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N fixing bacteria from extreme environments as a remedy for nitrogen deficiency in saline soils

Projektbeschreibung

Innovation zum Nachweis stickstoffbindender Bakterien

Pflanzenwachstumsfördernde Rhizobakterien liefern den Pflanzen die notwendigen Nährstoffe und können chemische Düngemittel ersetzen. Von besonderer Bedeutung ist ihre Fähigkeit, Stickstoff zu binden. Einige Techniken zum Screening stickstoffbindender Bakterien sind langwierig und ineffizient. Als Alternative dazu bietet sich ein schneller, kosteneffizienter membranbasierter Sensor an. Interessanterweise existieren in extrem salzhaltigen und alkalischen Kalkumgebungen verschiedene mikrobielle Gemeinschaften. Die Isolierung von pflanzenwachstumsfördernden Rhizobakterien aus diesen Umgebungen könnte dazu beitragen, den Salzstress bei verschiedenen Pflanzenarten wie Weizen zu minimieren. Im Rahmen des EU-finanzierten Projekts NitroFixSal wird ein innovativer membranbasierter Sensor zum Nachweis stickstoffbindender Bakterien und zur Isolierung pflanzenwachstumsfördernder Rhizobakterien aus extremen Umgebungen entwickelt. Im Rahmen des Projekts wird auch die suppressive subtraktive Hybridisierung untersucht, um Kenntnisse über die Interaktion zwischen Pflanzen und ihren wachstumsfördernden Rhizobakterien zu erlangen.

Ziel

Plant Growth-Promoting Rhizobacteria (PGPR) provide necessary nutrients to the plants and are promising substitute for the chemical fertilizers to promote plant growth and yield. Among various growth promotion properties of PGPR, the ability to fix N2 is important for plant growth. Several media-based techniques are available to screen the N2 fixing bacteria that are tedious, time-consuming and requires significant amount of resources. Therefore, a rapid, cost-effective membrane-based sensor can be a good alternative of these media-based screening methods. Further, a reservoir of diverse microbial communities is present in a unique extreme environment - saline and alkaline lime in Janikowo, Poland. Isolating PGPR from such extreme environments can be useful for mitigating salinity stress on different crops e.g. wheat (Triticum aestivum), which is one of the most important crops in the world facing significant yield loss in the production due to soil salinity. Also, the study of expression of genes that are differentially expressed in wheat upon interaction with PGPR can result in a better understanding of plant-microbe interaction. Hence, the work is proposed in a sequential manner where the membrane-sensor will be prepared to screen N2 fixing bacteria from the samples collected from extreme environments and allowed to interact with wheat plant under saline condition to check its growth promotion effects. Then the most effective strains/consortia for growth promotion will be selected. Finally, Suppression Subtractive Hybridization (SSH) will be performed to study differentially expressed genes in wheat plants upon interaction with selected strains/consortia. The project is expected to develop innovative membrane-based sensor for the detection of N2 fixing bacteria and isolation of novel and potential halotolerant PGPR from anthropogenic extreme environments. SSH based gene profiling study will also be a new approach to understand plant-PGPR interaction.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

H2020-WF-2018-2020

Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Unterauftrag

H2020-WF-03-2020

Koordinator

UNIWERSYTET MIKOLAJA KOPERNIKA W TORUNIU
Netto-EU-Beitrag
€ 137 625,60
Adresse
UL. JURIJA GAGARINA 11
87100 Torun
Polen

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Region
Makroregion północny Kujawsko-pomorskie Bydgosko-toruński
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
€ 137 625,60