Molecular mechanisms, evolutionary impacts and applications of prokaryotic epigenetic-targeted immune systems

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Veröffentlichungen

ENDO-Pore: high-throughput linked-end mapping of single DNA cleavage events using nanopore sequencing

Autoren: Oscar E Torres Montaguth, Stephen J Cross, Kincaid W A Ingram, Laura Lee, Fiona M Diffin, Mark D Szczelkun
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab727

Bacteriostatic antibiotics promote CRISPR-Cas adaptive immunity by enabling increased spacer acquisition

Autoren: Tatiana Dimitriu, Elena Kurilovich, Urszula Łapińska, Konstantin Severinov, Stefano Pagliara, Mark D Szczelkun, Edze R Westra
Veröffentlicht in: Cell Host Microbe, 2021, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2021.11.014

5′ modifications to CRISPR–Cas9 gRNA can change the dynamics and size of R-loops and inhibit DNA cleavage

Autoren: Grace Mullally, Kara van Aelst, Mohsin M Naqvi, Fiona M Diffin, Tautvydas Karvelis, Giedrius Gasiunas, Virginijus Siksnys, Mark D Szczelkun
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 48/12, 2020, Seite(n) 6811-6823, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa477

CRISPR–Cas12a-mediated DNA clamping triggers target-strand cleavage

Autoren: Mohsin M. Naqvi, Laura Lee, Oscar E. Torres Montaguth, Fiona M. Diffin, Mark D. Szczelkun
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology, Ausgabe 18, 2022, Seite(n) 1014–1022, ISSN 1552-4469
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41589-022-01082-8

The Effect of DNA Topology on Observed Rates of R-Loop Formation and DNA Strand Cleavage by CRISPR Cas12a

Autoren: Kara van Aelst, Carlos Martínez-Santiago, Stephen Cross, Mark Szczelkun
Veröffentlicht in: Genes, Ausgabe 10/2, 2019, Seite(n) 169, ISSN 2073-4425
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes10020169

The bacterial defense system MADS interacts with CRISPR-Cas to limit phage infection and escape

Autoren: Alice Maestri, Benoit J. Pons, Elizabeth Pursey, Charlotte E. Chong, Sylvain Gandon, Rafael Custodio, Anna Olina, Aleksei Agapov, Matthew A.W. Chisnall, Anita Grasso, Steve Paterson, Mark D. Szczelkun, Kate S. Baker, Stineke van Houte, Anne Chevallereau, Edze R. Westra
Veröffentlicht in: Cell Host & Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.07.005

Short-range translocation by a restriction enzyme motor triggers diffusion along DNA

Autoren: Martin Göse, Emma E. Magill, Alex Hughes-Games, Steven J. Shaw, Fiona M. Diffin, Tara Rawson, Zsofia Nagy, Ralf Seidel, Mark D. Szczelkun
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology, Ausgabe 20, 2024, Seite(n) 689-698, ISSN 1552-4450
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01504-1

Evolutionary Ecology and Interplay of Prokaryotic Innate and Adaptive Immune Systems

Autoren: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 30/19, 2020, Seite(n) R1189-R1202, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.08.028

Various plasmid strategies limit the effect of bacterial Restriction-Modification systems against conjugation

Autoren: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Veröffentlicht in: bioRXiv, 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.17.599295

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