Bacterial evolution of hypersensitivity and resistance against antimicrobial peptides

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Veröffentlichungen

Recombineering and MAGE

Autoren: Timothy M. Wannier, Peter N. Ciaccia, Andrew D. Ellington, Gabriel T. Filsinger, Farren J. Isaacs, Kamyab Javanmardi, Michaela A. Jones, Aditya M. Kunjapur, Akos Nyerges, Csaba Pal, Max G. Schubert & George M. Church
Veröffentlicht in: Nature Reviews Methods Primers, 2021, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s43586-020-00006-x

Hybrid Inhibitors of DNA Gyrase A and B: Design, Synthesis and Evaluation.

Autoren: Martina Durcik; Žiga Skok; Janez Ilaš; Nace Zidar; Anamarija Zega; Petra Szili; Gábor Draskovits; Tamás Révész; Danijel Kikelj; Ákos Nyerges; Ákos Nyerges; Csaba Pál; Lucija Peterlin Mašič; Tihomir Tomašič
Veröffentlicht in: Pharmaceutics, volumne 13, chapter 6, Ausgabe 2, 2020, ISSN 1999-4923
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pharmaceutics13010006

CRISPR-interference-based modulation of mobile genetic elements in bacteria

Autoren: Ákos Nyerges, Balázs Bálint, Judit Cseklye, István Nagy, Csaba Pál, Tamás Fehér
Veröffentlicht in: Synthetic Biology, Ausgabe 4/1, 2019, ISSN 2397-7000
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/synbio/ysz008

Rationally designed foldameric adjuvants enhance antibiotic efficacy via promoting membrane hyperpolarization

Autoren: Kaushik Nath Bhaumik; Anasztázia Hetényi; Gábor Olajos; Ana Martins; Réka Spohn; Lukács Németh; Balázs Jójárt; Petra Szili; Petra Szili; Anett Dunai; Pramod Kumar Jangir; Lejla Daruka; Lejla Daruka; Imre Földesi; D Kata; Csaba Pál; Tamás A. Martinek
Veröffentlicht in: Molecular Systems Design & Engineering, Ausgabe 2, 2021, ISSN 2058-9689
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1me00118c

Dual Action of the PN159/KLAL/MAP Peptide: Increase of Drug Penetration across Caco-2 Intestinal Barrier Model by Modulation of Tight Junctions and Plasma Membrane Permeability

Autoren: Alexandra Bocsik, Ilona Gróf, Lóránd Kiss, Ferenc Ötvös, Ottó Zsíros, Lejla Daruka, Lívia Fülöp, Monika Vastag, Ágnes Kittel, Norbert Imre, Tamás Martinek, Csaba Pál, Piroska Szabó-Révész, Mária A. Deli
Veröffentlicht in: Pharmaceutics, Ausgabe 11/2, 2019, Seite(n) 73, ISSN 1999-4923
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pharmaceutics11020073

Rational design of balanced dual-targeting antibiotics with limited resistance

Autoren: Akos Nyerges, Tihomir Tomašič, Martina Durcik, Tamas Revesz, Petra Szili, Gabor Draskovits, Ferenc Bogar, Žiga Skok, Nace Zidar, Janez Ilaš, Anamarija Zega, Danijel Kikelj, Lejla Daruka, Balint Kintses, Balint Vasarhelyi, Imre Foldesi, Diána Kata, Martin Welin, Raymond Kimbung, Dorota Focht, Lucija Peterlin Mašič, Csaba Pal
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 18/10, 2020, Seite(n) e3000819, ISSN 1545-7885
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000819

Proteome-wide landscape of solubility limits in a bacterial cell

Autoren: Ádám Györkei, Lejla Daruka, Dávid Balogh, Erika Őszi, Zoltán Magyar, Balázs Szappanos, Gergely Fekete, Mónika Fuxreiter, Péter Horváth, Csaba Pál, Bálint Kintses & Balázs Papp
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2022, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-10427-1

Phylogenetic barriers to horizontal transfer of antimicrobial peptide resistance genes in the human gut microbiota

Autoren: Bálint Kintses, Orsolya Méhi, Eszter Ari, Mónika Számel, Ádám Györkei, Pramod K. Jangir, István Nagy, Ferenc Pál, Gergely Fekete, Roland Tengölics, Ákos Nyerges, István Likó, Anita Bálint, Tamás Molnár, Balázs Bálint, Bálint Márk Vásárhelyi, Misshelle Bustamante, Balázs Papp, Csaba Pál
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 4/3, 2019, Seite(n) 447-458, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-018-0313-5

Integrated evolutionary analysis reveals antimicrobial peptides with limited resistance

Autoren: Réka Spohn, Lejla Daruka, Viktória Lázár, Ana Martins, Fanni Vidovics, Gábor Grézal, Orsolya Méhi, Bálint Kintses, Mónika Számel, Pramod K. Jangir, Bálint Csörgő, Ádám Györkei, Zoltán Bódi, Anikó Faragó, László Bodai, Imre Földesi, Diána Kata, Gergely Maróti, Bernadett Pap, Roland Wirth, Balázs Papp, Csaba Pál
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12364-6

Limited Evolutionary Conservation of the Phenotypic Effects of Antibiotic Resistance Mutations

Autoren: Gábor Apjok, Gábor Boross, Ákos Nyerges, Gergely Fekete, Viktória Lázár, Balázs Papp, Csaba Pál, Bálint Csörgő
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe 36/8, 2019, Seite(n) 1601-1611, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msz109

Suboptimal Global Transcriptional Response Increases the Harmful Effects of Loss-of-Function Mutations

Autoren: Károly Kovács; Zoltán Farkas; Djordje Bajić; Dorottya Kalapis; Andreea Daraba; Karola Almási; Bálint Kintses; Bálint Kintses; Zoltán Bódi; Richard A. Notebaart; Juan F. Poyatos; Patrick Kemmeren; Frank C. P. Holstege; Csaba Pál; Balázs Papp
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, 38(3), 1137 - 1150, Ausgabe 2, 2020, ISSN 0024-2160
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaa280

Pathogen diversity drives the evolution of generalist MHC-II alleles in human populations

Autoren: Máté Manczinger, Gábor Boross, Lajos Kemény, Viktor Müller, Tobias L. Lenz, Balázs Papp, Csaba Pál
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 17/1, 2019, Seite(n) e3000131, ISSN 1545-7885
Herausgeber: Plos Biology
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000131

Phenotypic heterogeneity promotes adaptive evolution

Autoren: Zoltán Bódi, Zoltán Farkas, Dmitry Nevozhay, Dorottya Kalapis, Viktória Lázár, Bálint Csörgő, Ákos Nyerges, Béla Szamecz, Gergely Fekete, Balázs Papp, Hugo Araújo, José L. Oliveira, Gabriela Moura, Manuel A. S. Santos, Tamás Székely Jr, Gábor Balázsi, Csaba Pál
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 15/5, 2017, Seite(n) e2000644, ISSN 1545-7885
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.2000644

A highly precise and portable genome engineering method allows comparison of mutational effects across bacterial species

Autoren: Ákos Nyerges, Bálint Csörgő, István Nagy, Balázs Bálint, Péter Bihari, Viktória Lázár, Gábor Apjok, Kinga Umenhoffer, Balázs Bogos, György Pósfai, Csaba Pál
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 113/9, 2016, Seite(n) 2502-2507, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1520040113

Collateral sensitivity of antibiotic-resistant microbes

Autoren: Csaba Pál, Balázs Papp, Viktória Lázár
Veröffentlicht in: Trends in Microbiology, Ausgabe 23/7, 2015, Seite(n) 401-407, ISSN 0966-842X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tim.2015.02.009

Evolution of complex adaptations in molecular systems

Autoren: Csaba Pál, Balázs Papp
Veröffentlicht in: Nature Ecology & Evolution, Ausgabe 1/8, 2017, Seite(n) 1084-1092, ISSN 2397-334X
Herausgeber: Springer Natur
DOI: 10.1038/s41559-017-0228-1

Adaptive evolution of complex innovations through stepwise metabolic niche expansion

Autoren: Balázs Szappanos, Jonathan Fritzemeier, Bálint Csörgő, Viktória Lázár, Xiaowen Lu, Gergely Fekete, Balázs Bálint, Róbert Herczeg, István Nagy, Richard A. Notebaart, Martin J. Lercher, Csaba Pál, Balázs Papp
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 7, 2016, Seite(n) 11607, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms11607

Indispensability of Horizontally Transferred Genes and Its Impact on Bacterial Genome Streamlining

Autoren: Ildikó Karcagi, Gábor Draskovits, Kinga Umenhoffer, Gergely Fekete, Károly Kovács, Orsolya Méhi, Gabriella Balikó, Balázs Szappanos, Zsuzsanna Györfy, Tamás Fehér, Balázs Bogos, Frederick R. Blattner, Csaba Pál, György Pósfai, Balázs Papp
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe 33/5, 2016, Seite(n) 1257-1269, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msw009

Evolution of Robustness to Protein Mistranslation by Accelerated Protein Turnover

Autoren: Dorottya Kalapis, Ana R. Bezerra, Zoltán Farkas, Peter Horvath, Zoltán Bódi, Andreea Daraba, Béla Szamecz, Ivo Gut, Mónica Bayes, Manuel A. S. Santos, Csaba Pál
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 13/11, 2015, Seite(n) e1002291, ISSN 1545-7885
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.1002291

Efflux Pump Control Alters Synthetic Gene Circuit Function

Autoren: Junchen Diao, Daniel A. Charlebois, Dmitry Nevozhay, Zoltán Bódi, Csaba Pál, Gábor Balázsi
Veröffentlicht in: ACS Synthetic Biology, Ausgabe 5/7, 2016, Seite(n) 619-631, ISSN 2161-5063
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.5b00154

Antibiotic-resistant bacteria show widespread collateral sensitivity to antimicrobial peptides

Autoren: Viktória Lázár, Ana Martins, Réka Spohn, Lejla Daruka, Gábor Grézal, Gergely Fekete, Mónika Számel, Pramod K Jangir, Bálint Kintses, Bálint Csörgő, Ákos Nyerges, Ádám Györkei, András Kincses, András Dér, Fruzsina R Walter, Mária A Deli, Edit Urbán, Zsófia Hegedűs, Gábor Olajos, Orsolya Méhi, Balázs Bálint, István Nagy, Tamás A Martinek, Balázs Papp, Csaba Pál
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 3/6, 2018, Seite(n) 718-731, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Research Journals
DOI: 10.1038/s41564-018-0164-0

Directed evolution of multiple genomic loci allows the prediction of antibiotic resistance

Autoren: Ákos Nyerges, Bálint Csörgő, Gábor Draskovits, Bálint Kintses, Petra Szili, Györgyi Ferenc, Tamás Révész, Eszter Ari, István Nagy, Balázs Bálint, Bálint Márk Vásárhelyi, Péter Bihari, Mónika Számel, Dávid Balogh, Henrietta Papp, Dorottya Kalapis, Balázs Papp, Csaba Pál
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 115/25, 2018, Seite(n) E5726-E5735, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1801646115

Rapid Evolution of Reduced Susceptibility against a Balanced Dual-Targeting Antibiotic through Stepping-Stone Mutations

Autoren: Petra Szili, Gábor Draskovits, Tamás Révész, Ferenc Bogár, Dávid Balogh, Tamás Martinek, Lejla Daruka, Réka Spohn, Bálint Márk Vásárhelyi, Márton Czikkely, Bálint Kintses, Gábor Grézal, Györgyi Ferenc, Csaba Pál, Ákos Nyerges
Veröffentlicht in: Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Ausgabe 63/9, 2019, ISSN 0066-4804
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aac.00207-19

Hsp70-associated chaperones have a critical role in buffering protein production costs

Autoren: Zoltán Farkas, Dorottya Kalapis, Zoltán Bódi, Béla Szamecz, Andreea Daraba, Karola Almási, Károly Kovács, Gábor Boross, Ferenc Pál, Péter Horváth, Tamás Balassa, Csaba Molnár, Aladár Pettkó-Szandtner, Éva Klement, Edit Rutkai, Attila Szvetnik, Balázs Papp, Csaba Pál
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 7, 2018, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.29845

Rapid decline of bacterial drug-resistance in an antibiotic-free environment through phenotypic reversion

Autoren: Anett Dunai, Réka Spohn, Zoltán Farkas, Viktória Lázár, Ádám Györkei, Gábor Apjok, Gábor Boross, Balázs Szappanos, Gábor Grézal, Anikó Faragó, László Bodai, Balázs Papp, Csaba Pál
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 8, 2019, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.47088

Chemical-genetic profiling reveals limited cross-resistance between antimicrobial peptides with different modes of action

Autoren: Bálint Kintses, Pramod K. Jangir, Gergely Fekete, Mónika Számel, Orsolya Méhi, Réka Spohn, Lejla Daruka, Ana Martins, Ali Hosseinnia, Alla Gagarinova, Sunyoung Kim, Sadhna Phanse, Bálint Csörgő, Ádám Györkei, Eszter Ari, Viktória Lázár, István Nagy, Mohan Babu, Csaba Pál, Balázs Papp
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13618-z

Mismatch repair hierarchy of Pseudomonas putida revealed by mutagenic ssDNA recombineering of the pyrF gene

Autoren: Tomas Aparicio, Akos Nyerges, István Nagy, Csaba Pal, Esteban Martínez‐García, Víctor Lorenzo
Veröffentlicht in: Environmental Microbiology, Ausgabe 22/1, 2019, Seite(n) 45-58, ISSN 1462-2912
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.14814

Chemical-genetic profiling to investigate cross-resistance and collateral sensitivity between antimicrobial peptides

Autoren: Kintses, Bálint; Jangir, Pramod K.; Fekete, Gergely; Számel, Mónika; Méhi, Orsolya; Spohn, Réka; Daruka, Lejla; Martins, Ana; Hosseinnia, Ali; Gagarinova, Alla; Kim, Sunyoung; Phanse, Sadhna; Csörgő, Bálint; Györkei, Ádám; Ari, Eszter; Lázár, Viktória; Faragó, Anikó; Bodai, László; Nagy, István; Babu, Mohan; Pál, Csaba; Papp, Balázs
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 3, 2019, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/542548

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