Molecular mechanisms, evolutionary impacts and applications of prokaryotic epigenetic-targeted immune systems

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Publications

ENDO-Pore: high-throughput linked-end mapping of single DNA cleavage events using nanopore sequencing

Auteurs: Oscar E Torres Montaguth, Stephen J Cross, Kincaid W A Ingram, Laura Lee, Fiona M Diffin, Mark D Szczelkun
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab727

Bacteriostatic antibiotics promote CRISPR-Cas adaptive immunity by enabling increased spacer acquisition

Auteurs: Tatiana Dimitriu, Elena Kurilovich, Urszula Łapińska, Konstantin Severinov, Stefano Pagliara, Mark D Szczelkun, Edze R Westra
Publié dans: Cell Host Microbe, 2021, ISSN 1931-3128
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2021.11.014

5′ modifications to CRISPR–Cas9 gRNA can change the dynamics and size of R-loops and inhibit DNA cleavage

Auteurs: Grace Mullally, Kara van Aelst, Mohsin M Naqvi, Fiona M Diffin, Tautvydas Karvelis, Giedrius Gasiunas, Virginijus Siksnys, Mark D Szczelkun
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 48/12, 2020, Page(s) 6811-6823, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa477

CRISPR–Cas12a-mediated DNA clamping triggers target-strand cleavage

Auteurs: Mohsin M. Naqvi, Laura Lee, Oscar E. Torres Montaguth, Fiona M. Diffin, Mark D. Szczelkun
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro 18, 2022, Page(s) 1014–1022, ISSN 1552-4469
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41589-022-01082-8

The Effect of DNA Topology on Observed Rates of R-Loop Formation and DNA Strand Cleavage by CRISPR Cas12a

Auteurs: Kara van Aelst, Carlos Martínez-Santiago, Stephen Cross, Mark Szczelkun
Publié dans: Genes, Numéro 10/2, 2019, Page(s) 169, ISSN 2073-4425
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes10020169

Hexameric assembly of the AAA+ protein McrB is necessary for GTPase activity

Auteurs: Neha Nirwan, Pratima Singh, Gyana Gourab Mishra, Christopher M Johnson, Mark D Szczelkun, Katsuaki Inoue, Kutti R Vinothkumar, Kayarat Saikrishnan
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 47, 2022, Page(s) 868-882, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky1170

The bacterial defense system MADS interacts with CRISPR-Cas to limit phage infection and escape

Auteurs: Alice Maestri, Benoit J. Pons, Elizabeth Pursey, Charlotte E. Chong, Sylvain Gandon, Rafael Custodio, Anna Olina, Aleksei Agapov, Matthew A.W. Chisnall, Anita Grasso, Steve Paterson, Mark D. Szczelkun, Kate S. Baker, Stineke van Houte, Anne Chevallereau, Edze R. Westra
Publié dans: Cell Host & Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.07.005

Short-range translocation by a restriction enzyme motor triggers diffusion along DNA

Auteurs: Martin Göse, Emma E. Magill, Alex Hughes-Games, Steven J. Shaw, Fiona M. Diffin, Tara Rawson, Zsofia Nagy, Ralf Seidel, Mark D. Szczelkun
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro 20, 2024, Page(s) 689-698, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01504-1

Evolutionary Ecology and Interplay of Prokaryotic Innate and Adaptive Immune Systems

Auteurs: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Publié dans: Current Biology, Numéro 30/19, 2020, Page(s) R1189-R1202, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.08.028

Various plasmid strategies limit the effect of bacterial Restriction-Modification systems against conjugation

Auteurs: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Publié dans: bioRXiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.17.599295

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