Livrables
Report on the availability of cloud-based data analysis pipelines based on software developed in the project
Report on the availability of cloudbased data analysis pipelines based on software developed in the project
Report on the organization of training workshopsSecond progress report
Report 2 on Coordination activities with ELIXIR
Lightweight NDA between industrial platform and EPIC-XS
Delivery of 133 days of access at KTH
Status report 3 on publication performance resulting from TA
Disseminate the clinical phosphoproteomics and histone PTM analysis technology within and outside EPIC-XS
Disseminate the clinical phosphoproteomics and histone PTM analysis technology within and outside EPICXS
Delivery of 180 days of access at IPIntegrated structural characterization of target protein systems in vitro and in situ
Report on rigorous quality control approaches and software for mass spectrometry proteomics data from clinical samples
Report on the interaction with industrial parties
Status report on publication performance resulting from TA
Report on the transfer of methods to study proteome organization and structural and spatial proteomics to the EPIC-XS access sites
Report on the transfer of methods to study proteome organization and structural and spatial proteomics to the EPICXS access sites
Delivery of 362 days of access at UUSummary report on networking activities with industry
Delivery of 175 days of access at CRG
Draft Engagement Plan
Optimized protocol for the enrichment and large-scale analysis of currently uncharacterized protein modifications
Optimized protocol for the enrichment and largescale analysis of currently uncharacterized protein modifications
Report on outreach activitiesDynamic structural and spatial proteome maps in response to perturbations or disease
Recruitment of a Project Manager
Optimized protocol for high-sensitivity proteomics towards single cell analysis including loss-less sample preparation methods and LC-MS/MS acquisition parameters with proof-of-concept on FACS-sorted cell populations
Optimized protocol for highsensitivity proteomics towards single cell analysis including lossless sample preparation methods and LCMSMS acquisition parameters with proofofconcept on FACSsorted cell populations
Disseminate developed robust and high-throughput plasma proteomics technology to hospitals and research groupsDisseminate developed robust and highthroughput plasma proteomics technology to hospitals and research groups
Report on novel tools for the identification and quantification of cross-linked peptidesReport on novel tools for the identification and quantification of crosslinked peptides
Report 2 on conferences and meetings with EPIC-XS representationReport on conferences and meetings with EPICXS representation
Report on the integration of proteome organization data with functional protein association dataForesight White Paper
Report 2 on outreach activities
Report on outreach activities
Disseminate optimized and standardized protocol for the proteomic analysis of EVs in clinically relevant samples.Disseminate optimized and standardized protocol for the proteomic analysis of EVs in clinically relevant samples
Management GuidelinesBest practice DIA library-free and hybrid DIA workflows for comprehensive proteome analysis
Best practice DIA libraryfree and hybrid DIA workflows for comprehensive proteome analysis
Optimized LiP-MS and HDX protocols with enhanced sensitivity and in cell applicationReport on the transfer of methods to study intact proteomes to the EPIC-XS access sites
Report on the transfer of methods to study intact proteomes to the EPICXS access sites
Status report on TA project evaluations and TA deliveryAt least two articles for the general public
Delivery of 368 days of access at VIB
First report on the higher order organization of the plasma proteome
Delivery of 109 days of access at CNIO
Disseminate protocols for enrichment and analysis of tissue leakage proteins from blood plasma and cell surface exposed proteins
Midterm summary report on networking activities
Delivery of 345 days of access at ETH
Report on conferences and meetings with EPIC-XS representation
Report on the transfer of methods to study clinical proteomes to the EPIC-XS access sites
Report on the transfer of methods to study clinical proteomes to the EPICXS access sites
Status report 2 on publication performance resulting from TAReport on the organization of annual user meetings
Status report 3 on TA project evaluations and TA delivery
Standard protocol for intact protein analysis including sample preparation, LC-MS/MS and data analysis
Standard protocol for intact protein analysis including sample preparation LCMSMS and data analysis
Report on Coordination activities with ELIXIRDelivery of 140 days of access at TUM
Delivery of 22 access projects at IEO
First progress report
Report on novel algorithms for top-down proteomics data
Report on novel algorithms for topdown proteomics data
Delivery of 40 days of access at MUDelivery of 80 days of access at IMIC
Report on Machine Learning modules to predict fragmentation spectra for phosphorylated, ubiquitinylated and acylated peptides, and their implementation in performant DDA and DIA identification algorithms
Report on Machine Learning modules to predict fragmentation spectra for phosphorylated ubiquitinylated and acylated peptides and their implementation in performant DDA and DIA identification algorithms
Final reportReport on a novel fragmentation spectrum prediction algorithm for unmodified peptides, and its application in performant DDA and DIA identification algorithms
Status report 2 on TA project evaluations and TA delivery
Report on algorithms for the reliable, unbiased identification of modifications in proteomes
Report on algorithms for the reliable unbiased identification of modifications in proteomes
Library of synthetic cross-linked peptides and optimized workflows for XL-MSLibrary of synthetic crosslinked peptides and optimized workflows for XLMS
Report on demands of the user communityProtocols for cooperation with ESFRI BMS RIs
Optimized protocols for the preparation and analysis of protein assemblies using hybrid approaches in link with JRA4
Publications
Auteurs:
Sidhaye, Jaydeep; Trepte, Philipp; Sepke, Natalie; Novatchkova, Maria; Schutzbier, Michael; Duernberger, Gerhard; Mechtler, Karl; Knoblich, Juergen A.
Publié dans:
eLife, Numéro 12, 2023, Page(s) e85135, ISSN 2050-084X
Éditeur:
eLife Sciences Publications
DOI:
10.7554/elife.85135
Auteurs:
Borges Lima D, Dupré M, Mariano Santos MD, Carvalho PC, Chamot-Rooke J.
Publié dans:
J Am Soc Mass Spectrom, 2021, ISSN 1044-0305
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1021/jasms.1c00014
Auteurs:
Walzer M, García-Seisdedos D, Prakash A, Brack P, Crowther P, Graham RL, George N, Mohammed S, Moreno P, Papatheodorou I, Hubbard SJ, Vizcaíno JA.
Publié dans:
Scientific data, 2022, ISSN 2052-4463
Éditeur:
Nature Pub
DOI:
10.1038/s41597-022-01380-9
Auteurs:
Klykov, Oleg; Kopylov, Mykhailo; Carragher, Bridget; Heck, Albert J. R.; Noble, Alex J.; Scheltema, Richard A.
Publié dans:
Mol. Cell, Numéro 82/2, 2022, Page(s) 285-303, ISSN 1097-2765
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.molcel.2021.12.027
Auteurs:
Walzer, Mathias; Jeong, Kyowon; Tabb, David L.; Vizcaino, Juan Antonio
Publié dans:
Proteomics, 2023, ISSN 1615-9861
Éditeur:
WILEY
DOI:
10.1002/pmic.202200403
Auteurs:
Tobias Hochstoeger, Tarek Al Said, Dante Maestre, Florian Walter, Alexandra Vilceanu, Miriam Pedron, Thomas D. Cushion, William Snider, Simon Nimpf, Gregory Charles Nordmann, Lukas Landler, Nathaniel Edelman, Lennard Kruppa, Gerhard Dürnberger, Karl Mechtler, Stefan Schuechner, Egon Ogris, E. Pascal Malkemper, Stefan Weber, Erik Schleicher, David A. Keays
Publié dans:
Science Advances, Numéro 6/33, 2020, Page(s) eabb9110, ISSN 2375-2548
Éditeur:
Amercian Assoc for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/sciadv.abb9110
Auteurs:
Robusti G, Vai A, Bonaldi T, Noberini R.
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Clinical Epigenetics, 2022, ISSN 1868-7083
Éditeur:
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DOI:
10.1186/s13148-022-01371-y
Auteurs:
Charlotte A.G.H. van Gelder, Maarten Altelaar
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 20, 2021, Page(s) 100087, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1016/j.mcpro.2021.100087
Auteurs:
Bras, Ana Rita; Fernandes, Pedro; Moreira, Tiago; Morales-Sanfrutos, Julia; Sabido, Eduard; Antunes, Alexandra M. M.; Valente, Andreia; Preto, Ana
Publié dans:
Pharmaceutics, Numéro 15/6, 2023, Page(s) 1731, ISSN 1999-4923
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/pharmaceutics15061731
Auteurs:
Fuertes-Perez S, Abele M, Ludwig C, Vogel RF, Hilgarth M.
Publié dans:
Frontiers in Microbiology, 2022, ISSN 1664-302X
Éditeur:
Frontiers Media
DOI:
10.3389/fmicb.2022.866629
Auteurs:
Dhenin, Jonathan; Dupre, Mathieu; Druart, Karen; Krick, Alain; Mauriac, Christine; Chamot-Rooke, Julia
Publié dans:
J. Mass Spectrom., Numéro 58/3, 2023, Page(s) e4909, ISSN 1076-5174
Éditeur:
IM Publications
DOI:
10.1002/jms.4909
Auteurs:
Heidorn-Czarna M, Maziak A, Janska H
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Front. Plant Sci., 2022, ISSN 1664-462X
Éditeur:
Frontiers Media S. A.
DOI:
10.3389/fpls.2022.824080
Auteurs:
Jones AR, Deutsch EW, Vizcaíno JA.
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Proteomics, 2022, ISSN 1615-9861
Éditeur:
Wiley
DOI:
10.1002/pmic.202200014
Auteurs:
Matzinger M, Vasiu A, Madalinski M, Müller F, Stanek F, Mechtler K
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Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-022-31701-w
Auteurs:
Joep Beumer, Jens Puschhof, Julia Bauzá-Martinez, Adriana Martínez-Silgado, Rasa Elmentaite, Kylie R. James, Alexander Ross, Delilah Hendriks, Benedetta Artegiani, Georg A. Busslinger, Bas Ponsioen, Amanda Andersson-Rolf, Aurelia Saftien, Charelle Boot, Kai Kretzschmar, Maarten H. Geurts, Yotam E. Bar-Ephraim, Cayetano Pleguezuelos-Manzano, Yorick Post, Harry Begthel, Franka van der Linden, Carm
Publié dans:
Cell, Numéro 181/6, 2020, Page(s) 1291-1306.e19, ISSN 0092-8674
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cell.2020.04.036
Auteurs:
Galhuber, Markus; Michenthaler, Helene; Heininger, Christoph; Reinisch, Isabel; Noessing, Christoph; Krstic, Jelena; Kupper, Nadja; Moyschewitz, Elisabeth; Auer, Martina; Heitzer, Ellen; Ulz, Peter; Birner-Gruenberger, Ruth; Liesinger, Laura; Lenihan-Geels, Georgia Ngawai; Oster, Moritz; Spreitzer, Emil; Chiozzi, Riccardo Zenezini; Schulz, Tim J.; Schupp, Michael; Madl, Tobias; Heck, Albert J. R.;
Publié dans:
Cell. Mol. Life Sci., Numéro 79/6, 2022, Page(s) 326, ISSN 1420-682X
Éditeur:
Birkhauser Verlag
DOI:
10.1007/s00018-022-04345-8
Auteurs:
Martial Rey, Jonathan Dhenin, Youxin Kong, Lucienne Nouchikian, Isaac Filella, Magalie Duchateau, Mathieu Dupré, Riccardo Pellarin, Guillaume Duménil, Julia Chamot-Rooke
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Analytical Chemistry, Numéro 93/9, 2021, Page(s) 4166-4174, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.0c04430
Auteurs:
Noberini, Roberta; Bonaldi, Tiziana
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Proteomics, 2023, ISSN 1615-9853
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John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.202200435
Auteurs:
Eismann, Lena; Fijalkowski, Igor; Galmozzi, Carla Veronica; Koubek, Jiri; Tippmann, Frank; Van Damme, Petra; Kramer, Guenter
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Cell Reports, Numéro 41/10, 2022, Page(s) 111776, ISSN 2211-1247
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Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2022.111776
Auteurs:
Muha, Villo; Williamson, Ritchie; Hills, Rachel; McNeilly, Alison D.; McWilliams, Thomas G.; Alonso, Jana; Schimpl, Marianne; Leney, Aneika C.; Heck, Albert J. R.; Sutherland, Calum; Read, Kevin D.; McCrimmon, Rory J.; Brooks, Simon P.; van Aalten, Daan M. F.
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Open Biol, Numéro 9/11, 2019, Page(s) 190192, ISSN 2046-2441
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DOI:
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Auteurs:
Moffitt JR, Lundberg E, Heyn H.
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Nature Reviews Genetics, 2022, ISSN 1471-0056
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Nature Publishing Group
DOI:
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Auteurs:
Pacheco-Garcia, Juan Luis; Loginov, Dmitry S.; Anoz-Carbonell, Ernesto; Vankova, Pavla; Palomino-Morales, Rogelio; Salido, Eduardo; Man, Petr; Medina, Milagros; Naganathan, Athi N.; Pey, Angel L.
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Antioxidants, Numéro 11/6, 2022, ISSN 2076-3921
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DOI:
10.3390/antiox11061110
Auteurs:
Smith LM, Agar J, Chamot-Rooke J, Danis P, Ge Y, Loo J, Pasa-Tolic L, Tsybin YO, Kelleher N.
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Science Advances, 2021, ISSN 2375-2548
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Amercian Assoc for the Advancement of Science
DOI:
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Auteurs:
Pascal Albanese, Sem Tamara, Guido Saracco, Richard A. Scheltema, Cristina Pagliano
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Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
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Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-020-15184-1
Auteurs:
Ramasamy P, Vandermarliere E, Vranken WF, Martens L.
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J. Proteome Research, 2022, ISSN 1535-3893
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Auteurs:
Brucher, Dominik; Franc, Vojtech; Smith, Sheena N.; Heck, Albert J. R.; Pluckthun, Andreas
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mAbs, Numéro 12/1, 2020, Page(s) 1792084, ISSN 1942-0862
Éditeur:
TAYLOR & FRANCIS INC
DOI:
10.1080/19420862.2020.1792084
Auteurs:
Heames, Brennen; Buchel, Filip; Aubel, Margaux; Tretyachenko, Vyacheslav; Loginov, Dmitry; Novak, Petr; Lange, Andreas; Bornberg-Bauer, Erich; Hlouchova, Klara
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Nat. Ecol. Evol., Numéro 7/4, 2023, Page(s) 570, ISSN 2397-334X
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NATURE PORTFOLIO
DOI:
10.1038/s41559-023-02010-2
Auteurs:
Gabriels, Ralf; Martens, Lennart; Degroeve, Sven
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Nucleic Acids Res., Numéro 47/W1, 2019, Page(s) W295-W299, ISSN 0305-1048
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Oxford University Press
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Auteurs:
Sem Tamara, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
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Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 117/27, 2020, Page(s) 15554-15564, ISSN 0027-8424
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National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.2002483117
Auteurs:
Cristina Chiva, Teresa Mendes Maia, Christian Panse, Karel Stejskal, Thibaut Douché, Mariette Matondo, Damarys Loew, Dominic Helm, Mandy Rettel, Karl Mechtler, Francis Impens, Paolo Nanni, Anna Shevchenko, Eduard Sabidó
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EMBO reports, Numéro 22/6, 2021, ISSN 1469-221X
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Nature Publishing Group
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10.15252/embr.202152626
Auteurs:
Pagano, Andrea; Kunz, Laura; Dittmann, Antje; Araujo, Susana De Sousa; Macovei, Anca; Shridhar Gaonkar, Shraddha; Sincinelli, Federico; Wazeer, Hisham; Balestrazzi, Alma
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Front. Plant Sci., Numéro 14, 2023, Page(s) 1188546, ISSN 1664-462X
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DOI:
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Auteurs:
Cossec, Jack-Christophe; Traboulsi, Tatiana; Sart, Sebastien; Loe-Mie, Yann; Guthmann, Manuel; Hendriks, Ivo A.; Theurillat, Ilan; Nielsen, Michael L.; Torres-Padilla, Maria-Elena; Baroud, Charles N.; Dejean, Anne
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Cell Reports, Numéro 42/4, 2023, Page(s) 112380, ISSN 2211-1247
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Cell Press
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10.1016/j.celrep.2023.112380
Auteurs:
Martinez-Val A, Bekker-Jensen DB, Steigerwald S, Koenig C, Østergaard O, Mehta A, Tran T, Sikorski K, Torres-Vega E, Kwasniewicz E, Brynjólfsdóttir SH, Frankel LB, Kjøbsted R, Krogh N, Lundby A, Bekker-Jensen S, Lund-Johansen F, Olsen JV.
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Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-27398-y
Auteurs:
Seidlitz T, Schmäche T, Garcίa F, Lee JH, Qin N, Kochall S, Fohgrub J, Pauck D, Rothe A, Koo BK, Weitz J, Remke M, Muñoz J, Stange DE.
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EMBO Molecular Medicine, 2022, ISSN 1757-4676
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10.15252/emmm.202215705
Auteurs:
Xia, Qin; Casas-Martinez, Jose C.; Zarzuela, Eduardo; Munoz, Javier; Miranda-Vizuete, Antonio; Goljanek-Whysall, Katarzyna; McDonagh, Brian
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Redox Biol., Numéro 60, 2023, Page(s) 102631, ISSN 2213-2317
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Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.redox.2023.102631
Auteurs:
Valentina Cappelletti, Thomas Hauser, Ilaria Piazza, Monika Pepelnjak, Liliana Malinovska, Tobias Fuhrer, Yaozong Li, Christian Dörig, Paul Boersema, Ludovic Gillet, Jan Grossbach, Aurelien Dugourd, Julio Saez-Rodriguez, Andreas Beyer, Nicola Zamboni, Amedeo Caflisch, Natalie de Souza, Paola Picotti
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Cell, Numéro 184/2, 2021, Page(s) 545-559.e22, ISSN 0092-8674
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Cell Press
DOI:
10.1016/j.cell.2020.12.021
Auteurs:
Van Den Bossche T, Kunath BJ, Schallert K, Schäpe SS, Abraham PE, Armengaud J, Arntzen MØ, Bassignani A, Benndorf D, Fuchs S, Giannone RJ, Griffin TJ, Hagen LH, Halder R, Henry C, Hettich RL, Heyer R, Jagtap P, Jehmlich N, Jensen M, Juste C, Kleiner M, Langella O, Lehmann T, Leith E, May P, Mesuere B, Miotello G, Peters SL, Pible O, Queiros PT, Reichl U, Renard BY, Schiebenhoefer H, Sczyrba A, T
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Nature Publishing Group, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-27542-8
Auteurs:
Růžena Filandrová, Karel Vališ, Jiří Černý, Josef Chmelík, Lukáš Slavata, Jan Fiala, Michal Rosůlek, Daniel Kavan, Petr Man, Tomáš Chum, Marek Cebecauer, Daniele Fabris, Petr Novák
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Structure, Numéro 29/4, 2021, Page(s) 345-356.e8, ISSN 0969-2126
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.str.2020.11.018
Auteurs:
Rüther PL, Husic IM, Bangsgaard P, Gregersen KM, Pantmann P, Carvalho M, Godinho RM, Friedl L, Cascalheira J, Taurozzi AJ, Jørkov MLS, Benedetti MM, Haws J, Bicho N, Welker F, Cappellini E, Olsen JV
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Nat Commun, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
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Auteurs:
Dmitry S. Loginov, Jan Fiala, Josef Chmelik, Peter Brechlin, Gary Kruppa, Petr Novak
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ACS Omega, Numéro 6/15, 2021, Page(s) 10352-10361, ISSN 2470-1343
Éditeur:
AMER CHEMICAL SOC
DOI:
10.1021/acsomega.1c00732
Auteurs:
Holstein, Tanja; Kistner, Franziska; Martens, Lennart; Muth, Thilo
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Bioinformatics, Numéro 39/5, 2023, Page(s) btad289, ISSN 1367-4803
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btad289
Auteurs:
Claeys, Tine; Menu, Maxime; Bouwmeester, Robbin; Gevaert, Kris; Martens, Lennart
Publié dans:
J. Proteome Res., Numéro 22/4, 2023, Page(s) 1181-1192, ISSN 1535-3893
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American Chemical Society
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Auteurs:
Provez L, Van Puyvelde B, Corveleyn L, Demeulemeester N, Verhelst S, Lintermans B, Daled S, Roels J, Clement L, Martens L, Deforce D, Van Vlierberghe P, Dhaenens M.
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Science Data, 2022, ISSN 2052-4463
Éditeur:
Nature Portfolio
DOI:
10.1038/s41597-022-01736-1
Auteurs:
Amatori, Stefano; Persico, Giuseppe; Cantatore, Francesco; Rusin, Martina; Formica, Mauro; Giorgi, Luca; Macedi, Eleonora; Casciaro, Francesca; Provenzano, Alfredo Errico; Gambardella, Stefano; Noberini, Roberta; Bonaldi, Tiziana; Fusi, Vieri; Giorgio, Marco; Fanelli, Mirco
Publié dans:
Cancer Gene Ther., Numéro 30/5, 2023, Page(s) 671-682, ISSN 0929-1903
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41417-022-00576-w
Auteurs:
Ana Santos-Coquillat,María Isabel González,Agustín Clemente-Moragón,Mario González-Arjona,Virginia Albaladejo-García,Héctor Peinado,Javier Muñoz,Pilar Ximénez Embún,Borja Ibañez,Eduardo Oliver, Manuel Desco, Beatriz Salinas
Publié dans:
Small, 2021, ISSN 1613-6810
Éditeur:
Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI:
10.1002/smll.202105421
Auteurs:
Mullari, Meeli; Fossat, Nicolas; Skotte, Niels H.; Asenjo-Martinez, Andrea; Humphreys, David T.; Bukh, Jens; Kirkeby, Agnete; Scheel, Troels K. H.; Nielsen, Michael L.
Publié dans:
Nat. Commun., Numéro 14/1, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-39936-x
Auteurs:
Vargas-Diaz D, Altelaar M
Publié dans:
J Proteome Res, 2022, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.1c00743
Auteurs:
Matteo Mori, Zhongge Zhang, Amir Banaei‐Esfahani, Jean‐Benoît Lalanne, Hiroyuki Okano, Ben C Collins, Alexander Schmidt, Olga T Schubert, Deok‐Sun Lee, Gene‐Wei Li, Ruedi Aebersold, Terence Hwa, Christina Ludwig
Publié dans:
Molecular Systems Biology, Numéro 17/5, 2021, ISSN 1744-4292
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.15252/msb.20209536
Auteurs:
Corbeski, Ivan; Guo, Xiaohu; Eckhardt, Bruna, V; Fasci, Domenico; Wiegant, Wouter; Graewert, Melissa A.; Vreeken, Kees; Wienk, Hans; Svergun, Dmitri, I; Heck, Albert J. R.; van Attikum, Haico; Boelens, Rolf; Sixma, Titia K.; Mattiroli, Francesca; van Ingen, Hugo
Publié dans:
Sci. Adv., Numéro 8/30, 2022, Page(s) eabo0517, ISSN 2375-2548
Éditeur:
AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE
DOI:
10.1126/sciadv.abo0517
Auteurs:
Ctortecka, Claudia; Mechtler, Karl
Publié dans:
Anal. Sci. Adv., Numéro 2/3-4, 2021, Page(s) 84-94, ISSN 2628-5452
Éditeur:
WILEY
DOI:
10.1002/ansa.202000152
Auteurs:
Tomislav Čaval, Albert J.R. Heck, Karli R. Reiding
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 20, 2021, Page(s) 100010, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.r120.002093
Auteurs:
David Y. Chiang, Satadru Lahiri, Guoliang Wang, Jason Karch, Meng C. Wang, Sung Y. Jung, Albert J. R. Heck, Arjen Scholten, Xander H. T. Wehrens
Publié dans:
Proteomes, Numéro 9/2, 2021, Page(s) 27, ISSN 2227-7382
Éditeur:
MDPI
DOI:
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Auteurs:
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Meena Choi, Jeremy Carver, Cristina Chiva, Manuel Tzouros, Ting Huang, Tsung-Heng Tsai, Benjamin Pullman, Oliver M. Bernhardt, Ruth Hüttenhain, Guo Ci Teo, Yasset Perez-Riverol, Jan Muntel, Maik Müller, Sandra Goetze, Maria Pavlou, Erik Verschueren, Bernd Wollscheid, Alexey I. Nesvizhskii, Lukas Reiter, Tom Dunkley, Eduard Sabidó, Nuno Bandeira, Olga Vitek
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Auteurs:
André M. Almeida, Syed Azmal Ali, Fabrizio Ceciliani, P. David Eckersall, Lorenzo E. Hernández-Castellano, Rongwei Han, Jaka J. Hodnik, Shalini Jaswal, John D. Lippolis, Mark McLaughlin, Ingrid Miller, Ashok Kumar Mohanty, Vladimir Mrljak, Jarlath E. Nally, Paolo Nanni, Jeffrey E. Plowman, Mirele D. Poleti, David M. Ribeiro, Pedro Rodrigues, Bernd Roschitzki, Ralph Schlapbach, Jože Starič, Yon
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Roberta Noberini, Evelyn Oliva Savoia, Stefania Brandini, Francesco Greco, Francesca Marra, Giovanni Bertalot, Giancarlo Pruneri, Liam A. McDonnell, Tiziana Bonaldi
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Auteurs:
Wael Kamel, Marko Noerenberg, Berati Cerikan, Honglin Chen, Aino I. Järvelin, Mohamed Kammoun, Jeffrey Y. Lee, Ni Shuai, Manuel Garcia-Moreno, Anna Andrejeva, Michael J. Deery, Natasha Johnson, Christopher J. Neufeldt, Mirko Cortese, Michael L. Knight, Kathryn S. Lilley, Javier Martinez, Ilan Davis, Ralf Bartenschlager, Shabaz Mohammed, Alfredo Castello
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Auteurs:
Luis Enrique Cabrera-Quio, Alexander Schleiffer, Karl Mechtler, Andrea Pauli
Publié dans:
PLOS Genetics, Numéro 17/2, 2021, Page(s) e1009390, ISSN 1553-7404
Éditeur:
Public Library Science
DOI:
10.1371/journal.pgen.1009390
Auteurs:
Cockx, Bram; Van Bael, Sven; Boelen, Rose; Vandewyer, Elke; Yang, Heeseung; Le, Tuan Anh; Dalzell, Johnathan J.; Beets, Isabel; Ludwig, Christina; Lee, Junho; Temmerman, Liesbet
Publié dans:
Mol. Cell. Proteomics, Numéro 22/2, 2023, Page(s) 100479, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1016/j.mcpro.2022.100479
Auteurs:
Melanie de Almeida, Matthias Hinterndorfer, Hanna Brunner, Irina Grishkovskaya, Kashish Singh, Alexander Schleiffer, Julian Jude, Sumit Deswal, Robert Kalis, Milica Vunjak, Thomas Lendl, Richard Imre, Elisabeth Roitinger, Tobias Neumann, Susanne Kandolf, Michael Schutzbier, Karl Mechtler, Gijs A. Versteeg, David Haselbach, Johannes Zuber
Publié dans:
Nature, Numéro 599/7885, 2021, Page(s) 491-496, ISSN 0028-0836
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41586-021-04035-8
Auteurs:
Giacobelli VG, Fujishima K, Lepšík M, Tretyachenko V, Kadavá T, Makarov M, Bednárová L, Novák P, Hlouchová K
Publié dans:
Mol Biol Evol, 2022, ISSN 0737-4038
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/molbev/msac032
Auteurs:
Barbara Steigenberger, Henk W. P. van den Toorn, Emiel Bijl, Jean-François Greisch, Oliver Räther, Markus Lubeck, Roland J. Pieters, Albert J. R. Heck, Richard A. Scheltema
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 19/10, 2020, Page(s) 1677-1687, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
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Auteurs:
Zecha, Jana; Bayer, Florian P.; Wiechmann, Svenja; Woortman, Julia; Berner, Nicola; Mueller, Julian; Schneider, Annika; Kramer, Karl; Abril-Gil, Mar; Hopf, Thomas; Reichart, Leonie; Chen, Lin; Hansen, Fynn M.; Lechner, Severin; Samaras, Patroklos; Eckert, Stephan; Lautenbacher, Ludwig; Reinecke, Maria; Hamood, Firas; Prokofeva, Polina; Vornholz, Larsen; Falcomata, Chiara; Dorsch, Madeleine; Schroe
Publié dans:
Science, Numéro 380/6640, 2023, ISSN 0036-8075
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/science.ade3925
Auteurs:
Bradbury, Melissa; Borras, Eva; Vilar, Marta; Castellvi, Josep; Luis Sanchez-Iglesias, Jose; Perez-Benavente, Assumpcio; Gil-Moreno, Antonio; Santamaria, Anna; Sabido, Eduard
Publié dans:
J. Transl. Med., Numéro 20/1, 2022, Page(s) 611, ISSN 1479-5876
Éditeur:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12967-022-03816-7
Auteurs:
Ramasamy, Pathmanaban; Turan, Demet; Tichshenko, Natalia; Hulstaert, Niels; Vandermarliere, Elien; Vranken, Wim; Martens, Lennart
Publié dans:
J. Proteome Res., Numéro 19/8, 2020, Page(s) 3478-3486, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.0c00306
Auteurs:
Roberta Noberini, Cristina Morales Torres, Evelyn Oliva Savoia, Stefania Brandini, Maria Giovanna Jodice, Giovanni Bertalot, Giuseppina Bonizzi, Maria Capra, Giuseppe Diaferia, Paola Scaffidi, Tiziana Bonaldi
Publié dans:
International Journal of Molecular Sciences, Numéro 21/19, 2020, Page(s) 7330, ISSN 1422-0067
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/ijms21197330
Auteurs:
Sergi Aranda, Eva Borràs, Eduard Sabidó, Luciano Di Croce
Publié dans:
STAR Protocols, Numéro 1/1, 2020, Page(s) 100014, ISSN 2666-1667
Éditeur:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.xpro.2020.100014
Auteurs:
Tabb, David L.; Jeong, Kyowon; Druart, Karen; Gant, Megan S.; Brown, Kyle A.; Nicora, Carrie; Zhou, Mowei; Couvillion, Sneha; Nakayasu, Ernesto; Williams, Janet E.; Peterson, Haley K.; McGuire, Michelle K.; McGuire, Mark A.; Metz, Thomas O.; Chamot-Rooke, Julia
Publié dans:
J. Proteome Res., Numéro 22/7, 2023, Page(s) 2199-2217, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.2c00673
Auteurs:
Martinez-Val, Ana; Fort, Kyle; Koenig, Claire; van der Hoeven, Leander; Franciosa, Giulia; Moehring, Thomas; Ishihama, Yasushi; Chen, Yu-ju; Makarov, Alexander; Xuan, Yue; Olsen, Jesper V.
Publié dans:
Nat. Commun., Numéro 14/1, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-39347-y
Auteurs:
Louis-Félix Nothias, Daniel Petras, Robin Schmid, Kai Dührkop, Johannes Rainer, Abinesh Sarvepalli, Ivan Protsyuk, Madeleine Ernst, Hiroshi Tsugawa, Markus Fleischauer, Fabian Aicheler, Alexander A. Aksenov, Oliver Alka, Pierre-Marie Allard, Aiko Barsch, Xavier Cachet, Andres Mauricio Caraballo-Rodriguez, Ricardo R. Da Silva, Tam Dang, Neha Garg, Julia M. Gauglitz, Alexey Gurevich, Giorgis Isaac
Publié dans:
Nature Methods, Numéro 17/9, 2020, Page(s) 905-908, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-020-0933-6
Auteurs:
Anglada-Girotto M, Handschin G, Ortmayr K, Campos AI, Gillet L, Manfredi P, Mulholland CV, Berney M, Jenal U, Picotti P, Zampieri M.
Publié dans:
Nat Chem Biol, 2022, ISSN 1552-4450
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41589-022-00970-3
Auteurs:
Subramaniam, Gunasekaran; Schleicher, Katharina; Kovanich, Duangnapa; Zerio, Anna; Folkmanaite, Milda; Chao, Ying-Chi; Surdo, Nicoletta C.; Koschinski, Andreas; Hu, Jianshu; Scholten, Arjen; Heck, Albert J. R.; Ercu, Maria; Sholokh, Anastasiia; Park, Kyung Chan; Klussmann, Enno; Meraviglia, Viviana; Bellin, Milena; Zanivan, Sara; Hester, Svenja; Mohammed, Shabaz; Zaccolo, Manuela
Publié dans:
Circ.Res., Numéro 132/7, 2023, Page(s) 828-848, ISSN 0009-7330
Éditeur:
Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI:
10.1161/circresaha.122.321448
Auteurs:
Varland, Sylvia; Silva, Rui Duarte; Kjosas, Ine; Faustino, Alexandra; Bogaert, Annelies; Billmann, Maximilian; Boukhatmi, Hadi; Kellen, Barbara; Costanzo, Michael; Drazic, Adrian; Osberg, Camilla; Chan, Katherine; Zhang, Xiang; Tong, Amy Hin Yan; Andreazza, Simonetta; Lee, Juliette J.; Nedyalkova, Lyudmila; Usaj, Matej; Whitworth, Alexander J.; Andrews, Brenda J.; Moffat, Jason; Myers, Chad L.; Ge
Publié dans:
Nat. Commun., Numéro 14/1, 2023, Page(s) 6774, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-42342-y
Auteurs:
Saul Lema A, Marina Klemenčič, Franziska Völlmy, Maarten Altelaar, Christiane Funk
Publié dans:
Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, ISSN 1664-302X
Éditeur:
Frontiers Media
DOI:
10.3389/fmicb.2021.634366
Auteurs:
Petracchini S, Hamaoui D, Doye A, Asnacios A, Fage F, Vitiello E, Balland M, Janel S, Lafont F, Gupta M, Ladoux B, Gilleron J, Maia TM, Impens F, Gagnoux-Palacios L, Daugaard M, Sorensen PH, Lemichez E, Mettouchi A.
Publié dans:
Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-022-33803-x
Auteurs:
Claire M. Mulvey, Lisa M. Breckels, Oliver M. Crook, David J. Sanders, Andre L. R. Ribeiro, Aikaterini Geladaki, Andy Christoforou, Nina Kočevar Britovšek, Tracey Hurrell, Michael J. Deery, Laurent Gatto, Andrew M. Smith, Kathryn S. Lilley
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-26000-9
Auteurs:
Fontana, Pietro; Buch-Larsen, Sara C.; Suyari, Osamu; Smith, Rebecca; Suskiewicz, Marcin J.; Schutzenhofer, Kira; Ariza, Antonio; Rack, Johannes Gregor Matthias; Nielsen, Michael L.; Ahel, Ivan
Publié dans:
Nat. Commun., Numéro 14/1, 2023, Page(s) 3200, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-38793-y
Auteurs:
Van den Bossche, Tim; Verschaffelt, Pieter; Schallert, Kay; Barsnes, Harald; Dawyndt, Peter; Benndorf, Dirk; Renard, Bernhard Y.; Mesuere, Bart; Martens, Lennart; Muth, Thilo
Publié dans:
J. Proteome Res., Numéro 19/8, 2020, Page(s) 3562-3566, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.0c00136
Auteurs:
Nuno Bandeira, Eric W. Deutsch, Oliver Kohlbacher, Lennart Martens, Juan Antonio Vizcaíno
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 20, 2021, Page(s) 100071, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1016/j.mcpro.2021.100071
Auteurs:
Ilaria Piazza, Nigel Beaton, Roland Bruderer, Thomas Knobloch, Crystel Barbisan, Lucie Chandat, Alexander Sudau, Isabella Siepe, Oliver Rinner, Natalie de Souza, Paola Picotti, Lukas Reiter
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-020-18071-x
Auteurs:
Pajenda S, Wagner L, Gerges D, Herkner H, Tevdoradze T, Mechtler K, Schmidt A, Winnicki W.
Publié dans:
Life, 2022, ISSN 2075-1729
Éditeur:
MDPI
DOI:
10.3390/life12091391
Auteurs:
C Silva AS, Bouwmeester R, Martens L, Degroeve S
Publié dans:
Bioinformatics, 2019, ISSN 1367-4803
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btz383
Auteurs:
Karli R. Reiding, Yu-Hsien Lin, Floris P. J. van Alphen, Alexander B. Meijer, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Communications Biology, Numéro 4/1, 2021, ISSN 2399-3642
Éditeur:
Nature Portfolio
DOI:
10.1038/s42003-021-02555-7
Auteurs:
Zhang M, Chiozzi RZ, Skerrett-Byrne DA, Veenendaal T, Klumperman J, Heck AJR, Nixon B, Helms JB, Gadella BM, Bromfield EG
Publié dans:
Front Cell Dev Biol, 2022, ISSN 2296-634X
Éditeur:
FRONTIERS MEDIA SA
DOI:
10.3389/fcell.2022.836208
Auteurs:
Anna-Kathrine Pedersen, Anamarija Pfeiffer, Gopal Karemore, Vyacheslav Akimov, Dorte B. Bekker-Jensen, Blagoy Blagoev, Chiara Francavilla, Jesper V. Olsen
Publié dans:
iScience, Numéro 24/4, 2021, Page(s) 102321, ISSN 2589-0042
Éditeur:
EMBO PRESS
DOI:
10.1016/j.isci.2021.102321
Auteurs:
Franziska Völlmy, Henk van den Toorn, Riccardo Zenezini Chiozzi, Ottavio Zucchetti, Alberto Papi, Carlo Alberto Volta, Luisa Marracino, Francesco Vieceli Dalla Sega, Francesca Fortini, Vadim Demichev, Pinkus Tober-Lau, Gianluca Campo, Marco Contoli, Markus Ralser, Florian Kurth, Savino Spadaro, Paola Rizzo, Albert JR Heck
Publié dans:
Life Science Alliance, Numéro 4/9, 2021, Page(s) e202101099, ISSN 2575-1077
Éditeur:
EMBO Press
DOI:
10.26508/lsa.202101099
Auteurs:
Bradbury M, Borràs E, Castellví J, Méndez O, Sánchez-Iglesias JL, Pérez-Benavente A, Gil-Moreno A, Sabidó E, Santamaria A.
Publié dans:
Scientific Reports, 2022, ISSN 2045-2322
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-022-08461-0
Auteurs:
Alves-Vale, Catarina; Capela, Ana Maria; Tavares-Marcos, Carlota; Domingues-Silva, Beatriz; Pereira, Bruno; Santos, Francisco; Gomes, Carla Pereira; Espadas, Guadalupe; Vitorino, Rui; Sabido, Eduard; Borralho, Paula; Nobrega-Pereira, Sandrina; de Jesuse, Bruno Bernardes
Publié dans:
Mol. Ther. Nucl. Acids, Numéro 33, 2023, ISSN 2162-2531
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1016/j.omtn.2023.08.019
Auteurs:
Zhao X, Hendriks IA, Le Gras S, Ye T, Ramos-Alonso L, Nguéa P A, Lien GF, Ghasemi F, Klungland A, Jost B, Enserink JM, Nielsen ML
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Nucleic Acids Res, 2022, ISSN 1362-4962
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DOI:
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Auteurs:
Ctortecka C, Krššáková G, Stejskal K, Penninger JM, Mendjan S, Mechtler K, Stadlmann J.
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Mol Cell Proteomics, 2022, ISSN 1535-9484
Éditeur:
Elsiver
DOI:
10.1016/j.mcpro.2021.100177
Auteurs:
Birklbauer, Micha J. J.; Matzinger, Manuel; Mueller, Fraenze; Mechtler, Karl; Dorfer, Viktoria
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J. Proteome Res., Numéro 22/9, 2023, Page(s) 3009-3021, ISSN 1535-3893
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American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.3c00325
Auteurs:
Sebastiaan C. de Graaf, Oleg Klykov, Henk van den Toorn, Richard A. Scheltema
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Journal of Proteome Research, Numéro 18/2, 2018, Page(s) 642-651, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
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Auteurs:
Barbara Steigenberger, Roland J. Pieters, Albert J. R. Heck, Richard A. Scheltema
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ACS Central Science, Numéro 5/9, 2019, Page(s) 1514-1522, ISSN 2374-7943
Éditeur:
ACS CENTRAL SCIENCE
DOI:
10.1021/acscentsci.9b00416
Auteurs:
Jakub Zeman, Yuzuru Itoh, Zdeněk Kukačka, Michal Rosůlek, Daniel Kavan, Tomáš Kouba, Myrte E Jansen, Mahabub P Mohammad, Petr Novák, Leoš S Valášek
Publié dans:
Nucleic Acids Research, Numéro 47/15, 2019, Page(s) 8282-8300, ISSN 0305-1048
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gkz570
Auteurs:
Yasset Perez-Riverol, Andrey Zorin, Gaurhari Dass, Manh-Tu Vu, Pan Xu, Mihai Glont, Juan Antonio Vizcaíno, Andrew F. Jarnuczak, Robert Petryszak, Peipei Ping, Henning Hermjakob
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-019-11461-w
Auteurs:
Erin K. Zess, Cassandra Jensen, Neftaly Cruz-Mireles, Juan Carlos De la Concepcion, Jan Sklenar, Madlen Stephani, Richard Imre, Elisabeth Roitinger, Richard Hughes, Khaoula Belhaj, Karl Mechtler, Frank L. H. Menke, Tolga Bozkurt, Mark J. Banfield, Sophien Kamoun, Abbas Maqbool, Yasin F. Dagdas
Publié dans:
PLOS Biology, Numéro 17/7, 2019, Page(s) e3000373, ISSN 1545-7885
Éditeur:
PLOS BIOL
DOI:
10.1371/journal.pbio.3000373
Auteurs:
Sem Tamara, Max Hoek, Richard A. Scheltema, Aneika C. Leney, Albert J.R. Heck
Publié dans:
Chem, Numéro 5/5, 2019, Page(s) 1302-1317, ISSN 2451-9294
Éditeur:
CHEM
DOI:
10.1016/j.chempr.2019.03.006
Auteurs:
Cristina Chiva, Olga Pastor, Lucía Trilla-Fuertes, Angelo Gámez-Pozo, Juan Ángel Fresno Vara, Eduard Sabidó
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 91/8, 2019, Page(s) 4934-4938, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.8b05802
Auteurs:
Clement M. Potel, Simone Lemeer, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 91/1, 2018, Page(s) 126-141, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.8b04746
Auteurs:
Slavata, Chmelík, Kavan, Filandrová, Fiala, Rosůlek, Mrázek, Kukačka, Vališ, Man, Miller, McIntyre, Fabris, Novák
Publié dans:
Biomolecules, Numéro 9/10, 2019, Page(s) 535, ISSN 2218-273X
Éditeur:
MDPI
DOI:
10.3390/biom9100535
Auteurs:
Johannes Stadlmann, Otto Hudecz, Gabriela Krššáková, Claudia Ctortecka, Geert Van Raemdonck, Jeff Op De Beeck, Gert Desmet, Josef M. Penninger, Paul Jacobs, Karl Mechtler
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 91/22, 2019, Page(s) 14203-14207, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.9b02899
Auteurs:
Johann Holzmann, Antonio Z Politi, Kota Nagasaka, Merle Hantsche-Grininger, Nike Walther, Birgit Koch, Johannes Fuchs, Gerhard Dürnberger, Wen Tang, Rene Ladurner, Roman R Stocsits, Georg A Busslinger, Béla Novák, Karl Mechtler, Iain Finley Davidson, Jan Ellenberg, Jan-Michael Peters
Publié dans:
eLife, Numéro 8, 2019, ISSN 2050-084X
Éditeur:
eLife Sciences Publications
DOI:
10.7554/elife.46269
Auteurs:
Rosulek, Darebna, Pompach, Slavata, Novak
Publié dans:
Catalysts, Numéro 9/10, 2019, Page(s) 833, ISSN 2073-4344
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/catal9100833
Auteurs:
Alicia Lundby, Giulia Franciosa, Kristina B. Emdal, Jan C. Refsgaard, Sebastian P. Gnosa, Dorte B. Bekker-Jensen, Anna Secher, Svetlana R. Maurya, Indranil Paul, Blanca L. Mendez, Christian D. Kelstrup, Chiara Francavilla, Marie Kveiborg, Guillermo Montoya, Lars J. Jensen, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Cell, Numéro 179/2, 2019, Page(s) 543-560.e26, ISSN 0092-8674
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cell.2019.09.008
Auteurs:
Oleg Klykov, Carmen van der Zwaan, Albert J. R. Heck, Alexander B. Meijer, Richard A. Scheltema
Publié dans:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 117/4, 2020, Page(s) 1976-1987, ISSN 0027-8424
Éditeur:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.1911785117
Auteurs:
Saar A. M. Laarse, Charlotte A. G. H. Gelder, Marshall Bern, Michiel Akeroyd, Maurien M. A. Olsthoorn, Albert J. R. Heck
Publié dans:
The FEBS Journal, 2020, ISSN 1742-464X
Éditeur:
Blackwell Publishing Inc.
DOI:
10.1111/febs.15190
Auteurs:
Ana S C. Silva, Robbin Bouwmeester, Lennart Martens, Sven Degroeve
Publié dans:
Bioinformatics, Numéro 35/24, 2019, Page(s) 5243-5248, ISSN 1367-4803
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btz383
Auteurs:
Dorte B. Bekker-Jensen, Oliver M. Bernhardt, Alexander Hogrebe, Ana Martinez-Val, Lynn Verbeke, Tejas Gandhi, Christian D. Kelstrup, Lukas Reiter, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-020-14609-1
Auteurs:
Julianus Pfeuffer, Timo Sachsenberg, Tjeerd M. H. Dijkstra, Oliver Serang, Knut Reinert, Oliver Kohlbacher
Publié dans:
Journal of Proteome Research, 2020, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.9b00566
Auteurs:
Roberta Noberini, Camilla Restellini, Evelyn Oliva Savoia, Tiziana Bonaldi
Publié dans:
Methods, 2019, ISSN 1046-2023
Éditeur:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.ymeth.2019.10.001
Auteurs:
Niels Hulstaert, Jim Shofstahl, Timo Sachsenberg, Mathias Walzer, Harald Barsnes, Lennart Martens, Yasset Perez-Riverol
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 19/1, 2019, Page(s) 537-542, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.9b00328
Auteurs:
Juan Antonio Vizcaíno, Peter Kubiniok, Kevin A. Kovalchik, Qing Ma, Jérôme D. Duquette, Ian Mongrain, Eric W. Deutsch, Bjoern Peters, Alessandro Sette, Isabelle Sirois, Etienne Caron
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 19/1, 2020, Page(s) 31-49, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.r119.001743
Auteurs:
Gordana Wutz, Rene Ladurner, Brian Glenn St Hilaire, Roman R Stocsits, Kota Nagasaka, Benoit Pignard, Adrian Sanborn, Wen Tang, Csilla Várnai, Miroslav P Ivanov, Stefan Schoenfelder, Petra van der Lelij, Xingfan Huang, Gerhard Dürnberger, Elisabeth Roitinger, Karl Mechtler, Iain Finley Davidson, Peter Fraser, Erez Lieberman-Aiden, Jan-Michael Peters
Publié dans:
eLife, Numéro 9, 2020, ISSN 2050-084X
Éditeur:
eLife Sciences Publications
DOI:
10.7554/elife.52091
Auteurs:
Brian C. Searle, Kristian E. Swearingen, Christopher A. Barnes, Tobias Schmidt, Siegfried Gessulat, Bernhard Küster, Mathias Wilhelm
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-020-15346-1
Auteurs:
Gaurhari Dass, Manh-Tu Vu, Pan Xu, Enrique Audain, Marc-Phillip Hitz, Björn A Grüning, Henning Hermjakob, Yasset Perez-Riverol
Publié dans:
Nucleic Acids Research, 2020, ISSN 0305-1048
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gkaa326
Auteurs:
Kyowon Jeong, Jihyung Kim, Manasi Gaikwad, Siti Nurul Hidayah, Laura Heikaus, Hartmut Schlüter, Oliver Kohlbacher
Publié dans:
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DOI:
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Auteurs:
Bart Van Puyvelde, Sander Willems, Ralf Gabriels, Simon Daled, Laura De Clerck, Sofie Vande Casteele, An Staes, Francis Impens, Dieter Deforce, Lennart Martens, Sven Degroeve, Maarten Dhaenens
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DOI:
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Auteurs:
B. Steigenberger, P. Albanese, A. J. R. Heck, R. A. Scheltema
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Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Numéro 31/2, 2020, Page(s) 196-206, ISSN 1044-0305
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DOI:
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Auteurs:
Tobias P. Wörner, Joost Snijder, Antonette Bennett, Mavis Agbandje-McKenna, Alexander A. Makarov, Albert J. R. Heck
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DOI:
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Auteurs:
Teresa Mendes Maia, An Staes, Kim Plasman, Jarne Pauwels, Katie Boucher, Andrea Argentini, Lennart Martens, Tony Montoye, Kris Gevaert, Francis Impens
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Auteurs:
Annelies Bogaert, Esperanza Fernandez, Kris Gevaert
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Auteurs:
Eric W Deutsch, Nuno Bandeira, Vagisha Sharma, Yasset Perez-Riverol, Jeremy J Carver, Deepti J Kundu, David García-Seisdedos, Andrew F Jarnuczak, Suresh Hewapathirana, Benjamin S Pullman, Julie Wertz, Zhi Sun, Shin Kawano, Shujiro Okuda, Yu Watanabe, Henning Hermjakob, Brendan MacLean, Michael J MacCoss, Yunping Zhu, Yasushi Ishihama, Juan A Vizcaíno
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Jan Fiala, Zdeněk Kukačka, Petr Novák
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Genet Abay Shiferaw, Elien Vandermarliere, Niels Hulstaert, Ralf Gabriels, Lennart Martens, Pieter-Jan Volders
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Auteurs:
Manuel Matzinger, Wolfgang Kandioller, Philipp Doppler, Elke H. Heiss, Karl Mechtler
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American Chemical Society
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Auteurs:
Fleur Kleinpenning, Barbara Steigenberger, Wei Wu, Albert J. R. Heck
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Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
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Nature Publishing Group
DOI:
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Auteurs:
Rebecca Beveridge, Johannes Stadlmann, Josef M. Penninger, Karl Mechtler
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-020-14608-2
Auteurs:
Robbin Bouwmeester, Ralf Gabriels, Tim Van Den Bossche, Lennart Martens, Sven Degroeve
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John Wiley & Sons Ltd.
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Auteurs:
Tim Van Den Bossche, Pieter Verschaffelt, Kay Schallert, Harald Barsnes, Peter Dawyndt, Dirk Benndorf, Bernhard Y. Renard, Bart Mesuere, Lennart Martens, Thilo Muth
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Journal of Proteome Research, 2020, ISSN 1535-3893
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Adriaan Sticker, Ludger Goeminne, Lennart Martens, Lieven Clement
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Robbin Bouwmeester, Lennart Martens, Sven Degroeve
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Auteurs:
Pathmanaban Ramasamy, Demet Turan, Natalia Tichshenko, Niels Hulstaert, Elien Vandermarliere, Wim Vranken, Lennart Martens
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Journal of Proteome Research, 2020, ISSN 1535-3893
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American Chemical Society
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Ralf Gabriels, Lennart Martens, Sven Degroeve
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Auteurs:
Bukova, Viktoria; Vargova, Jana; Babincak, Marian; Jendzelovsky, Rastislav; Zdrahal, Zbynek; Roudnicky, Pavel; Kosuth, Jan; Fedorocko, Peter
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Auteurs:
Matthieu R. Zeronian, Oleg Klykov, Júlia Portell i de Montserrat, Maria J. Konijnenberg, Anamika Gaur, Richard A. Scheltema, Bert J. C. Janssen
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Auteurs:
Kohler, Devon; Staniak, Mateusz; Tsai, Tsung-Heng; Huang, Ting; Shulman, Nicholas; Bernhardt, Oliver M.; MacLean, Brendan X.; Nesvizhskii, Alexey I.; Reiter, Lukas; Sabido, Eduard; Choi, Meena; Vitek, Olga
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American Chemical Society
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Auteurs:
Gabriels, Ralf; Declercq, Arthur; Bouwmeester, Robbin; Degroeve, Sven; Martens, Lennart
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American Chemical Society
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Roberta Noberini, Giulia Robusti, Tiziana Bonaldi
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Gambi, Giovanni; Mengus, Gabrielle; Davidson, Guillaume; Demesmaeker, Ewout; Cuomo, Alessandro; Bonaldi, Tiziana; Katopodi, Vicky; Malouf, Gabriel G.; Leucci, Eleonora; Davidson, Irwin
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Auteurs:
Agustín Hidalgo-Gutiérrez, Eliana Barriocanal-Casado, María Elena Díaz-Casado, Pilar González-García, Riccardo Zenezini Chiozzi, Darío Acuña-Castroviejo, Luis Carlos López
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Auteurs:
Mathieu Dupré, Magalie Duchateau, Christian Malosse, Diogo Borges-Lima, Valeria Calvaresi, Isabelle Podglajen, Dominique Clermont, Martial Rey, Julia Chamot-Rooke
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American Chemical Society
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Campolungo, Daniele; Salome, Mara; Biferali, Beatrice; Tascini, Anna Sofia; Gabellini, Davide
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Auteurs:
Frackowiak, Patryk; Wrzesinska, Barbara; Wieczorek, Przemyslaw; Sanchez-Bel, Paloma; Kunz, Laura; Dittmann, Antje; Obrepalska-Steplowska, Aleksandra
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Zhang, Xin; Noberini, Roberta; Vai, Alessandro; Bonaldi, Tiziana; Seidl, Michael F.; Collemare, Jerome
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Wu, Chenhao; Mori, Matteo; Abele, Miriam; Banaei-Esfahani, Amir; Zhang, Zhongge; Okano, Hiroyuki; Aebersold, Ruedi; Ludwig, Christina; Hwa, Terence
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Auteurs:
Manuel Matzinger, Karl Mechtler
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Auteurs:
Bondt, Albert; Hoek, Max; Tamara, Sem; Bastiaan de Graaf; Peng, Weiwei; Schulte, Douwe; van Rijswijck, Danique M. H.; den Boer, Maurits A.; Greisch, Jean-Francois; Varkila, Meri R. J.; Snijder, Joost; Cremer, Olaf L.; Bonten, Marc J. M.; Heck, Albert J. R.
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Auteurs:
Karel Stejskal, Jeff Op de Beeck, Gerhard Dürnberger, Paul Jacobs, Karl Mechtler
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Auteurs:
Jakob Schnabl, Juncheng Wang, Ulrich Hohmann, Maja Gehre, Julia Batki, Veselin I. Andreev, Kim Purkhauser, Nina Fasching, Peter Duchek, Maria Novatchkova, Karl Mechtler, Clemens Plaschka, Dinshaw J. Patel, Julius Brennecke
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Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI:
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Auteurs:
Papadopoulou, Dimitra; Roumelioti, Fani; Tzaferis, Christos; Chouvardas, Panagiotis; Pedersen, Anna-Kathrine; Charalampous, Filippos; Christodoulou-Vafeiadou, Eleni; Ntari, Lydia; Karagianni, Niki; Denis, Maria C.; V. Olsen, Jesper V.; Matralis, Alexios N.; Kollias, George
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JCI Insight, Numéro 8/9, 2023, Page(s) e165024, ISSN 2379-3708
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AMER SOC CLINICAL INVESTIGATION INC
DOI:
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Auteurs:
Trilla-Fuertes L, Gámez-Pozo A, Lumbreras-Herrera MI, López-Vacas R, Heredia-Soto V, Ghanem I, López-Camacho E, Zapater-Moros A, Miguel M, Peña-Burgos EM, Palacios E, De Uribe M, Guerra L, Dittmann A, Mendiola M, Fresno Vara JÁ, Feliu J
Publié dans:
Cancers, 2022, ISSN 2072-6694
Éditeur:
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DOI:
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Auteurs:
Andrea M. Brunner, Philip Lössl, Paul P. Geurink, Huib Ovaa, P. Albanese, A.F. Maarten Altelaar, Albert J.R. Heck, Richard A. Scheltema
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American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1016/j.mcpro.2021.100070
Auteurs:
Jeong, Kyowon; Babovic, Masa; Gorshkov, Vladimir; Kim, Jihyung; Jensen, Ole N.; Kohlbacher, Oliver
Publié dans:
Nat. Commun., Numéro 13/1, 2022, Page(s) 4407, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
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Auteurs:
Hoefsmit, Esmee P.; Vollmy, Franziska; Rozeman, Elisa A.; Reijers, Irene L. M.; Versluis, Judith M.; Hoekman, Liesbeth; van Akkooi, Alexander C. J.; Long, Georgina, V; Schadendorf, Dirk; Dummer, Reinhard; Altelaar, Maarten; Blank, Christian U.
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DOI:
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Auteurs:
Michael Taschner, Jérôme Basquin, Barbara Steigenberger, Ingmar B Schäfer, Young‐Min Soh, Claire Basquin, Esben Lorentzen, Markus Räschle, Richard A Scheltema, Stephan Gruber
Publié dans:
The EMBO Journal, Numéro 40/15, 2021, ISSN 0261-4189
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
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Auteurs:
Laura C. Demmers, Kai Kretzschmar, Arne Van Hoeck, Yotam E. Bar-Epraïm, Henk W. P. van den Toorn, Mandy Koomen, Gijs van Son, Joost van Gorp, Apollo Pronk, Niels Smakman, Edwin Cuppen, Hans Clevers, Albert J. R. Heck, Wei Wu
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Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
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Auteurs:
Jing Zhu, Yu-Hsien Lin, Kelly A. Dingess, Marko Mank, Bernd Stahl, Albert J. R. Heck
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Journal of Proteome Research, Numéro 19/5, 2020, Page(s) 1941-1952, ISSN 1535-3893
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Auteurs:
Ana Rita Cruz, Maurits A. den Boer, Jürgen Strasser, Seline A. Zwarthoff, Frank J. Beurskens, Carla J. C. de Haas, Piet C. Aerts, Guanbo Wang, Rob N. de Jong, Fabio Bagnoli, Jos A. G. van Strijp, Kok P. M. van Kessel, Janine Schuurman, Johannes Preiner, Albert J. R. Heck, Suzan H. M. Rooijakkers
Publié dans:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 118/7, 2021, Page(s) e2016772118, ISSN 0027-8424
Éditeur:
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Auteurs:
Bart Van Puyvelde, Katleen Van Uytfanghe, Olivier Tytgat, Laurence Van Oudenhove, Ralf Gabriels, Robbin Bouwmeester, Simon Daled, Tim Van Den Bossche, Pathmanaban Ramasamy, Sigrid Verhelst, Laura De Clerck, Laura Corveleyn, Sander Willems, Nathan Debunne, Evelien Wynendaele, Bart De Spiegeleer, Peter Judak, Kris Roels, Laurie De Wilde, Peter Van Eenoo, Tim Reyns, Marc Cherlet, Emmie Dumont, Griet
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Auteurs:
Rehfeldt, Tobias G.; Gabriels, Ralf; Bouwmeester, Robbin; Gessulat, Siegfried; Neely, Benjamin A.; Palmblad, Magnus; Perez-Riverol, Yasset; Schmidt, Tobias; Vizcaino, Juan Antonio; Deutsch, Eric W.
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Matzinger, Manuel; Mayer, Rupert L.; Mechtler, Karl
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Auteurs:
Anna Schmücker, Bingkun Lei, Zdravko J. Lorković, Matías Capella, Sigurd Braun, Pierre Bourguet, Olivier Mathieu, Karl Mechtler, Frédéric Berger
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Auteurs:
John J. H. Shin, Oliver M. Crook, Alicia C. Borgeaud, Jérôme Cattin-Ortolá, Sew Y. Peak-Chew, Lisa M. Breckels, Alison K. Gillingham, Jessica Chadwick, Kathryn S. Lilley, Sean Munro
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Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
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Auteurs:
Sara C. Buch-Larsen, Ivo A. Hendriks, Jean M. Lodge, Martin Rykær, Benjamin Furtwängler, Evgenia Shishkova, Michael S. Westphall, Joshua J. Coon, Michael L. Nielsen
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Declercq A, Bouwmeester R, Hirschler A, Carapito C, Degroeve S, Martens L, Gabriels R.
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Shiferaw, Genet Abay; Gabriels, Ralf; Bouwmeester, Robbin; Van den Bossche, Tim; Vandermarliere, Elien; Martens, Lennart; Volders, Pieter-Jan
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Auteurs:
Ivo A. Hendriks, Vyacheslav Akimov, Blagoy Blagoev, Michael L. Nielsen
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Journal of Proteome Research, Numéro 20/4, 2021, Page(s) 2042-2055, ISSN 1535-3893
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American Chemical Society
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Auteurs:
Georg J. Pirklbauer, Christian E. Stieger, Manuel Matzinger, Stephan Winkler, Karl Mechtler, Viktoria Dorfer
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Auteurs:
Bai, Mingze; Deng, Jingwen; Dai, Chengxin; Pfeuffer, Julianus; Sachsenberg, Timo; Perez-Riverol, Yasset
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J. Proteome Res., Numéro 22/6, 2023, Page(s) 2114-2123, ISSN 1535-3893
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Koenig C, Martinez-Val A, Franciosa G, Olsen JV.
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Auteurs:
Koenig, Claire; Martinez-Val, Ana; Naicker, Previn; Stoychev, Stoyan; Jordaan, Justin; Oslen, Jesper, V
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Auteurs:
Martinez-Val, Ana; Guzman, Ulises H.; Olsen, Jesper, V
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Auteurs:
Sternke-Hoffmann, Rebecca; Pauly, Thomas; Norrild, Rasmus K.; Hansen, Jan; Tucholski, Florian; Hoie, Magnus Haraldson; Marcatili, Paolo; Dupre, Mathieu; Duchateau, Magalie; Rey, Martial; Malosse, Christian; Metzger, Sabine; Boquoi, Amelie; Platten, Florian; Egelhaaf, Stefan U.; Chamot-Rooke, Julia; Fenk, Roland; Nagel-Steger, Luitgard; Haas, Rainer; Buell, Alexander K.
Publié dans:
BMC Biol., Numéro 21/1, 2023, Page(s) 21, ISSN 1741-7007
Éditeur:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12915-022-01506-w
Auteurs:
Picciani, Mario; Gabriel, Wassim; Giurcoiu, Victor-George; Shouman, Omar; Hamood, Firas; Lautenbacher, Ludwig; Jensen, Cecilia Bang; Mueller, Julian; Kalhor, Mostafa; Soleymaniniya, Armin; Kuster, Bernhard; The, Matthew; Wilhelm, Mathias
Publié dans:
Proteomics, 2023, ISSN 1615-9853
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.202300112
Auteurs:
Ivo A. Hendriks, Sara C. Buch-Larsen, Evgeniia Prokhorova, Jonas D. Elsborg, Alexandra K.L.F.S. Rebak, Kang Zhu, Dragana Ahel, Claudia Lukas, Ivan Ahel, Michael L. Nielsen
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-26172-4
Auteurs:
Car, Iris; Dittmann, Antje; Klobucar, Marko; Grbcic, Petra; Pavelic, Sandra Kraljevic; Sedic, Mirela
Publié dans:
Biology, Numéro 12/4, 2023, Page(s) 608, ISSN 2079-7737
Éditeur:
MDPI
DOI:
10.3390/biology12040608
Auteurs:
Mathieu Dupré, Magalie Duchateau, Rebecca Sternke-Hoffmann, Amelie Boquoi, Christian Malosse, Roland Fenk, Rainer Haas, Alexander K. Buell, Martial Rey, Julia Chamot-Rooke
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 93/30, 2021, Page(s) 10627-10634, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.1c01955
Auteurs:
Villanueva, Eneko; Smith, Tom; Pizzinga, Mariavittoria; Elzek, Mohamed; Queiroz, Rayner M. L.; Harvey, Robert F.; Breckels, Lisa M.; Crook, Oliver M.; Monti, Mie; Dezi, Veronica; Willis, Anne E.; Lilley, Kathryn S.
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Nat. Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-023-02101-9
Auteurs:
Mukherjee, Soumya; Jankevics, Andris; Busch, Florian; Lubeck, Markus; Zou, Yang; Kruppa, Gary; Heck, Albert J. R.; Scheltema, Richard A.; Reiding, Karli R.
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Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1016/j.mcpro.2022.100486
Auteurs:
McGann, Chris D.; Barshop, William D.; Canterbury, Jesse D.; Lin, Chuwei; Gabriel, Wassim; Huang, Jingjing; Bergen, David; Zabrouskov, Vlad; Melani, Rafael D.; Wilhelm, Mathias; McAlister, Graeme C.; Schweppe, Devin K.
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American Chemical Society
DOI:
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Auteurs:
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Publié dans:
Nature Communication, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-022-34058-2
Auteurs:
Loginov DS, Fiala J, Brechlin P, Kruppa G, Novak P.
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Biochemica et Biophysica Acta, 2021, ISSN 1570-9639
Éditeur:
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DOI:
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Auteurs:
Naumann C, Heisters M, Brandt W, Janitza P, Alfs C, Tang N, Toto Nienguesso A, Ziegler J, Imre R, Mechtler K, Dagdas Y, Hoehenwarter W, Sawers G, Quint M, Abel S.
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Current Biology, 2022, ISSN 0960-9822
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Cell Press
DOI:
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Auteurs:
Declercq, Arthur; Bouwmeester, Robbin; Chiva, Cristina; Sabido, Eduard; Hirschler, Aurelie; Carapito, Christine; Martens, Lennart; Degroeve, Sven; Gabriels, Ralf
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Nucleic Acids Res., Numéro 51/W1, 2023, Page(s) W338-W342, ISSN 0305-1048
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Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gkad335
Auteurs:
den Boer, Maurits A.; Greisch, Jean-Francois; Tamara, Sem; Bondt, Albert; Heck, Albert J. R.
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Chem. Sci., Numéro 11/43, 2020, Page(s) 11886-11896, ISSN 2041-6520
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DOI:
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Auteurs:
Wang, Fujia; Veth, Tim; Kuipers, Marije; Altelaar, Maarten; Stecker, Kelly E.
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Anal. Chem., Numéro 95/25, 2023, Page(s) 9471-9479, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
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Auteurs:
Sara C. Buch-Larsen, Alexandra K.L.F.S.rebak, Ivo. A. Hendriks and Michael L. Nielsen
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Cells, 2021, ISSN 2073-4409
Éditeur:
MDPI
DOI:
10.3390/cells10112927
Auteurs:
Eva Borràs, Olga Pastor, Eduard Sabidó
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Analytical Chemistry, Numéro 93/34, 2021, Page(s) 11649-11653, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
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Auteurs:
Viktoria Dorfer, Marina Strobl, Stephan Winkler, Karl Mechtler
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Rapid Communications in Mass Spectrometry, Numéro 35/11, 2021, ISSN 0951-4198
Éditeur:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/rcm.9088
Auteurs:
Noszka, Mateusz; Strzalka, Agnieszka; Muraszko, Jakub; Kolenda, Rafal; Meng, Chen; Ludwig, Christina; Stingl, Kerstin; Zawilak-Pawlik, Anna
Publié dans:
Nat. Commun., Numéro 14/1, 2023, Page(s) 6715, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-42364-6
Auteurs:
Wanshu Ma, Hyea Jin Gil, Noelia Escobedo, Alberto Benito-Martín, Pilar Ximénez-Embún, Javier Muñoz, Héctor Peinado, Stanley G. Rockson, Guillermo Oliver
Publié dans:
JCI Insight, Numéro 5/13, 2020, ISSN 2379-3708
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DOI:
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Auteurs:
Ye Z, Batth TS, Rüther P, Olsen JV
Publié dans:
Commun Biol, 2022, ISSN 2399-3642
Éditeur:
Nature portfolio
DOI:
10.1038/s42003-022-03095-4
Auteurs:
Tomislav Čaval, Yu-Hsien Lin, Meri Varkila, Karli R. Reiding, Marc J. M. Bonten, Olaf L. Cremer, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Frontiers in Immunology, Numéro 11, 2021, ISSN 1664-3224
Éditeur:
FRONTIERS MEDIA SA
DOI:
10.3389/fimmu.2020.608466
Auteurs:
Steven Verbruggen, Siegfried Gessulat, Ralf Gabriels, Anna Matsaroki, Hendrik Van de Voorde, Bernhard Kuster, Sven Degroeve, Lennart Martens, Wim Van Criekinge, Mathias Wilhelm, Gerben Menschaert
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 20, 2021, Page(s) 100076, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1016/j.mcpro.2021.100076
Auteurs:
Deutsch, Eric W.; Bandeira, Nuno; Perez-Riverol, Yasset; Sharma, Vagisha; Carver, Jeremy J.; Mendoza, Luis; Kundu, Deepti J.; Wang, Shengbo; Bandla, Chakradhar; Kamatchinathan, Selvakumar; Hewapathirana, Suresh; Pullman, Benjamin S.; Wertz, Julie; Sun, Zhi; Kawano, Shin; Okuda, Shujiro; Watanabe, Yu; MacLean, Brendan; MacCoss, Michael J.; Zhu, Yunping; Ishihama, Yasushi; Vizcaino, Juan Antonio
Publié dans:
Nucleic Acids Res., Numéro 51/D1, 2023, Page(s) D1539-D1548, ISSN 0305-1048
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gkac1040
Auteurs:
Gasparri, Roberto; Noberini, Roberta; Cuomo, Alessandro; Yadav, Avinash; Tricarico, Davide; Salvetto, Carola; Maisonneuve, Patrick; Caminiti, Valentina; Sedda, Giulia; Sabalic, Angela; Bonaldi, Tiziana; Spaggiari, Lorenzo
Publié dans:
Proteom. Clin. Appl., 2023, ISSN 1862-8346
Éditeur:
Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
DOI:
10.1002/prca.202200093
Auteurs:
Mundt F, Albrechtsen NJW, Mann SP, Treit P, Ghodgaonkar-Steger M, O'Flaherty M, Raijmakers R, Vizcaíno JA, Heck AJR, Mann M
Publié dans:
Open Res Eur, Numéro 3/59, 2023, ISSN 2732-5121
Éditeur:
F1000 Research Limited on behalf of the European Commission
DOI:
10.12688/openreseurope.15810.2
Auteurs:
Valverde, Juan Manuel; Dubra, Geronimo; Phillips, Michael; Haider, Austin; Elena-Real, Carlos; Fournet, Aurelie; Alghoul, Emile; Chahar, Dhanvantri; Andres-Sanchez, Nuria; Paloni, Matteo; Bernado, Pau; van Mierlo, Guido; Vermeulen, Michiel; van den Toorn, Henk; Heck, Albert J. R.; Constantinou, Angelos; Barducci, Alessandro; Ghosh, Kingshuk; Sibille, Nathalie; Knipscheer, Puck; Krasinska, Liliana;
Publié dans:
Nat. Commun., Numéro 14/1, 2020, Page(s) 6316, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-42049-0
Auteurs:
Alves, Sara; Pereira, Joana M.; Mayer, Rupert L.; Goncalves, Alexandre D. A.; Impens, Francis; Cabanes, Didier; Sousa, Sandra
Publié dans:
Toxins, Numéro 15/1, 2023, Page(s) 4, ISSN 2072-6651
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/toxins15010004
Auteurs:
Johannes F Hevler, Marie V Lukassen, Alfredo Cabrera‐Orefice, Susanne Arnold, Matti F Pronker, Vojtech Franc, Albert J R Heck
Publié dans:
The EMBO Journal, Numéro 40/4, 2021, ISSN 0261-4189
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.15252/embj.2020106174
Auteurs:
Peinado-Izaguerri, Jorge; Zarzuela, Eduardo; McLaughlin, Mark; Small, Alexandra C.; Riva, Francesca; McKeegan, Dorothy E. F.; Bain, Maureen; Munoz, Javier; Bhide, Mangesh; Preston, Tom
Publié dans:
Rapid Commun. Mass Spectrom., Numéro 37/10, 2023, Page(s) e9497, ISSN 0951-4198
Éditeur:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/rcm.9497
Auteurs:
Jingwen Bai, Chakradhar Bandla, Jiaxin Guo, Roberto Vera Alvarez, Mingze Bai, Juan Antonio Vizcaíno, Pablo Moreno, Björn Grüning, Olivier Sallou, Yasset Perez-Riverol
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 20/4, 2021, Page(s) 2056-2061, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.0c00904
Auteurs:
Roger Olivella, Cristina Chiva, Marc Serret, Daniel Mancera, Luca Cozzuto, Antoni Hermoso, Eva Borràs, Guadalupe Espadas, Julia Morales, Olga Pastor, Amanda Solé, Julia Ponomarenko, Eduard Sabidó
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 20/4, 2021, Page(s) 2010-2013, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.0c00853
Auteurs:
Kafkia, Eleni; Andres-Pons, Amparo; Ganter, Kerstin; Seiler, Markus; Smith, Tom S.; Andrejeva, Anna; Jouhten, Paula; Pereira, Filipa; Franco, Catarina; Kuroshchenkova, Anna; Leone, Sergio; Sawarkar, Ritwick; Boston, Rebecca; Thaventhiran, James; Zaugg, Judith B.; Lilley, Kathryn S.; Lancrin, Christophe; Beck, Martin; Patil, Kiran Raosaheb
Publié dans:
Sci. Adv., Numéro 8/35, 2022, Page(s) eabq5206, ISSN 2375-2548
Éditeur:
AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE
DOI:
10.1126/sciadv.abq5206
Auteurs:
Emdal KB, Palacio-Escat N, Wigerup C, Eguchi A, Nilsson H, Bekker-Jensen DB, Rönnstrand L, Kazi JU, Puissant A, Itzykson R, Saez-Rodriguez J, Masson K, Blume-Jensen P, Olsen JV.
Publié dans:
Cell Reports, 2022, ISSN 2211-1247
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2022.111177
Auteurs:
Giulia Franciosa, Jos G. A. Smits, Sonia Minuzzo, Ana Martinez-Val, Stefano Indraccolo, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-22787-9
Auteurs:
Clemens, A. C.; Loeffler, K. U.; Holz, F. G.; Herwig-Carl, M. C.
Publié dans:
Graefes Arch. Clin. Exp. Ophthalmol., Numéro 260/4, 2022, Page(s) 1415-1425, ISSN 0721-832X
Éditeur:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s00417-021-05464-x
Auteurs:
Adam J. Wargacki, Tobias P. Wörner, Michiel van de Waterbeemd, Daniel Ellis, Albert J. R. Heck, Neil P. King
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-21251-y
Auteurs:
Anaïs Menny, Marie V. Lukassen, Emma C. Couves, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck, Doryen Bubeck
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-021-26366-w
Auteurs:
Silvia García‐Adrián, Lucía Trilla‐Fuertes, Angelo Gámez‐Pozo, Cristina Chiva, Rocío López‐Vacas, Elena López‐Camacho, Andrea Zapater‐Moros, María I. Lumbreras‐Herrera, David Hardisson, Laura Yébenes, Pilar Zamora, Eduard Sabidó, Juan Ángel Fresno Vara, Enrique Espinosa
Publié dans:
PROTEOMICS, 2021, Page(s) 2100110, ISSN 1615-9853
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.202100110
Auteurs:
Trilla-Fuertes, Lucia; Gamez-Pozo, Angelo; Nogue, Miguel; Busquier, Isabel; Arias, Fernando; Lopez-Campos, Fernando; Fernandez-Montes, Ana; Ruiz, Ana; Velazquez, Concepcion; Martin-Bravo, Celia; Perez-Ruiz, Elisabeth; Asensio, Elena; Hernandez-Yague, Xavier; Rodrigues, Aline; Ghanem, Ismael; Lopez-Vacas, Rocio; Hafez, Ahmed; Arias, Pedro; Dapia, Irene; Solis, Mario; Dittmann, Antje; Ramos, Ricardo
Publié dans:
Cancer, Numéro 129/16, 2023, Page(s) 2581-2592, ISSN 0008-543X
Éditeur:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
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Auteurs:
Bouwmeester, R., Gabriels, R., Hulstaert, N. et al.
Publié dans:
Nature Methods, 2021, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-021-01301-5
Auteurs:
Anna M. Lone, Piero Giansanti, Marthe Jøntvedt Jørgensen, Enio Gjerga, Aurelien Dugourd, Arjen Scholten, Julio Saez-Rodriguez, Albert J. R. Heck, Kjetil Taskén
Publié dans:
Science Signaling, Numéro 14/703, 2021, ISSN 1937-9145
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/scisignal.abc8579
Auteurs:
LeDuc, Richard D.; Deutsch, Eric W.; Binz, Pierre-Alain; Fellers, Ryan T.; Cesnik, Anthony J.; Klein, Joshua A.; Van den Bossche, Tim; Gabriels, Ralf; Yalavarthi, Arshika; Perez-Riverol, Yasset; Carver, Jeremy; Bittremieux, Wout; Kawano, Shin; Pullman, Benjamin; Bandeira, Nuno; Kelleher, Neil L.; Thomas, Paul M.; Vizcaino, Juan Antonio
Publié dans:
J. Proteome Res., Numéro 21/4, 2022, Page(s) 1189-1195, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.1c00771
Auteurs:
Tobias Schmidt, Patroklos Samaras, Viktoria Dorfer, Christian Panse, Tobias Kockmann, Leon Bichmann, Bart van Puyvelde, Yasset Perez-Riverol, Eric W. Deutsch, Bernhard Kuster, Mathias Wilhelm
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 20/6, 2021, Page(s) 3388-3394, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.1c00096
Auteurs:
Dhenin J, Borges Lima D, Dupré M, Chamot-Rooke J.
Publié dans:
Bioinformatics, 2021, ISSN 1367-4803
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/bioinformatics/btab784
Auteurs:
Susana García-Silva, Pilar Ximénez-Embún, Javier Muñoz, Héctor Peinado
Publié dans:
Melanoma - Methods and Protocols, Numéro 2265, 2021, Page(s) 345-359, ISBN 978-1-0716-1204-0
Éditeur:
Springer US
DOI:
10.1007/978-1-0716-1205-7_25
Auteurs:
Dorte B. Bekker-Jensen, Ana Martínez-Val, Sophia Steigerwald, Patrick Rüther, Kyle L. Fort, Tabiwang N. Arrey, Alexander Harder, Alexander Makarov, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 19/4, 2020, Page(s) 716-729, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir119.001906
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