Imaging Brain Circuits to Decode Brain Computations: Multimodal Multiscale Imaging of Cortical Microcircuits to Model Predictive Coding in Human Vision

Projektinformationen

MULTICONNECT

ID Finanzhilfevereinbarung: 639938

DOI 10.3030/639938

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 11 Mai 2015

Startdatum 1 Juni 2015

Enddatum 30 November 2020

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 500 000,00

EU-Beitrag € 1 500 000,00

Koordiniert durch

UNIVERSITEIT MAASTRICHT
Netherlands

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Veröffentlichungen

Other (3)

Monte Carlo Simulation of Diffusion MRI in geometries constructed from two-photon microscopy of cortical gray matter

Autoren: Alard Roebroeck; Nima Gilani; Anna Schueth; Sven Hildebrand
Veröffentlicht in: Ausgabe 2, 2019
Herausgeber: bioRxiv
DOI: 10.1101/626945

MESMERISED: Super-accelerated 7 T STEAM imaging for quantitative multi-contrast and diffusion MRI

Autoren: F.J. Fritz, B.A. Poser, A. Roebroeck
Veröffentlicht in: 2020
Herausgeber: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.05.15.098269

Fast quantification of uncertainty in non-linear diffusion MRI models for artifact detection and more power in group studies

Autoren: Robbert L. Harms; Sanne Schoenmakers; Alard J. Roebroeck; Francisco J. Fritz
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2019
Herausgeber: bioRxiv
DOI: 10.1101/651547

Peer reviewed articles (15)

hFRUIT: An optimized agent for optical clearing of DiI-stained adult human brain tissue

Autoren: Sven Hildebrand, Anna Schueth, Klaus von Wangenheim, Christian Mattheyer, Francesco Pampaloni, Hansjürgen Bratzke, Alard F. Roebroeck, Ralf A. W. Galuske
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-66999-3

Compressed Sensing Diffusion Spectrum Imaging for Accelerated Diffusion Microstructure MRI in Long-Term Population Imaging

Autoren: Alexandra Tobisch, Rüdiger Stirnberg, Robbert L. Harms, Thomas Schultz, Alard Roebroeck, Monique M. B. Breteler, Tony Stöcker
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroscience, Ausgabe 12, 2018, ISSN 1662-453X
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnins.2018.00650

Robust and fast nonlinear optimization of diffusion MRI microstructure models

Autoren: R.L. Harms, F.J. Fritz, A. Tobisch, R. Goebel, A. Roebroeck
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 155, 2017, Seite(n) 82-96, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2017.04.064

Determining Excitatory and Inhibitory Neuronal Activity from Multimodal fMRI Data Using a Generative Hemodynamic Model

Autoren: Martin Havlicek, Dimo Ivanov, Alard Roebroeck, Kamil Uludağ
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroscience, Ausgabe 11, 2017, ISSN 1662-453X
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fnins.2017.00616

High resolution anatomical and quantitative MRI of the entire human occipital lobe ex vivo at 9.4 T

Autoren: S. Sengupta, F.J. Fritz, R.L. Harms, S. Hildebrand, D.H.Y. Tse, B.A. Poser, R. Goebel, A. Roebroeck
Veröffentlicht in: NeuroImage, 2017, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2017.03.039

On the importance of modeling fMRI transients when estimating effective connectivity: A dynamic causal modeling study using ASL data

Autoren: Martin Havlicek, Alard Roebroeck, Karl J. Friston, Anna Gardumi, Dimo Ivanov, Kamil Uludag
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 155, 2017, Seite(n) 217-233, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2017.03.017

T1 relaxometry of crossing fibres in the human brain

Autoren: Silvia De Santis, Yaniv Assaf, Ben Jeurissen, Derek K Jones, Alard Roebroeck
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 141, 2016, Seite(n) 133-142, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2016.07.037

A Specialized Multi-Transmit Head Coil for High Resolution fMRI of the Human Visual Cortex at 7T

Autoren: Shubharthi Sengupta, Alard Roebroeck, Valentin G. Kemper, Benedikt A. Poser, Jan Zimmermann, Rainer Goebel, Gregor Adriany
Veröffentlicht in: PLOS ONE, Ausgabe 11/12, 2016, Seite(n) e0165418, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0165418

Ultra-High Field MRI Post Mortem Structural Connectivity of the Human Subthalamic Nucleus, Substantia Nigra, and Globus Pallidus

Autoren: Birgit R. Plantinga, Alard Roebroeck, Valentin G. Kemper, Kâmil Uludağ, Maartje Melse, Jürgen Mai, Mark L. Kuijf, Andreas Herrler, Ali Jahanshahi, Bart M. ter Haar Romeny, Yasin Temel
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroanatomy, Ausgabe 10, 2016, ISSN 1662-5129
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnana.2016.00066

Including diffusion time dependence in the extra-axonal space improves in vivo estimates of axonal diameter and density in human white matter

Autoren: Silvia De Santis, Derek K. Jones, Alard Roebroeck
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 130, 2016, Seite(n) 91-103, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2016.01.047

Automatic Segmentation of Human Cortical Layer-Complexes and Architectural Areas Using Ex vivo Diffusion MRI and Its Validation

Autoren: Matteo Bastiani, Ana-Maria Oros-Peusquens, Arne Seehaus, Daniel Brenner, Klaus Möllenhoff, Avdo Celik, Jörg Felder, Hansjürgen Bratzke, Nadim J. Shah, Ralf Galuske, Rainer Goebel, Alard Roebroeck
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroscience, Ausgabe 10, 2016, ISSN 1662-453X
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnins.2016.00487

Robust and Fast Markov Chain Monte Carlo Sampling of Diffusion MRI Microstructure Models

Autoren: Robbert L. Harms, Alard Roebroeck
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroinformatics, Ausgabe 12, 2018, ISSN 1662-5196
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fninf.2018.00097

Ultra-high resolution and multi-shell diffusion MRI of intact ex vivo human brains using kT-dSTEAM at 9.4T

Autoren: F.J. Fritz, S. Sengupta, R.L. Harms, D.H. Tse, B.A. Poser, A. Roebroeck
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 202, 2019, Seite(n) 116087, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2019.116087

Ex vivo diffusion MRI of the human brain: Technical challenges and recent advances

Autoren: Alard Roebroeck, Karla L. Miller, Manisha Aggarwal
Veröffentlicht in: NMR in Biomedicine, Ausgabe 32/4, 2018, Seite(n) e3941, ISSN 0952-3480
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.3941

Curvilinear locus coeruleus functional connectivity trajectories over the adult lifespan: a 7T MRI study

Autoren: Heidi I.L. Jacobs, Lisa Müller-Ehrenberg, Nikos Priovoulos, Alard Roebroeck
Veröffentlicht in: Neurobiology of Aging, Ausgabe 69, 2018, Seite(n) 167-176, ISSN 0197-4580
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2018.05.021

Non-peer reviewed articles (2)

Scalable cytoarchitectonic characterization of large intact human neocortex samples

Autoren: Roebroeck, Alard; Galuske, Ralf; Herrler, Andreas; Schueth, Anna; Hildebrand, Sven
Veröffentlicht in: Nature Scientific Reports, Ausgabe 1, 2018, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/274985

The mesoSPIM initiative: open-source light-sheet mesoscopes for imaging in cleared tissue

Autoren: Fabian F. Voigt, Daniel Kirschenbaum, Evgenia Platonova, Stéphane Pagès, Robert A. A. Campbell, Rahel Kästli, Martina Schaettin, Ladan Egolf, Alexander van der Bourg, Philipp Bethge, Karen Haenraets, Noémie Frézel, Thomas Topilko, Paola Perin, Daniel Hillier, Sven Hildebrand, Anna Schueth, Alard Roebroeck, Botond Roska, Esther Stoeckli, Roberto Pizzala, Nicolas Renier, Hanns Ulrich Zeilhofer,
Veröffentlicht in: Nature Methods, 2020, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/577122