Kontrolowanie morfogenezy bakteryjnej komórek
Fundamentalnym pytaniem w biologii komórkowej jest, w jaki sposób komórka określa i reguluje kształt. Obecnie panuje pogląd, że komórka podlega dynamicznemu podziałowi na działy, gdzie cytoszkielet odgrywa decydującą rolę organizacyjną poprzez koordynację przestrzenną funkcji komórkowych. Odkrycie, że bakterie posiadają aktynopodobną strukturę cytoszkieletową (rodzina MreB), która może regulować morfogenezę komórkową doprowadziło do powstania projektu finansowanego przez UE "Kontrola morfogenezy komórkowej: bakteryjna ściana komórkowa i cytoszkielet aktynowy" (SHAPE). głównym celem badania było wyjaśnienie czynników kontrolujących morfogenezę bakteryjnej ściany komórkowej oraz określenie różnych funkcji cytoszkieletu bakteryjnego i mechanizmów za nie odpowiadających. Naukowcy są zdania, że rodzina białek aktynopodobnych MreB tworzy włókienkową sieć w obrębie komórek bakteryjnych, koordynującą ruch chromosomów lub innych makrocząsteczek, odgrywając w ten sposób rolę analogiczną do eukariotycznego cytoszkieletu w transporcie. Jednak szczegóły mechanistyczne oraz efektory wykorzystane przez białka MreB do spełniania tych ról pozostają niewyjaśnione. Wykorzystując bakterie gram-dodatnie Bacillus subtilis jako model, zespół projektu SHAPE proponuje zdemaskowanie białek wiążących MreB, miejsc docelowych i efektorów oraz określenie czasoprzestrzennej organizacji cytoszkieletu MreB. Jak dotąd wyniki wskazują, że MreB nie tworzą wydłużonych włókien in vivo, zamiast tego generują łaty, które poruszając się prostopadle do długiej osi komórki. Sugeruje to również, że ruch MreB zasilany jest kompleksem syntetyzującym ścianę komórkową. Projekt SHAPE przygląda się czynnikom decydującym o kształcie komórki, skupiając się na roli cytoszkieletu MreB. Poza dostarczeniem cennych informacji na temat mechanizmów odpowiadających za regulację dynamiki i funkcji MreB, wyniki badania mogą zostać potencjalnie wykorzystane jako nowe cele przeciwbakteryjne.