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Illuminating aptamers and ribozymes for biomolecular tagging and fluorogen activation

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Structure and mechanism of the methyltransferase ribozyme MTR1

Auteurs: Carolin P. M. Scheitl, Mateusz Mieczkowski, Hermann Schindelin, Claudia Höbartner
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro monthly, 2022, Page(s) 547-555, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-022-00976-x

Large Stokes shift fluorescence activation in an RNA aptamer by intermolecular proton transfer to guanine

Auteurs: Mateusz Mieczkowski, Christian Steinmetzger, Irene Bessi, Ann-Kathrin Lenz, Alexander Schmiedel, Marco Holzapfel, Christoph Lambert, Vladimir Pena, Claudia Höbartner
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12:3549, 2021, Page(s) 11, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23932-0

Mechanism of molnupiravir-induced SARS-CoV-2 mutagenesis

Auteurs: Florian Kabinger, Carina Stiller, Jana Schmitzová, Christian Dienemann, Goran Kokic, Hauke S. Hillen, Claudia Höbartner, Patrick Cramer
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 28:740, 2021, Page(s) 7, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-021-00651-0

Mechanism of SARS-CoV-2 polymerase stalling by remdesivir

Auteurs: Goran Kokic, Hauke S. Hillen, Dimitry Tegunov, Christian Dienemann, Florian Seitz, Jana Schmitzova, Lucas Farnung, Aaron Siewert, Claudia Höbartner, Patrick Cramer
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, Page(s) 7, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20542-0

The RNA methyltransferase METTL8 installs m3C32 in mitochondrial tRNAsThr/Ser(UCN) to optimise tRNA structure and mitochondrial translation

Auteurs: Nicole Kleiber, Nicolas Lemus-Diaz, Carina Stiller, Marleen Heinrichs, Mandy Mong-Quyen Mai, Philipp Hackert, Ricarda Richter-Dennerlein, Claudia Höbartner, Katherine E. Bohnsack, Markus T. Bohnsack
Publié dans: Nature Communications, Numéro 13:209, 2022, Page(s) 19, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27905-1

RNA-Cleaving Deoxyribozymes Differentiate Methylated Cytidine Isomers in RNA

Auteurs: Anam Liaqat, Maksim V. Sednev, Carina Stiller, Claudia Höbartner
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 60:19058, 2021, Page(s) 5, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202106517

Fundamental studies of functional nucleic acids: aptamers, riboswitches, ribozymes and DNAzymes

Auteurs: Ronald Micura and Claudia Höbartner
Publié dans: Chemical Society Reviews, Numéro 24/year, 2020, ISSN 0306-0012
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0cs00617c

N 6 -Methyladenosine-Sensitive RNA-Cleaving Deoxyribozymes

Auteurs: Maksim V. Sednev, Volodymyr Mykhailiuk, Priyanka Choudhury, Julia Halang, Katherine E. Sloan, Markus T. Bohnsack, Claudia Höbartner
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 57/46, 2018, Page(s) 15117-15121, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201808745

Debranchase-resistant labeling of RNA using the 10DM24 deoxyribozyme and fluorescent modified nucleotides

Auteurs: Tucker J. Carrocci, Lea Lohe, Matthew J. Ashton, Claudia Höbartner, Aaron A. Hoskins
Publié dans: Chemical Communications, Numéro 53/88, 2017, Page(s) 11992-11995, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c7cc06703h

A Multicolor Large Stokes Shift Fluorogen-Activating RNA Aptamer with Cationic Chromophores

Auteurs: Christian Steinmetzger, Navaneethan Palanisamy, Kiran R. Gore, Claudia Höbartner
Publié dans: Chemistry - A European Journal, Numéro weekly, 2018, Page(s) 5, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.201805882

Structure–fluorescence activation relationships of a large Stokes shift fluorogenic RNA aptamer

Auteurs: Christian Steinmetzger, Irene Bessi, Ann-Kathrin Lenz, Claudia Höbartner
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2019, Page(s) 2019, 47, 11538-11550, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkz1084

Direct in Vitro Selection of Trans -Acting Ribozymes for Posttranscriptional, Site-Specific, and Covalent Fluorescent Labeling of RNA

Auteurs: Mohammad Ghaem Maghami, Carolin P. M. Scheitl, Claudia Höbartner
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 141/50, 2019, Page(s) 19546-19549, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.9b10531

Supramolecular Fluorescence Resonance Energy Transfer in Nucleobase‐Modified Fluorogenic RNA Aptamers

Auteurs: Christian Steinmetzger, Carmen Bäuerlein, Claudia Höbartner
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 59/17, 2020, Page(s) 6760-6764, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201916707

Repurposing Antiviral Drugs for Orthogonal RNA‐Catalyzed Labeling of RNA

Auteurs: Mohammad Ghaem Maghami, Surjendu Dey, Ann‐Kathrin Lenz, Claudia Höbartner
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 59/24, 2020, Page(s) 9335-9339, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202001300

N 6‐isopentenyladenosine in RNA determines the cleavage site of endonuclease deoxyribozymes

Auteurs: Anam Liaqat, Carina Stiller, Manuela Michel, Maksim V Sednev, Claudia Höbartner
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, 2020, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202006218

New Deoxyribozymes for the Native Ligation of RNA

Auteurs: Carolin P. M. Scheitl, Sandra Lange, Claudia Höbartner
Publié dans: Molecules, Numéro 25/16, 2020, Page(s) 3650, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules25163650

Site-specific RNA methylation by a methyltransferase ribozyme

Auteurs: Carolin P. M. Scheitl, Mohammad Ghaem Maghami, Ann-Kathrin Lenz, Claudia Höbartner
Publié dans: Nature, Numéro 587/7835, 2020, Page(s) 663-667, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2854-z

Tuning Exciton Coupling of Merocyanine Nucleoside Dimers by RNA, DNA and GNA Double Helix Conformations

Auteurs: Julia Dietzsch, David Bialas, Johannes Bandorf, Frank Würthner, Claudia Höbartner
Publié dans: Angewandte Chemie Internation Edition, Numéro e202116783, 2022, Page(s) 8, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202116783

In Vitro Selection of Deoxyribozymes for the Detection of RNA Modifications

Auteurs: Anam Liaqat, Maksim V. Sednev, Claudia Höbartner
Publié dans: Ribosome Biogenesis: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, vol. 2533, 2022, Page(s) 167-179, ISBN 978-1-0716-2501-9
Éditeur: Humana Press
DOI: 10.1007/978-1-0716-2501-9_10

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