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Understanding microbiomes of the ruminant holobiont

Description du projet

Le rôle du microbiome dans la production et la santé des ruminants

Les espèces de bétail ruminant, comme les bovins, les moutons et les chèvres, dépendent des microbes associés à leur organisme pour exécuter des fonctions essentielles et pour interagir avec l’environnement. L’association entre le microbiome et l’hôte ruminant, l’holobionte, est l’unité biologique qui influence le développement, la croissance, la santé et l’empreinte environnementale des ruminants. Le principal objectif du projet HoloRuminant, financé par l’UE, consiste à étudier le rôle du microbiome sur la santé animale et l’efficacité de la production. Les chercheurs adopteront une approche multiomique pour analyser le microbiome et l’hôte, ainsi que les répercussions de leurs interactions à des étapes clés de la vie des ruminants. L’objectif final est de caractériser et d’identifier les microbiomes associés aux ruminants entraînant une amélioration de la production, la santé et le bien-être.

Objectif

Sustainability of ruminant production is of concern to society because of its implications for the environment, the economy and food security. Microbiomes associated with the host play a key role in health, welfare and environmental efficiency in ruminant production systems. However, despite the information already available, we lack the insights to precisely link the causes and mechanisms of microbial influence on ruminant phenotypes. This is because the interconnection and communication between the animal and its different microbiomes have never been studied in a deep, integrated way.
The goal of the project is to elucidate the role of ruminant-associated microbiomes and their interplay with the host in early life and throughout fundamental life events. HoloRuminant will use a holistic multi-omics approach to characterise the acquisition and evolution of microbiomes from different body sites, their inheritability and their influence on the host’s resistance to disease and environmental efficiency of production. Specifically we will: determine microbiomes’ functions by combining multi-level information for microbes, host and their interaction; define microbiomes’ roles during challenging life periods such as perinatal, weaning, and after exposure to pathogens; and evaluate the effect of ruminant microbiomes on critical phenotypes for sustainable production, health and welfare. This will allow the identification of novel microbial markers for monitoring, predicting and selecting phenotypes of interest. By engaging actors from the livestock value chain, we will evaluate the socio-economic impact and acceptability of the innovations proposed among stakeholders and the public.
HoloRuminant will provide highly innovative, standardized methodologies that will radically advance our understanding of the ruminant holobiont. This knowledge and the tools created will allow the use of microbiome-based diagnostics and solutions for improving ruminant sustainabilty.

Appel à propositions

H2020-SFS-2018-2020

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Sous appel

H2020-SFS-2020-2

Coordinateur

INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT
Contribution nette de l'UE
€ 1 240 470,00
Adresse
147 RUE DE L'UNIVERSITE
75007 Paris
France

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Région
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
€ 1 240 470,00

Participants (25)