Description du projet
Application de la génomique à la production bovine
Il est bien établi que les modifications épigénétiques sont impliquées dans la régulation de l’expression génique. Cependant, les associations entre ces modifications et les phénotypes complexes sont mal comprises. Le projet BovReg, financé par l’UE, souhaite comprendre comment la variation épigénétique chez les bovins se traduit par des phénotypes commercialement importants. Le projet rassemble des chercheurs de différentes régions du monde pour générer des données génomiques fonctionnelles liées à la robustesse, à la santé et à l’efficacité biologique des bovins. Les outils de prévision permettront de sélectionner les populations de bovins, de maintenir le bien-être animal et de soutenir une sélection de précision pour une production bovine efficace.
Objectif
Despite the revolution in functional genome analysis a wide gap in understanding associations between the (epi)genome and complex phenotypes of interest currently remains and impedes efficient use of annotated genomes for precision breeding. The BovReg consortium will provide a comprehensive map of functionally active genomic features in cattle and how their (epi)genetic variation in beef and dairy breeds translates into phenotypes. This constitutes key knowledge for biology-driven genomic prediction needed by scientific and industry livestock communities. The BovReg brings together a critical mass of experts in ruminant research and beyond encompassing bioinformatics, molecular and quantitative genetics, animal breeding, reproductive physiology, ethics and social science. Our 20 partners from the EU, Canada and Australia form a global interdisciplinary team, which builds on previous and running national and EU-funded projects and many established industry cooperations. In BovReg we will generate functional genome data based on FAANG core assays from representative bovine tissues and newly established cell lines covering different ontological stages and phenotypes applying novel bioinformatic pipelines. We will establish detailed knowledge on traits related to robustness, health and biological efficiency in cattle. Data, knowledge and protocols will be deposited in European biological archives, aiming to set up and maintain a knowledge hub and establish gold standards. Long-term availability of data and targeted dissemination and communication activities are guaranteed by EMBL-EBI, FAANG and EAAP. Our biology-driven genomic prediction tools will integrate biological knowledge on regulatory genomic variation into genomic selection schemes for local and global cattle populations. This improved knowledge will be useful for re-focussing cattle production, fully taking into account societal awareness, environmental and animal-welfare aspects and bio-efficiency.
Champ scientifique
Programme(s)
- H2020-EU.3.2. - SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy Main Programme
- H2020-EU.3.2.1.1. - Increasing production efficiency and coping with climate change, while ensuring sustainability and resilience
- H2020-EU.3.2.3.1. - Developing sustainable and environmentally-friendly fisheries
Régime de financement
RIA - Research and Innovation actionCoordinateur
18196 Dummerstorf
Allemagne
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Participants (20)
Entité juridique établie dans un pays tiers non associé qui n’est pas éligible au financement en vertu de l’article 10 du Règlement (UE) No 51290/2013 établissant les règles de participation et de diffusion à Horizon 2020.
3000 Melbourne
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08003 Barcelona
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75007 Paris
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4102 Seraing
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
4000 Liege
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8092 Zuerich
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6708 PB Wageningen
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8000 Aarhus C
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00790 Helsinki
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05-552 MAGDALENKA
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3584 CS Utrecht
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69117 Heidelberg
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00161 Roma
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T5J 4P6 EDMONTON ALBERTA
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EH8 9YL Edinburgh
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Participation terminée
6108 Halle
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87032 Limoges
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1300-477 Lisboa
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IV51 9YD ISLE OF SKYE
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
30559 Hannover
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