Obiettivo
"The SYSCID consortium aims to develop a systems medicine approach for disease prediction in CID. We will focus on three major CID indications with distinct characteristics, yet a large overlap of their molecular risk map: inflammatory bowel disease, systemic lupus erythematodes and rheumatoid arthritis. We have joined 15 partners from major cohorts and initiatives in Europe (e.g.IHEC ICGC, TwinsUK and Meta-HIT) to investigate human data sets on three major levels of resolution: whole blood signatures, signatures from purified immune cell types (with a focus on CD14 and CD4/CD8) and selected single cell level analyses. Principle data layers will comprise SNP variome, methylome, transcriptome and gut microbiome. SYSCID employs a dedicated data management infrastructure, strong algorithmic development groups (including an SME for exploitation of innovative software tools for data deconvolution) and will validate results in independent retrospective and prospective clinical cohorts.
Using this setup we will focus on three fundamental aims : (i) the identification of shared and unique ""core disease signatures” which are associated with the disease state and independent of temporal variation, (ii) the generation of ""predictive models of disease outcome""- builds on previous work that pathways/biomarkers for disease outcome are distinct from initial disease risk and may be shared across diseases to guide therapy decisions on an individual patient basis, (iii) ""reprogramming disease""- will identify and target temporally stable epigenetic alterations in macrophages and lymphocytes in epigenome editing approaches as biological validation and potential novel therapeutic tool .
Thus, SYSCID will foster the development of solid biomarkers and models as stratification in future long-term systems medicine clinical trials but also investigate new causative therapies by editing the epigenome code in specific immune cells, e.g. to alleviate macrophage polarization defects."
Campo scientifico
- medical and health sciencesclinical medicinerheumatology
- medical and health scienceshealth sciencesinflammatory diseases
- medical and health sciencesclinical medicinegastroenterologyinflammatory bowel disease
- medical and health sciencesbasic medicineimmunology
- medical and health scienceshealth sciencespersonalized medicine
Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Invito a presentare proposte
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H2020-SC1-2016-RTD
Meccanismo di finanziamento
RIA - Research and Innovation actionCoordinatore
24118 Kiel
Germania
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Partecipanti (16)
WC2R 2LS London
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9052 ZWIJNAARDE - GENT
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CB2 1TN Cambridge
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4000 Liege
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1211 Geneve
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53229 Bonn
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53113 Bonn
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4365 ESCH-SUR-ALZETTE
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5230 Odense M
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66123 Saarbrucken
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Partecipazione conclusa
20090 Pieve Emanuele
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115 27 Athina
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31000 OSIJEK
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Soggetto giuridico diverso da un subappaltatore che è affiliato o legalmente collegato a un partecipante. Il soggetto svolge le attività secondo le condizioni stabilite nell’accordo di sovvenzione, fornisce beni o servizi per l’azione, ma non ha sottoscritto l’accordo di sovvenzione. Una terza parte rispetta le regole applicabili al suo partecipante correlato ai sensi dell’accordo di sovvenzione per quanto riguarda l’ammissibilità dei costi e il controllo delle spese.
10000 Zagreb
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66386 St Ingbert
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20121 Milano
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