Una ayuda para los investigadores en proteómica
Desde el descubrimiento de nuevos marcadores proteicos para diagnosticar enfermedades hasta el estudio de nuevas dianas moleculares para obtener fármacos eficaces, la proteómica —el estudio del proteoma— desempeña un papel clave en la investigación médica. Las proteínas efectúan la mayor parte del trabajo en las células y se ocupan de muchas funciones esenciales del organismo. Cuando el ADN de una persona sufre mutaciones, en realidad, son las proteínas las que se ven afectadas. Los fármacos administrados para luchar contra una enfermedad consiguen hacer su trabajo gracias a la interacción con las proteínas. Para lograr nuevos avances, la investigación en proteómica debe combinar equipos avanzados y esfuerzos colaborativos de parte de los expertos en este ámbito. Sin embargo, los científicos no suelen tener acceso a este tipo de recursos. El proyecto EPIC-XS, financiado con fondos europeos, ha ofrecido a los investigadores acceso a los recursos y las tecnologías proteómicas más recientes que, de lo contrario, hubiesen estado fuera de su alcance.
Equipos y conocimientos técnicos de vanguardia en los sitios de acceso del proyecto
En su primer año y medio, el proyecto EPIC-XS, que tendrá una duración de cuatro años, ha aceptado más de doscientas sesenta solicitudes para usar sus recursos. Uno de los proyectos aprobados está dirigido por el doctor Esteban Gurzov de la Universidad Libre de Bruselas. El grupo de Gurzov se ha beneficiado del acceso al Hecklab de la Universidad de Utrecht (Países Bajos), coordinadora del proyecto EPIC-XS, para su investigación sobre el papel de las fosfatasas en el metabolismo y el impacto de las complicaciones relacionadas con la obesidad, como el cáncer. «En los últimos meses, mi investigación se ha beneficiado sobremanera de la iniciativa», afirma Gurzov en un artículo publicado en «TechnologyNetworks». «Pudimos efectuar cribajes completos de proteinas tirosinas fosfatasas (PTP), activa y expresada, a partir de biopsias de tejido hepático humano limitadas», continúa Gurzov. El investigador estudia los trastornos metabólicos para encontrar nuevas dianas terapéuticas. Otro sitio de acceso de EPIC-XS, situado en el Centro Bávaro de Espectrometría de Masas Biomolecular de la Universidad Técnica de Múnich (TUM), socia del proyecto, ha proporcionado una valiosa ayuda a los investigadores, como en el caso del doctor Sven Van Bael de la KU Leuven (Bélgica). Van Bael investiga la función de los neuropéptidos y sus efectos conductuales correspondientes. Hasta la fecha, su investigación en peptidómica se basaba principalmente en la espectrometría de masas por adquisición dependiente de datos, una técnica ideal con fines de descubrimiento, pero poco adaptada a estudios diferenciales precisos, debido a su incapacidad global para generar resultados coherentes en experimentos repetidos. El sitio de acceso de la TUM abrió nuevas vías gracias a sus conocimientos en materia de estrategias proteómicas específicas, como la observación paralela de reacciones y la adquisición independiente de datos. «EPIC-XS me ha ofrecido la oportunidad de interactuar directamente con expertos del ámbito de la espectrometría de masas específica. Su experiencia y conocimientos resultaron extremadamente útiles para mi investigación actual y será algo que conservaré a lo largo de mi carrera», señaló Van Bael. El doctor Sylvester Holt de la Universidad Côte d’Azur también se beneficia de la tecnología y los conocimientos del sitio de acceso de la TUM. Su investigación se centra en los efectos moleculares de las perturbaciones derivadas de las mutaciones de los cánceres humanos usando la levadura como sistema modelo. «Sin EPIC-XS, este proyecto nunca habría alcanzado su nivel actual de excelencia científica. Obtener la subvención de EPIC-XS ha resultado ser una experiencia muy positiva para mí y un impulso para mi carrera científica», indicó Holt. Las solicitudes para utilizar los sitios de acceso de EPIC-XS (European Proteomics Infrastructure Consortium providing Access) no proceden únicamente de países europeos, también han llegado de Canadá y Estados Unidos, lo cual indica el reconocimiento internacional del proyecto. EPIC-XS finaliza en diciembre de 2022. Para obtener más información, consulte: Sitio web del proyecto EPIC-XS
Palabras clave
EPIC-XS, proteómica, proteína, espectrometría de masas, trastornos metabólicos, neuropéptidos, cáncer