Publications
Auteurs:
Kanika D Nahata, Filip Bielejec, Juan Monetta, Simon Dellicour, Andrew Rambaut, Marc A Suchard, Guy Baele, Philippe Lemey
Publié dans:
Virus Evolution, 2022, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford Academic
DOI:
10.1093/ve/veac088
Auteurs:
Michael Worobey; Jonathan Pekar; Brendan B. Larsen; Martha I. Nelson; Verity Hill; Jeffrey B. Joy; Andrew Rambaut; Marc A. Suchard; Joel O. Wertheim; Philippe Lemey
Publié dans:
Science, Numéro 11, 2020, ISSN 0036-8075
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/science.abc8169
Auteurs:
Zhenyu Zhang; Akihiko Nishimura; Paul Bastide; Xiang Ji; Rebecca Payne; Philip J. R. Goulder; Philippe Lemey; Marc A. Suchard
Publié dans:
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03254483, Numéro 18, 2021, ISSN 1932-6157
Éditeur:
Institute of Mathematical Statistics
DOI:
10.1214/20-aoas1394
Auteurs:
Noémie Lefrancq; Valérie Bouchez; Nadia Fernandes; Alex-Mikael Barkoff; Thijs Bosch; Tine Dalby; Thomas Åkerlund; Jessica Darenberg; Katerina Fabianova; Didrik F. Vestrheim; Norman K. Fry; Juan José González-López; Karolina Gullsby; Adele Habington; Qiushui He; David Litt; Helena Martini; Denis Piérard; Paola Stefanelli; Marc Stegger; Jana Zavadilova; Nathalie Armatys; Annie Landier; Sophie
Publié dans:
Science Translational Medicine, Numéro 14, 2022, ISSN 1946-6234
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.17863/cam.82478
Auteurs:
Samuel L. Hong; Philippe Lemey; Marc A. Suchard; Guy Baele
Publié dans:
Curr Protoc, Numéro 7, 2021, ISSN 1934-3396
Éditeur:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/cpz1.98
Auteurs:
Raphaëlle Klitting; Liana E. Kafetzopoulou; Liana E. Kafetzopoulou; W. Thiery; G. Dudas; Sophie Gryseels; A. Kotamarthi; Bram Vrancken; Karthik Gangavarapu; Mambu Momoh; J. Demby Sandy; Augustine Goba; F. Alhasan; Don Grant; Robert F. Garry; Allison R. Smither; Mark Zeller; Matthias Pauthner; Michelle McGraw; Laura D. Hughes; Sophie Duraffour; Stephan Günther; Marc A. Suchard; Marc A. Suchard; P
Publié dans:
Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1101/2021.09.22.461380
Auteurs:
Philippe Lemey, Nick Ruktanonchai, Samuel L. Hong, Vittoria Colizza, Chiara Poletto, Frederik Van den Broeck, Mandev S. Gill, Xiang Ji, Anthony Levasseur, Bas B. Oude Munnink, Marion Koopmans, Adam Sadilek, Shengjie Lai, Andrew J. Tatem, Guy Baele, Marc A. Suchard, Simon Dellicour
Publié dans:
Nature, Numéro 595, 2021, Page(s) 713–717, ISSN 0028-0836
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41586-021-03754-2
Auteurs:
X., Fisher A.A., Su S., Thorne J.L., Potter B., Lemey P., Baele G., Suchard M.A
Publié dans:
Systematic Biology, 2023, ISSN 1063-5157
Éditeur:
Taylor & Francis
DOI:
10.1093/sysbio/syad039
Auteurs:
Adérito L Monjane, Simon Dellicour, Penelope Hartnady, Kehinde A Oyeniran, Betty E Owor, Marion Bezuidenhout, Daphné Linderme, Rizwan A Syed, Lara Donaldson, Shane Murray, Edward P Rybicki, Anders Kvarnheden, Elham Yazdkhasti, Pierre Lefeuvre, Rémy Froissart, Philippe Roumagnac, Dionne N Shepherd, Gordon W Harkins, Marc A Suchard, Philippe Lemey, Arvind Varsani, Darren P Martin
Publié dans:
eLife, Numéro 9, 2020, ISSN 2050-084X
Éditeur:
eLife Sciences Publications
DOI:
10.7554/elife.51984
Auteurs:
Nathan D. Grubaugh, Jason T. Ladner, Philippe Lemey, Oliver G. Pybus, Andrew Rambaut, Edward C. Holmes, Kristian G. Andersen
Publié dans:
Nature Microbiology, Numéro 4/1, 2019, Page(s) 10-19, ISSN 2058-5276
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41564-018-0296-2
Auteurs:
Sebastian Lequime, Paul Bastide, Simon Dellicour, Philippe Lemey, Guy Baele
Publié dans:
Methods in Ecology and Evolution, Numéro 11/8, 2020, Page(s) 1002-1007, ISSN 2041-210X
Éditeur:
John Wiley and Sons Inc.
DOI:
10.1111/2041-210x.13422
Auteurs:
Dellicour, Simon; Lequime, Sebastian; Vrancken, Bram; Gill, Mandev S.; Bastide, Paul; Gangavarapu, Karthik; Matteson, Nate; Tan, Yi; Plessis, Louis du; Fisher, Alexander A.; Nelson, Martha I.; Gilbert, Marius; Suchard, Marc A.; Grubaugh, Nathan D.; Andersen, Kristian G.; Pybus, Oliver G.; Lemey, Philippe
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 18, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1101/788059
Auteurs:
Abbas Jariani; Christopher Warth; Koen Deforche; Pieter Libin; Pieter Libin; Alexei J. Drummond; Alexei J. Drummond; Andrew Rambaut; Frederick A. Matsen; Kristof Theys
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro 19, 2019, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford Academic
DOI:
10.1093/ve/vez003
Auteurs:
Kristof Theys; Philippe Lemey; Anne-Mieke Vandamme; Guy Baele
Publié dans:
Frontiers in Public Health, Vol 7 (2019), Numéro 17, 2019, ISSN 2296-2565
Éditeur:
Frontiers Media S.A.
DOI:
10.3389/fpubh.2019.00208
Auteurs:
Tsui, Joseph L-H; McCrone, John T; Lambert, Ben; Bajaj, Sumali; Inward, Rhys PD; Bosetti, Paolo; Pena, Rosario Evans; Tegally, Houriiyah; Hill, Verity; Zarebski, Alexander E; Peacock, Thomas P; Liu, Luyang; Wu, Neo; Davis, Megan; Bogoch, Isaac I; Khan, Kamran; Kall, Meaghan; Aziz, Nurin Iwani Binti Abdul; Colquhoun, Rachel; O'Toole, Aine; Jackson, Ben; Dasgupta, Abhishek; Wilkinson, Eduan; de Oliv
Publié dans:
Science, 2023, ISSN 0036-8075
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/science.adg660
Auteurs:
Paul Bastide; Lam Si Tung Ho; Guy Baele; Philippe Lemey; Marc A. Suchard
Publié dans:
Annals of Applied Statistics, Numéro 15(2), 2021, ISSN 1932-6157
Éditeur:
Institute of Mathematical Statistics
DOI:
10.1214/20-aoas1419
Auteurs:
Guy Baele, Simon Dellicour, Marc A Suchard, Philippe Lemey, Bram Vrancken
Publié dans:
Current Opinion in Virology, Numéro 31, 2018, Page(s) 24-32, ISSN 1879-6257
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.coviro.2018.08.009
Auteurs:
Kremer C., Torneri A., Libin P.J.K., Meex C., Hayette M.P., Bontems S., Durkin K., Artesi M., Bours V., Lemey P., Darcis G., Hens N., Meuris C
Publié dans:
Epidemics, 2023, ISSN 1755-4365
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.epidem.2023.100701
Auteurs:
Maciej F. Boni, Philippe Lemey, Xiaowei Jiang, Tommy Tsan-Yuk Lam, Blair W. Perry, Todd A. Castoe, Andrew Rambaut, David L. Robertson
Publié dans:
Nature Microbiology, 2020, ISSN 2058-5276
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41564-020-0771-4
Auteurs:
Ana Belén Pérez; Bram Vrancken; Natalia Chueca; Antonio Aguilera; Gabriel Reina; Miguel Garcia del Toro; Francisco Vera; Miguel Angel Von Wichman; Juan Arenas; Francisco Téllez; Juan A. Pineda; Mohamed Omar; Enrique Bernal; Antonio Rivero-Juárez; Elisa Fernández-Fuertes; Alberto de la Iglesia; Juan Manuel Pascasio; Philippe Lemey; Federico García; Lize Cuypers
Publié dans:
Eurosurveillance, Numéro 2, 2019, ISSN 1560-7917
Éditeur:
ECDC
DOI:
10.2807/1560-7917.es.2019.24.9.1800227
Auteurs:
Hassler, G.W., Magee, A.F., Zhang, Z., Baele, G., Lemey P., Ji, X., Fourment, M. and Suchard, M.A.
Publié dans:
Annual Review of Statistics and Its Application, Numéro 10(1), 2023, Page(s) 353-377, ISSN 2326-8298
Éditeur:
Annual Reviews
DOI:
10.1146/annurev-statistics-033021-112532
Auteurs:
Sebastián Duchêne; Leo Featherstone; Melina Haritopoulou-Sinanidou; Andrew Rambaut; Philippe Lemey; Guy Baele
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro 10, 2020, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/ve/veaa061
Auteurs:
Gabriel W. Hassler; Max R. Tolkoff; William L. Allen; Lam Si Tung Ho; Philippe Lemey; Marc A. Suchard
Publié dans:
Journal of the American Statistical Association, Numéro vol 117, iss 538, 2022, ISSN 0162-1459
Éditeur:
American Statistical Association
DOI:
10.1080/01621459.2020.1799812
Auteurs:
Darren P, Martin; Steven, Weaver; Houryiah, Tegally; Emmanuel James, San; Stephen D, Shank; Eduan, Wilkinson; Alexander G, Lucaci; Jennifer, Giandhari; Sureshnee, Naidoo; Yeshnee, Pillay; Lavanya, Singh; Richard J, Lessells; Ravindra K, Gupta; Joel O, Wertheim; Anton, Nekturenko; Ben, Murrell; Gordon W, Harkins; Philippe, Lemey; Oscar A, MacLean; David L, Robertson; Tulio, de Oliveira; Sergei L, K
Publié dans:
Cell, Numéro Volume 184, Numéro 20, 2021, Page(s) 5189-5200.e7, ISSN 0092-8674
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1101/2021.02.23.21252268
Auteurs:
Zhang, Zhenyu; Nishimura, Akihiko; Trovão, Nídia S.; Cherry, Joshua L.; Holbrook, Andrew J.; Ji, Xiang; Lemey, Philippe; Suchard, Marc A.
Publié dans:
Plos Computational Biology, Numéro 3, 2023, ISSN 1553-734X
Éditeur:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pcbi.1011419
Auteurs:
Magda Bletsa, Bram Vrancken, Sophie Gryseels, Ine Boonen, Antonios Fikatas, Yiqiao Li, Anne Laudisoit, Sebastian Lequime, Josef Bryja, Rhodes Makundi, Yonas Meheretu, Benjamin Dudu Akaibe, Sylvestre Gambalemoke Mbalitini, Frederik Van de Perre, Natalie Van Houtte, Jana Těšíková, Elke Wollants, Marc Van Ranst, Oliver G Pybus, Jan Felix Drexler, Erik Verheyen, H
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro Volume 7, Numéro 1, 2021, Page(s) veab036, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford Academic
DOI:
10.1093/ve/veab036
Auteurs:
Sophie Gryseels, Thomas D. Watts, Jean-Marie Kabongo Mpolesha, Brendan B. Larsen, Philippe Lemey, Jean-Jacques Muyembe-Tamfum, Dirk E. Teuwen, Michael Worobey
Publié dans:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 117/22, 2020, Page(s) 12222-12229, ISSN 0027-8424
Éditeur:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.1913682117
Auteurs:
Lore Vinken; Katrien Fransen; Lize Cuypers; Ivailo Alexiev; Claudia Balotta; Laurent Debaisieux; Carole Seguin-Devaux; Sergio García Ribas; Perpétua Gomes; Perpétua Gomes; Francesca Incardona; Rolf Kaiser; Jean Ruelle; Murat Sayan; Murat Sayan; Simona Paraschiv; Roger Paredes; Martine Peeters; Anders Sönnerborg; Ellen Vancutsem; Anne-Mieke Vandamme; Anne-Mieke Vandamme; Sigi Van den Wijngaert;
Publié dans:
ISSN: 1664-302X, Numéro 10, 2019, ISSN 1664-302X
Éditeur:
Frontiers Media
DOI:
10.3389/fmicb.2019.00613
Auteurs:
Oumar Faye, Maria de Lourdes Monteiro, Bram Vrancken, Matthieu Prot, Sebastian Lequime, Maryam Diarra, Oumar Ndiaye, Tomas Valdez, Sandra Tavarez, Jessica Ramos, Silvânia da Veiga Leal, Cecilio Pires, Antonio Moreira, Maria Filomena Tavares, Linete Fernandes, Jorge Noel Barreto, Maria do Céu Teixeira, Maria da Luz de Lima Mendonça, Carolina Cardoso da Silva Leite Gomes, Mariano Salazar Castello
Publié dans:
Emerging Infectious Diseases, Numéro 26/6, 2020, Page(s) 1084-1090, ISSN 1080-6040
Éditeur:
US National Center for Infectious Diseases
DOI:
10.3201/eid2606.190928
Auteurs:
N. R. Faria, M. U. G. Kraemer, S. C. Hill, J. Goes de Jesus, R. S. Aguiar, F. C. M. Iani, J. Xavier, J. Quick, L. du Plessis, S. Dellicour, J. Thézé, R. D. O. Carvalho, G. Baele, C.-H. Wu, P. P. Silveira, M. B. Arruda, M. A. Pereira, G. C. Pereira, J. Lourenço, U. Obolski, L. Abade, T. I. Vasylyeva, M. Giovanetti, D. Yi, D. J. Weiss, G. R. W. Wint, F. M. Shearer, S. Funk, B. Nikolay, V. Fonseca
Publié dans:
Science, Numéro 361/6405, 2018, Page(s) 894-899, ISSN 0036-8075
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/science.aat7115
Auteurs:
Marc A Suchard, Philippe Lemey, Guy Baele, Daniel L Ayres, Alexei J Drummond, Andrew Rambaut
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro 4/1, 2018, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/ve/vey016
Auteurs:
Simon Dellicour, Guy Baele, Gytis Dudas, Nuno R. Faria, Oliver G. Pybus, Marc A. Suchard, Andrew Rambaut, Philippe Lemey
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-03763-2
Auteurs:
L. E. Kafetzopoulou, S. T. Pullan, P. Lemey, M. A. Suchard, D. U. Ehichioya, M. Pahlmann, A. Thielebein, J. Hinzmann, L. Oestereich, D. M. Wozniak, K. Efthymiadis, D. Schachten, F. Koenig, J. Matjeschk, S. Lorenzen, S. Lumley, Y. Ighodalo, D. I. Adomeh, T. Olokor, E. Omomoh, R. Omiunu, J. Agbukor, B. Ebo, J. Aiyepada, P. Ebhodaghe, B. Osiemi, S. Ehikhametalor, P. Akhilomen, M. Airende, R. Esumeh,
Publié dans:
Science, Numéro 363/6422, 2019, Page(s) 74-77, ISSN 0036-8075
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/science.aau9343
Auteurs:
Huaiyu Tian, Yun Feng, Bram Vrancken, Bernard Cazelles, Hua Tan, Mandev S. Gill, Qiqi Yang, Yidan Li, Weihong Yang, Yuzhen Zhang, Yunzhi Zhang, Philippe Lemey, Oliver G. Pybus, Nils Chr. Stenseth, Hailin Zhang, Simon Dellicour
Publié dans:
PLOS Pathogens, Numéro 14/12, 2018, Page(s) e1007392, ISSN 1553-7374
Éditeur:
PLoS
DOI:
10.1371/journal.ppat.1007392
Auteurs:
Simon Dellicour, Bram Vrancken, Nídia S Trovão, Denis Fargette, Philippe Lemey
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro 4/2, 2018, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/ve/vey023
Auteurs:
Bert Vanmechelen, Magda Bletsa, Lies Laenen, Ana Rita Lopes, Valentijn Vergote, Leen Beller, Ward Deboutte, Miša Korva, Tatjana Avšič Županc, Joëlle Goüy de Bellocq, Sophie Gryseels, Herwig Leirs, Philippe Lemey, Bram Vrancken, Piet Maes
Publié dans:
BMC Genomics, Numéro 19/1, 2018, ISSN 1471-2164
Éditeur:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12864-018-4995-0
Auteurs:
Bram Vrancken, Marc A Suchard, Philippe Lemey
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro 3/2, 2017, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/ve/vex028
Auteurs:
Andrew Rambaut, Alexei J Drummond, Dong Xie, Guy Baele, Marc A Suchard
Publié dans:
Systematic Biology, Numéro 67/5, 2018, Page(s) 901-904, ISSN 1063-5157
Éditeur:
Taylor & Francis
DOI:
10.1093/sysbio/syy032
Auteurs:
Jade Vincent Membrebe, Marc A Suchard, Andrew Rambaut, Guy Baele, Philippe Lemey
Publié dans:
Molecular Biology and Evolution, Numéro 36/8, 2019, Page(s) 1793-1803, ISSN 0737-4038
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/molbev/msz094
Auteurs:
Daniel L Ayres, Michael P Cummings, Guy Baele, Aaron E Darling, Paul O Lewis, David L Swofford, John P Huelsenbeck, Philippe Lemey, Andrew Rambaut, Marc A Suchard
Publié dans:
Systematic Biology, Numéro 68/6, 2019, Page(s) 1052-1061, ISSN 1063-5157
Éditeur:
Taylor & Francis
DOI:
10.1093/sysbio/syz020
Auteurs:
Marie-Angélique De Scheerder, Bram Vrancken, Simon Dellicour, Timothy Schlub, Eunok Lee, Wei Shao, Sofie Rutsaert, Chris Verhofstede, Tessa Kerre, Thomas Malfait, Dimitri Hemelsoet, Marc Coppens, Annemieke Dhondt, Danny De Looze, Frank Vermassen, Philippe Lemey, Sarah Palmer, Linos Vandekerckhove
Publié dans:
Cell Host & Microbe, Numéro 26/3, 2019, Page(s) 347-358.e7, ISSN 1931-3128
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.chom.2019.08.003
Auteurs:
Magda Bletsa, Marc A Suchard, Xiang Ji, Sophie Gryseels, Bram Vrancken, Guy Baele, Michael Worobey, Philippe Lemey
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro 5/2, 2019, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford University Presss
DOI:
10.1093/ve/vez036
Auteurs:
Mandev S Gill, Philippe Lemey, Marc A Suchard, Andrew Rambaut, Guy Baele
Publié dans:
Molecular Biology and Evolution, 2020, ISSN 0737-4038
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/molbev/msaa047
Auteurs:
Samuel L. Hong, Simon Dellicour, Bram Vrancken, Marc A. Suchard, Michael T. Pyne, David R. Hillyard, Philippe Lemey, Guy Baele
Publié dans:
Viruses, Numéro 12/2, 2020, Page(s) 182, ISSN 1999-4915
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/v12020182
Auteurs:
Qiqi Yang, Xiang Zhao, Philippe Lemey, Marc A. Suchard, Yuhai Bi, Weifeng Shi, Di Liu, Wenbao Qi, Guogang Zhang, Nils Chr. Stenseth, Oliver G. Pybus, Huaiyu Tian
Publié dans:
Proceedings of the National Academy of Sciences, 2020, Page(s) 201906954, ISSN 0027-8424
Éditeur:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.1906954117
Auteurs:
Nuno R. Faria, Nicole Vidal, José Lourenco, Jayna Raghwani, Kim C. E. Sigaloff, Andy J. Tatem, David A. M. van de Vijver, Andrea-Clemencia Pineda-Peña, Rebecca Rose, Carole L. Wallis, Steve Ahuka-Mundeke, Jean-Jacques Muyembe-Tamfum, Jérémie Muwonga, Marc A. Suchard, Tobias F. Rinke de Wit, Raph L. Hamers, Nicaise Ndembi, Guy Baele, Martine Peeters, Oliver G. Pybus, Philippe Lemey, Simon Delli
Publié dans:
PLOS Pathogens, Numéro 15/12, 2019, Page(s) e1007976, ISSN 1553-7374
Éditeur:
PLoS
DOI:
10.1371/journal.ppat.1007976
Auteurs:
Alice Fusaro, Bianca Zecchin, Bram Vrancken, Celia Abolnik, Rose Ademun, Abdou Alassane, Abdelsatar Arafa, Joseph Adongo Awuni, Emmanuel Couacy-Hymann, M.’ Bétiégué Coulibaly, Nicolas Gaidet, Emilie Go-Maro, Tony Joannis, Simon Dickmu Jumbo, Germaine Minoungou, Clement Meseko, Maman Moutari Souley, Deo Birungi Ndumu, Ismaila Shittu, Augustin Twabela, Abel Wade, Lidewij Wiersma, Yao P. Akpeli,
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-019-13287-y
Auteurs:
Oscar A. MacLean; Spyros Lytras; Steven Weaver; Joshua B Singer; Maciej F. Boni; Philippe Lemey; Sergei L Kosakovsky Pond; David Robertson
Publié dans:
PLoS Biology, Numéro Vol 19, Iss 3, 2021, Page(s) e3001115, ISSN 1544-9173
Éditeur:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pbio.3001115
Auteurs:
Gabriel W. Hassler; Brigida Gallone; Leandro Aristide; William L. Allen; Max R. Tolkoff; Andrew J. Holbrook; Guy Baele; Philippe Lemey; Marc A. Suchard
Publié dans:
Methods in ecology and evolution, Numéro 13, 2023, ISSN 2041-210X
Éditeur:
John Wiley and Sons Inc.
DOI:
10.1111/2041-210x.13920
Auteurs:
Ji, Xiang; Zhang, Zhenyu; Holbrook, Andrew; Nishimura, Akihiko; Baele, Guy; Rambaut, Andrew; Lemey, Philippe; Suchard, Marc A.
Publié dans:
Molecular Biology and Evolution, 2020, ISSN 1537-1719
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/molbev/msaa130
Auteurs:
Layan M., Dacheux L, Lemey P., Brunker K., Ma L., Troupin C., Dussart P., Chevalier V., Wood J.L.N., Ly S., Duong V., Bourhy H., Dellicour S
Publié dans:
Molecular Ecology, 2022, ISSN 1365-294X
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd
DOI:
10.1111/mec.17087
Auteurs:
Deborah U. Ehichioya, Simon Dellicour, Meike Pahlmann, Toni Rieger, Lisa Oestereich, Beate Becker-Ziaja, Daniel Cadar, Yemisi Ighodalo, Thomas Olokor, Emmanuel Omomoh, Jennifer Oyakhilome, Racheal Omiunu, Jacqueline Agbukor, Benevolence Ebo, John Aiyepada, Paulson Ebhodaghe, Blessing Osiemi, Solomon Ehikhametalor, Patience Akhilomen, Michael Airende, Rita Esumeh, Ekene Muoebonam, Rosemary Giwa, An
Publié dans:
Journal of Virology, Numéro 93/21, 2019, ISSN 0022-538X
Éditeur:
American Society for Microbiology
DOI:
10.1128/JVI.00929-19
Auteurs:
de Moraes L., Portilho M.M., Vrancken B., Van den Broeck F., Santos L.A., Cucco M., Tauro L.B., Kikuti M., Silva M.M.O., Campos G.S., Reis M.G., Barral A., Barral-Netto M., Boaventura V.S., Vandamme A.M., Theys K., Lemey P., Ribeiro G.S. and Khouri R
Publié dans:
Viruses, 2023, ISSN 1999-4915
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/v15061236
Auteurs:
Alexander A. Fisher; Gabriel W. Hassler; Xiang Ji; Guy Baele; Marc A. Suchard; Philippe Lemey
Publié dans:
PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B, Numéro Volume 377Numéro 1861, 2022, ISSN 0962-8436
Éditeur:
Royal Society of London
DOI:
10.1098/rstb.2021.0242
Auteurs:
Baele, Guy; Gill, Mandev S.; Lemey, Philippe; Suchard, Marc A.
Publié dans:
Wellcome Open Research, Numéro 4, 2020, ISSN 2398-502X
Éditeur:
F1000 Research
DOI:
10.12688/wellcomeopenres.15770.1
Auteurs:
Sebastian Duchene, Philippe Lemey, Tanja Stadler, Simon Y W Ho, David A Duchene, Vijaykrishna Dhanasekaran, Guy Baele
Publié dans:
Molecular Biology and Evolution, Numéro 06 July 2020, 2020, ISSN 0737-4038
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/molbev/msaa163
Auteurs:
Ariane Düx, Sebastian Lequime, Livia Victoria Patrono, Bram Vrancken, Sengül Boral, Jan F. Gogarten, Antonia Hilbig, David Horst, Kevin Merkel, Baptiste Prepoint, Sabine Santibanez, Jasmin Schlotterbeck, Marc A. Suchard, Markus Ulrich, Navena Widulin, Annette Mankertz, Fabian H. Leendertz, Kyle Harper, Thomas Schnalke, Philippe Lemey, Sébastien Calvignac-Spencer
Publié dans:
Science, Numéro 368/6497, 2020, Page(s) 1367-1370, ISSN 0036-8075
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/science.aba9411
Auteurs:
Mbolarinosy Rakotomalala, Bram Vrancken, Agnès Pinel-Galzi, Perle Ramavovololona, Eugénie Hébrard, Jean Stéphan Randrianangaly, Simon Dellicour, Philippe Lemey, Denis Fargette
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro 5/2, 2019, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford Academic
DOI:
10.1093/ve/vez023
Auteurs:
Fisher, Alexander A.; Ji, Xiang; Lemey, Philippe; Suchard, Marc A.
Publié dans:
Systematic Biology, 2021, ISSN 1063-5157
Éditeur:
Taylor & Francis
DOI:
10.1093/sysbio/syaa056
Auteurs:
Bert Vanmechelen; Zafeiro Zisi; Sophie Gryseels; Joëlle Goüy de Bellocq; Bram Vrancken; Philippe Lemey; Piet Maes; Magda Bletsa
Publié dans:
Volume 13, Numéro 1, 2021, ISSN 1999-4915
Éditeur:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.3390/v13091842
Auteurs:
Silvie Van den Hoecke; Marlies Ballegeer; Bram Vrancken; Lei Deng; Emma R. Job; Kenny Roose; Bert Schepens; Lien Van Hoecke; Philippe Lemey; Xavier Saelens
Publié dans:
MBIO, Numéro 15, 2021, ISSN 2150-7511
Éditeur:
American Society for Microbiology
DOI:
10.1128/mbio.00745-21
Auteurs:
George M Nduva; Frederick Otieno; Joshua Kimani; Elizabeth Wahome; Lyle R McKinnon; Francois Cholette; Maxwell Majiwa; Moses Masika; Gaudensia Mutua; Omu Anzala; Susan M Graham; Larry Gelmon; Matt A Price; Adrian D Smith; Robert C Bailey; Guy Baele; Philippe Lemey; Amin S Hassan; Eduard J Sanders; Joakim Esbjörnsson
Publié dans:
Virus Evolution, Numéro Volume 8, Numéro 1, 2022, Page(s) veac016, ISSN 2057-1577
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/ve/veac016
Auteurs:
Fara R. Koundouno; Liana E. Kafetzopoulou; Martin Faye; Annick Renevey; Barrè Soropogui; Kékoura Ifono; Emily V. Nelson; Aly A. Kamano; Charles Tolno; Giuditta Annibaldis; Saa L. Millimono; Jacob Camara; Karifa Kourouma; Ahmadou Doré; Tamba E. Millimouno; Fernand M.B. Tolno; Julia Hinzmann; Hugo Soubrier; Mette Hinrichs; Anke Thielebein; Glaucia Herzer; Meike Pahlmann; Georges A. Ki-Zerbo; Pier
Publié dans:
The New England Journal of Medicine, 2022, ISSN 0028-4793
Éditeur:
Massachusetts Medical Society
DOI:
10.1056/nejmc2120183
Auteurs:
Andrew J. Holbrook, Philippe Lemey, Guy Baele, Simon Dellicour, Dirk Brockmann, Andrew Rambaut, Marc A. Suchard
Publié dans:
Journal of Computational and Graphical Statistics, Numéro 08 Jun 2020, 2020, Page(s) 1-14, ISSN 1061-8600
Éditeur:
American Statistical Association
DOI:
10.1080/10618600.2020.1754226
Auteurs:
Philippe Lemey, Samuel L. Hong, Verity Hill, Guy Baele, Chiara Poletto, Vittoria Colizza, Áine O’Toole, John T. McCrone, Kristian G. Andersen, Michael Worobey, Martha I. Nelson, Andrew Rambaut & Marc A. Suchard
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 11, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-020-18877-9
Auteurs:
YQ Li, M Ghafari, AJ Holbrook, I Boonen, N Amor, S Catalano, JP Webster, YY Li, HT Li, V Vergote, P Maes, YL Chong, A Laudisoit, P Baelo, S Ngoy, SG Mbalitini, GC Gembu, P Musaba Akawa, J Goüy de Bellocq, H Leirs, E Verheyen, OG Pybus, A Katzourakis, AN Alagaili, S Gryseels, YC Li, MA Suchard, M Bletsa, P Lemey
Publié dans:
bioRxiv, 2023
Éditeur:
Cold Spring Harbour Laboratory
DOI:
10.1101/2023.06.30.547218
Auteurs:
Lytras, Spyros ; Ghafari, Mahan ; Magee, Andrew F ; Parker, Edyth ; Havens, Jennifer L ; Katzourakis, Aris ; Vasylyeva, Tetyana I ; Suchard, Marc A ; Hughes, Alice C ; Hughes, Joseph ; Robertson, David L ; Dellicour, Simon ; Worobey, Michael ; Wertheim, Joel O ; Lemey, Philippe
Publié dans:
bioArxiv, 2023
Éditeur:
Cold Spring Harbour Laboratory
DOI:
10.1101/2023.07.12.548617
Auteurs:
Franziska Hufsky; Denis Beslic; Dimitri Boeckaerts; Sebastian Duchene; Enrique González-Tortuero; Andreas J. Gruber; Jiarong Guo; Daan Jansen; John Juma; Kunaphas Kongkitimanon; Antoni Luque; Muriel Ritsch; Gabriel Lencioni Lovate; Luca Nishimura; Célia Pas; Esteban Domingo; Emma Hodcroft; Philippe Lemey; Matthew B. Sullivan; Friedemann Weber; Fernando González-Candelas; Sarah Krautwurst; Alba
Publié dans:
VIRUSES, Numéro 14(5), 2022, ISSN 1999-4915
Éditeur:
MDPI
DOI:
10.48350/170316
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