Oporność na chloramfenikol produktów akwakultury w południowo-wschodniej Azji
W projekcie uwzględniono oporność na leki przeciwbakteryjne u bakterii występujących w produktach akwakultur z południowo-wschodniej Azji importowanych przez kraje europejskie. Leki przeciwbakteryjne są szeroko stosowane w gospodarstwach rybnych w południowo-wschodniej Azji i mogą skutkować rozwojem lekoopornych bakterii, co mogłoby być szkodliwe dla zdrowia publicznego oraz stanowić zagrożenie dla produktywności i miejscowej gospodarki. Z tego względu podstawowym celem było zastosowanie odpowiednich środków kontroli zagrożeń w celu skutecznego zarządzania ekosystemem. W ramach projektu ASIARESIST podjęto badania nad niezawodną metodą identyfikacji bakterii opornych na lek przeciwbakteryjny chloramfenikol (ang. CHL, chloramphenicol) z początkowym zastosowaniem techniki repetytywnej reakcji PCR (ang. repPCR, repetitive polymerase chain reaction) dla fragmentów chromosomów. Na podstawie uzyskanych profilów zidentyfikowano prawdopodobne duplikaty genów opornych na CHL i oddzielono od pozostałych próbek, które z kolei poddano analizie z użyciem chromatografii gazowo-cieczowej w kierunku komórkowych estrów metylowych kwasów tłuszczowych (ang. FAME, fatty acid methyl ester). Profile FAME dla nieznanych próbek zostały porównane z ogólną bazą danych TSBA z zamierzeniem ich klasyfikacji przynajmniej na poziomie rodziny bakterii. Umożliwiło to sporządzenie pierwszego wszechstronnego raportu odnośnie bakterii opornych na chloramfenikol w akwakulturach południowo-wschodniej Azji.
