MIXed plastics biodegradation and UPcycling using microbial communities

Leistungen

Related to task 82Final Data Management Plan

Related to task 8.2: Initial Data Management Plan

Online blog as platform for consistent public dissemination

Related to task 8.1: An online blog as platform for consistent public dissemination. After setting up the blog, frequent posts (English, minimum four per month) will report about the project’s progress and news from the global plastic crisis to set the consortium’s work in a comprehensive context. The blog will be linked to the social media channels of the consortium members to maximize the communication and impact (PGS).

Update SEVA collection

Related to task 7.7:Update SEVA collection with at least three new platforms for genome editing and site-specific sequence diversification of chromosomal segments (CSIC).

Veröffentlichungen

Synthetic Biology and Genome-Editing Tools for Improving PHA Metabolic Engineering

Autoren: Xu Zhang, Yina Lin, Qiong Wu, Ying Wang, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Trends in Biotechnology, Ausgabe 38/7, 2020, Seite(n) 689-700, ISSN 0167-7799
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2019.10.006

Biodegradation of polyester polyurethane by Cladosporium sp. P7: Evaluating its degradation capacity and metabolic pathways

Autoren: Jiawei Liu, Qingyi Zeng, Huirui Lei, Kaiyuan Xin, Anming Xu, Ren Wei, Ding Li, Jie Zhou, Weiliang Dong, Min Jiang.
Veröffentlicht in: Journal of Hazardous Materials, 2023, ISSN 1873-3336
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.jhazmat.2023.130776

Enzymatic degradation of polyethylene terephthalate nanoplastics analyzed in real time by isothermal titration calorimetry

Autoren: Kristina Vogel, Ren Wei, Lara Pfaff, Daniel Breite, Hassan Al-Fathi, Christian Ortmann, Irina Estrela-Lopis, Tom Venus, Agnes Schulze, Hauke Harms, Uwe T. Bornscheuer, Thomas Maskow
Veröffentlicht in: Science of The Total Environment, Ausgabe 773, 2021, Seite(n) 145111, ISSN 0048-9697
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2021.145111

Anti-staphylococcal hydrogels based on bacterial cellulose and the antimicrobial biopolyester poly(3-hydroxy-acetylthioalkanoate-co-3-hydroxyalkanoate)

Autoren: Virginia Rivero-Buceta, María Rosa Aguilar, Ana María Hernández-Arriaga, Francisco G. Blanco, Antonia Rojas, Marta Tortajada, Rosa Ana Ramírez-Jiménez, Blanca Vázquez-Lasa, Auxiliadora Prieto
Veröffentlicht in: International Journal of Biological Macromolecules, Ausgabe 162, 2020, Seite(n) 1869-1879, ISSN 0141-8130
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2020.07.289

Pseudomonas putida as a synthetic biology chassis and a metabolic engineering platform

Autoren: Esteban Martínez-García, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Current Opinion in Biotechnology, Ausgabe 85, 2024, Seite(n) 103025, ISSN 0958-1669
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.copbio.2023.103025

Water potential governs the effector specificity of the transcriptional regulator XylR of Pseudomonas putida

Autoren: Pavel Dvořák, Teca Calcagno Galvão, Katharina Pflüger-Grau, Alice M Banks, Víctor de Lorenzo, Jose I Jiménez
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, 2023, ISSN 1462-2920
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/1462-2920.16342

Chemical and biological catalysis for plastics recycling and upcycling

Autoren: Lucas D. Ellis, Nicholas A. Rorrer, Kevin P. Sullivan, Maike Otto, John E. McGeehan, Yuriy Román-Leshkov, Nick Wierckx, Gregg T. Beckham
Veröffentlicht in: Nature Catalysis, Ausgabe 4/7, 2021, Seite(n) 539-556, ISSN 2520-1158
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41929-021-00648-4

MIXed plastics biodegradation and UPcycling using microbial communities: EU Horizon 2020 project MIX-UP started January 2020

Autoren: Hendrik Ballerstedt, Till Tiso, Nick Wierckx, Ren Wei, Luc Averous, Uwe Bornscheuer, Kevin O’Connor, Tilman Floehr, Andreas Jupke, Jürgen Klankermayer, Luo Liu, Victor de Lorenzo, Tanja Narancic, Juan Nogales, Rémi Perrin, Eric Pollet, Auxiliadora Prieto, William Casey, Thomas Haarmann, Alexandru Sarbu, Ulrich Schwaneberg, Fengxue Xin, Weiliang Dong, Jiamin Xing, Guo-Qiang Chen, Tianwei Tan, M
Veröffentlicht in: Environmental Sciences Europe, Ausgabe 33/1, 2021, Seite(n) 99, ISSN 2190-4707
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1186/s12302-021-00536-5

High-Efficiency Multi-site Genomic Editing of Pseudomonas putida through Thermoinducible ssDNA Recombineering

Autoren: Tomas Aparicio, Akos Nyerges, Esteban Martínez-García, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: iScience, Ausgabe 23/3, 2020, Seite(n) 100946, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2020.100946

Structural Insights into (Tere)phthalate-Ester Hydrolysis by a Carboxylesterase and Its Role in Promoting PET Depolymerization

Autoren: Gerlis von Haugwitz, Xu Han, Lara Pfaff, Qian Li, Hongli Wei, Jian Gao, Karen Methling, Yufei Ao, Yannik Brack, Jan Mican, Christian G. Feiler, Manfred S. Weiss, David Bednar, Gottfried J. Palm, Michael Lalk, Michael Lammers, Jiri Damborsky, Gert Weber, Weidong Liu, Uwe T. Bornscheuer, Ren Wei
Veröffentlicht in: ACS Catalysis, 2022, ISSN 2155-5435
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.2c03772

Biosynthesis of functional polyhydroxyalkanoates by engineered Halomonas bluephagenesis

Autoren: Lin-Ping Yu, Xu Yan, Xu Zhang, Xiang-Bin Chen, Qiong Wu, Xiao-Ran Jiang, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, Ausgabe 59, 2020, Seite(n) 119-130, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2020.02.005

Polyhydroxyalkanoates (PHA) toward cost competitiveness and functionality

Autoren: Guo-Qiang Chen, Xin-Yu Chen, Fu-Qing Wu, Jin-Chun Chen
Veröffentlicht in: Advanced Industrial and Engineering Polymer Research, Ausgabe 3/1, 2020, Seite(n) 1-7, ISSN 2542-5048
Herausgeber: Science Direct
DOI: 10.1016/j.aiepr.2019.11.001

A pseudo-homogeneous system for PET glycolysis using a colloidal catalyst of graphite carbon nitride in ethylene glycol

Autoren: Zishuai Wang, Yaoqiang Wang, Shengnan Xu, Yu Jin, Zequn Tang, Gang Xiao, Haijia Su
Veröffentlicht in: Polymer Degradation and Stability, Ausgabe 190, 2021, Seite(n) 109638, ISSN 0141-3910
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.polymdegradstab.2021.109638

Molecular and Biochemical Differences of the Tandem and Cold-Adapted PET Hydrolases Ple628 and Ple629, Isolated From a Marine Microbial Consortium

Autoren: Ingrid E. Meyer Cifuentes, Pan Wu, Yipei Zhao, Weidong Liu, Meina Neumann-Schaal, Lara Pfaff, Justyna Barys, Zhishuai Li, Jian Gao, Xu Han, Uwe T. Bornscheuer, Ren Wei, Basak Öztürk
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2022, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media S.A
DOI: 10.3389/fbioe.2022.930140

Production of PHA copolymers consisting of 3-hydroxybutyrate and 3-hydroxyhexanoate (PHBHHx) by recombinant Halomonas bluephagenesis

Autoren: Huan Wang, Jian-Wen Ye, Xinyu Chen, Yiping Yuan, Jingwen Shi, Xinyi Liu, Fang Yang, Yueyuan Ma, Jinchun Chen, Fuqing Wu, Yuxuan Lan, Qiong Wu, Yi Tong, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Chemical Engineering Journal, Ausgabe 466, 2024, Seite(n) 143261, ISSN 1385-8947
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cej.2023.143261

Enzymes for microplastic-free agricultural soils

Autoren: Cristina Palacios-Mateo, Ke Meng, Lucia Legaz-Pol, Erik Steen Redeker, Esperanza Huerta-Lwanga, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Ecotoxicology and Environmental Safety, Ausgabe 258, 2023, Seite(n) 114982, ISSN 0147-6513
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ecoenv.2023.114982

Engineering Halomonas bluephagenesis for L-Threonine production

Autoren: Hetong Du, Yiqing Zhao, Fuqing Wu, Peifei Ouyang, Jinchun Chen, Xiaoran Jiang, Jianwen Ye, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, Ausgabe 60, 2020, Seite(n) 119-127, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2020.04.004

Hints from nature for a PHA circular economy: Carbon synthesis and sharing by Pseudomonas solani GK13

Autoren: José D. Jiménez, Manuel S. Godoy, Carlos del Cerro, M. Auxiliadora Prieto
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 84, 2024, Seite(n) 9-23, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2024.09.002

The molecular basis and enzyme engineering strategies for improvement of coupling efficiency in cytochrome P450s

Autoren: Shuaiqi Meng, Yu Ji, LeiLei Zhu, Gaurao V. Dhoke, Mehdi D. Davari, Ulrich Schwaneberg
Veröffentlicht in: Biotechnology Advances, 2022, ISSN 0734-9750
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biotechadv.2022.108051

Uncoupling Foam Fractionation and Foam Adsorption for Enhanced Biosurfactant Synthesis and Recovery.

Autoren: Christian C. Blesken; Tessa Strümpfler; Till Tiso; Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 2, 2020, ISSN 2078-2489
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.18154/rwth-2021-00396

Proposal for a systematic naming convention for liamocins

Autoren: Till Tiso, Gina Welsing, Anna Lipphardt, Daniel F. Sauer, Zhenming Chi, Lars M. Blank, Heiko Hayen
Veröffentlicht in: Journal of Surfactants and Detergents, Ausgabe 27, 2024, Seite(n) 459-461, ISSN 1097-3958
Herausgeber: American oil chemists' society Press
DOI: 10.1002/jsde.12735

For the sake of the Bioeconomy: define what a Synthetic Biology Chassis is!

Autoren: Víctor de Lorenzo, Natalio Krasnogor, Markus Schmidt
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 60, 2021, Seite(n) 44-51, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2020.08.004

Computational design of an efficient and thermostable esterase for polylactic acid depolymerization

Autoren: Bin Xie, Jun Zhang, Huashan Sun, Rongrong Bai, Diannan Lu, Yushan Zhu, Weiliang Dong, Jie Zhou, Min Jiang
Veröffentlicht in: Green Chemistry, Ausgabe 26, 2024, Seite(n) 7268-7279, ISSN 1463-9262
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3gc04888h

Synthetic Control of Metabolic States in Pseudomonas putida by Tuning Polyhydroxyalkanoate Cycle

Autoren: Maria-Tsampika Manoli, Juan Nogales, Auxiliadora Prieto
Veröffentlicht in: mBio, Ausgabe January/February 2022 Volume 13 Ausgabe 11, 2022, ISSN 2150-7511
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.01794-21

Sustainable cycloaliphatic polyurethanes from synthesis to applications

Autoren: Agathe Mouren, Luc Avérous
Veröffentlicht in: Chem. Soc. Rev., Ausgabe Vol. 52, 2023, Seite(n) 277-317, ISSN 1460-4744
Herausgeber: RSC
DOI: 10.1039/d2cs00509c

CRISPR/Cas9-enhanced targetron insertion for the delivery of heterologous sequences into the genome of Gram-negative bacteria

Autoren: Elena Velázquez, Yamal Al-Ramahi, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Current Protocols, Ausgabe 2(9), 2022, Seite(n) e532, ISSN 2691-1299
Herausgeber: Wiley on line Library
DOI: 10.1002/cpz1.532

ArsH protects Pseudomonas putida from oxidative damage caused by exposure to arsenic

Autoren: A. David Páez‐Espino, Pablo I. Nikel, Max Chavarría, Víctor Lorenzo
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 22/6, 2020, Seite(n) 2230-2242, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.14991

Pseudomonas umsongensis GO16 as a platform for the in vivo synthesis of short and medium chain length polyhydroxyalkanoate blends

Autoren: Federico Cerrone, Binbin Zhou, Agathe Mouren, Luc Avérous, Stephen Conroy, Jeremy C. Simpson, Kevin E. O'Connor, Tanja Narancic
Veröffentlicht in: Bioresource Technology, Ausgabe 387, 2024, Seite(n) 129668, ISSN 0960-8524
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biortech.2023.129668

Toward merging bottom–up and top–down model-based designing of synthetic microbial communities

Autoren: David San León, Juan Nogales
Veröffentlicht in: Current Opinion in Microbiology, Ausgabe Volume 69, October 2022, 102169, 2022, Seite(n) 102169, ISSN 1369-5274
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mib.2022.102169

Towards bio-upcycling of polyethylene terephthalate

Autoren: Till Tiso, Tanja Narancic, Ren Wei, Eric Pollet, Niall Beagan, Katja Schröder, Annett Honak, Mengying Jiang, Shane T. Kenny, Nick Wierckx, Rémi Perrin, Luc Avérous, Wolfgang Zimmermann, Kevin O'Connor, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, Ausgabe 66, 2021, Seite(n) 167-178, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2021.03.011

Advances in Aureobasidium research: Paving the path to industrial utilization

Autoren: Difan Xiao, Marielle Driller, Marie Dielentheis‐Frenken, Frederick Haala, Philipp Kohl, Karla Stein, Lars M. Blank, Till Tiso
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, Ausgabe 17, 2024, ISSN 1751-7915
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1111/1751-7915.14535

An updated structural model of the A domain of the Pseudomonas putida XylR regulator poses an atypical interplay with aromatic effectors

Autoren: Pavel Dvořák, Carlos Alvarez‐Carreño, Sergio Ciordia, Alberto Paradela, Víctor Lorenzo
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 23/8, 2021, Seite(n) 4418-4433, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15628

Tailor‐Made Polyhydroxyalkanoates by Reconstructing Pseudomonas Entomophila

Autoren: Mengyi Li, Yueyuan Ma, Xu Zhang, Lizhan Zhang, Xinyu Chen, Jian‐Wen Ye, Guo‐Qiang Chen
Veröffentlicht in: Advanced Materials, 2021, Seite(n) 2102766, ISSN 0935-9648
Herausgeber: United Nations Industrial Developement Organization
DOI: 10.1002/adma.202102766

Mixed plastics biodegradation and UPcycling using microbial communities: the NSFC-EU 2019 project MIX-UP to help achieve “carbon neutrality”

Autoren: Jie Zhou, Haijia Su, Qiong Wu, Jianmin Xing, Weiliang Dong and Min Jiang
Veröffentlicht in: Chinese Journal of Biotechnology, 2021, ISSN 1000-3061
Herausgeber: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.13345/j.cjb.210398

Reconfiguration of metabolic fluxes in Pseudomonas putida as a response to sub-lethal oxidative stress

Autoren: Pablo I. Nikel, Tobias Fuhrer, Max Chavarría, Alberto Sánchez-Pascuala, Uwe Sauer, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: The ISME Journal, Ausgabe 15/6, 2021, Seite(n) 1751-1766, ISSN 1751-7362
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-020-00884-9

Novel Magnetic Carbon Supported Molybdenum Disulfide Catalyst and Its Application in Residue Upgrading

Autoren: Xiangyang Zhu, Dong Qiao, Liangrong Yang, Qinling Bi, Huifang Xing, Shan Ni, Menglei Yuan, Huizhou Liu, Luhai Wang, An Ma
Veröffentlicht in: Green Energy & Environment, 2020, ISSN 2468-0257
Herausgeber: ELSEVIER ScienceDirect
DOI: 10.1016/j.gee.2020.06.025

From Residues to Added-Value Bacterial Biopolymers as Nanomaterials for Biomedical Applications

Autoren: Francisco G. Blanco, Natalia Hernández, Virginia Rivero-Buceta, Beatriz Maestro, Jesús M. Sanz, Aránzazu Mato, Ana M. Hernández-Arriaga, M. Auxiliadora Prieto
Veröffentlicht in: Nanomaterials, Ausgabe 11/6, 2021, Seite(n) 1492, ISSN 2079-4991
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/nano11061492

Editorial: Microbial Degradation of Plastics

Autoren: Ren Wei, Nick Wierckx
Veröffentlicht in: Frontiers in Microbiology, Ausgabe 12, 2021, ISSN 1664-302X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.635621

Synthesis of Modified Poly(vinyl Alcohol)s and Their Degradation Using an Enzymatic Cascade

Autoren: Gerlis von Haugwitz, Kian Donnelly, Mara Di Filippo, Daniel Breite, Max Phippard, Agnes Schulze, Ren Wei, Marcus Baumann, Uwe Bornscheuer
Veröffentlicht in: Angew. Chem. Int. Ed., 2023, ISSN 1521-3773
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/anie.202216962

Concomitant prediction of environmental fate and toxicity of chemical compounds

Autoren: Juan Antonio Garcia-Martin, Max Chavarría, Victor de Lorenzo, Florencio Pazos
Veröffentlicht in: Biology Methods and Protocols, Ausgabe 5/1, 2020, ISSN 2396-8923
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/biomethods/bpaa025

Process analysis of microplastic degradation using activated PMS and Fenton reagents

Autoren: Bin Liu, Qixuan Jiang, Zenghui Qiu, Luo Liu, Ren Wei, Xin Zhang, Haijun Xu
Veröffentlicht in: Chemosphere, 2022, ISSN 0045-6535
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.chemosphere.2022.134220

Surface Display of Designer Protein Scaffolds on Genome-Reduced Strains of Pseudomonas putida

Autoren: Pavel Dvořák, Edward A. Bayer, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 9/10, 2020, Seite(n) 2749-2764, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.0c00276

Enhanced bone regeneration via PHA scaffolds coated with polydopamine-captured BMP2

Autoren: Xu Zhang, Jian Li, Jin Chen, Zi-Xin Peng, Jiang-Nan Chen, Xinyi Liu, Fuqing Wu, Peng Zhang, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Journal of Materials Chemistry B, Ausgabe 10, 2024, Seite(n) 6214-6227, ISSN 2050-7518
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2tb01122k

Innovation versus novelty in microbial systems

Autoren: de Lorenzo, Víctor
Veröffentlicht in: Environmental Microbioly, Ausgabe 25(1), 2023, Seite(n) 167-170, ISSN 1462-2920
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/1462-2920.16278

ssDNA recombineering boosts in vivo evolution of nanobodies displayed on bacterial surfaces.

Autoren: Yamal Al-ramahi, Akos Nyerges, Yago Margolles, Lidia Cerdán, Gyorgyi Ferenc, Csaba Pál, Luis Ángel Fernández, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe volume 4, Article number: 1169, 2021, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Nature Research
DOI: 10.1038/s42003-021-02702-0

The Cradle-to-Cradle Life Cycle Assessment of Polyethylene terephthalate: Environmental Perspective

Autoren: Muhammad Tamoor, Nadia A. Samak, Maohua Yang, Jianmin Xing
Veröffentlicht in: Molecules, Ausgabe 27, 2024, Seite(n) 1599, ISSN 1420-3049
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules27051599

Fabrication of hypercrosslinked hydroxyl-rich solid phase extractants for cesium separation from the salt lake brine

Autoren: Zihao Xu, Meng Rong, Qiyu Meng, Haoyu Yao, Shan Ni, Li Wang, Huifang Xing, Hongnan Qu, Liangrong Yang, Huizhou Liu
Veröffentlicht in: Chemical Engineering Journal, Ausgabe 400, 2020, Seite(n) 125991, ISSN 1385-8947
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cej.2020.125991

Possibilities and limitations of biotechnological plastic degradation and recycling

Autoren: Ren Wei, Till Tiso, Jürgen Bertling, Kevin O’Connor, Lars M. Blank, Uwe T. Bornscheuer
Veröffentlicht in: Nature Catalysis, Ausgabe Monthly journal, 2020, ISSN 2520-1158
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41929-020-00521-w

A Standardized Inverter Package Borne by Broad Host Range Plasmids for Genetic Circuit Design in Gram-Negative Bacteria

Autoren: Huseyin Tas, Ángel Goñi-Moreno, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 10/1, 2021, Seite(n) 213-217, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.0c00529

A Combined Bio-Chemical Synthesis Route for 1-Octene Sheds Light on Rhamnolipid Structure

Autoren: Till Tiso, Daniel F. Sauer, Klaus Beckerle, Christian C. Blesken, Jun Okuda, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Catalysts, Ausgabe 10/8, 2020, Seite(n) 874, ISSN 2073-4344
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/catal10080874

Efficient recovery of bio-based 1,2,4-butanetriol by using boronic acid anionic reactive extraction

Autoren: Qiyu Meng, Jiemiao Yu, Liangrong Yang, Yanqing Li, Mo Xian, Huizhou Liu
Veröffentlicht in: Separation and Purification Technology, Ausgabe 255, 2021, Seite(n) 117728, ISSN 1383-5866
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.seppur.2020.117728

Fusion of Chitin-Binding Domain From Chitinolyticbacter meiyuanensis SYBC-H1 to the Leaf-Branch Compost Cutinase for Enhanced PET Hydrolysis

Autoren: Rui Xue, Yinping Chen, Huan Rong, Ren Wei, Zhongli Cui, Jie Zhou, Weiliang Dong, Min Jiang
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2021, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fbioe.2021.762854

Standardization of inducer-activated broad host range expression modules: Debugging and refactoring an alkane-responsive AlkS/PalkB device.

Autoren: Alejandro Arce-Rodríguez, Ilaria Benedetti, José Manuel Borrero-de Acuña, Rafael Silva-Rocha, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Synthetic Biology, Ausgabe Volume 6, Ausgabe 1, 2021, Seite(n) 1–11, ISSN 2397-7000
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/synbio/ysab030

Enhanced resistance of Trichoderma harzianum LZDX-32-08 to hygromycin B induced by sea salt

Autoren: Xijia Yu, Huiling Wei, Xianrui Liu, Dong Liu, Aili Fan, Haijia Su
Veröffentlicht in: Biotechnology Letters, Ausgabe 43/1, 2021, Seite(n) 213-222, ISSN 0141-5492
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10529-020-02994-y

Hyphenation of supercritical fluid chromatography with different detection methods for identification and quantification of liamocin biosurfactants

Autoren: Karen Scholz, Anna Lipphardt, Carina M. Wienken, Till Tiso, Heiko Hayen
Veröffentlicht in: Journal of Chromatography A, Ausgabe 1631, 2020, Seite(n) 461584, ISSN 0021-9673
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chroma.2020.461584

Synthetic biology of extremophiles: a new wave of biomanufacturing

Autoren: Jian-Wen Ye, Yi-Na Lin, Xue-Qing Yi, Zhuo-Xuan Yu, Xu Liu, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Trends in Biotechnology, Ausgabe 41, 2024, Seite(n) 342-357, ISSN 0167-7799
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2022.11.010

New insights into the biodegradation of polylactic acid: from degradation to upcycling

Autoren: Bin Xu, Yinping Chen, Jie He, Shixiang Cao, Jiawei Liu, Rui Xue, Fengxue Xin, Xiujuan Qian, Jie Zhou, Weiliang Dong, Min Jiang
Veröffentlicht in: Environmental Reviews, Ausgabe 30, 2022, Seite(n) 30-38, ISSN 1181-8700
Herausgeber: NRC Research Press
DOI: 10.1139/er-2020-0117

Hypermutation of specific genomic loci of Pseudomonas putida for continuous evolution of target genes

Autoren: Elena Velázquez, Beatriz Álvarez, Luis Ángel Fernández, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, Ausgabe 15(9), 2022, Seite(n) 2309-2323, ISSN 1751-7915
Herausgeber: Wiley Open Access
DOI: 10.1111/1751-7915.14098

Gaining control of bacterial cellulose colonization by polyhydroxyalkanoate-producing microorganisms to develop bioplasticized ultrathin films

Autoren: Campano, Cristina; Rivero-Buceta, Virginia; Fabra, María José; Prieto, M Auxiliadora
Veröffentlicht in: International Journal of Biological Macromolecules, Ausgabe Volume 223, Part A, 2022, Seite(n) 1495-1505, ISSN 1879-0003
Herausgeber: Elsevier B.V.
DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2022.11.120

Quantitative assessment of morphological traits of planktonic bacterial aggregates

Autoren: David R. Espeso, Esteban Martínez-García, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Water Research, Ausgabe 188, 2021, Seite(n) 116468, ISSN 0043-1354
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.watres.2020.116468

Low CyaA expression and anti‐cooperative binding of cAMP to CRP frames the scope of the cognate regulon of Pseudomonas putida

Autoren: Alejandro Arce‐Rodríguez, Pablo I. Nikel, Belén Calles, Max Chavarría, Raúl Platero, Tino Krell, Victor Lorenzo
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 23/3, 2021, Seite(n) 1732-1749, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15422

Rapid colonization and biodegradation of untreated commercial polyethylene wrap by a new strain of Bacillus velezensis C5

Autoren: Xianrui Liu, Yiming Zhang, Qiufeng Sun, Zihan Liu, Yilin Zhao, Aili Fan, Haijia Su
Veröffentlicht in: Journal of Environmental Management, 2021, ISSN 0301-4797
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jenvman.2021.113848

Genome analysis of the metabolically versatile Pseudomonas umsongensis GO16: the genetic basis for PET monomer upcycling into polyhydroxyalkanoates

Autoren: Tanja Narancic, Manuel Salvador, Graham M. Hughes, Niall Beagan, Umar Abdulmutalib, Shane T. Kenny, Huihai Wu, Marta Saccomanno, Jounghyun Um, Kevin E. O'Connor, José I. Jiménez
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, 2021, ISSN 1751-7915
Herausgeber: WILEY
DOI: 10.1111/1751-7915.13712

Metabolic modelling approaches for describing and engineering microbial communities

Autoren: Beatriz García-Jiménez, Jesús Torres-Bacete, Juan Nogales
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, Ausgabe 19, 2021, Seite(n) 226-246, ISSN 2001-0370
Herausgeber: Elsevier B.V.
DOI: 10.1016/j.csbj.2020.12.003

A SsrA/NIa-based Strategy for Post-Translational Regulation of Protein Levels in Gram-negative Bacteria

Autoren: Gonzalo Durante-Rodríguez, Belén Calles, Víctor Lorenzo, Pablo Nikel
Veröffentlicht in: BIO-PROTOCOL, Ausgabe 10/14, 2020, ISSN 2331-8325
Herausgeber: Bio-101
DOI: 10.21769/bioprotoc.3688

The faulty SOS response of Pseudomonas putida KT2440 stems from an inefficient RecA‐LexA interplay

Autoren: Özlem Akkaya, Tomás Aparicio, Danilo Pérez‐Pantoja, Víctor Lorenzo
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 23/3, 2021, Seite(n) 1608-1619, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15384

Biodegradation of polyether-polyurethane foam in yellow mealworms (Tenebrio molitor) and effects on the gut microbiome

Autoren: Jiawei Liu, Jingyuan Liu, Bin Xu, Anming Xu, Shixiang Cao, Ren Wei, Jie Zhou, Min Jiang, Weiliang Dong
Veröffentlicht in: Chemosphere, 2022, ISSN 0045-6535
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.chemosphere.2022.135263

Rational flux-tuning of Halomonas bluephagenesis for co-production of bioplastic PHB and ectoine

Autoren: Hong Ma, Yiqing Zhao, Wuzhe Huang, Lizhan Zhang, Fuqing Wu, Jianwen Ye, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-17223-3

Applications of phage-derived RNA-based technologies in synthetic biology

Autoren: Wenhui Zhang, Qiong Wu
Veröffentlicht in: Synthetic and Systems Biotechnology, Ausgabe 5/4, 2020, Seite(n) 343-360, ISSN 2405-805X
Herausgeber: Science Direct
DOI: 10.1016/j.synbio.2020.09.003

Can bioplastics always offer a truly sustainable alternative to fossil‐based plastics?

Autoren: Lara Serrano‐Aguirre, M. Auxiliadora Prieto
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, Ausgabe 17, 2024, ISSN 1751-7915
Herausgeber: John Wiley & Sons, Ltd
DOI: 10.1111/1751-7915.14458

The principle of uncertainty in biology: Will machine learning/artificial intelligence lead to the end of mechanistic studies?

Autoren: Victor de Lorenzo
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 22, 2024, Seite(n) e3002495, ISSN 1545-7885
Herausgeber: Plos
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002495

Naked Bacterium: Emerging Properties of a Surfome-Streamlined Pseudomonas putida Strain

Autoren: Esteban Martínez-García, Sofía Fraile, David Rodríguez Espeso, Davide Vecchietti, Giovanni Bertoni, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 9/9, 2020, Seite(n) 2477-2492, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.0c00272

The metabolic potential of plastics as biotechnological carbon sources – Review and targets for the future

Autoren: Till Tiso, Benedikt Winter, RenWei, Johann Hee, Jan de Witt, NickWierckx, Peter Quicker, Uwe T. Bornscheuer, André Bardow, Juan Nogales, Lars M.Blank
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, 2021, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2021.12.006

Environmental Performance of Pseudomonas putida with a Uracylated Genome

Autoren: Elena Algar, Yamal Al‐Ramahi, Víctor Lorenzo, Esteban Martínez‐García
Veröffentlicht in: ChemBioChem, Ausgabe 21/22, 2020, Seite(n) 3255-3265, ISSN 1439-4227
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000330

Quantum Mechanical Investigation of the Oxidative Cleavage of the C–C Backbone Bonds in Polyethylene Model Molecules

Autoren: Qixuan Jiang, Zhongyu Li, Ziheng Cui, Ren Wei, Kaili Nie, Haijun Xu, Luo Liu
Veröffentlicht in: Polymers, Ausgabe 13/16, 2021, Seite(n) 2730, ISSN 2073-4360
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/polym13162730

Insight into formation and biological characteristics of Aspergillus tubingensis-based aerobic granular sludge (AT-AGS) in wastewater treatment

Autoren: Yingyun Chen, Jiye Ge, Shaojie Wang, Haijia Su
Veröffentlicht in: Science of The Total Environment, Ausgabe 739, 2020, Seite(n) 140128, ISSN 0048-9697
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2020.140128

Rapid degradation of poly(butylene succinate-co-butylene terephthalate)s by microbial communities at high-temperature

Autoren: Hongyan Shen, Ye Yuan, Chuang Liu, Maohua Yang, Jianmin Xing
Veröffentlicht in: Biochemical Engineering Journal, Ausgabe 204, 2024, Seite(n) 109230, ISSN 1369-703X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bej.2024.109230

Engineering Tropism of Pseudomonas putida toward Target Surfaces through Ectopic Display of Recombinant Nanobodies

Autoren: Sofía Fraile, María Briones, Mónica Revenga-Parra, Víctor de Lorenzo, Encarnación Lorenzo, Esteban Martínez-García
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 10/8, 2021, Seite(n) 2049-2059, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.1c00227

Defined Microbial Mixed Culture for Utilization of Polyurethane Monomers

Autoren: Romualdus Nugraha Catur Utomo, Wing-Jin Li, Till Tiso, Christian Eberlein, Moritz Doeker, Hermann J. Heipieper, Andreas Jupke, Nick Wierckx, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: ACS Sustainable Chemistry & Engineering, Ausgabe 8/47, 2020, Seite(n) 17466-17474, ISSN 2168-0485
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssuschemeng.0c06019

Depolymerization of post-consumer PET bottles with engineered cutinase 1 from Thermobifida cellulosilytica

Autoren: Zixuan Zhang, Shiming Huang, Di Cai, Chaofeng Shao, Changwei Zhang, Junhui Zhou, Ziheng Cui, Tianqi He, Changjing Chen, Biqiang Chen, Tianwei Tan
Veröffentlicht in: Green chemistry, Ausgabe 14639270, 2022, ISSN 1463-9270
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2gc01834a

Application of a novel fluorogenic polyurethane analogue probe in polyester-degrading microorganisms screening by microfluidic droplet

Autoren: Anming Xu, Jiawei Liu, Shixiang Cao, Bin Xu, Chengzhi Guo, Ziyi Yu, Xiaoqiang Chen, Jie Zhou, Weiliang Dong, Min Jiang
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, 2022, ISSN 1751-7907
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1751-7915.14121

Nano-immobilization of PETase enzyme for enhanced polyethylene terephthalate biodegradation

Autoren: Jia, Yunpu Samak, Nadia A. Hao, Xuemi Chen, Zheng Yang, Gama Zhao, Xuhao Mu, Tingzhen Yang, Maohua Xing, Jianmin
Veröffentlicht in: Biochemical Engineering Journal, 2021, ISSN 1369-703X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bej.2021.108205

Contextual dependencies expand the re-usability of genetic inverters

Autoren: Huseyin Tas; Lewis Grozinger; Ruud Stoof; V de Lorenzo; Angel Goñi-Moreno
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 3, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.07.15.204651

Subcellular Architecture of the xyl Gene Expression Flow of the TOL Catabolic Plasmid of Pseudomonas putida mt-2

Autoren: Juhyun Kim, Angel Goñi-Moreno, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: mBio, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2161-2129
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.03685-20

Transcription-Associated Fluorescence-Activated Droplet Sorting for Di-rhamnolipid Hyperproducers

Autoren: Anming Xu, Xiaoxiao Zhang, Shixiang Cao, Xiaoli Zhou, Ziyi Yu, Xiujuan Qian, Jie Zhou, Weiliang Dong, and Min Jiang
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, 2022, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.1c00622

A Competitive High‐Throughput Screening Platform for Designing Polylactic Acid‐Specific Binding Peptides

Autoren: Yi Lu, Kai‐Wolfgang Hintzen, Tetiana Kurkina, Yu Ji, Ulrich Schwaneberg
Veröffentlicht in: Advanced Science, Ausgabe 10, 2024, ISSN 2198-3844
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/advs.202303195

Construction of a Stable Expression System Based on the Endogenous hbpB/hbpC Toxin–Antitoxin System of Halomonas bluephagenesis

Autoren: Kang Ren, Yiqing Zhao, Guo-Qiang Chen, Xiang Ao, Qiong Wu
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 13, 2024, Seite(n) 61-67, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00622

Synthetic Biology─High Time to Deliver?

Autoren: Andrew D. Hanson, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 12, 2023, Seite(n) 1579-1582, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00238

Rapid depolymerization of poly(ethylene terephthalate) thin films by a dual-enzyme system and its impact on material properties

Autoren: Natalia A. Tarazona, Ren Wei, Stefan Brott, Lara Pfaff, Uwe T. Bornscheuer, Andreas Lendlein, Rainhard Machatschek
Veröffentlicht in: Chem Catalysis, 2022, ISSN 2667-1093
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.checat.2022.11.004

When microbial biotechnology meets material engineering

Autoren: Ana M. Hernandez-Arriaga, Cristina Campano, Virginia Rivero-Buceta and M. Auxiliadora Prieto
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, Ausgabe 2021, 2021, Seite(n) 1-15, ISSN 1751-7915
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd and Society for Applied Microbiology
DOI: 10.1111/1751-7915.13975

Synthetic biology enabling a shift from domination to partnership with natural space

Autoren: Víctor de Lorenzo, Miguel de la Ossa
Veröffentlicht in: Journal of Chinese Architecture and Urbanism, Ausgabe 5, 2023, Seite(n) 0619, ISSN 2717-5626
Herausgeber: John Wiley
DOI: 10.36922/jcau.0619

Towards robust Pseudomonas cell factories to harbour novel biosynthetic pathways

Autoren: Nora Lisa Bitzenhofer, Luzie Kruse, Stephan Thies, Benedikt Wynands, Thorsten Lechtenberg, Jakob Rönitz, Ekaterina Kozaeva, Nicolas Thilo Wirth, Christian Eberlein, Karl-Erich Jaeger, Pablo Iván Nikel, Hermann J. Heipieper, Nick Wierckx, Anita Loeschcke
Veröffentlicht in: Essays in Biochemistry, Ausgabe 65, 2021, Seite(n) 319-336, ISSN 0071-1365
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/ebc20200173

Standardization of regulatory nodes for engineering heterologous gene expression:a feasibility study

Autoren: Pablo I. Nikel; Ilaria Benedetti; Nicolas T. Wirth; Víctor de Lorenzo; Belén Calles
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, 2022, ISSN 1751-7915
Herausgeber: Applied Microbiology and John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1111/1751-7915.14063

Mechanism-Based Design of Efficient PET Hydrolases

Autoren: Ren Wei, Gerlis von Haugwitz, Lara Pfaff, Jan Mican, Christoffel P. S. Badenhorst, Weidong Liu, Gert Weber, Harry P. Austin, David Bednar, Jiri Damborsky, Uwe T. Bornscheuer
Veröffentlicht in: ACS Catalysis, 2022, ISSN 2155-5435
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.1c05856

Unraveling 1,4-Butanediol Metabolism in Pseudomonas putida KT2440

Autoren: Li, Wing Jin; Narancic, Tanja; Kenny, Shane T.; Niehoff, Paul-Joachim; O’Connor, Kevin; Blank, Lars M.; Wierckx, Nick
Veröffentlicht in: Frontiers in Microbiology, Ausgabe 19, 2020, ISSN 1664-302X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.18154/rwth-2020-05721

Automated design and implementation of a NOR gate in Pseudomonas putida

Autoren: Huseyin Tas, Lewis Grozinger, Angel Goñi-Moreno, Victor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Synthetic Biology, Ausgabe Volume 6, Ausgabe 1, 2021, ISSN 2397-7000
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/synbio/ysab024

A self-stimulating system based on a polyhydroxyalkanoates coupled induction mechanism and its applications for Halomonas

Autoren: Shuang Zheng, Zonghao Zhang, Peng Jiang, Jiale Wang, Yifei Zheng, Kang Ren, Lizhan Zhang, Xu Yan, Xu Liu, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Chemical Engineering Journal, Ausgabe 489, 2024, Seite(n) 151413, ISSN 1385-8947
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cej.2024.151413

Bio-upcycling of even and uneven medium-chain-length diols and dicarboxylates to polyhydroxyalkanoates using engineered Pseudomonas putida

Autoren: Yannic S. Ackermann, Jan de Witt, Mariela P. Mezzina, Christoph Schroth, Tino Polen, Pablo I. Nikel, Benedikt Wynands and Nick Wierckx
Veröffentlicht in: Microbial Cell Factories, Ausgabe 23, 2024, Seite(n) 54, ISSN 1475-2859
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12934-024-02310-7

Recent Advances in Bioplastics: Application and Biodegradation

Autoren: Tanja Narancic, Federico Cerrone, Niall Beagan, Kevin E. O’Connor
Veröffentlicht in: Polymers, Ausgabe 12/4, 2020, Seite(n) 920, ISSN 2073-4360
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/polym12040920

Biodegradation of low-density polyethylene by Microbulbifer hydrolyticus IRE-31

Autoren: Zhongyu Li, Ren Wei, Meixi Gao, Yanru Ren, Bo Yu, Kaili Nie, Haijun Xu, Luo Liu
Veröffentlicht in: Journal of Environmental Management, Ausgabe 263, 2020, Seite(n) 110402, ISSN 0301-4797
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jenvman.2020.110402

Thermophilic whole‐cell degradation of polyethylene terephthalate using engineered Clostridium thermocellum

Autoren: Fei Yan, Ren Wei, Qiu Cui, Uwe T. Bornscheuer, Ya‐Jun Liu
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, 2020, ISSN 1751-7915
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd
DOI: 10.1111/1751-7915.13580

Impact of the number of rhamnose moieties of rhamnolipids on the structure, lateral organization and morphology of model biomembranes

Autoren: Marius Herzog; Lei Li; Christian C. Blesken; Gina Welsing; Till Tiso; Lars M. Blank; Roland Winter
Veröffentlicht in: Soft Matter, Ausgabe 4, 2021, Seite(n) 3191-3206, ISSN 1744-683X
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.18154/rwth-2021-04514

Construction and comparison of synthetic microbial consortium system (SMCs) by non-living or living materials immobilization and application in acetochlor degradation

Autoren: Jingyuan Liu, Xiaoli Zhou, Tong Wang, Lingling Fan, Shixun Liu, Nan Wu, Anming Xu, Xiujuan Qian, Zhoukun Li, Min Jiang, Jie Zhou, Weiliang Dong
Veröffentlicht in: Journal of Hazardous Materials, 2022, ISSN 0304-3894
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhazmat.2022.129460

Chemical recycling of bioplastics: technical opportunities to preserve chemical functionality as path towards a circular economy

Autoren: Merchan AL, Fischöder T, Hee J, Lehnertz MS, Osterthun O, Pielsticker S, Schleier J, Tiso T, Blank LM, Klankermayer J, Kneer R, Quicker P, Walther G, Palkovits R
Veröffentlicht in: Green Chemistry, 2022, ISSN 1463-9262
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2gc02244c

Biocatalysis in the Recycling Landscape for Synthetic Polymers and Plastics towards Circular Textiles

Autoren: Christina Jönsson, Ren Wei, Antonino Biundo, Johan Landberg, Lisa Schwarz Bour, Fabio Pezzotti, Andreea Toca, Les M. Jacques, Uwe T. Bornscheuer, Per‐Olof Syrén
Veröffentlicht in: ChemSusChem, 2021, ISSN 1864-5631
Herausgeber: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/cssc.202002666

Foam control in biotechnological processes—challenges and opportunities

Autoren: Till Tiso, Philipp Demling, Tobias Karmainski, Amira Oraby, Jens Eiken, Luo Liu, Patrick Bongartz, Matthias Wessling, Peter Desmond, Simone Schmitz, Sophie Weiser, Frank Emde, Hannah Czech, Juliane Merz, Susanne Zibek, Lars M. Blank, Lars Regestein
Veröffentlicht in: Discover Chemical Engineering, Ausgabe 4, 2024, ISSN 2730-7700
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s43938-023-00039-0

Flexibility Regulation of Loops Surrounding the Tunnel Entrance in Cytochrome P450 Enhanced Substrate Access Substantially

Autoren: Zhongyu Li, Shuaiqi Meng, Kaili Nie, Ulrich Schwaneberg, Mehdi D. Davari, Haijun Xu, Yu Ji, and Luo Liu
Veröffentlicht in: ACS Catalysis, Ausgabe 21555435, 2022, ISSN 2155-5435
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.2c02258

Thermal and ultrasound foam control in biotechnology: a mini-review

Autoren: Shahin Shah Khan; Irfan Ullah; Qingyun Wang; Haijun Xu; Till Tiso; Lars M. Blank; Luo Liu
Veröffentlicht in: Discover Chemical Engineering, 2022, ISSN 2730-7700
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s43938-022-00016-z

Aromatic thermoplastic polyurethanes synthesized from different potential sustainable resources

Autoren: Agathe Mouren, Luc Avérous
Veröffentlicht in: European Polymer Journal, Ausgabe 197, 2023, Seite(n) 112338, ISSN 0014-3057
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.eurpolymj.2023.112338

Effective Production of Poly(3-hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate) by Engineered Halomonas bluephagenesis Grown on Glucose and 1,4-Butanediol

Autoren: Lizhan Zhang, Jian-Wen Ye,Xu Zhang, Wuzhe Huang, Zhongnan Zhang, Yina Lin, Ge Zhang, Fuqing Wu, Ziyu Wang, Qiong Wu, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Bioresource Technology, Ausgabe 2022-06, 2022, ISSN 1873-2976
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.biortech.2022.127270

Tunnel engineering for modulating the substrate preference in cytochrome P450BsβHI

Autoren: Shuaiqi Meng, Ruipeng An, Zhongyu Li, Ulrich Schwaneberg, Yu Ji, Mehdi D. Davari, Fang Wang, Meng Wang, Meng Qin, Kaili Nie, Luo Liu
Veröffentlicht in: Bioresources and Bioprocessing, Ausgabe 8, 2021, ISSN 2197-4365
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1186/s40643-021-00379-1

Biosensor and chemo-enzymatic one-pot cascade applications to detect and transform PET-derived terephthalic acid in living cells

Autoren: Thomas Bayer, Lara Pfaff, Yannick Branson, Aileen Becker, Shuke Wu, Uwe T.Bornscheuer, Ren Wei
Veröffentlicht in: iScience, 2022, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.isci.2022.104326

SEVA 4.0: an update of the Standard European Vector Architecture database for advanced analysis and programming of bacterial phenotypes

Autoren: Esteban Martínez-García, Sofía Fraile, Elena Algar, Tomás Aparicio, Elena Velázquez, Belén Calles, Huseyin Tas, Blas Blázquez, Bruno Martín, Clara Prieto, Lucas Sánchez-Sampedro, Morten H H Nørholm, Daniel C Volke, Nicolas T Wirth, Pavel Dvořák, Lorea Alejaldre, Lewis Grozinger, Matthew Crowther, Angel Goñi-Moreno, Pablo I Nikel, Juan Nogales, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 51(D1), 2023, Seite(n) D1558-D1567, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac1059

Flux optimization using multiple promoters in Halomonas bluephagenesis as a model chassis of the next generation industrial biotechnology

Autoren: Yueyuan Ma, Jian-Wen Ye, Yina Lin, Xueqing Yi, Xuan Wang, Huan Wang, Ruiyan Huang, Fuqing Wu, Qiong Wu, Xu Liu, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, Ausgabe 81, 2024, Seite(n) 249-261, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2023.12.011

Recent advances in the improvement of bi-directional electron transfer between abiotic/biotic interfaces in electron-assisted biosynthesis system

Autoren: Bin Xu, Zhe Li, Yujia Jiang, Minjiao Chen, Boryann Chen, Fengxue Xin, Weiliang Dong, Min Jiang
Veröffentlicht in: Biotechnology Advances, 2021, Seite(n) 107810, ISSN 0734-9750
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biotechadv.2021.107810

Engineering and evaluation of thermostable IsPETase variants for PET degradation

Autoren: Stefan Brott, Lara Pfaff, Josephine Schuricht, Jan-Niklas Schwarz, Dominique Böttcher, Christoffel P. S. Badenhorst, Ren Wei, Uwe T. Bornscheuer
Veröffentlicht in: Engineering in Life Sciences, 2021, ISSN 1618-2863
Herausgeber: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.1002/elsc.202100105

Biosynthesis of diverse α,ω-diol-derived polyhydroxyalkanoates by engineered Halomonas bluephagenesis

Autoren: Xu Yan, Xu Liu, Lin-Ping Yu, Fuqing Wu, Xirao-Ran Jiang, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, Ausgabe 2022-07, 2022, Seite(n) 275-288, ISSN 1096-7184
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.ymben.2022.04.001

Recent advances in biocatalysts engineering for polyethylene terephthalate plastic waste green recycling

Autoren: Nadia A. Samak, Yunpu Jia, Moustafa M. Sharshar, Tingzhen Mu, Maohua Yang, Sumit Peh, Jianmin Xing
Veröffentlicht in: Environment International, Ausgabe 145, 2020, Seite(n) 106144, ISSN 0160-4120
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.envint.2020.106144

Biodegradation and up-cycling of polyurethanes: Progress, challenges, and prospects

Autoren: Jiawei Liu, Jie He, Rui Xue, Bin Xu, Xiujuan Qian, Fengxue Xin, Lars M. Blank, Jie Zhou, Ren Wei, Weiliang Dong, Min Jiang
Veröffentlicht in: Biotechnology Advances, Ausgabe 48, 2021, Seite(n) 107730, ISSN 0734-9750
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biotechadv.2021.107730

Current progress on the biodegradation of synthetic plastics: from fundamentals to biotechnological applications.

Autoren: Andler R, Tiso T, Blank L, Andreeßen C, Zampolli J, D’Afonseca V, Guajardo C, Díaz-Barrera A
Veröffentlicht in: Reviews in Environmental Science and Bio/Technology, 2022, ISSN 1572-9826
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s11157-022-09631-2

Engineering adipic acid metabolism in Pseudomonas putida

Autoren: Yannic S. Ackermann, Wing-Jin Li, Leonie Op de Hipt, Paul-Joachim Niehoff, William Casey, Tino Polen, Sebastian Köbbing, Hendrik Ballerstedt, Benedikt Wynands, Kevin O'Connor, Lars M. Blank, Nick Wierckx
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, Ausgabe 67, 2021, Seite(n) 29-40, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2021.05.001

The Wsp intermembrane complex mediates metabolic control of the swim‐attach decision of Pseudomonas putida

Autoren: Ángeles Hueso‐Gil, Belén Calles, Víctor Lorenzo
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 22/8, 2020, Seite(n) 3535-3547, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15126

Future focuses of enzymatic plastic degradation

Autoren: Anming Xu, Jie Zhou, Lars M. Blank, Min Jiang
Veröffentlicht in: Trends in Microbiology, Ausgabe 31, 2023, Seite(n) 668-671, ISSN 0966-842X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tim.2023.04.002

Feasible Cluster Model Method for Simulating the Redox Potentials of Laccase CueO and Its Variant

Autoren: Qixuan Jiang, Ziheng Cui, Ren Wei, Kaili Nie, Haijun Xu, Luo Liu
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2022, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fbioe.2022.957694

Recombinant protein production in the filamentous fungus Trichoderma

Autoren: Huiling Wei, Mengyue Wu, Aili Fan, Haijia Su
Veröffentlicht in: Chinese Journal of Chemical Engineering, 2020, ISSN 1004-9541
Herausgeber: Chemical Industry Press
DOI: 10.1016/j.cjche.2020.11.006

Comparative Analysis of the Behaviour of Marine Litter in Thermochemical Waste Treatment Processes

Autoren: Johann Hee, Kai Schlögel, Simone Lechthaler, Jacqueline Plaster, Kristina Bitter, Lars Mathias Blank, Peter Quicker
Veröffentlicht in: Processes, Ausgabe 9/1, 2021, Seite(n) 13, ISSN 2227-9717
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/pr9010013

An automated DIY framework for experimental evolution of Pseudomonas putida

Autoren: David R. Espeso, Pavel Dvořák, Tomás Aparicio, Víctor Lorenzo
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, 2020, Seite(n) 1-7, ISSN 1751-7915
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd and Society for Applied Microbiology
DOI: 10.1111/1751-7915.13678

Multiple Substrate Binding Mode-Guided Engineering of a Thermophilic PET Hydrolase

Autoren: Lara Pfaff; Jian Gao; Zhishuai Li; Anna Jäckering; Gert Weber; Jan Mican; Yinping Chen; Weiliang Dong; Xu Han; Christian G. Feiler; Yu-Fei Ao; Christoffel P. S. Badenhorst; David Bednar; Gottfried J. Palm; Michael Lammers; Jiri Damborsky; Birgit Strodel; Weidong Liu; Uwe T. Bornscheuer; Ren Wei
Veröffentlicht in: ACS Catalysis, 2022, ISSN 2155-5435
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.2c02275

Granulation enhancement and microbial community shift of tylosin-tolerant aerobic granular sludge on the treatment of tylosin wastewater

Autoren: Wei Xiong, Shaojie Wang, Nan Zhou, Yingyun Chen, Haijia Su
Veröffentlicht in: Bioresource Technology, Ausgabe 318, 2020, Seite(n) 124041, ISSN 0960-8524
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biortech.2020.124041

Picking the right metaphors for addressing microbial systems: economic theory helps understanding biological complexity

Autoren: Juhyun Kim, Rafael Silva-Rocha, Víctor de Lorenzo
Veröffentlicht in: International Microbiology, 2021, ISSN 1139-6709
Herausgeber: Sociedad Espanola de Microbiologia
DOI: 10.1007/s10123-021-00194-w

Grand Challenges for Industrializing Polyhydroxyalkanoates (PHAs)

Autoren: Dan Tan, Ying Wang, Yi Tong, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Trends in Biotechnology, Ausgabe 39/9, 2021, Seite(n) 953-963, ISSN 0167-7799
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2020.11.010

Rapid Quantification of Polyhydroxyalkanoates Accumulated in Living Cells Based on Green Fluorescence Protein-Labeled Phasins: The qPHA Method

Autoren: Xu Liu, Dianjie Li, Xu Yan, Zonghao Zhang, Shuang Zheng, Jingpeng Zhang, Wuzhe Huang, Fuqing Wu, Fangting Li, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Biomacromolecules, Ausgabe 2022-10-10, 2022, Seite(n) 4153-4166, ISSN 1526-4602
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.2c00624

Transcriptional control of 2,4‐dinitrotoluene degradation in Burkholderia sp . R34 bears a regulatory patch that eases pathway evolution

Autoren: Danilo Pérez‐Pantoja, Pablo I. Nikel, Max Chavarría, Víctor Lorenzo
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 23/5, 2021, Seite(n) 2522-2531, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15472

Recent Advances in Yeast Recombinant Biosynthesis of the Triterpenoid Protopanaxadiol and Glycosylated Derivatives Thereof

Autoren: Shangkun Qiu, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Journal of Agricultural and Food Chemistry, Ausgabe 71, 2023, Seite(n) 2197-2210, ISSN 0021-8561
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jafc.2c06888

Applications of synthetic biology in medical and pharmaceutical fields

Autoren: Xu Yan, Xu Liu, Cuihuan Zhao, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Signal Transduction and Targeted Therapy, Ausgabe 8, 2023, Seite(n) 268-2670, ISSN 2059-3635
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41392-023-01440-5

Directed Evolution of Material Binding Peptide for Polylactic Acid-specific Degradation in Mixed Plastic Wastes

Autoren: Yi Lu, Kai-Wolfgang Hintzen, Tetiana Kurkina, Yu Ji, Ulrich Schwaneberg
Veröffentlicht in: ACS Catalysis, Ausgabe 13, 2023, Seite(n) 12746-12754, ISSN 2155-5435
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.3c02142

Seawater activated TiO2 photocatalyst for degradation of organic compounds

Autoren: Max-Fabian Volhard, Jonas Johannes Christ, Lars Mathias Blank, Thomas Jüstel
Veröffentlicht in: Sustainable Chemistry and Pharmacy, Ausgabe 16, 2020, Seite(n) 100251, ISSN 2352-5541
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.scp.2020.100251

The four Fs of the knowledge-based BioEconomy – A homage to Christian Patermann

Autoren: Victor De Lorenzo
Veröffentlicht in: EFB Bioeconomy Journal, 2022, ISSN 2667-0410
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bioeco.2022.100035

PHB production from food waste hydrolysates by Halomonas bluephagenesis Harboring PHB operon linked with an essential gene

Autoren: Mengke Ji, Taoran Zheng, Ziyu Wang, Weijian Lai, Lizhan Zhang, Qianyi Zhang, Hongyi Yang, Si Meng, Wanghui Xu, Cuihuan Zhao, Qiong Wu, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, 2023, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2023.03.003

Hyperproduction of PHA copolymers containing high fractions of 4‐hydroxybutyrate (4HB) by outer membrane‐defected Halomonas bluephagenesis grown in bioreactors

Autoren: Ziyu Wang; Yifei Zheng; Mengke Ji; Xu Zhang; Huan Wang; Yuemeng Chen; Qiong Wu; Guo‐Qiang Chen
Veröffentlicht in: Microbial Biotechnology, Ausgabe 2022-05, 2022, Seite(n) 1586-1597, ISSN 1751-7907
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1751-7915.13999

Engineering the permeability of Halomonas bluephagenesis enhanced its chassis properties

Autoren: Ziyu Wang, Qin Qin, Yifei Zheng, Fajin Li, Yiqing Zhao, Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Metabolic Engineering, Ausgabe 67, 2021, Seite(n) 53-66, ISSN 1096-7176
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2021.05.010

Hyperproduction of 3-hydroxypropionate by Halomonas bluephagenesis

Autoren: Xiao-Ran Jiang; Xiao-Ran Jiang; Xu Yan; Lin-Ping Yu; Xin-Yi Liu; Guo-Qiang Chen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2021, Seite(n) 1531, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21632-3

Golden Standard: A complete standard, portable, and interoperative MoClo tool for model and non-model bacterial hosts

Autoren: Blas Blázquez, Jesús Torres-Bacete, David San Leon, Ryan Kniewel, Igor Martinez, Sandra Sordon, Aleksandra Wilczak, Sergio Salgado, Ewa Huszcza, Jarosław Popłoński, M Auxiliadora Prieto, Juan Nogales
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2022, Seite(n) 508659, ISSN 2692-8205
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.09.20.508659

Cyanamide as a Highly Efficient Organocatalyst for the Glycolysis Recycling of PET

Autoren: Zishuai Wang, Yu Jin, Yaoqiang Wang, Zequn Tang, Shaojie Wang, Gang Xiao, Haijia Su
Veröffentlicht in: ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 2023, Seite(n) 7965−7973, ISSN 2168-0485
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssuschemeng.2c01235

High-Efficiency Multi-site Genomic Editing (HEMSE) Made Easy.

Autoren: Tomás Aparicio, Víctor de Lorenzo, Esteban Martínez-García
Veröffentlicht in: MIMB,volume 2479, Ausgabe 2479, 2022, Seite(n) 37-52, ISBN 978-1-0716-2233-9
Herausgeber: Humana, New York,
DOI: 10.1007/978-1-0716-2233-9_4

Großartige Winzlinge - Mikroben sind die heimlichen Herrscher der Welt. Und wir können sie für vieles nutzen.

Autoren: Magdalena Hamm, Susan Schädlich, Anja Garms, Michael Stang
Veröffentlicht in: Das Magazin für neugierige Forscher, Ausgabe "#1, April 2020", 2020, Seite(n) 2-5
Herausgeber: Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)

Waste to plastics by enzymes and bacteria - From plastic waste to PHA using enzymes and the bacterium P. putida

Autoren: MT
Veröffentlicht in: bioplastics MAGAZINE, Ausgabe 02/20 Vol. 15, 2020, Seite(n) 22-24
Herausgeber: Polymedia Publisher GmbH

Converting petrochemical plastic to biodegradable plastic

Autoren: Narancic T., Wierckx N., Liu S., O'Connor K.E.
Veröffentlicht in: The Handbook of Polyhydroxyalkanoates – Microbial biosynthesis and feedstocks, 2020, ISBN 9780429296611
Herausgeber: CRC press, Taylor & Francis Group

Microbes and Plastic – A Sustainable Duo for the Future

Autoren: Birger Wolter, Henric M.T. Hintzen, Gina Welsing, Till Tiso, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Good Microbes in Medicine, Food Production, Biotechnology, Bioremediation, and Agriculture, Ausgabe one time book publication, 2022, Seite(n) 294-311, ISBN 9781119762621
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd
DOI: 10.1002/9781119762621.ch24

Fluorimetric high-throughput screening method for polyester hydrolase activity using polyethylene terephthalate nanoparticles

Autoren: Lara Pfaff, Daniel Breite, Christoffel P.S. Badenhorst, Uwe T. Bornscheuer, Ren Wei
Veröffentlicht in: Enzymatic Plastic Degradation, Ausgabe 648, 2021, Seite(n) 253-270, ISSN 0076-6879
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/bs.mie.2020.11.003

Anchor peptides promote degradation of mixed plastics for recycling

Autoren: Yu Ji, Yi Lu, Hendrik Puetz, Ulrich Schwaneberg
Veröffentlicht in: Enzymatic Plastic Degradation, Ausgabe 648, 2021, Seite(n) 271-292, ISBN 9780128220122
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.mie.2020.12.027

Upcycling of hydrolyzed PET by microbial conversion to a fatty acid derivative

Autoren: Gina Welsing, Birger Wolter, Henric M.T. Hintzen, Till Tiso, Lars M. Blank
Veröffentlicht in: Enzymatic Plastic Degradation, Ausgabe 648, 2021, Seite(n) 391-421, ISBN 9780128220122
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.mie.2020.12.025

Biotechnological approach for polyurethane recycling: Separation of diamines from by-products via liquid-liquid extractio

Autoren: Eberz, J., Doeker, M. and Jupke, A.
Veröffentlicht in: Chemie Ingenieur Technik, Ausgabe 11, 2022, Seite(n) 1351 - 1351, ISSN 1522-2640
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/cite.202255341

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