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Certifications for biosafety, GMO manipulation, animal experimentation

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Publications

Cecembia

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Egas Conceiçao; Froufe Hugo; Raposo Pedro; Da Costa, S, Milton
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 6, 2018
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458277

Albidovulum

Auteurs: Albuquerque Luciana; Froufre Hugo; Conceiçao Egas; Rainy Fred; Da Costa, S
Publié dans: Whitman, WB (Ed), Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 9, 2018
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458176

Meiothermus

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 8, 2018
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458314

Pullulanibacillus

Auteurs: Albuquerque Luciana; Tiago Igor; Veríssimo António; Da Costa, S, Milton
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 9, 2019
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458514

Hydrotalea

Auteurs: Albuquerque Luciana; Egas Conceição; Froufe Hugo; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 7, 2019
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458512

Tepidicella

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Da Costa, S, Milton
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 6, 2019
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458506

Salirhabdus

Auteurs: Albuquerque Luciana; Igor, Tiago; António, Veríssimo; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 1, 2019
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458495

Gaiella

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 2, 2018
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458297

Aquicella

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey, Fred; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 13, 2018
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458275

Rubritepida

Auteurs: Albuquerque Luciana; Egas Conceiçao; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 11, 2019
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458332

Truepera

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 6, 2018
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458508

Tepidamorphus

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Da Costa, S
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 10, 2018
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458498

Eliorea

Auteurs: Da Costa, S; Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Froufe Hugo; Roxo Inês; Raposo Pedro; Egas Conceiçao
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, Numéro 2, 2019
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458286

Herminiimonas

Auteurs: Albuquerque Luciana; Rainey Fred; Da Costa, S, Milton
Publié dans: Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, 2019
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.3458306

Investigating host-microbiome interactions by droplet based microfluidics

Auteurs: Alexandra S. Tauzin, Mariana Rangel Pereira, Liisa D. Van Vliet, Pierre-Yves Colin, Elisabeth Laville, Jeremy Esque, Sandrine Laguerre, Bernard Henrissat, Nicolas Terrapon, Vincent Lombard, Marion Leclerc, Joël Doré, Florian Hollfelder, Gabrielle Potocki-Veronese
Publié dans: Microbiome, Numéro 8/1, 2020, ISSN 2049-2618
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1186/s40168-020-00911-z

A Modular Vector Toolkit with a Tailored Set of Thermosensors To Regulate Gene Expression in Thermus thermophilus

Auteurs: Carlos Verdú, Esther Sanchez, Carmen Ortega, Aurelio Hidalgo, José Berenguer, Mario Mencía
Publié dans: ACS Omega, Numéro 4/11, 2019, Page(s) 14626-14632, ISSN 2470-1343
Éditeur: American Chemical Society Publications (ACS Publications)
DOI: 10.1021/acsomega.9b02107

Investigating Host Microbiota Relationships Through Functional Metagenomics

Auteurs: Elisabeth Laville, Josette Perrier, Nada Bejar, Marc Maresca, Jeremy Esque, Alexandra S. Tauzin, Emna Bouhajja, Marion Leclerc, Elodie Drula, Bernard Henrissat, Stephane Berdah, Eric Di Pasquale, Patrick Robe, Gabrielle Potocki-Veronese
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 10, 2019, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.01286

Complete Genome Sequence of Mycolicibacterium hassiacum DSM 44199.

Auteurs: Alba Blesa; Eva Sacristán-Horcajada; José Berenguer; Mercedes Sánchez
Publié dans: Microbiology Resource Anouncements, Numéro 3, 2019, Page(s) e01522-18, ISSN 2576-098X
Éditeur: AMERICAN SOCIETY FOR MICROBIOLOGY
DOI: 10.1128/mra.01522-18

Developing robust protein analysis profiles to identify bacterial acid phosphatases in genomes and metagenomic libraries

Auteurs: Zulema Udaondo, Estrella Duque, Abdelali Daddaoua, Carlos Caselles, Amalia Roca, Paloma Pizarro‐Tobias, Juan L. Ramos
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 22/8, 2020, Page(s) 3561-3571, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15138

Novel Genes Involved in Resistance to Both Ultraviolet Radiation and Perchlorate From the Metagenomes of Hypersaline Environments

Auteurs: María Lamprecht-Grandío, Marta Cortesão, Salvador Mirete, Macarena Benguigui de la Cámara, Carolina G. de Figueras, Danilo Pérez-Pantoja, Joseph John White, María Eugenia Farías, Ramon Rosselló-Móra, José Eduardo González-Pastor
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 11, 2020, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.00453

Harvesting of Prebiotic Fructooligosaccharides by Nonbeneficial Human Gut Bacteria

Auteurs: Zhi Wang, Alexandra S. Tauzin, Elisabeth Laville, Pietro Tedesco, Fabien Létisse, Nicolas Terrapon, Pascale Lepercq, Myriam Mercade, Gabrielle Potocki-Veronese
Publié dans: mSphere, Numéro 5/1, 2020, ISSN 2379-5042
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msphere.00771-19

Effect of design geometry, exposure energy, cytophilic molecules, cell type and load in fabrication of single-cell arrays using micro-contact printing

Auteurs: Swapnil Vilas Bhujbal, Maren Dekov, Vegar Ottesen, Karen Dunker, Rahmi Lale, Marit Sletmoen
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-72080-w

In Vitro Synthesis and Crystallization of β-1,4-Mannan

Auteurs: Florent Grimaud, Sandra Pizzut-Serin, Laurence Tarquis, Simon Ladevèze, Sandrine Morel, Jean-Luc Putaux, Gabrielle Potocki-Veronese
Publié dans: Biomacromolecules, Numéro 20/2, 2018, Page(s) 846-853, ISSN 1525-7797
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.8b01457

Analysis of the diversity of the glycoside hydrolase family 130 in mammal gut microbiomes reveals a novel mannoside-phosphorylase function

Auteurs: Ao Li, Elisabeth Laville, Laurence Tarquis, Vincent Lombard, David Ropartz, Nicolas Terrapon, Bernard Henrissat, David Guieysse, Jeremy Esque, Julien Durand, Diego P. Morgavi, Gabrielle Potocki-Veronese
Publié dans: Microbial Genomics, Numéro 6/10, 2020, ISSN 2057-5858
Éditeur: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.000404

Use of photoswitchable fluorescent proteins for droplet-based microfluidic screening

Auteurs: Adilya Dagkesamanskaya, Krzysztof Langer, Alexandra S. Tauzin, Catherine Rouzeau, Delphine Lestrade, Gabrielle Potocki-Veronese, Laurent Boitard, Jérôme Bibette, Jean Baudry, Denis Pompon, Véronique Anton-Leberre
Publié dans: Journal of Microbiological Methods, Numéro 147, 2018, Page(s) 59-65, ISSN 0167-7012
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mimet.2018.03.001

Mechanisms and Regulation of Extracellular DNA Release and Its Biological Roles in Microbial Communities

Auteurs: Alejandra L. Ibáñez de Aldecoa, Olga Zafra, José E. González-Pastor
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 8, 2017, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2017.01390

Role of Archaeal HerA Protein in the Biology of the Bacterium Thermus thermophilus

Auteurs: Alba Blesa, Nieves Quintans, Ignacio Baquedano, Carlos Mata, José Castón, José Berenguer
Publié dans: Genes, Numéro 8/5, 2017, Page(s) 130, ISSN 2073-4425
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes8050130

Into the Thermus Mobilome: Presence, Diversity and Recent Activities of Insertion Sequences Across Thermus spp.

Auteurs: Alba Blesa, Mercedes Sánchez, Eva Sacristán-Horcajada, Sandra González-de la Fuente, Ramón Peiró, José Berenguer
Publié dans: Microorganisms, Numéro 7/1, 2019, Page(s) 25, ISSN 2076-2607
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms7010025

Raineya orbicola gen. nov., sp. nov. a slightly thermophilic bacterium of the phylum Bacteroidetes and the description of Raineyaceae fam. nov.

Auteurs: Luciana Albuquerque, Ana Rita M. Polónia, Cristina Barroso, Hugo J. C. Froufe, Olga Lage, Alexandre Lobo-da-Cunha, Conceição Egas, Milton S. da Costa
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Numéro 68/4, 2018, Page(s) 982-989, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.002556

Vibrio communities in scleractinian corals differ according to health status and geographic location in the Mediterranean Sea

Auteurs: Esther Rubio-Portillo, Juan F. Gago, Manuel Martínez-García, Luigi Vezzulli, Ramon Rosselló-Móra, Josefa Antón, Alfonso A. Ramos-Esplá
Publié dans: Systematic and Applied Microbiology, Numéro 41/2, 2018, Page(s) 131-138, ISSN 0723-2020
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.syapm.2017.11.007

Biogeographic Differences in the Microbiome and Pathobiome of the Coral Cladocora caespitosa in the Western Mediterranean Sea

Auteurs: Esther Rubio-Portillo, Diego K. Kersting, Cristina Linares, Alfonso A. Ramos-Esplá, Josefa Antón
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2018.00022

Discovery of carbamate degrading enzymes by functional metagenomics

Auteurs: Lisa Ufarté, Elisabeth Laville, Sophie Duquesne, Diego Morgavi, Patrick Robe, Christophe Klopp, Angeline Rizzo, Sandra Pizzut-Serin, Gabrielle Potocki-Veronese
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 12/12, 2017, Page(s) e0189201, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0189201

Hierarchical Control of Nitrite Respiration by Transcription Factors Encoded within Mobile Gene Clusters of Thermus thermophilus

Auteurs: Laura Alvarez, Nieves G. Quintáns, Alba Blesa, Ignacio Baquedano, Mario Mencía, Carlos Bricio, José Berenguer
Publié dans: Genes, Numéro 8/12, 2017, Page(s) 361, ISSN 2073-4425
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes8120361

Solimicrobium silvestre gen. nov., sp. nov., isolated from alpine forest soil

Auteurs: Rosa Margesin, Luciana Albuquerque, De-Chao Zhang, Hugo J. C. Froufe, Rita Severino, Inês Roxo, Conceição Egas, Milton S. da Costa
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Numéro 68/8, 2018, Page(s) 2491-2498, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.002861

Transfer of Meiothermus chliarophilus (Tenreiro et al.1995) Nobre et al. 1996, Meiothermus roseus Ming et al. 2016, Meiothermus terrae Yu et al. 2014 and Meiothermus timidus Pires et al. 2005, to Calidithermus gen. nov., as Calidithermus chliarophilus comb. nov., Calidithermus roseus comb. nov., Calidithermus terrae comb. nov. and Calidithermus timidus comb. nov., respectively, and emended descrip

Auteurs: Pedro Raposo, Tomeu Viver, Luciana Albuquerque, Hugo Froufe, Cristina Barroso, Conceição Egas, Ramon Rosselló-Móra, Milton S. da Costa
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Numéro 69/4, 2019, Page(s) 1060-1069, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.003270

High‐quality draft genome sequence of Gaiella occulta isolated from a 150 meter deep mineral water borehole and comparison with the genome sequences of other deep‐branching lineages of the phylum Actinobacteria

Auteurs: Rita Severino, Hugo J. C. Froufe, Cristina Barroso, Luciana Albuquerque, Alexandre Lobo‐da‐Cunha, Milton S. da Costa, Conceição Egas
Publié dans: MicrobiologyOpen, 2019, Page(s) e840, ISSN 2045-8827
Éditeur: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1002/mbo3.840

Are in vivo selections on the path to extinction?

Auteurs: Berenguer, José; Mencía, Mario; Hidalgo, Aurelio
Publié dans: Microbial Biotechnology, Numéro 1, 2017, Page(s) 46-49, ISSN 1751-7915
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/1751-7915.12490

Virulence as a Side Effect of Interspecies Interaction in Vibrio Coral Pathogens.

Auteurs: Josefa Antón; Andrés Mauricio Caraballo-Rodríguez; Forest Rohwer; Ana B. Martin-Cuadrado; Esther Rubio-Portillo; Esther Rubio-Portillo; Pieter C. Dorrestein
Publié dans: mBio, Numéro 1, 2020, ISSN 2150-7511
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.00201-20

Comparative genome sequence analysis of several species in the genus Tepidimonas and the description of a novel species Tepidimonas charontis sp. nov.

Auteurs: Luciana Albuquerque, Nadine Castelhano, Pedro Raposo, Hugo J. C. Froufe, Igor Tiago, Rita Severino, Inês Roxo, Inês Gregório, Cristina Barroso, Conceição Egas, Milton S. da Costa
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Numéro 70/3, 2020, Page(s) 1596-1604, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.003942

Análisis del Pangenoma de Pseudomonas putida

Auteurs: Udaondo Domínguez, Zulema
Publié dans: Numéro 1, 2016
Éditeur: Universidad de Granada

Droits de propriété intellectuelle

PLANT GROWTH PROMOTING MICROORGANISM AND ENZYMES FOR SOIL BIOGENIC CYCLES

Numéro de demande/publication: 18 382861
Date: 2018-11-28
Demandeur(s): BIOILIBERIS RESEARCH AND DEVELOPMENT SL

STRAINS CAPABLE OF PRODUCING PLANT GROWTH-STIMULATING COMPOUNDS

Numéro de demande/publication: 18 382933
Date: 2018-12-17
Demandeur(s): BIOILIBERIS RESEARCH AND DEVELOPMENT SL

MODULATION OF GENE EXPRESSION

Numéro de demande/publication: 20 18058227
Date: 2018-03-29

Advanced toolbox for rapid and cost-effective functional metagenomic screening - microbiology meets microfluidics.

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