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Complex Oscillatory Systems: Modeling and Analysis

Livrables

School1, Workshop1

School 1 and workshop 1

Software toolbox

Different software packages are unified an a toolbox package

Workshop3

Workshop 3 performed

Announcements

Announcement on ESR positions published

Workshop2

Workshop 2 performed

School2

School 2

Final conference

Final conference performed

Supervisory Board

Supervisory board of the network

Publications

Noise-driven neuromorphic tuned amplifier

Auteurs: Duccio Fanelli, Francesco Ginelli, Roberto Livi, Niccoló Zagli, Clement Zankoc
Publié dans: Physical Review E, Numéro 96/6, 2017, ISSN 2470-0045
Éditeur: APS
DOI: 10.1103/physreve.96.062313

Firing rate equations require a spike synchrony mechanism to correctly describe fast oscillations in inhibitory networks

Auteurs: Federico Devalle, Alex Roxin, Ernest Montbrió
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 13/12, 2017, Page(s) e1005881, ISSN 1553-7358
Éditeur: International Society for Computational Biology
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005881

Which spike train distance is most suitable for distinguishing rate and temporal coding?

Auteurs: Eero Satuvuori, Thomas Kreuz
Publié dans: Journal of Neuroscience Methods, 2018, ISSN 0165-0270
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2018.02.009

Stabilization of dynamics of oscillatory systems by nonautonomous perturbation

Auteurs: Maxime Lucas, Julian Newman, Aneta Stefanovska
Publié dans: Physical Review E, Numéro 97/4, 2018, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreve.97.042209

Desynchronization induced by time-varying network

Auteurs: Maxime Lucas, Duccio Fanelli, Timoteo Carletti, Julien Petit
Publié dans: EPL (Europhysics Letters), Numéro 121/5, 2018, Page(s) 50008, ISSN 0295-5075
Éditeur: EDP Sciences
DOI: 10.1209/0295-5075/121/50008

Disentangling respiratory sinus arrhythmia in heart rate variability records

Auteurs: Çağdaş Topçu, Matthias Frühwirth, Maximilian Moser, Michael Rosenblum, Arkady Pikovsky
Publié dans: Physiological Measurement, Numéro 39/5, 2018, Page(s) 054002, ISSN 1361-6579
Éditeur: IOP
DOI: 10.1088/1361-6579/aabea4

Scale-freeness or partial synchronization in neural mass phase oscillator networks: Pick one of two?

Auteurs: Andreas Daffertshofer, Robert Ton, Bastian Pietras, Morten L. Kringelbach, Gustavo Deco
Publié dans: NeuroImage, Numéro 180, part B, 2018, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2018.03.070

Analytical approach to network inference: Investigating degree distribution

Auteurs: Gloria Cecchini, Björn Schelter
Publié dans: Physical Review E, Numéro 98/2, 2018, Page(s) 022311, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreve.98.022311

Surrogate data for hypothesis testing of physical systems

Auteurs: Gemma Lancaster, Dmytro Iatsenko, Aleksandra Pidde, Valentina Ticcinelli, Aneta Stefanovska
Publié dans: Physics Reports, Numéro 748, 2018, Page(s) 1-60, ISSN 0370-1573
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.physrep.2018.06.001

Inferring the phase response curve from observation of a continuously perturbed oscillator

Auteurs: Rok Cestnik, Michael Rosenblum
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 8/1, 2018, Page(s) 13606, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-32069-y

Using spike train distances to identify the most discriminative neuronal subpopulation

Auteurs: Eero Satuvuori, Mario Mulansky, Andreas Daffertshofer, Thomas Kreuz
Publié dans: Journal of Neuroscience Methods, 2018, ISSN 0165-0270
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2018.09.008

Evidence of a Critical Phase Transition in Purely Temporal Dynamics with Long-Delayed Feedback

Auteurs: Marco Faggian, Francesco Ginelli, Francesco Marino, Giovanni Giacomelli
Publié dans: Physical Review Letters, Numéro 120/17, 2018, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.120.173901

Dynamics of a large system of spiking neurons with synaptic delay

Auteurs: Federico Devalle, Ernest Montbrió, Diego Pazó
Publié dans: Physical Review E, Numéro 98/4, 2018, Page(s) 042214, ISSN 2470-0045
Éditeur: american physical society
DOI: 10.1103/physreve.98.042214

Pattern invariance for reaction-diffusion systems on complex networks

Auteurs: Giulia Cencetti, Pau Clusella, Duccio Fanelli
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-34372-0

Nonautonomous driving induces stability in network of identical oscillators

Auteurs: Maxime Lucas, Duccio Fanelli, and Aneta Stefanovska
Publié dans: Physical Review E, Numéro 99/12, 2019, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevE.99.012309

Desynchronization and pattern formation in a noisy feed-forward oscillator network

Auteurs: Clément Zankoc, Duccio Fanelli, Francesco Ginelli, Roberto Livi
Publié dans: Physical Review E, Numéro 99/1, 2019, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreve.99.012303

First-order phase transitions in the Kuramoto model with compact bimodal frequency distributions

Auteurs: Bastian Pietras, Nicolás Deschle, Andreas Daffertshofer
Publié dans: Physical Review E, Numéro 98/6, 2018, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreve.98.062219

Inferring directed networks using a rank-based connectivity measure

Auteurs: Marc G. Leguia, Cristina G. B. Martínez, Irene Malvestio, Adrià Tauste Campo, Rodrigo Rocamora, Zoran Levnajić, Ralph G. Andrzejak
Publié dans: Physical Review E, Numéro 99/1, 2019, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreve.99.012319

A minimal model of self-consistent partial synchrony

Auteurs: Pau Clusella, Antonio Politi and Michael Rosenblum
Publié dans: New Journal of Physics, Numéro 18, 2016, ISSN 1367-2630
Éditeur: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1367-2630/18/9/093037

Immunization and Targeted Destruction of Networks using Explosive Percolation

Auteurs: Pau Clusella, Peter Grassberger, Francisco J. Pérez-Reche, and Antonio Politi
Publié dans: Physical Review Letters, Numéro 117, 2016, Page(s) 208301, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevLett.117.208301

Ott-Antonsen attractiveness for parameter-dependent oscillatory networks

Auteurs: Bastian Pietras, Andreas Daffertshofer
Publié dans: Chaos, Numéro 26, 2016, Page(s) 103101, ISSN 1054-1500
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.4963371

Equivalence of coupled networks and networks with multimodal frequency distributions: Conditions for the bimodal and trimodal case

Auteurs: Bastian Pietras, Nicolás Deschle, and Andreas Daffertshofer
Publié dans: Physical Review E, Numéro 94, 2016, Page(s) 052211, ISSN 1539-3755
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevE.94.052211

Synchronization in time-varying random networks with vanishing connectivity

Auteurs: Marco Faggian, Francesco Ginelli, Fernando Rosas, Zoran Levnajić
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-46345-y

Between phase and amplitude oscillators

Auteurs: Pau Clusella, Antonio Politi
Publié dans: Physical Review E, Numéro 99/6, 2019, ISSN 2470-0045
Éditeur: APS
DOI: 10.1103/physreve.99.062201

Network dynamics of coupled oscillators and phase reduction techniques

Auteurs: Bastian Pietras, Andreas Daffertshofer
Publié dans: Physics Reports, Numéro 819, 2019, ISSN 0370-1573
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.physrep.2019.06.001

Reconstructing dynamical networks via feature ranking

Auteurs: Marc G. Leguia, Zoran Levnajić, Ljupčo Todorovski, Bernard Ženko
Publié dans: Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, Numéro 29/9, 2019, Page(s) 093107, ISSN 1054-1500
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.5092170

Exact firing rate model reveals the differential effects of chemical versus electrical synapses in spiking networks

Auteurs: Bastian Pietras, Federico Devalle, Alex Roxin, Andreas Daffertshofer, Ernest Montbrió
Publié dans: Physical Review E, Numéro 100/4, 2019, ISSN 2470-0045
Éditeur: APS
DOI: 10.1103/physreve.100.042412

Leaders and followers: quantifying consistency in spatio-temporal propagation patterns

Auteurs: Thomas Kreuz, Eero Satuvuori, Martin Pofahl, Mario Mulansky
Publié dans: New Journal of Physics, Numéro 19/4, 2017, Page(s) 043028, ISSN 1367-2630
Éditeur: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1367-2630/aa68c3

Generalized synchronization between chimera states

Auteurs: Ralph G. Andrzejak, Giulia Ruzzene, Irene Malvestio
Publié dans: Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, Numéro 27/5, 2017, Page(s) 053114, ISSN 1054-1500
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.4983841

Measures of spike train synchrony for data with multiple time scales

Auteurs: Eero Satuvuori, Mario Mulansky, Nebojsa Bozanic, Irene Malvestio, Fleur Zeldenrust, Kerstin Lenk, Thomas Kreuz
Publié dans: Journal of Neuroscience Methods, Numéro 287, 2017, Page(s) 25-38, ISSN 0165-0270
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2017.05.028

Noise-induced stabilization of collective dynamics

Auteurs: Pau Clusella, Antonio Politi
Publié dans: Physical Review E, Numéro 95/6, 2017, Page(s) 062221, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevE.95.062221

Reconstructing networks of pulse-coupled oscillators from spike trains

Auteurs: Rok Cestnik, Michael Rosenblum
Publié dans: Physical Review E, Numéro 96/1, 2017, Page(s) 012209, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevE.96.012209

Evolutionary optimization of network reconstruction from derivative-variable correlations

Auteurs: Marc G Leguia, Ralph G Andrzejak, Zoran Levnajić
Publié dans: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, Numéro 50/33, 2017, Page(s) 334001, ISSN 1751-8113
Éditeur: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1751-8121/aa7925

SPIKE-order

Auteurs: Thomas Kreuz, Eero Satuvuori, Mario Mulansky
Publié dans: Scholarpedia, Numéro 12/7, 2017, Page(s) 42441, ISSN 1941-6016
Éditeur: Scholarpedia
DOI: 10.4249/scholarpedia.42441

Intertangled stochastic motifs in networks of excitatory-inhibitory units

Auteurs: Clement Zankoc, Duccio Fanelli, Francesco Ginelli, Roberto Livi
Publié dans: Physical Review E, Numéro 96/2, 2017, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevE.96.022308

Robustness and versatility of a nonlinear interdependence method for directional coupling detection from spike trains

Auteurs: Irene Malvestio, Thomas Kreuz, Ralph G. Andrzejak
Publié dans: Physical Review E, Numéro 96/2, 2017, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevE.96.022203

Measures of Spike Train Synchrony and Directionality

Auteurs: Eero Satuvuori, Irene Malvestio, Thomas Kreuz
Publié dans: Mathematical and Theoretical Neuroscience, Numéro 24, 2017, Page(s) 201-222, ISBN 978-3-319-68297-6
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-68297-6_13

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