Next Generation Instrument for In-Depth Analysis of Mitochondrial Fitness

Livrables

Report containing updated communication strategy and activities performed during Year 1 of the project.

Report containing the final communication plan and all the activities and results performed during Year 1 and Year 2 of the project

Final SOPs and User’s Manual for each module

A compiled list of SOPs and protocols in the User Manual that will be posted online and accompany the NextGenO2k device

Website

Updated website with a dedicated section for NextGen-O2k Phase 2 project.

Publications

Comparable respiratory activity in attached and suspended human fibroblasts.

Auteurs: Zdrazilova L, Hansikova H, Gnaiger E
Publié dans: MitoFit Preprints, Numéro 2021.7, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

O2k-FluoRespirometer manual

Auteurs: Gnaiger E, Komlódi T, Schmitt S, Cecatto C, Gradl L, Gradl P
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 22.11(v9), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Hepatitis C virus-linked mitochondrial dysfunction promotes hypoxia-inducible factor 1α-mediated glycolytic adaptation

Auteurs: Cardoso LHD and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 21/07/2020, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Experimental oxygen concentration influences rates of mitochondrial hydrogen peroxide release from cardiac and skeletal muscle preparations

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 24/06/2020, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Mitochondrial dysfunction in peripheral blood mononuclear cells in early experimental and clinical acute pancreatitis. Pancreatology

Auteurs: Falaye T, Sobotka O and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 30/07/2020, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

NextGen-O2k: PB-Module manual

Auteurs: Di Marcello M, Merth A, Doerrier C, Schmitt S, Schwaninger H, Walter-Vracevic M, Gradl P, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 26.11, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

O2k Quality Control 1: Polarographic oxygen sensors and accuracy of calibration - DatLab 8.

Auteurs: Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 06.03, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Service of the polarographic oxygen sensor OroboPOS.

Auteurs: Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 19.18B(v9), 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

DatLab-guide through the menus

Auteurs: Gnaiger E, Cecatto C, Gradl L
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 26.06, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

O2k-Chamber cleaning SOP and Integrated Suction System (ISS).

Auteurs: Di Marcello M, Komlodi T, Schmitt S, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 19.03(v7), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

O2k-MultiSensor system with ion selective electrodes (ISE).

Auteurs: Komlodi T, Schmitt S, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 15.03(v9), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Cell-permeable succinate rescues mitochondrial respiration in cellular models of statin toxicity

Auteurs: Cecatto C and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 27/04/2021, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

O2k-checklist: get started with an O2k-experiment

Auteurs: Doerrier C, Schmitt S, Cecatto C, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 20.04(v5), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Bioenergetic cluster analysis – mitochondrial respiratory control in human fibroblasts

Auteurs: Gnaiger E
Publié dans: MitoFit Preprints, Numéro 2021.8, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Doxorubicin-transferrin conjugate alters mitochondrial homeostasis and energy metabolism in human breast cancer cells

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 30/06/2021, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Magnesium Green for fluorometric measurement of ATP production does not interfere with mitochondrial respiration

Auteurs: Cardoso LHD, Doerrier C, Gnaiger
Publié dans: Bioenergetics Communications, Numéro 2021.1, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Oncogenic HSP60 regulates mitochondrial oxidative phosphorylation to support Erk1/2 activation during pancreatic cancer cell growth

Auteurs: Cecatto C and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 18/11/2020, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Laboratory protocol: isolation of mouse heart mitochondria

Auteurs: Komlodi T, Cardoso LHD, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 20.068v2), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

High-resolution respirometry for chloroplast and mitochondrial bioenergetics in Chlamydomonas reinhardtii ― towards biotechnology exploitations

Auteurs: Huete-Ortega M, Di Marcello M, Iglesias-Gonzalez J, Gnaiger E
Publié dans: MitoFit Preprints, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Magnesium Green for fluorometric measurement of ATP production does not interfere with mitochondrial respiration.

Auteurs: Cardoso LHD, Doerrier C, Gnaiger E
Publié dans: MitoFit Preprints, Numéro 2021.1, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Effects of ultramarathon running on mitochondrial function of platelets and oxidative stress parameters: a pilot study

Auteurs: Cecatto C and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 16/09/2021, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

O2k-Specifications for respirometry and comprehensive OXPHOS analysis

Auteurs: Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 18.10(09), 2019, Page(s) 1-8
Éditeur: Oroboros Instruments

O2k Quality Control 2: Instrumental oxygen background correction and accuracy of oxygen flux

Auteurs: Fasching M, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 14.06(08), 2020, Page(s) 1-16
Éditeur: Oroboros Instruments

NextGen-O2k: Q-Module Manual

Auteurs: Komlodi T, Cardoso LHD, Gollner M, Merth A, Hunger M, Iglesias-Gonzalez J, Doerrier C, Tindle-Solomon L, Schwaninger H, Walter-Vracevic M, Gradl P, Moore AL, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 24.12(02), 2020, Page(s) 1-21
Éditeur: Oroboros Instruments

DatLab 8.0: Cyclic voltammetry manual

Auteurs: Komlodi T, Cardoso LHD, Haider M, Tindle-Solomon L, Iglesias-Gonzalez J, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 24.16(01), 2019, Page(s) 1-10
Éditeur: Oroboros Instruments

Oxygen flux analysis with DatLab 7.4

Auteurs: Cardoso LHD, Antunes D, Iglesias-Gonzalez J, Komlodi T, Doerrier C, Garcia-Souza LF, Gnaiger E, Sobotka O
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 24.06(02), 2020, Page(s) 1-11
Éditeur: Oroboros Instruments

Hydrogen peroxide flux analysis using Amplex Ultra Red assay in MiR05-Kit with DatLab 7.4

Auteurs: Komlodi T, Iglesias-Gonzalez J, Cardoso LHD, Sobotka O, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 24.10(02), 2020, Page(s) 1-6
Éditeur: Oroboros Instruments

Data analysis of mitochondrial membrane potential estimation using safranin

Auteurs: Komlodi T, Fasching M, Antunes D, Iglesias-Gonzalez J, Sobotka O, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 24.08(02), 2020, Page(s) 1-8
Éditeur: Oroboros Instruments

Data analysis of mitochondrial membrane potential estimation using various fluorescence dyes

Auteurs: Komlodi T, Antunes D, Iglesias-Gonzalez J, Sobotka O, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 24.09(02), 2020, Page(s) 1-5
Éditeur: Oroboros Instruments

Mitochondrial respiratory states and rates

Auteurs: Gnaiger E, Aasander Frostner E, Abdul Karim N, Abdel-Rahman EA, Abumrad NA, Acuna-Castroviejo D, Adiele RC, Ahn B, Alencar MB, Ali SS, Almeida A, Alton L, Alve sMG, Amati F, Amoedo ND, Amorim R, Andreadou I, Antunes D, Aragó M, Aral C, Arandarčikaitė O,Arias Reyes C, Armand AS, Arnould T, Avram VF, Bailey DM, Bairam A, Bajpeyi S, Bajzikova M, Bakker BM, Banni A, Bardal T, Barlow J, Bastos Sant'
Publié dans: MitoFit Preprint Archives, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Mitochondrial physiology

Auteurs: Gnaiger E, Aasander Frostner E, Abdul Karim N, Abdel-Rahman EA, Abumrad NA, Acuna-Castroviejo D, Adiele RC, Ahn B, Alencar MB, Ali SS, Almeida A, Alton L, Alve sMG, Amati F, Amoedo ND, Amorim R, Andreadou I, Antunes D, Aragó M, Aral C, Arandarčikaitė O,Arias Reyes C, Armand AS, Arnould T, Avram VF, Bailey DM, Bairam A, Bajpeyi S, Bajzikova M, Bakker BM, Banni A, Bardal T, Barlow J, Bastos Sant'
Publié dans: Bioenergetics Communications, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Inter-laboratory harmonization of respiratory protocols in permeabilized human muscle fibers

Auteurs: Doerrier C, Gama-Perez P, Distefano G, Pesta D, Soendergaard SD, Chroeis KM, Gonzalez-Franquesa A, Goodpaster BH, Coen P, Larsen S, Gnaiger E, Garcia-Roves PM
Publié dans: MitoFit Preprint Archives, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Partitioning between cytochrome c oxidase and alternative oxidase studied by oxygen kinetics of dark respiration in Chlamydomonas reinhardtii: a microalgae model organism

Auteurs: Di Marcello M, Iglesias-Gonzalez J, Meszaros A, Haider M, Gnaiger E, Huete-Ortega M
Publié dans: MitoFit Preprint Archives, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Generating reference values on mitochondrial respiration in permeabilized muscle fibers

Auteurs: Chabi Béatrice, Ost M, Gama-Perez P, Dahdah N, Lemieux H, Holody CD, Carpenter RG, Tepp K, Puurand M, Kaambre T, Dubouchaud H, Cortade F, Pesta D, Calabria E, Casado M, Fernandez-Ortiz M, Acuña-Castroviejo D, Villena JA, Grefte S, Keijer J, O'Brien K, Sowton A, Murray AJ, Campbell MD, Marcinek DJ, Nollet E, Wüst R, Dayanidhi S, Gnaiger E, Doerrier C, Garcia-Roves PM
Publié dans: MitoFit Preprint Archives, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Commitment to reproducibility in targeting mitochondrial respiratory control: basic and advanced applications of the O2k-FluoRespirometer

Auteurs: Doerrier C, Di Marcello M, Gnaiger E
Publié dans: 2020
Éditeur: Foundation for Translational Myology

Endogenous quinones sustain a moderate NADH oxidation by Complex I during anoxia

Auteurs: Ravasz D, Bui D, Kitayev A, Greenwood B, Hill C, Komlodi T, Doerrier C, Ozohanics O, Moore AL, Gnaiger E, Kiebish M, Kolev K, Seyfried TN, Willis WT, Narain N, Adam-Vizi V, Chinopoulos C
Publié dans: 2019
Éditeur: Mitochondrial Physiology Network

Succinate dehydrogenase is a source of reactive oxygen species in plants and regulates development and stress responses

Auteurs: Huete-Ortega M
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-06-05, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Regulation of ATP production: dependence on calcium concentration and respiratory state

Auteurs: Cardoso L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-06-12, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Mitochondrial respiration in peripheral blood mono nuclear cells correlates with depressive sub-symptoms and severity of major depression

Auteurs: Garcia-Souza LF
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-06-19, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Mitochondrial respiratory control and early defects of oxidative phosphorylation in the failing human heart

Auteurs: Gnaiger E and Iglesias-Gonzalez J
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-06-26, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

High intensity exercise inhibits carnitine palmoyltranferase-I sensitivity to L-carnitine

Auteurs: Krumschnable G
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-07-02, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Rapid kinetics of changes in oxygen consumption rate in thrombin-stimulated platelets measured by high-resolution respirometry

Auteurs: Garcia-Souza LF
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-07-09, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Direct effects of phenformin on metabolism/bioenergetics and viability of SH-SY5Y neuroblastoma cells

Auteurs: Bastos AC
Publié dans: O2k-brief, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Selective disruption of respiratory supercomplexes as a new strategy to supress Her2high breast cancer

Auteurs: Bastos AC
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-07-24, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Endogenous myoglobin in breast cancer is hypoxia-inducible by alternate transcription and functions to impair mitochondrial activity: a role in tumor suppression?

Auteurs: Iglesias-Gonzalez J
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-07-31, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

6-Hydroxidopamine induces different mitochondrial bioenergetics response in brain regions of rat

Auteurs: Iglesias-Gonzalez J
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-08-07, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Non-canonical BAD activity regulates breast cancer cells and tumor growth via 14-3-3 binding and mitochondrial metabolism

Auteurs: Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-10-25, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Measurement of ADP-ATP exchange in relation to mitochondrial transmembrane potential and oxygen consumption

Auteurs: Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-11-28, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Analysis of respiratory capacity in brain tissue preparations: high-resolution respirometry for intact hippocampal slices

Auteurs: Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2019-11-12, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Inhibition of mitochondrial respiration prevents BRAF-mutant melanoma brain metastasis

Auteurs: Antunes D and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-01-20, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

The metabolite BH4 controls T cell proliferation in autoimmunity and cancer

Auteurs: Garcia-Souza LF and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-02-04, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Effects of aging and exercise training on mitochondrial function and apoptosis in the rat heart

Auteurs: Cecatto C and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-03-18, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Effect of initial aging and high-fat/high-fructose diet on mitochondrial bioenergetics and oxidative status in rat brain

Auteurs: Antunes D and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-03-05, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Muscle-derived GDF15 drives diurnal anorexia and systemic metabolic remodeling during mitochondrial stress

Auteurs: Antunes D and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-04-03, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Respiratory chain signaling is essential for adaptive remodeling following cardiac ischaemia

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-05-15, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

OXPHOS remodeling n high-grade prostate cancer involves mtDNA mutations and increased succinate oxidation

Auteurs: Bastos AC and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-05-28, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Peripheral mitochondrial dysfunction in Alzheimer’s disease: focus on lymphocytes.

Auteurs: Garcia-Souza LF and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 2020-04-16, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

High-Fat diet activates liver iPLA2γ generating eicosanoids that mediate metabolic stress

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 15/06/2021, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Platelet mitochondrial respiration, endogenous coenzyme Q10 and oxidative stress in patients with chronic kidney disease

Auteurs: Falaye T, Sobotka O and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 29/05/2020, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

NextGen-O2k manual

Auteurs: Gnaiger E, Cardoso LHD, Cecatto C, Niedenzu W, Haider M, Gollner M, Merth A, Schwaninger H, Walter-Vracevic M, Gradl P
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 26.13, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Measurement of mitochondrial ATP production using Magnesium Green: DL-Protocols and data analysis with DatLab 7.4

Auteurs: Cardoso LHD, Komlodi T, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 26.10, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

NextGen-O2k: NADH-Module manual

Auteurs: Doerrier C, Schwaninger H, Walter-Vracevic M, Haider M, Niedenzu W, Komlódi T, Gradl P, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 26.12, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Hippocampal growth factor and myokine cathepsin B expression following aerobic and resistance training in 3xTg-AD mice

Auteurs: Cecatto C and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 18/09/2020, 2020
Éditeur: Oroboros Instruments

Adaptation of mitochondrial substrate flux in a mouse model of nonalcoholic fatty liver disease

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 04/01/2021, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

An mtDNA mutant mouse demonstrates that mitochondrial deficiency can result in autism endophenotypes

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 29/03/2021, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Ex vivo mitochondrial respiration parallels biochemical response to ibrutinib in CLL cells

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 16/08/2021, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Oxygen dependence of photosynthesis and light-enhanced dark respiration studied by High-Resolution PhotoRespirometry

Auteurs: Went N, Di Marcello M, Gnaiger E
Publié dans: MitoFit Preprints, Numéro 2021.5, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

The elementary unit — canonical reviewer's comments on: Bureau International des Poids et Mesures

Auteurs: Gnaiger E
Publié dans: MitoFit Preprints, Numéro 2021.4(v2), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Colon cancer cell differentiation by sodium butyrate modulates metabolic plasticity of Caco-2 cells via alteration of phosphotransfer network

Auteurs: Komlodi T and Tindle-Solomon L
Publié dans: O2k-brief, Numéro 09/06/2021, 2019
Éditeur: Oroboros Instruments

Titration-Injection microPump TIP2k manual.

Auteurs: Gradl L, Gradl P, Gnaiger E
Publié dans: Mitochondrial Physiology Network, Numéro 12.10(v9), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Coupling and pathway control of coenzyme Q redox state and respiration in isolated mitochondria

Auteurs: Komlódi T, Cardoso LHD, Doerrier C, Moore AL, Rich PR, Gnaiger E
Publié dans: MitoFit Preprints, Numéro 2021.2(v4), 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Mitochondrial respiration of platelets: comparison of isolation methods.

Auteurs: Vernerova A, Garcia-Souza LF, Soucek O, Kostal M, Rehacek V, Krcmova LK, Gnaiger E, Sobotka O
Publié dans: MitoFit Preprints, Numéro 2021.6, 2021
Éditeur: Oroboros Instruments

Mitochondrial pathways and respiratory control

Auteurs: Gnaiger E
Publié dans: Bioenergetics Communicatoins, Numéro 2020.2, 2020, ISBN 978-3-9504814-2-6
Éditeur: Bioenergetics Communicatoins

Droits de propriété intellectuelle

High-Resolution Respirometry (HRR)

Numéro de demande/publication: EU 018170785
Date: 2020-05-25
Demandeur(s): OROBOROS INSTRUMENTS GmbH

DatLab

Numéro de demande/publication: EU 018170784
Date: 2020-05-25
Demandeur(s): OROBOROS INSTRUMENTS GmbH

O2k

Numéro de demande/publication: EU 018480189
Date: 2021-05-27
Demandeur(s): OROBOROS INSTRUMENTS GmbH

NextGen-O2k

Numéro de demande/publication: EU 018170776
Date: 2020-05-25
Demandeur(s): OROBOROS INSTRUMENTS GmbH

Livrables

Publications

Droits de propriété intellectuelle

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