Approccio software per la comprensione della MAPK
Finanziato dalla CE, il progetto MAPK SIGNALLING si proponeva di chiarire l'organizzazione spazio-temporale della via e il modo in cui tale organizzazione incide sulla funzione. In altre parole, anche se oggi gli scienziati sanno come è fatta questa via, la sua implicazione in tutti i differenti processi resta ancora da capire. Partner del progetto, il Beatson Institute for Cancer Research si è concentrato sullo sviluppo degli strumenti appropriati occorrenti per l'elaborazione dei dati di espressione di proteine e di geni. Tali strumenti formano una parte essenziale degli sforzi di ricerca nel quadro del progetto, considerata la quantità d'informazione che deve essere elaborata e interpretata. I ricercatori hanno cercato di identificare le proteine che possono essere usate per gli studi di espressione di proteine utilizzando gel bidimensionali (2D). Lo scopo finale era quello di modellizzare la via MAPK utilizzando questa enorme quantità di dati di proteomica. Una parte dell'obiettivo è stata raggiunta mediante lo sviluppo di uno specifico portale usato per gestire i dati di gel bidimensionale e delineare le interazioni proteina-proteina. Il database on-line è stato ideato in forma di piattaforma .NET e le interrogazioni possono essere fatte con una varietà di mezzi. Tra questi un software terzo e un set di interrogazioni standard integrate nel database.
