La stratégie d'invasion des bactéries
Les molécules responsables sont les adhésines. Les recherches ont récemment révélé une nouvelle famille, les adhésines autotransporteurs trimériques (TAA, de l'anglais trimeric autotransporter adhesins) dans les bactéries à gram négatif. Ce groupe de bactéries inclut de nombreux pathogènes, dont Escherichia coli et d'autres microbes intestinaux. L'organisation moléculaire des TAA suit des règles étonnement simples et basiques. Ils ont une tête et une tige faites de bases pouvant se répéter et varier, et qui ont évolué de manière à probablement conférer à l'hôte un mouvement spécifique. L'objectif du projet Trimbat («Trimeric Bacterial Autotransporters») est d'étudier la structure et la biochimie de la famille des TAA. La formation d'une plateforme d'atterrissage et d'accroche est essentielle à l'invasion, aussi est-il indispensable de connaître leur structure d'initiation et de construction pour le développement de médicaments et de vaccins afin de contenir l'infection. L'équipe de Trimbat a tout d'abord sélectionné une base contenant la protéine YadA et quatre longueurs de tiges. Afin de correspondre à la nature modulaire de la plateforme d'invasion, ils ont ensuite choisi une variété de têtes, dont celles que l'on surnomme la Cherry-tag et la protéine de liaison du maltose. Les chercheurs sont parvenus à concevoir et à exprimer les TAA hybrides pour des études in vivo du mécanisme et des structures impliquées. En manipulant la MBP, le taux de pliage de la protéine a été réduit, rendant la tête de YadA plus grande que la normale dans l'espace extracellulaire de la bactérie, ce qui a facilité l'étude de la structure. Une fois la structure des TAA totalement comprise, la prochaine étape consistera à concevoir des médicaments et des vaccins qui possèdent la configuration nécessaire pour prévenir l'adhésion à l'hôte et ainsi bloquer les premières étapes de colonisation. L'alternative consistera à utiliser des super-adhésifs le cas échéant, notamment pour accrocher les bactéries bénéfiques.
