Les gènes de la fraise révèlent des secrets fruités
Une nouvelle étude publiée dans la revue «Horticulture Research» identifie des marqueurs génétiques clés et des gènes candidats pour la sélection de meilleures fraises. Soutenue par le projet BreedingValue financé par l’UE, l’étude explore l’évolution génétique de la diversité des fraises au cours des 160 dernières années et identifie des marqueurs moléculaires pour les programmes de sélection, permettant d’obtenir des fraises plus éclatantes, plus juteuses et plus durables. Fruit le plus consommé dans le monde, la fraise cultivée est née de l’hybridation spontanée, dans la France du XVIIIe siècle, de deux espèces de fraises importées du Nouveau Monde. Depuis lors, les scientifiques n’ont eu de cesse d’améliorer la fraise en maintenant la diversité génétique, tout en améliorant le rendement et les qualités du fruit, telles que la fermeté et la saveur. L’extension des périodes de stockage et la réduction de la pourriture post-récolte, toutes deux liées à la fermeté des fruits et à d’autres propriétés de leur surface, constituent un autre domaine d’intervention.
De nouveaux marqueurs génétiques pour de meilleures fraises
Alors que les méthodes traditionnelles de sélection ont eu du mal à trouver un équilibre entre la diversité génétique et l’amélioration de la qualité des fruits, des progrès tels que les études d’association à l’échelle du génome (GWAS) offrent de nouvelles possibilités. Grâce aux GWAS, les chercheurs de l’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) et du centre de recherche Invenio, partenaires français du projet BreedingValue, ont découvert des marqueurs génétiques clés liés à des caractéristiques de qualité telles que le poids, la fermeté et la brillance des fruits. L’équipe a identifié 71 associations avec 11 traits de qualité différents, validant des marqueurs connus tels que la fermeté et le sucre et découvrant de nouveaux locus de caractère quantitatif. Trois des six balayages sélectifs détectés sont associés à la brillance et à la résistance de la peau: des caractéristiques importantes pour l’attrait des fruits et la durée de conservation après la récolte. Les résultats indiquent que des améliorations substantielles des principaux objectifs de sélection, y compris le poids, la fermeté, la composition et l’apparence des fruits, se produisent simultanément dans les cultivars européens et américains. Les chercheurs ont également constaté une diminution de la diversité génétique dans certaines régions chromosomiques en raison de la pression de sélection, soulignant l’impact de la sélection sur la variation génétique. Les résultats de l’étude soutenue par le projet BreedingValue (Pre-breeding strategies for obtaining new resilient and added value berries) peuvent entraîner des changements significatifs dans les programmes de sélection des fraises. Les sélectionneurs peuvent utiliser les marqueurs génétiques nouvellement identifiés pour choisir des caractéristiques qui améliorent la qualité des fruits, ce qui permet de produire des fraises qui se conservent plus longtemps sans devoir faire de compromis sur la couleur et la saveur. Béatrice Denoyes, autrice principale de l’étude et chercheuse principale à l’INRAE, déclare dans un communiqué de presse EurekAlert!: «Cette étude offre une vue d’ensemble de la diversité génétique des fraises et de son impact sur la qualité des fruits. L’identification de nouveaux marqueurs génétiques aidera considérablement les programmes de sélection axés sur l’amélioration des caractéristiques des fruits qui sont importantes pour les producteurs et les consommateurs». Pour plus d’informations, veuillez consulter: site web du projet BreedingValue
Mots‑clés
BreedingValue, fraise, fruit, marqueur génétique, diversité génétique, sélection, sélectionneur