Leistungen
Report which describes the uptake of biomedicine applications on various European e-infrastructures, and the use of community applications on HPC systems facilitated by this project.
Report on Deployment of Deep Track Tools and Services to Improve Efficiency of Research and Facilitating Access to CoE CapabilitiesReport on progress in and impact of deployment of these tools in support of complex workflows (including multiscale models) on available HPC environments.
Project HandbookWP1 will produce a project handbook outlining the project’s procedures, legal obligations and reporting processes, to assist each partner.
Report on dissemination and training materialReport on dissemination and training material as produced by the project.
Training PlanA report with a detailed training plan, including both training events, ways of delivery, and partners responsible for the training.
Quality Assurance PlanTo manage the project’s quality control process, a Quality Assurance Plan will be created to assist internal reviewers in monitoring all deliverables before they are finalised and submitted to the commission. The deliverable will also contain a detailed risk analysis and contingency planning.
Report on existing solutions in support of biomedical applicationsThis is a public document, which describes the existing solutions (tools, services, datasets) that can be of benefit to a range of new biomedical research applications.
Dissemination Action PlanA detailed and comprehensive report on the dissemination actions that will be carried out by the project.
Report on the Impact of Modelling and Simulation within Biomedical Research as enabled by CompBioMedThis report will be a major outcome of the project and will present an overview of the impact to date of computational approaches in biomedical research, together with a forecast of the anticipated impact that these methods and associated technologies will have within academia, industry and healthcare.
Report on best practices for e-infrastructure application usageReport which will cover usage of the e-infrastructure from an applications point of view.
First report on training and disseminationReport on delivered training and dissemination actions as well as update to the training plan and dissemination action plan
Report on Extreme Scaling of and Porting of Exemplar Applications to Novel ArchitecturesReport on the implementation of high fidelity CompBioMed applications on emerging HPC architectures on the path to the exascale and on porting to new and maturing architectures.
Report on selected emerging use cases for existing solutionsAs part of T6.2, an updated version of D6.1.1 will be produced at M24, to address emerging use cases.
Final report on the end-user solutionsA final update of the public document, describing all the end-user solutions.
Final Report on Industrial and cPPP CollaborationA detailed report on our engagement with industrial stakeholders and ETH4HPC, and our Innovation Exchange Programme, throughout the course of the CompBioMed project
Innovation PlanWe will deliver an innovation plan, to be adhered to by all members of the consortium, to promote the innovation and commercialisation aspects of this project.
Report on computing and data needs of the biomedical communityReport which identifies the needs for infrastructure usage and access models for the biomedicine community
Final training and dissemination reportA report on the training and dissemination actions, as well as delivery of a reusable set of training materials, as developed and used during the project.
Sustainability PlanA plan to ensure the sustainability of our CompBioMed Centre of Excellence
Preparing data infrastructures for large-scale resources: report on the optimization activitiesReport which describes the selected optimization tasks, and the outcome of these tasks.
Final Public ReportA non-confidential summary of the final status of the project.
Interim Report on Industrial and cPPP CollaborationA report on our initial engagement with industrial stakeholders and ETH4HPC, and our Innovation Exchange Programme.
Report on Application Software Readiness and Fast Track ExploitationReport on the applications and research being undertaken within the CompBioMed environment based on the initial, Fast Track deployment.
Report on Workflow system provisionThis report will describe the initial workflow system deployment conducted in T6.5
Report on the optimization activitiesA report that describes the progress achieved in the optimisation activities (T6.3).
Report on access mechanisms to HPC systemsReport on the various access models to HPC systems for scientific usage, in particular for the biomedicine community
WP1 will produce a Data Management Plan in M6.
We will make available our community software repository to members of the computational biomedicine research community
Website ReleaseThe project website will provide a focal point for the dissemination activities of the project.
Deployment of project informatics platformWe will make a release of our project informatics platform for community members to use.
Veröffentlichungen
Autoren:
Aurore Lyon, Ana Mincholé, Juan Pablo Martínez, Pablo Laguna, Blanca Rodriguez
Veröffentlicht in:
Journal of The Royal Society Interface, Ausgabe 15/138, 2018, Seite(n) 20170821, ISSN 1742-5689
Herausgeber:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2017.0821
Autoren:
Brodie A. J. Lawson, Christopher C. Drovandi, Nicole Cusimano, Pamela Burrage, Blanca Rodriguez, Kevin Burrage
Veröffentlicht in:
Science Advances, Ausgabe 4/1, 2018, Seite(n) e1701676, ISSN 2375-2548
Herausgeber:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/sciadv.1701676
Autoren:
Sha Li, Jonas Latt, Bastien Chopard
Veröffentlicht in:
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, Ausgabe 34/3, 2018, Seite(n) e2949, ISSN 2040-7939
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/cnm.2949
Autoren:
Carlos Sánchez, Alfonso Bueno-Orovio, Esther Pueyo, Blanca Rodríguez
Veröffentlicht in:
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Ausgabe 5, 2017, ISSN 2296-4185
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fbioe.2017.00029
Autoren:
Xin Zhou, Alfonso Bueno-Orovio, Blanca Rodriguez
Veröffentlicht in:
Current Opinion in Physiology, Ausgabe 1, 2018, Seite(n) 95-103, ISSN 2468-8673
Herausgeber:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.cophys.2017.11.003
Autoren:
Inaki Morao, Dmitri G. Fedorov, Roger Robinson, Michelle Southey, Andrea Townsend-Nicholson, Mike J. Bodkin, Alexander Heifetz
Veröffentlicht in:
Journal of Computational Chemistry, Ausgabe 38/23, 2017, Seite(n) 1987-1990, ISSN 0192-8651
Herausgeber:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/jcc.24850
Autoren:
Alexander Patronis, Robin A. Richardson, Sebastian Schmieschek, Brian J. N. Wylie, Rupert W. Nash, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2018.00331
Autoren:
Agastya P. Bhati, Shunzhou Wan, David W. Wright, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Theory and Computation, Ausgabe 13/1, 2016, Seite(n) 210-222, ISSN 1549-9618
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.6b00979
Autoren:
Shunzhou Wan, Agastya P. Bhati, Stefan J. Zasada, Ian Wall, Darren Green, Paul Bamborough, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Theory and Computation, Ausgabe 13/2, 2017, Seite(n) 784-795, ISSN 1549-9618
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.6b00794
Autoren:
Saad Alowayyed, Derek Groen, Peter V. Coveney, Alfons G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Journal of Computational Science, Ausgabe 22, 2017, Seite(n) 15-25, ISSN 1877-7503
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.jocs.2017.07.004
Autoren:
Shunzhou Wan, Agastya P. Bhati, Sarah Skerratt, Kiyoyuki Omoto, Veerabahu Shanmugasundaram, Sharan K. Bagal, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 57/4, 2017, Seite(n) 897-909, ISSN 1549-9596
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.6b00780
Autoren:
Pavel S. Zun, Tatiana Anikina, Andrew Svitenkov, Alfons G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 8, 2017, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2017.00284
Autoren:
Michelangelo Paci, Elisa Passini, Stefano Severi, Jari Hyttinen, Blanca Rodriguez
Veröffentlicht in:
Heart Rhythm, Ausgabe 14/11, 2017, Seite(n) 1704-1712, ISSN 1547-5271
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.hrthm.2017.07.026
Autoren:
Ritabrata Dutta, Bastien Chopard, Jonas Lätt, Frank Dubois, Karim Zouaoui Boudjeltia, Antonietta Mira
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2018.01128
Autoren:
Gábor Závodszky, Britt van Rooij, Victor Azizi, Alfons Hoekstra
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 8, 2017, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2017.00563
Autoren:
Jakub Tomek, Blanca Rodriguez, Gil Bub, Jordi Heijman
Veröffentlicht in:
American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology, Ausgabe 313/2, 2017, Seite(n) H338-H353, ISSN 0363-6135
Herausgeber:
American Physiological Society
DOI:
10.1152/ajpheart.00094.2017
Autoren:
R. Charlotte Eccleston, Shunzhou Wan, Neil Dalchau, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Frontiers in Immunology, Ausgabe 8, 2017, ISSN 1664-3224
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fimmu.2017.00797
Autoren:
Abhijeet Kapoor, Gerard Martinez-Rosell, Davide Provasi, Gianni de Fabritiis, Marta Filizola
Veröffentlicht in:
Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-017-11483-8
Autoren:
Nojood A. Altwaijry, Michael Baron, David W. Wright, Peter V. Coveney, Andrea Townsend-Nicholson
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Theory and Computation, Ausgabe 13/5, 2017, Seite(n) 2254-2270, ISSN 1549-9618
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.6b01246
Autoren:
R. Charlotte Eccleston, Peter V. Coveney, Neil Dalchau
Veröffentlicht in:
Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, Seite(n) 14367, ISSN 2045-2322
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-017-14415-8
Autoren:
Linford J. B. Briant, Quan Zhang, Elisa Vergari, Joely A. Kellard, Blanca Rodriguez, Frances M. Ashcroft, Patrik Rorsman
Veröffentlicht in:
Journal of The Royal Society Interface, Ausgabe 14/128, 2017, Seite(n) 20160999, ISSN 1742-5689
Herausgeber:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2016.0999
Autoren:
Sha Li, Jonas Latt, Bastien Chopard
Veröffentlicht in:
Computers & Fluids, 2018, ISSN 0045-7930
Herausgeber:
Pergamon Press Ltd.
DOI:
10.1016/j.compfluid.2018.02.007
Autoren:
Laura Pérez-Benito, Henrik Keränen, Herman van Vlijmen, Gary Tresadern
Veröffentlicht in:
Scientific Reports, Ausgabe 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-018-23039-5
Autoren:
S. Alowayyed, G. Závodszky, V. Azizi, A.G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Journal of Computational Science, Ausgabe 24, 2018, Seite(n) 1-7, ISSN 1877-7503
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/J.JOCS.2017.11.008
Autoren:
Aurore Lyon, Rina Ariga, Ana Mincholé, Masliza Mahmod, Elizabeth Ormondroyd, Pablo Laguna, Nando de Freitas, Stefan Neubauer, Hugh Watkins, Blanca Rodriguez
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2018.00213
Autoren:
Zainab Altai, Marco Viceconti, Amaka C. Offiah, Xinshan Li
Veröffentlicht in:
Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, 2018, ISSN 1617-7959
Herausgeber:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s10237-018-1008-9
Autoren:
Daniel G León, Mariña López-Yunta, José Manuel Alfonso-Almazán, Manuel Marina-Breysse, Jorge G Quintanilla, Javier Sánchez-González, Carlos Galán-Arriola, Francisco Castro-Núñez, Juan José González-Ferrer, Borja Ibáñez, Julián Pérez-Villacastín, Nicasio Pérez-Castellano, Valentín Fuster, José Jalife, Mariano Vázquez, Jazmín Aguado-Sierra, David Filgueiras-Rama
Veröffentlicht in:
EP Europace, Ausgabe 21/5, 2019, Seite(n) 822-832, ISSN 1099-5129
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/europace/euy306
Autoren:
Mariña López-Yunta, Daniel G León, José Manuel Alfonso-Almazán, Manuel Marina-Breysse, Jorge G Quintanilla, Javier Sánchez-González, Carlos Galán-Arriola, Victoria Cañadas-Godoy, Daniel Enríquez-Vázquez, Carlos Torres, Borja Ibáñez, Julián Pérez-Villacastín, Nicasio Pérez-Castellano, José Jalife, Mariano Vázquez, Jazmín Aguado-Sierra, David Filgueiras-Rama
Veröffentlicht in:
EP Europace, Ausgabe 21/1, 2018, Seite(n) 163-174, ISSN 1099-5129
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/europace/euy192
Autoren:
Miha Skalic, Alejandro Varela-Rial, José Jiménez, Gerard Martínez-Rosell, Gianni De Fabritiis
Veröffentlicht in:
Bioinformatics, Ausgabe 35/2, 2018, Seite(n) 243-250, ISSN 1367-4803
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/bty583
Autoren:
Christos Kotsalos, Jonas Latt, Bastien Chopard
Veröffentlicht in:
Journal of Computational Physics, Ausgabe 398, 2019, Seite(n) 108905, ISSN 0021-9991
Herausgeber:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.jcp.2019.108905
Autoren:
Louie Cardone-Noott, Blanca Rodriguez, Alfonso Bueno-Orovio
Veröffentlicht in:
PLOS ONE, Ausgabe 13/8, 2018, Seite(n) e0202410, ISSN 1932-6203
Herausgeber:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0202410
Autoren:
José Jiménez, Miha Škalič, Gerard Martínez-Rosell, Gianni De Fabritiis
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 58/2, 2018, Seite(n) 287-296, ISSN 1549-9596
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.7b00650
Autoren:
Hadrien Calmet, Kiao Inthavong, Beatriz Eguzkitza, Oriol Lehmkuhl, Guillaume Houzeaux, Mariano Vázquez
Veröffentlicht in:
PLOS ONE, Ausgabe 14/9, 2019, Seite(n) e0221330, ISSN 1932-6203
Herausgeber:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0221330
Autoren:
David W. Wright, Shunzhou Wan, Christophe Meyer, Herman van Vlijmen, Gary Tresadern, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Scientific Reports, Ausgabe 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-019-41758-1
Autoren:
Adrià Pérez, Gerard Martínez-Rosell, Gianni De Fabritiis
Veröffentlicht in:
Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 49, 2018, Seite(n) 139-144, ISSN 0959-440X
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.sbi.2018.02.004
Autoren:
Patricia Garcia-Canadilla, Hector Dejea, Anne Bonnin, Vedrana Balicevic, Sven Loncaric, Chong Zhang, Constantine Butakoff, Jazmin Aguado-Sierra, Mariano Vázquez, Laurence H. Jackson, Daniel J. Stuckey, Cristoph Rau, Marco Stampanoni, Bart Bijnens, Andrew C. Cook
Veröffentlicht in:
Circulation: Cardiovascular Imaging, Ausgabe 11/10, 2018, ISSN 1941-9651
Herausgeber:
Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI:
10.1161/circimaging.118.007753
Autoren:
Sauro Succi, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Ausgabe 377/2142, 2019, Seite(n) 20180145, ISSN 1364-503X
Herausgeber:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rsta.2018.0145
Autoren:
Denise S. M. Boulanger, Ruth C. Eccleston, Andrew Phillips, Peter V. Coveney, Tim Elliott, Neil Dalchau
Veröffentlicht in:
Frontiers in Immunology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-3224
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fimmu.2018.01538
Autoren:
S. Alowayyed, T. Piontek, J.L. Suter, O. Hoenen, D. Groen, O. Luk, B. Bosak, P. Kopta, K. Kurowski, O. Perks, K. Brabazon, V. Jancauskas, D. Coster, P.V. Coveney, A.G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Future Generation Computer Systems, Ausgabe 91, 2019, Seite(n) 335-346, ISSN 0167-739X
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.future.2018.08.045
Autoren:
Carlos A. Ledezma, Xin Zhou, Blanca Rodríguez, P. J. Tan, Vanessa Díaz-Zuccarini
Veröffentlicht in:
PLOS ONE, Ausgabe 14/8, 2019, Seite(n) e0220294, ISSN 1932-6203
Herausgeber:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0220294
Autoren:
Marco Viceconti, Muhammad Qasim, Pinaki Bhattacharya, Xinshan Li
Veröffentlicht in:
Current Osteoporosis Reports, Ausgabe 16/3, 2018, Seite(n) 216-223, ISSN 1544-1873
Herausgeber:
Current Science Inc.
DOI:
10.1007/s11914-018-0438-8
Autoren:
Federica Sacco, Bruno Paun, Oriol Lehmkuhl, Tinen L. Iles, Paul A. Iaizzo, Guillaume Houzeaux, Mariano Vázquez, Constantine Butakoff, Jazmin Aguado-Sierra
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2018.00458
Autoren:
Eliott Tixier, Damiano Lombardi, Blanca Rodriguez, Jean-Frédéric Gerbeau
Veröffentlicht in:
Journal of The Royal Society Interface, Ausgabe 14/133, 2017, Seite(n) 20170238, ISSN 1742-5689
Herausgeber:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2017.0238
Autoren:
Derek Groen, Robin A. Richardson, Rachel Coy, Ulf D. Schiller, Hoskote Chandrashekar, Fergus Robertson, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2018.00721
Autoren:
Jumana Dakka, Matteo Turilli, David W. Wright, Stefan J. Zasada, Vivek Balasubramanian, Shunzhou Wan, Peter V. Coveney, Shantenu Jha
Veröffentlicht in:
BMC Bioinformatics, Ausgabe 19/S18, 2018, ISSN 1471-2105
Herausgeber:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12859-018-2506-6
Autoren:
Agastya P. Bhati, Shunzhou Wan, Yuan Hu, Brad Sherborne, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Theory and Computation, Ausgabe 14/6, 2018, Seite(n) 2867-2880, ISSN 1549-9618
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.7b01143
Autoren:
Jiang Wang, Simon Olsson, Christoph Wehmeyer, Adrià Pérez, Nicholas E. Charron, Gianni de Fabritiis, Frank Noé, Cecilia Clementi
Veröffentlicht in:
ACS Central Science, 2019, ISSN 2374-7943
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acscentsci.8b00913
Autoren:
L. J. B. Briant, T. M. Reinbothe, I. Spiliotis, C. Miranda, B. Rodriguez, P. Rorsman
Veröffentlicht in:
The Journal of Physiology, Ausgabe 596/2, 2018, Seite(n) 197-215, ISSN 0022-3751
Herausgeber:
Blackwell Publishing Inc.
DOI:
10.1113/JP274581
Autoren:
Elisa Passini, Oliver J. Britton, Hua Rong Lu, Jutta Rohrbacher, An N. Hermans, David J. Gallacher, Robert J. H. Greig, Alfonso Bueno-Orovio, Blanca Rodriguez
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 8, 2017, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2017.00668
Autoren:
Miguel O. Bernabeu, Martin L. Jones, Rupert W. Nash, Anna Pezzarossa, Peter V. Coveney, Holger Gerhardt, Claudio A. Franco
Veröffentlicht in:
Biophysical Journal, Ausgabe 114/9, 2018, Seite(n) 2052-2058, ISSN 0006-3495
Herausgeber:
Biophysical Society
DOI:
10.1016/j.bpj.2018.03.032
Autoren:
D Gil, R Aris, A Borras, E Ramirez, R Sebastian, M Vazquez
Veröffentlicht in:
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Ausgabe 14/1, 2019, Seite(n) 63-72, ISSN 1861-6410
Herausgeber:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s11548-018-1849-9
Autoren:
Agastya P. Bhati, Shunzhou Wan, Peter V. Coveney
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Theory and Computation, Ausgabe 15/2, 2018, Seite(n) 1265-1277, ISSN 1549-9618
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.8b01118
Autoren:
Alfonso Santiago, Jazmín Aguado-Sierra, Miguel Zavala-Aké, Ruben Doste-Beltran, Samuel Gómez, Ruth Arís, Juan C. Cajas, Eva Casoni, Mariano Vázquez
Veröffentlicht in:
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, Ausgabe 34/12, 2018, Seite(n) e3140, ISSN 2040-7939
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/cnm.3140
Autoren:
Miha Skalic, Gerard Martínez-Rosell, José Jiménez, Gianni De Fabritiis
Veröffentlicht in:
Bioinformatics, Ausgabe 35/7, 2018, Seite(n) 1237-1238, ISSN 1367-4803
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/bty758
Autoren:
Mike de Haan, Gabor Zavodszky, Victor Azizi, Alfons Hoekstra
Veröffentlicht in:
Applied Sciences, Ausgabe 8/9, 2018, Seite(n) 1616, ISSN 2076-3417
Herausgeber:
MDPI
DOI:
10.3390/app8091616
Autoren:
B. Czaja, G. Závodszky, V. Azizi Tarksalooyeh, A. G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Journal of The Royal Society Interface, Ausgabe 15/146, 2018, Seite(n) 20180485, ISSN 1742-5689
Herausgeber:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2018.0485
Autoren:
Victor W. Azizi Tarksalooyeh, Gábor Závodszky, Britt J. M. van Rooij, Alfons G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Computers & Fluids, Ausgabe 172, 2018, Seite(n) 312-317, ISSN 0045-7930
Herausgeber:
Pergamon Press Ltd.
DOI:
10.1016/j.compfluid.2018.04.025
Autoren:
Anna Nikishova, Lourens Veen, Pavel Zun, Alfons G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Cardiovascular Engineering and Technology, Ausgabe 9/4, 2018, Seite(n) 761-774, ISSN 1869-408X
Herausgeber:
Springer Pub. Co.,
DOI:
10.1007/s13239-018-00372-4
Autoren:
Federica Sacco, Bruno Paun, Oriol Lehmkuhl, Tinen L. Iles, Paul A. Iaizzo, Guillaume Houzeaux, Mariano Vázquez, Constantine Butakoff, Jazmin Aguado-Sierra
Veröffentlicht in:
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, Ausgabe 34/9, 2018, Seite(n) e3115, ISSN 2040-7939
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/cnm.3115
Autoren:
Alfonso Bueno-Orovio, Kevin Burrage
Veröffentlicht in:
Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, Ausgabe 52, 2017, Seite(n) 91-109, ISSN 1007-5704
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.cnsns.2017.04.013
Autoren:
José Jiménez, Davide Sabbadin, Alberto Cuzzolin, Gerard Martínez-Rosell, Jacob Gora, John Manchester, José Duca, Gianni De Fabritiis
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 59/3, 2018, Seite(n) 1172-1181, ISSN 1549-9596
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.8b00711
Autoren:
Miha Skalic, José Jiménez, Davide Sabbadin, Gianni De Fabritiis
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 59/3, 2018, Seite(n) 1205-1214, ISSN 1549-9596
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.8b00706
Autoren:
Andrea Townsend-Nicholson, Nojood Altwaijry, Andrew Potterton, Inaki Morao, Alexander Heifetz
Veröffentlicht in:
Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 55, 2019, Seite(n) 178-184, ISSN 0959-440X
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.sbi.2019.04.005
Autoren:
Alexander Heifetz, Tim James, Michelle Southey, Inaki Morao, Matteo Aldeghi, Laurie Sarrat, Dmitri G Fedorov, Mike J Bodkin, Andrea Townsend-Nicholson
Veröffentlicht in:
Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 55, 2019, Seite(n) 85-92, ISSN 0959-440X
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.sbi.2019.03.021
Autoren:
Claudia Llinas del Torrent, Laura Pérez-Benito, Gary Tresadern
Veröffentlicht in:
Molecules, Ausgabe 24/6, 2019, Seite(n) 1098, ISSN 1420-3049
Herausgeber:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/molecules24061098
Autoren:
Claudia Llinas del Torrent, Nil Casajuana-Martin, Leonardo Pardo, Gary Tresadern, Laura Pérez-Benito
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 59/5, 2019, Seite(n) 2456-2466, ISSN 1549-9596
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jcim.8b00924
Autoren:
Laura Pérez-Benito, Nil Casajuana-Martin, Mireia Jiménez-Rosés, Herman van Vlijmen, Gary Tresadern
Veröffentlicht in:
Journal of Chemical Theory and Computation, Ausgabe 15/3, 2019, Seite(n) 1884-1895, ISSN 1549-9618
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jctc.8b01290
Autoren:
Jakub Tomek, Guoliang Hao, Markéta Tomková, Andrew Lewis, Carolyn Carr, David J. Paterson, Blanca Rodriguez, Gil Bub, Neil Herring
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 10, 2019, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2019.00350
Autoren:
Xin Zhou, Alfonso Bueno-Orovio, Richard J. Schilling, Claire Kirkby, Chris Denning, Divya Rajamohan, Kevin Burrage, Andrew Tinker, Blanca Rodriguez, Stephen C. Harmer
Veröffentlicht in:
Frontiers in Physiology, Ausgabe 10, 2019, ISSN 1664-042X
Herausgeber:
Frontiers Research Foundation
DOI:
10.3389/fphys.2019.00259
Autoren:
Zainab Altai, Muhammad Qasim, Xinshan Li, Marco Viceconti
Veröffentlicht in:
Clinical Biomechanics, Ausgabe 68, 2019, Seite(n) 137-143, ISSN 0268-0033
Herausgeber:
Pergamon Press Ltd.
DOI:
10.1016/j.clinbiomech.2019.06.004
Autoren:
A. Melis, F. Moura, I. Larrabide, K. Janot, R.H. Clayton, A.P. Narata, A. Marzo
Veröffentlicht in:
Journal of Biomechanics, Ausgabe 90, 2019, Seite(n) 24-32, ISSN 0021-9290
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.jbiomech.2019.04.019
Autoren:
Philipp Berg, Samuel Voß, Gábor Janiga, Sylvia Saalfeld, Aslak W. Bergersen, Kristian Valen-Sendstad, Jan Bruening, Leonid Goubergrits, Andreas Spuler, Tin Lok Chiu, Anderson Chun On Tsang, Gabriele Copelli, Benjamin Csippa, György Paál, Gábor Závodszky, Felicitas J. Detmer, Bong J. Chung, Juan R. Cebral, Soichiro Fujimura, Hiroyuki Takao, Christof Karmonik, Saba Elias, Nicole M. Cancelliere
Veröffentlicht in:
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Ausgabe 14/10, 2019, Seite(n) 1795-1804, ISSN 1861-6410
Herausgeber:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s11548-019-01986-2
Autoren:
Gábor Závodszky, Britt van Rooij, Ben Czaja, Victor Azizi, David de Kanter, Alfons G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Physics of Fluids, Ausgabe 31/3, 2019, Seite(n) 031903, ISSN 1070-6631
Herausgeber:
American Institute of Physics
DOI:
10.1063/1.5085881
Autoren:
Sha Li, Bastien Chopard, Jonas Latt
Veröffentlicht in:
Journal of Computational Science, Ausgabe 38, 2019, Seite(n) 101045, ISSN 1877-7503
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.jocs.2019.101045
Autoren:
B. J. M. van Rooij, G. Závodszky, V. W. Azizi Tarksalooyeh, A. G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Journal of The Royal Society Interface, Ausgabe 16/159, 2019, Seite(n) 20190148, ISSN 1742-5689
Herausgeber:
The Royal Society
DOI:
10.1098/rsif.2019.0148
Autoren:
Dakka, Jumana; Farkas-Pall, Kristof; Balasubramanian, Vivek; Turilli, Matteo; Wright, David W; Wan, Shunzhou; Zasada, Stefan; Coveney, Peter V; Jha, Shantenu
Veröffentlicht in:
Ausgabe 1, 2018
Herausgeber:
arXiv
Autoren:
Dakka, Jumana; Turilli, Matteo; Wright, David W; Zasada, Stefan J; Balasubramanian, Vivek; Wan, Shunzhou; Coveney, Peter V; Jha, Shantenu
Veröffentlicht in:
Ausgabe 1, 2018
Herausgeber:
arXiv
Autoren:
McCarthy, Adam; Rodriguez, Blanca; Minchole, Ana
Veröffentlicht in:
Ausgabe 2, 2017
Herausgeber:
ArXiv
Autoren:
Galvelis, Raimondas; Doerr, Stefan; Damas, Joao M.; Harvey, Matt J.; De Fabritiis, Gianni
Veröffentlicht in:
Ausgabe 2, 2019
Herausgeber:
ArXiv
Autoren:
P.V. Coveney and R. Highfield
Veröffentlicht in:
Longevity Bulletin: Big data in health, 2017, ISSN 2397-7213
Herausgeber:
Institute and Faculty of Actuaries
Autoren:
Alexander Heifetz, Michelle Southey, Inaki Morao, Andrea Townsend-Nicholson, Mike J. Bodkin
Veröffentlicht in:
Methods in Molecular Biology, 2017, Seite(n) 375-394
Herausgeber:
Springer New York
DOI:
10.1007/978-1-4939-7465-8_19
Autoren:
Andrew Potterton, Alexander Heifetz, Andrea Townsend-Nicholson
Veröffentlicht in:
Methods in Molecular Biology, 2018, Seite(n) 335-343
Herausgeber:
Springer New York
DOI:
10.1007/978-1-4939-7465-8_15
Autoren:
Joey Sing Yee Tan, Gábor Závodszky, Peter M. A. Sloot
Veröffentlicht in:
Computational Science – ICCS 2018, Ausgabe 10860, 2018, Seite(n) 392-403, ISBN 978-3-319-93697-0
Herausgeber:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-319-93698-7_30
Autoren:
Victor Azizi Tarksalooyeh, Gábor Závodszky, Alfons G. Hoekstra
Veröffentlicht in:
Computational Science – ICCS 2019 - 19th International Conference, Faro, Portugal, June 12–14, 2019, Proceedings, Part III, Ausgabe 11538, 2019, Seite(n) 537-547, ISBN 978-3-030-22743-2
Herausgeber:
Springer International Publishing
DOI:
10.1007/978-3-030-22744-9_42
Autoren:
Jumana Dakka, Kristof Farkas-Pall, Matteo Turilli, David W. Wright, Peter V. Coveney, Shantenu Jha
Veröffentlicht in:
2018 IEEE 14th International Conference on e-Science (e-Science), 2018, Seite(n) 189-200, ISBN 978-1-5386-9156-4
Herausgeber:
IEEE
DOI:
10.1109/escience.2018.00034
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