Internetowa baza danych toksykologicznych
Obecnie większość badań toksykologicznych stosowanych w ocenie bezpieczeństwa oparta jest na testach na zwierzętach. Program FP7-HEALTH SEURAT-1 wspiera tworzenie alternatywnych strategii oceny bezpieczeństwa. Powinny one umożliwić dokładniejsze przewidywanie toksyczności przy niższych kosztach w porównaniu z tradycyjnymi testami na zwierzętach, dzięki czemu będą atrakcyjnym alternatywnym rozwiązaniem. Finansowany ze środków UE projekt TOXBANK (ToxBank – Supporting integrated data analysis and servicing of alternative testing methods in toxicology) pomógł w osiągnięciu tego celu poprzez stworzenie odpowiedniej infrastruktury. Uczestnicy projektu stworzyli centralny i standardowy zbiór zasobów danych, związków i próbek biologicznych, których uzupełnieniem będą standardowe procedury i wytyczne. Opracowano też specjalny internetowy magazyn danych ToxBank do zarządzania danymi na temat toksyczności i modelowania. Baza umożliwia swobodny dostęp do wszystkich przetworzonych danych i protokołów eksperymentalnych, a także informacji publicznych. Ostatnio do repozytorium wprowadzono także dane dotyczące badań. TOXBANK obejmuje także bazę danych na temat związków chemicznych oraz repozytorium wybranych związków testowych. Baza tworzona jest we współpracy z platformą MediaWiki, a kryteria selekcji oraz standardowe procedury operacyjne można znaleźć w Internecie. Do bazy wprowadzono informacje dotyczące zbioru 51 związków oraz ich składu chemicznego, działań niepożądanych, mechanizmów toksyczności i celów terapeutycznych. Dane te uzyskano podczas przeglądu piśmiennictwa oraz rozszerzonej metaanalizy wielu różnych danych omicznych i funkcjonalnych. System TOXBANK wzbogacono o sekcję biomateriałów, stanowiącą wzorcowe repozytorium odpowiednich komórek, linii komórkowych i tkanek do prowadzenia badań in vitro toksyczności ogólnoustrojowej. Ponadto baza obejmuje informacje o odczynnikach i dostawcach oraz wykaz istniejących europejskich biobanków i repozytoriów. Cała infrastruktura TOXBANK pomoże w projektowaniu i opracowywaniu dokładnych testów toksykologicznych in vitro na potrzeby oceny bezpieczeństwa, do wykorzystania także po zakończeniu realizacji projektu.
Słowa kluczowe
Toksykologia, internetowa baza danych, eksperymenty na zwierzętach, ocena bezpieczeństwa, TOXBANK