Secuenciado el mayor cromosoma del trigo
El trigo (Triticum spp.) constituye uno de los cultivos más importantes del mundo, pero el tamaño y la complejidad del genoma de este cereal ha dificultado su secuenciación y caracterización. En estudios recientes se ha sugerido que, en el trigo, la duplicación y las reorganizaciones de genes son especialmente frecuentes en relación a otros cultivos. El proyecto financiado con fondos europeos «Origin, fate and function of wheat genes noncollinear with the other cereal genomes» (NONCOLLINEARGENES) pretendía utilizar la secuencia de referencia del cromosoma 3B, obtenida por el proyecto 3BSEQ (financiado por la Agencia Nacional de Investigación de Francia), para comprender más a fondo el papel de las duplicaciones en la evolución del genoma del trigo. Para comparar el cromosoma 3B del trigo con los de Oryza sativa (arroz), Brachypodium distachyon (una hierba) y Sorghum bicolor (el sorgo) se utilizaron herramientas bioinformáticas. Concretamente, en este proyecto se investigaron genes no colineales (o no sinténicos), grupos funcionales de genes localizados de forma dispersa en el cromosoma y que son el resultado de intensas actividades de duplicación. En el cromosoma 3B se observó una elevada tasa de genes no sinténicos (un 38 %, en comparación con un 5 % para otras especies), lo que sugiere que, recientemente, la evolución del trigo se ha acelerado. Este fenómeno es especialmente frecuente en los extremos externos del cromosoma. Los resultados indican también que los genes no sinténicos proporcionan diversidad de funcional y potencial de adaptación. Además, se confirmó que la duplicación génica era especialmente frecuente en el cromosoma 3B. En el trigo, la tasa de duplicación intracromosómica es el doble que en otras especies y el 82 % de estos fenómenos tuvieron lugar en los últimos cuarenta millones de años. NONCOLLINEARGENES confirmó que el trigo ha sufrido una evolución rápida en su historia reciente y aportó conocimientos nuevos sobre el efecto funcional de las duplicaciones. Los datos obtenidos en este proyecto contribuyen a mejorar el conocimiento de la compleja genética del trigo.
Palabras clave
Trigo, cromosoma 3B, duplicación génica, genoma del cereal, bioinformática, no sinténico, genética