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Zebrafish vision in its natural context: from natural scenes through retinal and central processing to behaviour.

Publications

TReND in Africa: Toward a Truly Global (Neuro)science Community

Auteurs: Tom Baden, Mahmoud Bukar Maina, Andre Maia Chagas, Yunusa Garba Mohammed, Thomas O. Auer, Ana Silbering, Lukas von Tobel, Marie Pertin, Renee Hartig, Jelena Aleksic, Ibukun Akinrinade, Mosab A. Awadelkareem, Artemis Koumoundourou, Aled Jones, Fabiana Arieti, Andrew Beale, Daniel Münch, Samyra Cury Salek, Sadiq Yusuf, Lucia L. Prieto-Godino
Publié dans: Neuron, Numéro 107/3, 2020, Page(s) 412-416, ISSN 0896-6273
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2020.06.026

Species-specific motion detectors

Auteurs: Thomas Euler, Tom Baden
Publié dans: Nature, Numéro 535/7610, 2016, Page(s) 45-46, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature18454

Vertebrate vision: Lessons from non-model species

Auteurs: Tom Baden
Publié dans: Seminars in Cell & Developmental Biology, Numéro 106, 2020, Page(s) 1-4, ISSN 1084-9521
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcdb.2020.05.028

A low-cost hyperspectral scanner for natural imaging and the study of animal colour vision above and under water

Auteurs: N. E. Nevala, T. Baden
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-47220-6

Type-specific dendritic integration in mouse retinal ganglion cells

Auteurs: Yanli Ran, Ziwei Huang, Tom Baden, Timm Schubert, Harald Baayen, Philipp Berens, Katrin Franke, Thomas Euler
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-15867-9

Fovea-like Photoreceptor Specializations Underlie Single UV Cone Driven Prey-Capture Behavior in Zebrafish

Auteurs: Takeshi Yoshimatsu, Cornelius Schröder, Noora E. Nevala, Philipp Berens, Tom Baden
Publié dans: Neuron, Numéro 107/2, 2020, Page(s) 320-337.e6, ISSN 0896-6273
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2020.04.021

Distinct Synaptic Transfer Functions in Same-Type Photoreceptors

Auteurs: Cornelius Schröder; Jonathan Oesterle; Philipp Berens; Takeshi Yoshimatsu; Tom Baden; Tom Baden
Publié dans: eLife, Numéro 2050084X, 2020, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2021.02.24.432674

Circuit mechanisms for colour vision in zebrafish

Auteurs: Tom Baden
Publié dans: Current Biology, Numéro 09609822, 2021, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2021.04.053

Zebrafish Retinal Ganglion Cells Asymmetrically Encode Spectral and Temporal Information across Visual Space

Auteurs: Mingyi Zhou, John Bear, Paul A. Roberts, Filip K. Janiak, Julie Semmelhack, Takeshi Yoshimatsu, Tom Baden
Publié dans: Current Biology, Numéro 30/15, 2020, Page(s) 2927-2942.e7, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.05.055

African neuroscience on the global stage: Nigeria as a model

Auteurs: Mahmoud Bukar Maina, Yunusa Garba Mohammed, Ali Maina Bukar, Umar Ahmad, Abubakar Tijjani Salihu, Harun A. Ibrahim, Muhammad Abdurrazak, Suleiman Kwairanga Hamidu, Aisha Umar Yaro, Mosab Ali Awadelkareem, Fayza Eid Nasr, Tom Baden
Publié dans: European Journal of Neuroscience, Numéro 49/12, 2019, Page(s) 1544-1551, ISSN 0953-816X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ejn.14372

General features of inhibition in the inner retina

Auteurs: Franke, Katrin; Baden, Tom
Publié dans: The Journal of Physiology, Numéro 7, 2019, ISSN 1469-7793
Éditeur: Wiley

The €100 lab: A 3D-printable open-source platform for fluorescence microscopy, optogenetics, and accurate temperature control during behaviour of zebrafish, Drosophila, and Caenorhabditis elegans

Auteurs: Andre Maia Chagas, Lucia L. Prieto-Godino, Aristides B. Arrenberg, Tom Baden
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 15/7, 2017, Page(s) e2002702, ISSN 1545-7885
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.2002702

General features of inhibition in the inner retina

Auteurs: Katrin Franke, Tom Baden
Publié dans: The Journal of Physiology, Numéro 595/16, 2017, Page(s) 5507-5515, ISSN 0022-3751
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1113/JP273648

Openspritzer: an open hardware pressure ejection system for reliably delivering picolitre volumes

Auteurs: C. J. Forman, H. Tomes, B. Mbobo, R. J. Burman, M. Jacobs, T Baden, J. V. Raimondo
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 7/1, 2017, Page(s) 2188, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-02301-2

Zebrafish Differentially Process Color across Visual Space to Match Natural Scenes

Auteurs: Maxime J.Y. Zimmermann, Noora E. Nevala, Takeshi Yoshimatsu, Daniel Osorio, Dan-Eric Nilsson, Philipp Berens, Tom Baden
Publié dans: Current Biology, Numéro 28/13, 2018, Page(s) 2018-2032.e5, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2018.04.075

Spikeling: A low-cost hardware implementation of a spiking neuron for neuroscience teaching and outreach

Auteurs: Tom Baden, Ben James, Maxime J. Y. Zimmermann, Phillip Bartel, Dorieke Grijseels, Thomas Euler, Leon Lagnado, Miguel Maravall
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 16/10, 2018, Page(s) e2006760, ISSN 1545-7885
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.2006760

Inhibition decorrelates visual feature representations in the inner retina

Auteurs: Katrin Franke, Philipp Berens, Timm Schubert, Matthias Bethge, Thomas Euler, Tom Baden
Publié dans: Nature, Numéro 542/7642, 2017, Page(s) 439-444, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature21394

Visual Neuroscience: A Retinal Ganglion Cell to Report Image Focus?

Auteurs: Tom Baden, Frank Schaeffel, Philipp Berens
Publié dans: Current Biology, Numéro 27/4, 2017, Page(s) R139-R141, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2016.12.022

Retinal Physiology: Non-Bipolar-Cell Excitatory Drive in the Inner Retina

Auteurs: Tom Baden, Thomas Euler
Publié dans: Current Biology, Numéro 26/15, 2016, Page(s) R706-R708, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2016.03.065

The retinal basis of vision in chicken

Auteurs: M. Seifert, T. Baden, D. Osorio
Publié dans: Seminars in Cell & Developmental Biology, Numéro 106, 2020, Page(s) 106-115, ISSN 1084-9521
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcdb.2020.03.011

Spectral inference reveals principal cone-integration rules of the zebrafish inner retina

Auteurs: Philipp Bartel; Takeshi Yoshimatsu; F. Janiak; Tom Baden; Tom Baden
Publié dans: Current Biology, Numéro 09609822, 2021, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1101/2021.08.10.455697

LED Zappelin’: An open source LED controller for arbitrary spectrum visual stimulation and optogenetics during 2-photon imaging

Auteurs: Zimmermann, M.J.Y.; Chagas, A.M.; Bartel, P.; Pop, S.; Godino, L.L. Prieto; Baden, T.
Publié dans: HardwareX, Numéro 2, 2020, ISSN 0000-0000
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.ohx.2020.e00127

An arbitrary-spectrum spatial visual stimulator for vision research

Auteurs: Katrin Franke; André Maia Chagas; Zhijian Zhao; Maxime JY Zimmermann; Philipp Bartel; Yongrong Qiu; Klaudia P Szatko; Tom Baden; Thomas Euler
Publié dans: eLife, Numéro 3, 2019, ISSN 0000-0000
Éditeur: eLife
DOI: 10.7554/elife.48779

Leveraging open hardware to alleviate the burden of COVID-19 on global health systems

Auteurs: Andre Maia Chagas, Jennifer C. Molloy, Lucia L. Prieto-Godino, Tom Baden
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 18/4, 2020, Page(s) e3000730, ISSN 1545-7885
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000730

The Functional Organization of Vertebrate Retinal Circuits for Vision

Auteurs: Tom Baden, Timm Schubert, Philipp Berens, Thomas Euler
Publié dans: Oxford Research Encyclopedias, Neuroscience, Numéro Online, 2018, Page(s) N/A
Éditeur: Oxford Research Encyclopedias
DOI: 10.1093/acrefore/9780190264086.013.68

Studying a Light Sensor with Light: Multiphoton Imaging in the Retina

Auteurs: Thomas Euler, Katrin Franke , Tom Baden
Publié dans: 2019
Éditeur: preprints
DOI: 10.20944/preprints201903.0244.v1

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