Livrables
Report which describes the uptake of biomedicine applications on various European e-infrastructures, and the use of community applications on HPC systems facilitated by this project.
Report on Deployment of Deep Track Tools and Services to Improve Efficiency of Research and Facilitating Access to CoE CapabilitiesReport on progress in and impact of deployment of these tools in support of complex workflows (including multiscale models) on available HPC environments.
Project HandbookWP1 will produce a project handbook outlining the project’s procedures, legal obligations and reporting processes, to assist each partner.
Report on dissemination and training materialReport on dissemination and training material as produced by the project.
Training PlanA report with a detailed training plan, including both training events, ways of delivery, and partners responsible for the training.
Quality Assurance PlanTo manage the project’s quality control process, a Quality Assurance Plan will be created to assist internal reviewers in monitoring all deliverables before they are finalised and submitted to the commission. The deliverable will also contain a detailed risk analysis and contingency planning.
Report on existing solutions in support of biomedical applicationsThis is a public document, which describes the existing solutions (tools, services, datasets) that can be of benefit to a range of new biomedical research applications.
Dissemination Action PlanA detailed and comprehensive report on the dissemination actions that will be carried out by the project.
Report on the Impact of Modelling and Simulation within Biomedical Research as enabled by CompBioMedThis report will be a major outcome of the project and will present an overview of the impact to date of computational approaches in biomedical research, together with a forecast of the anticipated impact that these methods and associated technologies will have within academia, industry and healthcare.
Report on best practices for e-infrastructure application usageReport which will cover usage of the e-infrastructure from an applications point of view.
First report on training and disseminationReport on delivered training and dissemination actions as well as update to the training plan and dissemination action plan
Report on Extreme Scaling of and Porting of Exemplar Applications to Novel ArchitecturesReport on the implementation of high fidelity CompBioMed applications on emerging HPC architectures on the path to the exascale and on porting to new and maturing architectures.
Report on selected emerging use cases for existing solutionsAs part of T6.2, an updated version of D6.1.1 will be produced at M24, to address emerging use cases.
Final report on the end-user solutionsA final update of the public document, describing all the end-user solutions.
Final Report on Industrial and cPPP CollaborationA detailed report on our engagement with industrial stakeholders and ETH4HPC, and our Innovation Exchange Programme, throughout the course of the CompBioMed project
Innovation PlanWe will deliver an innovation plan, to be adhered to by all members of the consortium, to promote the innovation and commercialisation aspects of this project.
Report on computing and data needs of the biomedical communityReport which identifies the needs for infrastructure usage and access models for the biomedicine community
Final training and dissemination reportA report on the training and dissemination actions, as well as delivery of a reusable set of training materials, as developed and used during the project.
Sustainability PlanA plan to ensure the sustainability of our CompBioMed Centre of Excellence
Preparing data infrastructures for large-scale resources: report on the optimization activitiesReport which describes the selected optimization tasks, and the outcome of these tasks.
Final Public ReportA non-confidential summary of the final status of the project.
Interim Report on Industrial and cPPP CollaborationA report on our initial engagement with industrial stakeholders and ETH4HPC, and our Innovation Exchange Programme.
Report on Application Software Readiness and Fast Track ExploitationReport on the applications and research being undertaken within the CompBioMed environment based on the initial, Fast Track deployment.
Report on Workflow system provisionThis report will describe the initial workflow system deployment conducted in T6.5
Report on the optimization activitiesA report that describes the progress achieved in the optimisation activities (T6.3).
Report on access mechanisms to HPC systemsReport on the various access models to HPC systems for scientific usage, in particular for the biomedicine community
WP1 will produce a Data Management Plan in M6.
We will make available our community software repository to members of the computational biomedicine research community
Website ReleaseThe project website will provide a focal point for the dissemination activities of the project.
Deployment of project informatics platformWe will make a release of our project informatics platform for community members to use.
Publications
Auteurs:
Aurore Lyon, Ana Mincholé, Juan Pablo Martínez, Pablo Laguna, Blanca Rodriguez
Publié dans:
Journal of The Royal Society Interface, Numéro 15/138, 2018, Page(s) 20170821, ISSN 1742-5689
Éditeur:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2017.0821
Auteurs:
Brodie A. J. Lawson, Christopher C. Drovandi, Nicole Cusimano, Pamela Burrage, Blanca Rodriguez, Kevin Burrage
Publié dans:
Science Advances, Numéro 4/1, 2018, Page(s) e1701676, ISSN 2375-2548
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/sciadv.1701676
Auteurs:
Sha Li, Jonas Latt, Bastien Chopard
Publié dans:
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, Numéro 34/3, 2018, Page(s) e2949, ISSN 2040-7939
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John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/cnm.2949
Auteurs:
Carlos Sánchez, Alfonso Bueno-Orovio, Esther Pueyo, Blanca Rodríguez
Publié dans:
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Numéro 5, 2017, ISSN 2296-4185
Éditeur:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fbioe.2017.00029
Auteurs:
Xin Zhou, Alfonso Bueno-Orovio, Blanca Rodriguez
Publié dans:
Current Opinion in Physiology, Numéro 1, 2018, Page(s) 95-103, ISSN 2468-8673
Éditeur:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.cophys.2017.11.003
Auteurs:
Inaki Morao, Dmitri G. Fedorov, Roger Robinson, Michelle Southey, Andrea Townsend-Nicholson, Mike J. Bodkin, Alexander Heifetz
Publié dans:
Journal of Computational Chemistry, Numéro 38/23, 2017, Page(s) 1987-1990, ISSN 0192-8651
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John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/jcc.24850
Auteurs:
Alexander Patronis, Robin A. Richardson, Sebastian Schmieschek, Brian J. N. Wylie, Rupert W. Nash, Peter V. Coveney
Publié dans:
Frontiers in Physiology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-042X
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Frontiers Research Foundation
DOI:
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Auteurs:
Agastya P. Bhati, Shunzhou Wan, David W. Wright, Peter V. Coveney
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Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.6b00979
Auteurs:
Shunzhou Wan, Agastya P. Bhati, Stefan J. Zasada, Ian Wall, Darren Green, Paul Bamborough, Peter V. Coveney
Publié dans:
Journal of Chemical Theory and Computation, Numéro 13/2, 2017, Page(s) 784-795, ISSN 1549-9618
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.6b00794
Auteurs:
Saad Alowayyed, Derek Groen, Peter V. Coveney, Alfons G. Hoekstra
Publié dans:
Journal of Computational Science, Numéro 22, 2017, Page(s) 15-25, ISSN 1877-7503
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Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.jocs.2017.07.004
Auteurs:
Shunzhou Wan, Agastya P. Bhati, Sarah Skerratt, Kiyoyuki Omoto, Veerabahu Shanmugasundaram, Sharan K. Bagal, Peter V. Coveney
Publié dans:
Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 57/4, 2017, Page(s) 897-909, ISSN 1549-9596
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.6b00780
Auteurs:
Pavel S. Zun, Tatiana Anikina, Andrew Svitenkov, Alfons G. Hoekstra
Publié dans:
Frontiers in Physiology, Numéro 8, 2017, ISSN 1664-042X
Éditeur:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2017.00284
Auteurs:
Michelangelo Paci, Elisa Passini, Stefano Severi, Jari Hyttinen, Blanca Rodriguez
Publié dans:
Heart Rhythm, Numéro 14/11, 2017, Page(s) 1704-1712, ISSN 1547-5271
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.hrthm.2017.07.026
Auteurs:
Ritabrata Dutta, Bastien Chopard, Jonas Lätt, Frank Dubois, Karim Zouaoui Boudjeltia, Antonietta Mira
Publié dans:
Frontiers in Physiology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-042X
Éditeur:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2018.01128
Auteurs:
Gábor Závodszky, Britt van Rooij, Victor Azizi, Alfons Hoekstra
Publié dans:
Frontiers in Physiology, Numéro 8, 2017, ISSN 1664-042X
Éditeur:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2017.00563
Auteurs:
Jakub Tomek, Blanca Rodriguez, Gil Bub, Jordi Heijman
Publié dans:
American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology, Numéro 313/2, 2017, Page(s) H338-H353, ISSN 0363-6135
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American Physiological Society
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10.1152/ajpheart.00094.2017
Auteurs:
R. Charlotte Eccleston, Shunzhou Wan, Neil Dalchau, Peter V. Coveney
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Frontiers in Immunology, Numéro 8, 2017, ISSN 1664-3224
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Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fimmu.2017.00797
Auteurs:
Abhijeet Kapoor, Gerard Martinez-Rosell, Davide Provasi, Gianni de Fabritiis, Marta Filizola
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Scientific Reports, Numéro 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
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Nature Publishing Group
DOI:
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Nojood A. Altwaijry, Michael Baron, David W. Wright, Peter V. Coveney, Andrea Townsend-Nicholson
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Journal of Chemical Theory and Computation, Numéro 13/5, 2017, Page(s) 2254-2270, ISSN 1549-9618
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American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.6b01246
Auteurs:
R. Charlotte Eccleston, Peter V. Coveney, Neil Dalchau
Publié dans:
Scientific Reports, Numéro 7/1, 2017, Page(s) 14367, ISSN 2045-2322
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Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-017-14415-8
Auteurs:
Linford J. B. Briant, Quan Zhang, Elisa Vergari, Joely A. Kellard, Blanca Rodriguez, Frances M. Ashcroft, Patrik Rorsman
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Journal of The Royal Society Interface, Numéro 14/128, 2017, Page(s) 20160999, ISSN 1742-5689
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Auteurs:
Sha Li, Jonas Latt, Bastien Chopard
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Auteurs:
Laura Pérez-Benito, Henrik Keränen, Herman van Vlijmen, Gary Tresadern
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Scientific Reports, Numéro 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
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Nature Publishing Group
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Auteurs:
S. Alowayyed, G. Závodszky, V. Azizi, A.G. Hoekstra
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Journal of Computational Science, Numéro 24, 2018, Page(s) 1-7, ISSN 1877-7503
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Auteurs:
Aurore Lyon, Rina Ariga, Ana Mincholé, Masliza Mahmod, Elizabeth Ormondroyd, Pablo Laguna, Nando de Freitas, Stefan Neubauer, Hugh Watkins, Blanca Rodriguez
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Frontiers in Physiology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-042X
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Frontiers Research Foundation
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Auteurs:
Zainab Altai, Marco Viceconti, Amaka C. Offiah, Xinshan Li
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Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, 2018, ISSN 1617-7959
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Auteurs:
Daniel G León, Mariña López-Yunta, José Manuel Alfonso-Almazán, Manuel Marina-Breysse, Jorge G Quintanilla, Javier Sánchez-González, Carlos Galán-Arriola, Francisco Castro-Núñez, Juan José González-Ferrer, Borja Ibáñez, Julián Pérez-Villacastín, Nicasio Pérez-Castellano, Valentín Fuster, José Jalife, Mariano Vázquez, Jazmín Aguado-Sierra, David Filgueiras-Rama
Publié dans:
EP Europace, Numéro 21/5, 2019, Page(s) 822-832, ISSN 1099-5129
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
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Auteurs:
Mariña López-Yunta, Daniel G León, José Manuel Alfonso-Almazán, Manuel Marina-Breysse, Jorge G Quintanilla, Javier Sánchez-González, Carlos Galán-Arriola, Victoria Cañadas-Godoy, Daniel Enríquez-Vázquez, Carlos Torres, Borja Ibáñez, Julián Pérez-Villacastín, Nicasio Pérez-Castellano, José Jalife, Mariano Vázquez, Jazmín Aguado-Sierra, David Filgueiras-Rama
Publié dans:
EP Europace, Numéro 21/1, 2018, Page(s) 163-174, ISSN 1099-5129
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
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Auteurs:
Miha Skalic, Alejandro Varela-Rial, José Jiménez, Gerard Martínez-Rosell, Gianni De Fabritiis
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Oxford University Press
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Auteurs:
Christos Kotsalos, Jonas Latt, Bastien Chopard
Publié dans:
Journal of Computational Physics, Numéro 398, 2019, Page(s) 108905, ISSN 0021-9991
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Auteurs:
Louie Cardone-Noott, Blanca Rodriguez, Alfonso Bueno-Orovio
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PLOS ONE, Numéro 13/8, 2018, Page(s) e0202410, ISSN 1932-6203
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Auteurs:
José Jiménez, Miha Škalič, Gerard Martínez-Rosell, Gianni De Fabritiis
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Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 58/2, 2018, Page(s) 287-296, ISSN 1549-9596
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Auteurs:
Hadrien Calmet, Kiao Inthavong, Beatriz Eguzkitza, Oriol Lehmkuhl, Guillaume Houzeaux, Mariano Vázquez
Publié dans:
PLOS ONE, Numéro 14/9, 2019, Page(s) e0221330, ISSN 1932-6203
Éditeur:
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DOI:
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Auteurs:
David W. Wright, Shunzhou Wan, Christophe Meyer, Herman van Vlijmen, Gary Tresadern, Peter V. Coveney
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Scientific Reports, Numéro 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
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Auteurs:
Adrià Pérez, Gerard Martínez-Rosell, Gianni De Fabritiis
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Elsevier BV
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Auteurs:
Patricia Garcia-Canadilla, Hector Dejea, Anne Bonnin, Vedrana Balicevic, Sven Loncaric, Chong Zhang, Constantine Butakoff, Jazmin Aguado-Sierra, Mariano Vázquez, Laurence H. Jackson, Daniel J. Stuckey, Cristoph Rau, Marco Stampanoni, Bart Bijnens, Andrew C. Cook
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Circulation: Cardiovascular Imaging, Numéro 11/10, 2018, ISSN 1941-9651
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Auteurs:
Sauro Succi, Peter V. Coveney
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Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Numéro 377/2142, 2019, Page(s) 20180145, ISSN 1364-503X
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Denise S. M. Boulanger, Ruth C. Eccleston, Andrew Phillips, Peter V. Coveney, Tim Elliott, Neil Dalchau
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Frontiers in Immunology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-3224
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Auteurs:
S. Alowayyed, T. Piontek, J.L. Suter, O. Hoenen, D. Groen, O. Luk, B. Bosak, P. Kopta, K. Kurowski, O. Perks, K. Brabazon, V. Jancauskas, D. Coster, P.V. Coveney, A.G. Hoekstra
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Future Generation Computer Systems, Numéro 91, 2019, Page(s) 335-346, ISSN 0167-739X
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Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.future.2018.08.045
Auteurs:
Carlos A. Ledezma, Xin Zhou, Blanca Rodríguez, P. J. Tan, Vanessa Díaz-Zuccarini
Publié dans:
PLOS ONE, Numéro 14/8, 2019, Page(s) e0220294, ISSN 1932-6203
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Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0220294
Auteurs:
Marco Viceconti, Muhammad Qasim, Pinaki Bhattacharya, Xinshan Li
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Current Osteoporosis Reports, Numéro 16/3, 2018, Page(s) 216-223, ISSN 1544-1873
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Auteurs:
Federica Sacco, Bruno Paun, Oriol Lehmkuhl, Tinen L. Iles, Paul A. Iaizzo, Guillaume Houzeaux, Mariano Vázquez, Constantine Butakoff, Jazmin Aguado-Sierra
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Frontiers in Physiology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-042X
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Frontiers Research Foundation
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10.3389/fphys.2018.00458
Auteurs:
Eliott Tixier, Damiano Lombardi, Blanca Rodriguez, Jean-Frédéric Gerbeau
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Journal of The Royal Society Interface, Numéro 14/133, 2017, Page(s) 20170238, ISSN 1742-5689
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The Royal Society
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10.1098/rsif.2017.0238
Auteurs:
Derek Groen, Robin A. Richardson, Rachel Coy, Ulf D. Schiller, Hoskote Chandrashekar, Fergus Robertson, Peter V. Coveney
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Frontiers in Physiology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-042X
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Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2018.00721
Auteurs:
Jumana Dakka, Matteo Turilli, David W. Wright, Stefan J. Zasada, Vivek Balasubramanian, Shunzhou Wan, Peter V. Coveney, Shantenu Jha
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BMC Bioinformatics, Numéro 19/S18, 2018, ISSN 1471-2105
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10.1186/s12859-018-2506-6
Auteurs:
Agastya P. Bhati, Shunzhou Wan, Yuan Hu, Brad Sherborne, Peter V. Coveney
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Journal of Chemical Theory and Computation, Numéro 14/6, 2018, Page(s) 2867-2880, ISSN 1549-9618
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Auteurs:
Jiang Wang, Simon Olsson, Christoph Wehmeyer, Adrià Pérez, Nicholas E. Charron, Gianni de Fabritiis, Frank Noé, Cecilia Clementi
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ACS Central Science, 2019, ISSN 2374-7943
Éditeur:
American Chemical Society
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10.1021/acscentsci.8b00913
Auteurs:
L. J. B. Briant, T. M. Reinbothe, I. Spiliotis, C. Miranda, B. Rodriguez, P. Rorsman
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The Journal of Physiology, Numéro 596/2, 2018, Page(s) 197-215, ISSN 0022-3751
Éditeur:
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DOI:
10.1113/JP274581
Auteurs:
Elisa Passini, Oliver J. Britton, Hua Rong Lu, Jutta Rohrbacher, An N. Hermans, David J. Gallacher, Robert J. H. Greig, Alfonso Bueno-Orovio, Blanca Rodriguez
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Frontiers in Physiology, Numéro 8, 2017, ISSN 1664-042X
Éditeur:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2017.00668
Auteurs:
Miguel O. Bernabeu, Martin L. Jones, Rupert W. Nash, Anna Pezzarossa, Peter V. Coveney, Holger Gerhardt, Claudio A. Franco
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Biophysical Journal, Numéro 114/9, 2018, Page(s) 2052-2058, ISSN 0006-3495
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Biophysical Society
DOI:
10.1016/j.bpj.2018.03.032
Auteurs:
D Gil, R Aris, A Borras, E Ramirez, R Sebastian, M Vazquez
Publié dans:
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Numéro 14/1, 2019, Page(s) 63-72, ISSN 1861-6410
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Springer Verlag
DOI:
10.1007/s11548-018-1849-9
Auteurs:
Agastya P. Bhati, Shunzhou Wan, Peter V. Coveney
Publié dans:
Journal of Chemical Theory and Computation, Numéro 15/2, 2018, Page(s) 1265-1277, ISSN 1549-9618
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.8b01118
Auteurs:
Alfonso Santiago, Jazmín Aguado-Sierra, Miguel Zavala-Aké, Ruben Doste-Beltran, Samuel Gómez, Ruth Arís, Juan C. Cajas, Eva Casoni, Mariano Vázquez
Publié dans:
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, Numéro 34/12, 2018, Page(s) e3140, ISSN 2040-7939
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/cnm.3140
Auteurs:
Miha Skalic, Gerard Martínez-Rosell, José Jiménez, Gianni De Fabritiis
Publié dans:
Bioinformatics, Numéro 35/7, 2018, Page(s) 1237-1238, ISSN 1367-4803
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/bty758
Auteurs:
Mike de Haan, Gabor Zavodszky, Victor Azizi, Alfons Hoekstra
Publié dans:
Applied Sciences, Numéro 8/9, 2018, Page(s) 1616, ISSN 2076-3417
Éditeur:
MDPI
DOI:
10.3390/app8091616
Auteurs:
B. Czaja, G. Závodszky, V. Azizi Tarksalooyeh, A. G. Hoekstra
Publié dans:
Journal of The Royal Society Interface, Numéro 15/146, 2018, Page(s) 20180485, ISSN 1742-5689
Éditeur:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2018.0485
Auteurs:
Victor W. Azizi Tarksalooyeh, Gábor Závodszky, Britt J. M. van Rooij, Alfons G. Hoekstra
Publié dans:
Computers & Fluids, Numéro 172, 2018, Page(s) 312-317, ISSN 0045-7930
Éditeur:
Pergamon Press Ltd.
DOI:
10.1016/j.compfluid.2018.04.025
Auteurs:
Anna Nikishova, Lourens Veen, Pavel Zun, Alfons G. Hoekstra
Publié dans:
Cardiovascular Engineering and Technology, Numéro 9/4, 2018, Page(s) 761-774, ISSN 1869-408X
Éditeur:
Springer Pub. Co.,
DOI:
10.1007/s13239-018-00372-4
Auteurs:
Federica Sacco, Bruno Paun, Oriol Lehmkuhl, Tinen L. Iles, Paul A. Iaizzo, Guillaume Houzeaux, Mariano Vázquez, Constantine Butakoff, Jazmin Aguado-Sierra
Publié dans:
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, Numéro 34/9, 2018, Page(s) e3115, ISSN 2040-7939
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/cnm.3115
Auteurs:
Alfonso Bueno-Orovio, Kevin Burrage
Publié dans:
Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, Numéro 52, 2017, Page(s) 91-109, ISSN 1007-5704
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.cnsns.2017.04.013
Auteurs:
José Jiménez, Davide Sabbadin, Alberto Cuzzolin, Gerard Martínez-Rosell, Jacob Gora, John Manchester, José Duca, Gianni De Fabritiis
Publié dans:
Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 59/3, 2018, Page(s) 1172-1181, ISSN 1549-9596
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.8b00711
Auteurs:
Miha Skalic, José Jiménez, Davide Sabbadin, Gianni De Fabritiis
Publié dans:
Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 59/3, 2018, Page(s) 1205-1214, ISSN 1549-9596
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.8b00706
Auteurs:
Andrea Townsend-Nicholson, Nojood Altwaijry, Andrew Potterton, Inaki Morao, Alexander Heifetz
Publié dans:
Current Opinion in Structural Biology, Numéro 55, 2019, Page(s) 178-184, ISSN 0959-440X
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.sbi.2019.04.005
Auteurs:
Alexander Heifetz, Tim James, Michelle Southey, Inaki Morao, Matteo Aldeghi, Laurie Sarrat, Dmitri G Fedorov, Mike J Bodkin, Andrea Townsend-Nicholson
Publié dans:
Current Opinion in Structural Biology, Numéro 55, 2019, Page(s) 85-92, ISSN 0959-440X
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.sbi.2019.03.021
Auteurs:
Claudia Llinas del Torrent, Laura Pérez-Benito, Gary Tresadern
Publié dans:
Molecules, Numéro 24/6, 2019, Page(s) 1098, ISSN 1420-3049
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/molecules24061098
Auteurs:
Claudia Llinas del Torrent, Nil Casajuana-Martin, Leonardo Pardo, Gary Tresadern, Laura Pérez-Benito
Publié dans:
Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 59/5, 2019, Page(s) 2456-2466, ISSN 1549-9596
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.8b00924
Auteurs:
Laura Pérez-Benito, Nil Casajuana-Martin, Mireia Jiménez-Rosés, Herman van Vlijmen, Gary Tresadern
Publié dans:
Journal of Chemical Theory and Computation, Numéro 15/3, 2019, Page(s) 1884-1895, ISSN 1549-9618
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.8b01290
Auteurs:
Jakub Tomek, Guoliang Hao, Markéta Tomková, Andrew Lewis, Carolyn Carr, David J. Paterson, Blanca Rodriguez, Gil Bub, Neil Herring
Publié dans:
Frontiers in Physiology, Numéro 10, 2019, ISSN 1664-042X
Éditeur:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2019.00350
Auteurs:
Xin Zhou, Alfonso Bueno-Orovio, Richard J. Schilling, Claire Kirkby, Chris Denning, Divya Rajamohan, Kevin Burrage, Andrew Tinker, Blanca Rodriguez, Stephen C. Harmer
Publié dans:
Frontiers in Physiology, Numéro 10, 2019, ISSN 1664-042X
Éditeur:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2019.00259
Auteurs:
Zainab Altai, Muhammad Qasim, Xinshan Li, Marco Viceconti
Publié dans:
Clinical Biomechanics, Numéro 68, 2019, Page(s) 137-143, ISSN 0268-0033
Éditeur:
Pergamon Press Ltd.
DOI:
10.1016/j.clinbiomech.2019.06.004
Auteurs:
A. Melis, F. Moura, I. Larrabide, K. Janot, R.H. Clayton, A.P. Narata, A. Marzo
Publié dans:
Journal of Biomechanics, Numéro 90, 2019, Page(s) 24-32, ISSN 0021-9290
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.jbiomech.2019.04.019
Auteurs:
Philipp Berg, Samuel Voß, Gábor Janiga, Sylvia Saalfeld, Aslak W. Bergersen, Kristian Valen-Sendstad, Jan Bruening, Leonid Goubergrits, Andreas Spuler, Tin Lok Chiu, Anderson Chun On Tsang, Gabriele Copelli, Benjamin Csippa, György Paál, Gábor Závodszky, Felicitas J. Detmer, Bong J. Chung, Juan R. Cebral, Soichiro Fujimura, Hiroyuki Takao, Christof Karmonik, Saba Elias, Nicole M. Cancelliere
Publié dans:
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Numéro 14/10, 2019, Page(s) 1795-1804, ISSN 1861-6410
Éditeur:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s11548-019-01986-2
Auteurs:
Gábor Závodszky, Britt van Rooij, Ben Czaja, Victor Azizi, David de Kanter, Alfons G. Hoekstra
Publié dans:
Physics of Fluids, Numéro 31/3, 2019, Page(s) 031903, ISSN 1070-6631
Éditeur:
American Institute of Physics
DOI:
10.1063/1.5085881
Auteurs:
Sha Li, Bastien Chopard, Jonas Latt
Publié dans:
Journal of Computational Science, Numéro 38, 2019, Page(s) 101045, ISSN 1877-7503
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.jocs.2019.101045
Auteurs:
B. J. M. van Rooij, G. Závodszky, V. W. Azizi Tarksalooyeh, A. G. Hoekstra
Publié dans:
Journal of The Royal Society Interface, Numéro 16/159, 2019, Page(s) 20190148, ISSN 1742-5689
Éditeur:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2019.0148
Auteurs:
Dakka, Jumana; Farkas-Pall, Kristof; Balasubramanian, Vivek; Turilli, Matteo; Wright, David W; Wan, Shunzhou; Zasada, Stefan; Coveney, Peter V; Jha, Shantenu
Publié dans:
Numéro 1, 2018
Éditeur:
arXiv
Auteurs:
Dakka, Jumana; Turilli, Matteo; Wright, David W; Zasada, Stefan J; Balasubramanian, Vivek; Wan, Shunzhou; Coveney, Peter V; Jha, Shantenu
Publié dans:
Numéro 1, 2018
Éditeur:
arXiv
Auteurs:
McCarthy, Adam; Rodriguez, Blanca; Minchole, Ana
Publié dans:
Numéro 2, 2017
Éditeur:
ArXiv
Auteurs:
Galvelis, Raimondas; Doerr, Stefan; Damas, Joao M.; Harvey, Matt J.; De Fabritiis, Gianni
Publié dans:
Numéro 2, 2019
Éditeur:
ArXiv
Auteurs:
P.V. Coveney and R. Highfield
Publié dans:
Longevity Bulletin: Big data in health, 2017, ISSN 2397-7213
Éditeur:
Institute and Faculty of Actuaries
Auteurs:
Alexander Heifetz, Michelle Southey, Inaki Morao, Andrea Townsend-Nicholson, Mike J. Bodkin
Publié dans:
Methods in Molecular Biology, 2017, Page(s) 375-394
Éditeur:
Springer New York
DOI:
10.1007/978-1-4939-7465-8_19
Auteurs:
Andrew Potterton, Alexander Heifetz, Andrea Townsend-Nicholson
Publié dans:
Methods in Molecular Biology, 2018, Page(s) 335-343
Éditeur:
Springer New York
DOI:
10.1007/978-1-4939-7465-8_15
Auteurs:
Joey Sing Yee Tan, Gábor Závodszky, Peter M. A. Sloot
Publié dans:
Computational Science – ICCS 2018, Numéro 10860, 2018, Page(s) 392-403, ISBN 978-3-319-93697-0
Éditeur:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-319-93698-7_30
Auteurs:
Victor Azizi Tarksalooyeh, Gábor Závodszky, Alfons G. Hoekstra
Publié dans:
Computational Science – ICCS 2019 - 19th International Conference, Faro, Portugal, June 12–14, 2019, Proceedings, Part III, Numéro 11538, 2019, Page(s) 537-547, ISBN 978-3-030-22743-2
Éditeur:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-030-22744-9_42
Auteurs:
Jumana Dakka, Kristof Farkas-Pall, Matteo Turilli, David W. Wright, Peter V. Coveney, Shantenu Jha
Publié dans:
2018 IEEE 14th International Conference on e-Science (e-Science), 2018, Page(s) 189-200, ISBN 978-1-5386-9156-4
Éditeur:
IEEE
DOI:
10.1109/escience.2018.00034
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