Une base de données en ligne de toxicologie
Aujourd'hui encore, la plupart des tests de toxicologie se font sur des animaux. Le projet programme FP7-HEALTH SEURAT-1 a été conçu pour soutenir la mise au point d'autres méthodes d'évaluation de la sûreté pour l'homme. Ces méthodes devaient être hautement prédictives et moins coûteuses que les tests de toxicité sur l'animal, et donc représenter de bonnes solutions de remplacement. Le projet TOXBANK (ToxBank – Supporting integrated data analysis and servicing of alternative testing methods in toxicology), financé par l'UE, a apporté l'infrastructure appropriée. Ses membres ont mis en place un ensemble centralisé et standardisé de ressources de données, de composés et de prélèvements biologiques, accompagné des procédures et des directives opérationnelles standardisées. Le projet a mis en place une base de données ToxBank accessible par le Web pour gérer et modéliser les données de toxicité. Elle donne accès à toutes les données (expérimentales et traitées), aux protocoles et aux informations publiques pertinentes. Récemment, elle a été enrichie des investigations. TOXBANK inclut également une base de données des composés et un référentiel de certains composés de test. La base de données a été réalisée en collaboration avec MediaWiki. Les critères de sélection et les procédures opérationnelles standard pour l'analyse et le contrôle de la qualité des données sont disponibles en ligne. La base de données comprend 51 composés avec leur identité chimique, les effets secondaires, les mécanismes de toxicité et les cibles thérapeutiques. Les données viennent d'études de la littérature, et de méta-analyses enrichies de nombreuses données d'omique et fonctionnelles. Le cadre TOXBANK a aussi été enrichi d'une section sur les biomatériaux, qui constitue une référence des cellules, lignées cellulaires et tissus utilisés pour les études in vitro sur la toxicité systémique. Il intègre aussi des informations sur les réactifs et les fournisseurs, et un inventaire des biobanques et des référentiels européens. L'infrastructure TOXBANK soutiendra la conception et le développement de tests de toxicologie fiables, in vitro, pour évaluer la sûreté des produits après la fin du projet.
Mots‑clés
Toxicologie, base de données en ligne, expérimentation sur l'animal, évaluation de la sécurité, TOXBANK