Facilitar la investigación transfronteriza del cáncer basada en datos
En varios sectores, entre ellos la sanidad, dependemos cada vez más del soporte informático para gestionar el fuerte aumento del volumen y la complejidad de los datos. Sin embargo, para que Europa pueda beneficiarse plenamente de estas innovaciones, es necesario armonizar estos datos, y los investigadores y el personal clínico necesitan formas de acceder a la información y compartirla de forma transfronteriza. Para lograrlo, se puso en marcha el proyecto financiado con fondos europeos EOSC4Cancer, que estará en marcha hasta marzo de 2025 y reúne a centros de investigación del cáncer, infraestructuras de investigación, hospitales y centros de supercomputación de catorce países europeos.
De la prevención al diagnóstico y el tratamiento del cáncer
El consorcio del proyecto EOSC4Cancer está aplicando estos principios a una serie de casos de uso que abarcan el itinerario asistencial del paciente. Un elemento fundamental es garantizar que esos conjuntos de datos estén armonizados, sean automatizables y se presten a métodos de inteligencia artificial. Un caso de uso se centra en los programas de cribado del cáncer, fundamentales para mejorar las tasas de supervivencia gracias a la detección precoz. Los programas de cribado suelen producir conjuntos de datos que pueden utilizarse para investigaciones posteriores basadas en datos. El equipo del proyecto correlacionó un subconjunto de datos, extraídos de programas de cribado de tres países, para evaluar el riesgo/beneficio del cribado del cáncer colorrectal y ayudar a optimizar las estrategias de cribado. Un objetivo fundamental es lograr un mejor flujo de datos y facilitar la investigación colaborativa al hacer accesible esta información a través de espacios de datos federados. En un segundo caso de uso se estudia la multiómica para el diagnóstico y tratamiento eficaces del cáncer colorrectal. Se han recopilado conjuntos de datos que abarcan imágenes médicas, genómica y otros factores, con el objetivo de garantizar su armonización. El equipo del proyecto tiene previsto ofrecer plantillas normalizadas que los investigadores y el personal asistencial puedan utilizar para compartir datos multiómicos como estos. Otro caso de uso es la exploración de la optimización de los datos moleculares tumorales en el contexto de la medicina de precisión del cáncer. El objetivo es construir un sistema de apoyo a la toma de decisiones clínicas (CDSS, por sus siglas en inglés) para ayudar a los médicos a realizar intervenciones de medicina de precisión basadas en biomarcadores. En la actualidad, el equipo del proyecto está investigando las infraestructuras de datos y las especificaciones de formato necesarias para que el CDSS pueda cumplir esta tarea. Este elemento del proyecto se basa en el trabajo que está llevando a cabo el portal Molecular Tumor Board Portal, que utiliza herramientas bioinformáticas para identificar oportunidades de tratamiento.
Investigación médica eficaz basada en pruebas
Los conjuntos de datos que se están recopilando a partir de estos y otros casos de uso específicos, así como el trabajo del equipo del proyecto que se está llevando a cabo para garantizar que dichos datos sean accesibles y puedan compartirse y reutilizarse, ayudarán a sentar las bases de una mayor investigación colaborativa sobre el cáncer. La compleja naturaleza del cáncer exige una amplia cooperación para poder ofrecer nuevos tratamientos eficaces a los pacientes. La principal contribución del proyecto EOSC4Cancer consiste en garantizar que diversos tipos de datos sobre el cáncer —genómicos, de obtención de imágenes, médicos, clínicos, ambientales y socioeconómicos— puedan procesarse y reutilizarse de forma segura de forma transfronteriza, mediante sistemas federados e interoperables. La inversión en este tipo de infraestructura de investigación acabará dando sus frutos, ya que fomentará una investigación médica eficaz basada en pruebas que conduzca a mejores resultados sanitarios.
Palabras clave
EOSC4Cancer, cáncer, diagnóstico, genómica, medicina, datos, multiómica