022
Autoren:
Karan Pattni, Mark Broom, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Discrete & Continuous Dynamical Systems - B, Ausgabe 23/5, 2018, Seite(n) 1997-2026, ISSN 1553-524X
Herausgeber:
American Institute of Mathematical Sciences
DOI:
10.3934/dcdsb.2018191
Autoren:
Karan Pattni, Mark Broom, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 429, 2017, Seite(n) 105-115, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.06.034
Autoren:
Vlastimil Křivan, Theodore E. Galanthay, Ross Cressman
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 455, 2018, Seite(n) 232-248, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.07.003
Autoren:
Vlastimil Křivan, Ross Cressman
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 416, 2017, Seite(n) 199-207, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.01.010
Autoren:
Jozsef Garay, Villo Csiszar, Tamas Mori
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe Volume 415, 21 February 2017, Pages 1–12, 2017, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2016.11.029
Autoren:
Christopher E. Overton, Mark Broom, Christoforos Hadjichrysanthou, Kieran J. Sharkey
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 468, 2019, Seite(n) 45-59, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.02.009
Autoren:
Mark Broom, Karan Pattni, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Bulletin of Mathematical Biology, 2018, ISSN 0092-8240
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1007/s11538-018-00545-1
Autoren:
Pedro H. T. Schimit, Karan Pattni, Mark Broom
Veröffentlicht in:
Physical Review E, Ausgabe 99/3, 2019, ISSN 2470-0045
Herausgeber:
Physical Review
DOI:
10.1103/physreve.99.032306
Autoren:
Mark Broom, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Dynamic Games and Applications, Ausgabe 26 Dec 2016, 2016, ISSN 2153-0785
Herausgeber:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-016-0212-4
Autoren:
Joel S. Brown, Jessica J. Cunningham, Robert A. Gatenby
Veröffentlicht in:
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Ausgabe 64/3, 2017, Seite(n) 512-518, ISSN 0018-9294
Herausgeber:
Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI:
10.1109/TBME.2016.2623564
Autoren:
Joel S. Brown
Veröffentlicht in:
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Ausgabe 283/1838, 2016, Seite(n) 20160847, ISSN 0962-8452
Herausgeber:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rspb.2016.0847
Autoren:
Robert A. Gatenby, Jingsong Zhang, Joel S. Brown
Veröffentlicht in:
Cancer Research, Ausgabe 79/13, 2019, Seite(n) 3174-3177, ISSN 0008-5472
Herausgeber:
American Association for Cancer Research
DOI:
10.1158/0008-5472.can-19-0807
Autoren:
Ross Cressman, Vlastimil Křivan
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 460, 2019, Seite(n) 262-273, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2018.10.033
Autoren:
Li You, Maximilian Knobloch, Teresa Lopez, Vanessa Peschen, Sidney Radcliffe, Praveen Koshy Sam, Frank Thuijsman, Kateřina Staňková, Joel Brown
Veröffentlicht in:
Games, Ausgabe 10/1, 2019, Seite(n) 13, ISSN 2073-4336
Herausgeber:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/g10010013
Autoren:
G. Chowell, K. Mizumoto, J. M. Banda, S. Poccia, C. Perrings
Veröffentlicht in:
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Ausgabe 374/1775, 2019, Seite(n) 20180272, ISSN 0962-8436
Herausgeber:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rstb.2018.0272
Autoren:
Sicong Liu, Silvestro Roberto Poccia, K. Selçuk Candan, Maria Luisa Sapino, Xiaolan Wang
Veröffentlicht in:
ACM Transactions on Multimedia Computing, Communications, and Applications, Ausgabe 14/1, 2018, Seite(n) 1-24, ISSN 1551-6857
Herausgeber:
Association for Computing Machinary, Inc.
DOI:
10.1145/3152123
Autoren:
Katerina Stanková, Joel S. Brown, William S. Dalton, Robert A. Gatenby
Veröffentlicht in:
JAMA Oncology, Ausgabe 5/1, 2019, Seite(n) 96, ISSN 2374-2437
Herausgeber:
JAMA
DOI:
10.1001/jamaoncol.2018.3395
Autoren:
Mark Broom, Ross Cressman, Vlastimil Křivan
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 483, 2019, Seite(n) 109993, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.109993
Autoren:
Tamás Varga, Tamás F. Móri, József Garay
Veröffentlicht in:
Journal of Mathematical Biology, 2019, ISSN 1432-1416
Herausgeber:
Springer
DOI:
10.1007/s00285-019-01440-6
Autoren:
Igor V. Erovenko, Johann Bauer, Mark Broom, Karan Pattni, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Ausgabe 475/2230, 2019, Seite(n) 20190399, ISSN 1364-5021
Herausgeber:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rspa.2019.0399
Autoren:
Mark Broom, Igor V. Erovenko, Jonathan T. Rowell, Jan Rychtář
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 484, 2020, Seite(n) 110002, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.110002
Autoren:
Johann Bauer, Mark Broom, Eduardo Alonso
Veröffentlicht in:
Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Ausgabe 475/2231, 2019, Seite(n) 20190355, ISSN 1364-5021
Herausgeber:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rspa.2019.0355
Autoren:
Vlastimil Křivan, Tomás A. Revilla
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 480, 2019, Seite(n) 112-128, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2019.08.003
Autoren:
Giacomo Cavallo, Francesco Di Mauro, Paolo Pasteris, Maria Luisa Sapino, K. Selcuk Candan
Veröffentlicht in:
Journal of Intelligent Information Systems, Ausgabe 53/3, 2019, Seite(n) 453-480, ISSN 0925-9902
Herausgeber:
Kluwer Academic Publishers
DOI:
10.1007/s10844-019-00559-8
Autoren:
Sarah R. Amend, Robert A. Gatenby, Kenneth J. Pienta, Joel S. Brown
Veröffentlicht in:
Current Pathobiology Reports, Ausgabe 6/4, 2018, Seite(n) 209-218, ISSN 2167-485X
Herausgeber:
Springer Nature
DOI:
10.1007/s40139-018-0185-7
Autoren:
Robert A. Gatenby, Yael Artzy-Randrup, Tamir Epstein, Damon R. Reed, Joel S. Brown
Veröffentlicht in:
Cancer Research, Ausgabe 80/3, 2020, Seite(n) 613-623, ISSN 0008-5472
Herausgeber:
American Association for Cancer Research
DOI:
10.1158/0008-5472.can-19-1941
Autoren:
Jeffrey B. West, Mina N. Dinh, Joel S. Brown, Jingsong Zhang, Alexander R. Anderson, Robert A. Gatenby
Veröffentlicht in:
Clinical Cancer Research, Ausgabe 25/14, 2019, Seite(n) 4413-4421, ISSN 1078-0432
Herausgeber:
American Association for Cancer Research
DOI:
10.1158/1078-0432.ccr-19-0006
Autoren:
Ross Cressman, Miklós Koller, M. Barnabás Garay, József Garay
Veröffentlicht in:
Dynamic Games and Applications, 2019, ISSN 2153-0785
Herausgeber:
Springer Science + Business Media
DOI:
10.1007/s13235-019-00324-0
Autoren:
Kateřina Staňková
Veröffentlicht in:
Nature Ecology & Evolution, Ausgabe 3/3, 2019, Seite(n) 336-337, ISSN 2397-334X
Herausgeber:
Nature
DOI:
10.1038/s41559-018-0785-y
Autoren:
József Garay, Villő Csiszár, Tamás F. Móri
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 430, 2017, Seite(n) 86-91, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2017.06.031
Autoren:
Aming Li, Mark Broom, Jinming Du, Long Wang
Veröffentlicht in:
Physical Review E, Ausgabe 93/2, 2016, ISSN 2470-0045
Herausgeber:
American Physical Society
DOI:
10.1103/PhysRevE.93.022407
Autoren:
Ross Cressman, Vlastimil Křivan
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 503, 2020, Seite(n) 110382, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2020.110382
Autoren:
Mark Broom, Vlastimil Křivan
Veröffentlicht in:
Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 506, 2020, Seite(n) 110426, ISSN 0022-5193
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jtbi.2020.110426
Autoren:
Jung Hyun Kim, Mao-Lin Li, K. Selçuk Candan, Maria Luisa Sapino
Veröffentlicht in:
Proceedings of the 40th International ACM SIGIR Conference on Research and Development in Information Retrieval - SIGIR '17, 2017, Seite(n) 525-534, ISBN 9781-450350228
Herausgeber:
ACM Press
DOI:
10.1145/3077136.3080794
Autoren:
Silvestro Roberto Poccia, Maria Luisa Sapino, Sicong Liu, Xilun Chen, Yash Garg, Shengyu Huang, Jung Hyun Kim, Xinsheng Li, Parth Nagarkar, K. Selcuk Candan
Veröffentlicht in:
Proceedings of the 20th International Conference on Extending Database Technology, {EDBT} 2017, Ausgabe yearly event, 2017, Seite(n) 582--585, ISBN 978-3-89318-073-8
Herausgeber:
OpenProceedings.org
DOI:
10.5441/002/edbt.2017.75
Autoren:
Xinsheng Li, K. Selçuk Candan, Maria Luisa Sapino
Veröffentlicht in:
Proceedings of the 26th International Conference on World Wide Web - WWW '17, Ausgabe yearly publication, 2017, Seite(n) 243-252, ISBN 9781-450349130
Herausgeber:
ACM Press
DOI:
10.1145/3038912.3052641
Autoren:
Yash Garg, Silvestro Roberto Poccia
Veröffentlicht in:
Proceedings of the 2017 ACM on International Conference on Multimedia Retrieval - ICMR '17, 2017, Seite(n) 489-493, ISBN 9781-450347013
Herausgeber:
ACM Press
DOI:
10.1145/3078971.3079009
Autoren:
F. J. Muros, J. M. Maestre, L. You, K. Stankova
Veröffentlicht in:
2017 IEEE 56th Annual Conference on Decision and Control (CDC), 2017, Seite(n) 5539-5544, ISBN 978-1-5090-2873-3
Herausgeber:
IEEE
DOI:
10.1109/CDC.2017.8264481
Autoren:
Ruocheng Guo, Paulo Shakarian
Veröffentlicht in:
2016 IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Networks Analysis and Mining (ASONAM), Ausgabe 18 Aug 2016, 2016, Seite(n) 591-598, ISBN 978-1-5090-2846-7
Herausgeber:
IEEE
DOI:
10.1109/ASONAM.2016.7752296
Autoren:
Nikhil Kumar, Ruocheng Guo, Ashkan Aleali, Paulo Shakarian
Veröffentlicht in:
2016 IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Networks Analysis and Mining (ASONAM), Ausgabe 18 Aug 2016, 2016, Seite(n) 1329-1336, ISBN 978-1-5090-2846-7
Herausgeber:
IEEE
DOI:
10.1109/ASONAM.2016.7752408
Autoren:
Rosaria Rossini, Silvestro Poccia, K. Selcuk Candan, Maria Luisa Sapino
Veröffentlicht in:
Proceedings of the 11th International Conference on Management of Digital EcoSystems, 2019, Seite(n) 36-43, ISBN 9781-450362382
Herausgeber:
ACM
DOI:
10.1145/3297662.3365830
Autoren:
Xilun Chen,
K. Selcuk Candan,
Maria Luisa Sapino
Veröffentlicht in:
Proceedings of the Thirty-Second {AAAI} Conference on Artificial Intelligence, 2018, Seite(n) 5078--5085
Herausgeber:
AAAI.org
Autoren:
Xinsheng Li,
Kasim Selcuk Candan,
Maria Luisa Sapino
Veröffentlicht in:
34th {IEEE} International Conference on Data Engineering, {ICDE} 2018, 2018, Seite(n) 1144-1155
Herausgeber:
IEEE
Autoren:
Ross Cressman, Joe Apaloo
Veröffentlicht in:
Handbook of Dynamic Game Theory, 2016, Seite(n) 1-50, ISBN 978-3-319-27335-8
Herausgeber:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-319-27335-8_6-1
Autoren:
Mark Broom, Vlastimil Křivan
Veröffentlicht in:
Handbook of Dynamic Game Theory, 2016, Seite(n) 1-39, ISBN 978-3-319-27335-8
Herausgeber:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-319-27335-8_31-1
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