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Targeting environmental pollution with engineered microbial systems á la carte

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Décollage de la biologie de synthèse en Europe

La biologie de synthèse est une nouvelle discipline scientifique qui combine biologie cellulaire et une approche rationnelle d'ingénierie pour créer de nouveaux outils biologiques et de nouveaux processus. Des chercheurs ont pris des mesures pour normaliser ce domaine en développant les bases de données et les outils nécessaires et en accroissant la collaboration et la communication entre les chercheurs.

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La biologie de synthèse offre la possibilité de nouvelles solutions dans les domaines de la santé, de l'énergie et de la pollution environnementale. Malheureusement jusqu'à présent, les recherches dans ce domaine ont été ralenties par une communauté de recherche fragmentée et le manque d'outils simples et fonctionnels.De la même manière, l'informatique embarquée a révolutionné la façon dont nous observons et contrôlons le monde physique:GPS, téléphones portables, commandes de vol électriques, véhicules et robots auto-conduits.Le projet TARPOL financé par l'UE («Targeting environmental pollution with engineered microbial systems a la carte») a justement été mis en place pour orienter et coordonner les recherches de la biologie de synthèse en Europe. Le projet rassemble de nombreuses institutions de l'Union européenne afin d'encourager les collaborations et projets interdisciplinaires dans le domaine. Les principaux objectifs de TARPOL consistaient à promouvoir la biologie de synthèse comme une réelle discipline scientifique tant du côté universitaire que vis à vis du grand public et à développer les moyens matériels, techniques et logiciels appropriés. Les partenaires du projet ont organisé plusieurs ateliers et conférences, développé la recherche et mis en place des banques de données dans plusieurs institutions européennes. Ils ont généré plusieurs outils moléculaires et logiciels pour les biologistes synthétiques. Parmi ces outils moléculaires, il est possible de citer des systèmes génétiques rationalisés ou la sélection de souches bactériennes utiles pour la biologie de synthèse. Les logiciels quant à eux, comprennent une banque de différents gènes de synthèse et d'éléments génétiques et une suite d'outils numériques permettant l'étude de la physiologie bactérienne. En combinant cette boîte à outils génétique avec les disciplines d'ingénierie et d'informatique, les partenaires du projet ont permis de stimuler de nouvelles approches pour résoudre les problèmes de pollution environnementale. Ces nouveaux outils de la biologie de synthèse pourront par exemple être utilisés pour la capture, le stockage et la réutilisation du carbone ou la biorestauration des sols et des rivières.

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