Des bases de données génomiques pour le virus de la fièvre catarrhale
Le virus de la fièvre catarrhale (VFC) est une maladie dévastatrice qui touche les ruminants. Si l'histoire dénombre quelques incursions sporadiques dans les régions les plus au sud de l'Europe, depuis 1998, les souches de fièvre catarrhale se sont propagées vers le nord et à travers toute l'Europe. Son vecteur, le moucheron Culcoides spp, a également élargi son champ d'action et des cas ont été récemment recensés au Royaume-Uni. Cette propagation explique la très haute importance des travaux de recherche menés par le projet BLUETONGUE VACCINATION financé par la CE pour le monde agricole. Les partenaires du projet ont entrepris de développer une stratégie de vaccination efficace et sûre afin d'enrayer la propagation de la maladie. Dans le cadre des efforts pour parvenir au contrôle du virus, les chercheurs de l'Institute for Animal Health à Surrey ont créé une base de données d'isolats de VFC provenant du monde entier. En recourant à des comparaisons de séquences pour tous les isolats de VFC, ils ont par ailleurs développé des amorces visant à distinguer les segments génomiques des vaccins vivants atténués et des souches sauvages européennes. Ces amorces sont répertoriées sur le site www.iah.bbsrc.ac.uk/dsRNA_virus_proteins/ReoID/rt-pcr-primers.htm. Pour plus d'informations sur les origines géographiques possibles des souches européennes du VFC, visitez le site www.iah.bbsrc.ac.uk/dsRNA_virus_proteins/orbivirus-phylogenetic-trees.htm. Ces bases de données permettront d'entreprendre des études épidémiologiques sur les souches du VFC, de même que d'identifier l'origine des infections européennes et la détection précoce de l'affaiblissement du vaccin. Tout cela devrait permettre un contrôle rapide et efficace des éruptions futures. Le service est disponible sous la forme d'une ressource internationale gratuite.
